Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLiXu_Ung0002000 | OGI:01011260 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg35:134533-145360 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MNYTHRCLHSHKLPLLILLIAIVVILIQPYSIHAAANSSNTTIRCLTSQSSALLQLKSSFHDASSLSSWQPDTDCCRWEGVTCRMASGHVVVLNLSDGYLQSNGLHPALFNLTLLTNLALSGNDFMGAQLPDSGFERLSKLVSLDLSATNFAGQIPIGIGNLSSMLALDLSNNPNLYLSEPSFQTFIANLSNLRELYLDEMDLSSSGSTWSSDLAASAPQIQILSFMSCGLSGFIDPSFSRLRSLTMINLRLNVISGMVPEFFANLSFLTILELSGNAFEGQFPTKIFQLKRLQFIDLYWNDKLCVQLPEFLPGSRLEVLDLILTNRSNAIPASVVNLKYLKHLGLTTVEASMNSDILLIRELHWLEVLRLYGGSGQGKLVSFSWIGSLKHLTYLELGNYNFSGLMPSSIINLTNLTSLTLYNCSMSGPIPSWIGNLIQLNNLNFRSNNLNGTIPKSIFALPALQSLYLDSNQLSGHLEDIPIPSSSSVYDIDLSNNWLHGPIPKSFFCLPNLEYLNLESNHLTGIVELRPFWRLRSLYFLGFSNNKLSVIDGEDSPSQYLPKIQHLGLACCNLTKLPRILRHLYDILELDLSSNKIGGVIPGWIWEIWKDTLGSLDLSNNAFTSLENSPSLVTFTHLSHLNLSFNRLQGEIPIPAISLPYGVVVLDYSNNGFSSILRTFGSMTKLQFLYLSDNNFSGFVPSCLVEGRSLRVLNLRGNKFNGMLPKGIKEGCKLETIDLNSNQIEGRLPRTLSNCKSLELLDVSNNHILDLFPLWLGNLPKLRVLVLRSNQLYGTIKGLHNSDLTRDHFSSLQILDLANNTLSGQLPPKWFEKLKSMMANVDDGQVLEHQTNFSQGFIYRDIITITYKGFDMTFNRMLTTFKAIDFSNNSFVGVIPGTIGSLVSLHGLNMSHNNFTGAIPQQLGNLAQLESLDLSWNQLSGVIPHELIFLTSLAWLNLSNNNLTGRIPQSNQFLSFSNSSFEGNLGLCGRPLSKDCDSSGSITPNTEASSEDSSLWQDKVGVILLFVFAGLGFVVGFVLTIIFQLVCQLPPAKMSPRVAQREYKPLLLVLLLLLQTLIASSLPCLPDQAAALLQLKRSFSATTASATAFRSWPAGTDCCRWEGIRCDDGGGRVTSLDLGGRHLQSGGLDTAVFSLTSLRYLNLGGNDFNGSQLPATGFEMLTELTHLNISPPSFTGQIPAGIGSLTNLVSLDLSSRIYVVNQGDDGATVMSNLLPSWGFSRVNFENLIANLGNLRELYLGLVYMSNGGEGWCNALANSTPKIQVLSLPLCEISGPICQSLFSLRSLSVVDLQGNDLSGAIPEFFADLSSLSVLQLSRNKLDGFFPPRIFHNRKLTVIDIGYNYEIYGNLPNFPPNSSLIKLHVSGTKFSGYIPSSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSFLGMLKSLSLFEVSGLGLVGSMPAWITNLTSLTELQFSHCDLSGSLPSSIGNLKNLRRLSLFKSNFSGNIPLQIFNLTQLHSLHLPLNNFVGIVELTSFWRLPYLSHLDLSNNKLSVVDGLVNDSAVSSPKVTFLRLASCNILKFPNALRHQDKIDFLDLSNNQIHGAIPPWAWETWKNLFFLDLSNNKFTSLGHDTLLPLDTRYINLSYNMFEGPIPIPEESTASQLDYSNNRFSSMPFDLIPYLAGALSLKVSMNNVSGEVPSTFCTVKSLQILDLSHNILNGSIPSCLMENSSTLKIINLRGNQLRGELPHNIKEDCAFEALDFGYNWIEGTLPKSLVACKNLVLLDVGNNQIRDSFPCWMHLLPKLQVLILKSNRFYGQLGPTLAKDEDSCELQDLRILDLASNNFSGILPGGWFIKLKSMMSISSNETLVMKDGDTYGAFYHKPYIFTTRVTYKGLDLTFTKILKTLVLIDVSNNRFHGSIPETIATLSMLSSLNMSHNAITGPIPNQLASLHQLESLDLSSNKLSGEIPKKLASLDFLSTLNLSDNMLEGIIPESPHFLTLPNSSFIRNAGLCGPPLSNECSNKSTSNVMPHLSEEKSADVMLFLFVGLGFGVGFAIAIVVRKPCIGKYT |
||||||||||
Function | Receptor-like protein 7 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C699] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLiXu_Ung0002000 | OsLiXu_Ung0002000.01 | ChrUN-Ctg35 | 134533 | 145360 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGAACTACACGCATAGATGCCTCCACAGCCACAAACTCCCTCTTCTCATCCTCCTCATTGCCATCGTCGTCATACTCATACAGCCATACTCCATCCATGCTGCTGCCAACAGCAGCAACACCACCATCAGATGCCTGACATCTCAGTCATCCGCCCTCCTCCAGCTGAAGAGCTCCTTCCACGACGCGAGCAGCCTCTCGTCCTGGCAACCGGACACCGACTGCTGCCGATGGGAGGGCGTCACCTGCCGCATGGCTTCTGGGCATGTCGTTGTGCTGAACCTCAGTGATGGTTATCTTCAGAGCAATGGGCTGCACCCTGCACTGTTCAACCTCACCTTGCTCACAAACCTCGCCCTCAGTGGCAATGACTTCATGGGAGCACAACTCCCAGATTCTGGGTTTGAGAGGCTTTCGAAACTTGTCAGCCTTGACCTCTCTGCGACCAACTTTGCTGGCCAGATCCCCATTGGCATTGGAAATCTGAGCAGCATGCTTGCTCTTGACTTGTCTAACAACCCCAATTTGTACCTCTCGGAGCCAAGTTTTCAGACCTTCATAGCGAACCTGAGCAATCTGAGAGAGCTCTACCTTGATGAGATGGACCTCTCTAGCAGCGGGTCAACTTGGTCAAGCGATCTAGCAGCGTCTGCTCCACAGATTCAGATACTTAGCTTCATGTCATGTGGCTTGTCTGGTTTCATTGATCCCTCCTTCTCACGACTCCGTTCACTGACAATGATCAACCTCAGACTCAATGTCATCAGTGGCATGGTTCCTGAGTTCTTTGCCAACCTCTCTTTCTTAACGATTCTGGAGCTATCTGGCAATGCTTTTGAGGGTCAATTCCCCACAAAGATCTTCCAACTAAAAAGGCTGCAGTTTATTGATTTATACTGGAACGATAAGCTCTGTGTGCAGTTGCCAGAATTCCTACCTGGTAGTCGTCTGGAAGTGTTGGATCTCATATTGACCAACCGTTCCAACGCCATACCAGCATCAGTGGTCAATCTCAAGTATCTAAAGCATTTGGGCCTTACAACGGTAGAGGCTTCAATGAATTCTGATATCCTTTTGATCAGAGAACTCCACTGGCTGGAAGTTCTCCGGCTCTATGGAGGATCAGGACAAGGGAAGCTGGTGTCGTTCTCTTGGATAGGCAGCCTTAAACATTTGACATACCTGGAGCTTGGCAATTACAACTTCTCTGGATTGATGCCCTCTTCGATTATCAATCTTACAAATCTGACAAGTTTAACGCTCTACAATTGCAGCATGTCTGGGCCCATACCTTCTTGGATTGGGAACTTGATCCAACTCAATAATTTGAACTTCAGAAGCAACAACCTCAACGGAACAATTCCAAAGTCCATCTTCGCACTTCCTGCGTTGCAATCATTATATCTAGACTCTAATCAACTTTCTGGTCATTTAGAAGACATCCCTATTCCATCATCTTCATCTGTGTATGACATTGATTTAAGTAACAATTGGCTTCATGGCCCCATTCCCAAATCATTTTTCTGTCTTCCAAATCTTGAGTATCTCAATCTTGAGTCAAATCACTTGACCGGCATAGTGGAACTTAGACCTTTCTGGAGACTAAGAAGCCTTTATTTTCTGGGTTTCTCTAACAATAAGCTGTCGGTGATTGATGGAGAAGATTCTCCATCTCAATATCTCCCTAAGATTCAGCACCTAGGACTAGCATGTTGCAACCTCACAAAACTTCCAAGAATTCTGAGACATCTATATGACATTCTTGAGCTAGACCTTTCAAGTAATAAGATTGGTGGAGTTATACCAGGATGGATATGGGAGATTTGGAAGGACACCCTTGGATCATTGGACCTCTCGAACAATGCATTTACTAGCCTGGAGAACTCTCCCTCTCTTGTTACATTTACACATCTAAGCCATCTAAATCTCAGTTTCAATAGACTTCAAGGAGAAATACCCATACCAGCCATATCATTGCCTTATGGTGTAGTTGTATTGGATTACTCAAACAATGGGTTCTCTTCCATACTACGTACATTTGGTAGTATGACGAAACTCCAATTCCTGTACTTATCTGATAACAACTTTAGTGGTTTCGTTCCATCTTGTCTGGTAGAAGGCAGAAGCTTAAGGGTACTGAATTTGAGGGGGAATAAATTCAACGGGATGTTGCCTAAGGGCATTAAAGAAGGATGTAAGCTTGAGACTATAGATTTGAACAGCAACCAAATTGAAGGGAGGCTGCCCAGAACACTATCAAACTGCAAAAGTCTGGAACTCCTCGATGTTAGTAACAATCACATCCTCGATCTGTTCCCTTTGTGGCTGGGGAATCTTCCCAAGCTTCGAGTTCTTGTACTGAGATCCAACCAATTATATGGCACAATTAAGGGTCTCCATAATAGTGATCTAACAAGGGATCACTTCTCAAGCTTGCAAATACTTGATTTAGCCAATAACACTCTATCTGGTCAGTTGCCCCCAAAATGGTTTGAGAAACTGAAATCAATGATGGCAAATGTCGATGATGGACAAGTTTTGGAGCACCAAACAAACTTTTCACAAGGATTTATCTATCGAGACATCATCACTATCACATACAAAGGGTTTGATATGACATTCAATAGAATGCTAACTACCTTTAAAGCAATTGATTTCTCAAATAACTCATTTGTTGGAGTTATTCCTGGAACGATAGGGAGTCTTGTTTCACTTCATGGACTTAACATGTCACATAATAATTTCACTGGAGCAATCCCGCAACAGCTTGGTAACTTGGCTCAGCTAGAGTCCTTGGATCTCTCTTGGAACCAGCTCTCAGGGGTAATACCACATGAGTTAATATTTCTAACTTCTCTTGCTTGGCTGAATCTTTCGAATAACAACTTGACTGGAAGAATACCACAGAGCAACCAGTTCTTGTCGTTTTCCAACAGTTCATTTGAAGGTAATTTGGGCCTCTGTGGAAGGCCACTATCCAAAGATTGTGATAGTTCTGGTTCAATAACGCCAAATACAGAAGCTTCTTCAGAAGACAGCAGTTTGTGGCAAGATAAAGTAGGGGTCATCCTATTGTTTGTCTTTGCTGGCTTGGGGTTTGTGGTTGGCTTTGTGCTGACAATCATATTTCAACTGGTTTGCCAGCTGCCACCCGCCAAGATGTCACCTCGGGTAGCCCAACGAGAGTACAAGCCGTTGTTACTTGTACTCCTCCTCCTACTACAAACCTTGATCGCGAGCTCGCTTCCATGCTTGCCGGACCAGGCGGCGGCGCTGCTCCAGCTGAAGCGATCGTTCTCGGCGACCACCGCGTCCGCCACCGCGTTCCGGTCATGGCCCGCCGGCACGGATTGCTGCCGCTGGGAGGGCATCCGCTGCGACGACGGCGGTGGCCGCGTCACTTCCCTCGATCTCGGCGGCCGACACCTGCAGAGCGGCGGCCTTGACACCGCCGTCTTCAGCCTCACGTCGCTGAGGTATCTCAACCTCGGTGGCAACGACTTCAACGGGTCACAGCTCCCGGCCACCGGATTCGAGATGCTCACCGAGCTCACCCATCTCAACATCTCGCCACCCAGCTTCACAGGCCAGATACCGGCAGGTATAGGAAGCCTCACCAACTTGGTCTCTCTTGATCTGTCATCTCGCATTTACGTCGTCAATCAAGGAGATGACGGTGCCACTGTCATGTCAAATTTGTTACCCTCCTGGGGCTTCTCGAGGGTAAACTTCGAGAATTTGATTGCAAATCTTGGTAATCTGAGGGAGCTCTATCTTGGCTTGGTGTACATGTCCAATGGAGGCGAAGGGTGGTGCAACGCTCTGGCTAATTCCACTCCTAAGATTCAGGTTCTGAGCCTACCATTATGCGAAATCTCTGGTCCCATTTGCCAATCTCTGTTTAGTTTGCGATCCCTTTCTGTTGTTGACTTGCAAGGAAATGACCTGTCTGGTGCCATACCTGAATTCTTCGCTGATTTGTCCTCCCTTAGTGTTCTTCAGCTTTCAAGAAACAAGTTAGATGGTTTTTTTCCACCAAGAATCTTCCACAACAGAAAACTAACAGTTATTGATATTGGCTACAACTACGAAATCTATGGTAATTTGCCCAATTTTCCACCTAATAGCAGTTTGATCAAATTGCATGTCAGTGGCACCAAGTTCTCAGGTTACATACCAAGCTCTATTTCTAATCTCACGGGTCTGAAGGAGCTGGGTCTGAGTGCAAATGATTTCCCTACAGAACTGCCGTCTTTTCTAGGAATGCTTAAATCCTTGAGCTTATTTGAGGTTTCTGGGCTCGGCCTAGTAGGATCAATGCCAGCTTGGATAACAAATCTAACATCTTTGACAGAGCTCCAATTTTCTCATTGTGACTTGTCTGGATCTTTACCATCTTCCATAGGCAATCTTAAGAATCTCAGAAGACTATCTTTATTCAAGAGCAACTTTTCTGGAAACATACCATTGCAAATCTTTAACTTGACACAACTGCATAGCTTGCATCTTCCACTAAACAACTTCGTGGGGATAGTGGAACTTACCTCATTCTGGAGACTACCATACCTATCACACCTTGATCTTTCAAATAACAAATTATCTGTGGTGGATGGGTTAGTAAATGATTCAGCAGTGTCCTCTCCCAAAGTAACATTCTTGAGGCTAGCTTCCTGCAACATATTAAAGTTTCCCAATGCATTAAGACATCAAGATAAGATAGACTTCCTTGATCTTTCAAATAATCAAATACATGGGGCAATACCTCCATGGGCATGGGAAACTTGGAAAAATTTGTTCTTCTTGGACCTATCAAATAACAAATTTACCAGTCTAGGACATGACACTTTGCTCCCCTTGGACACAAGATATATCAATCTCAGTTATAATATGTTTGAAGGACCCATACCTATACCTGAAGAGAGTACAGCCTCTCAGTTGGATTACTCAAATAATCGGTTTTCGTCTATGCCATTTGACCTAATTCCATATCTTGCTGGCGC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More
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Protein seq | MNYTHRCLHSHKLPLLILLIAIVVILIQPYSIHAAANSSNTTIRCLTSQSSALLQLKSSFHDASSLSSWQPDTDCCRWEGVTCRMASGHVVVLNLSDGYLQSNGLHPALFNLTLLTNLALSGNDFMGAQLPDSGFERLSKLVSLDLSATNFAGQIPIGIGNLSSMLALDLSNNPNLYLSEPSFQTFIANLSNLRELYLDEMDLSSSGSTWSSDLAASAPQIQILSFMSCGLSGFIDPSFSRLRSLTMINLRLNVISGMVPEFFANLSFLTILELSGNAFEGQFPTKIFQLKRLQFIDLYWNDKLCVQLPEFLPGSRLEVLDLILTNRSNAIPASVVNLKYLKHLGLTTVEASMNSDILLIRELHWLEVLRLYGGSGQGKLVSFSWIGSLKHLTYLELGNYNFSGLMPSSIINLTNLTSLTLYNCSMSGPIPSWIGNLIQLNNLNFRSNNLNGTIPKSIFALPALQSLYLDSNQLSGHLEDIPIPSSSSVYDIDLSNNWLHGPIPKSFFCLPNLEYLNLESNHLTGIVELRPFWRLRSLYFLGFSNNKLSVIDGEDSPSQYLPKIQHLGLACCNLTKLPRILRHLYDILELDLSSNKIGGVIPGWIWEIWKDTLGSLDLSNNAFTSLENSPSLVTFTHLSHLNLSFNRLQGEIPIPAISLPYGVVVLDYSNNGFSSILRTFGSMTKLQFLYLSDNNFSGFVPSCLVEGRSLRVLNLRGNKFNGMLPKGIKEGCKLETIDLNSNQIEGRLPRTLSNCKSLELLDVSNNHILDLFPLWLGNLPKLRVLVLRSNQLYGTIKGLHNSDLTRDHFSSLQILDLANNTLSGQLPPKWFEKLKSMMANVDDGQVLEHQTNFSQGFIYRDIITITYKGFDMTFNRMLTTFKAIDFSNNSFVGVIPGTIGSLVSLHGLNMSHNNFTGAIPQQLGNLAQLESLDLSWNQLSGVIPHELIFLTSLAWLNLSNNNLTGRIPQSNQFLSFSNSSFEGNLGLCGRPLSKDCDSSGSITPNTEASSEDSSLWQDKVGVILLFVFAGLGFVVGFVLTIIFQLVCQLPPAKMSPRVAQREYKPLLLVLLLLLQTLIASSLPCLPDQAAALLQLKRSFSATTASATAFRSWPAGTDCCRWEGIRCDDGGGRVTSLDLGGRHLQSGGLDTAVFSLTSLRYLNLGGNDFNGSQLPATGFEMLTELTHLNISPPSFTGQIPAGIGSLTNLVSLDLSSRIYVVNQGDDGATVMSNLLPSWGFSRVNFENLIANLGNLRELYLGLVYMSNGGEGWCNALANSTPKIQVLSLPLCEISGPICQSLFSLRSLSVVDLQGNDLSGAIPEFFADLSSLSVLQLSRNKLDGFFPPRIFHNRKLTVIDIGYNYEIYGNLPNFPPNSSLIKLHVSGTKFSGYIPSSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSFLGMLKSLSLFEVSGLGLVGSMPAWITNLTSLTELQFSHCDLSGSLPSSIGNLKNLRRLSLFKSNFSGNIPLQIFNLTQLHSLHLPLNNFVGIVELTSFWRLPYLSHLDLSNNKLSVVDGLVNDSAVSSPKVTFLRLASCNILKFPNALRHQDKIDFLDLSNNQIHGAIPPWAWETWKNLFFLDLSNNKFTSLGHDTLLPLDTRYINLSYNMFEGPIPIPEESTASQLDYSNNRFSSMPFDLIPYLAGALSLKVSMNNVSGEVPSTFCTVKSLQILDLSHNILNGSIPSCLMENSSTLKIINLRGNQLRGELPHNIKEDCAFEALDFGYNWIEGTLPKSLVACKNLVLLDVGNNQIRDSFPCWMHLLPKLQVLILKSNRFYGQLGPTLAKDEDSCELQDLRILDLASNNFSGILPGGWFIKLKSMMSISSNETLVMKDGDTYGAFYHKPYIFTTRVTYKGLDLTFTKILKTLVLIDVSNNRFHGSIPETIATLSMLSSLNMSHNAITGPIPNQLASLHQLESLDLSSNKLSGEIPKKLASLDFLSTLNLSDNMLEGIIPESPHFLTLPNSSFIRNAGLCGPPLSNECSNKSTSNVMPHLSEEKSADVMLFLFVGLGFGVGFAIAIVVRKPCIGKYT
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.059400 | 0.0 | 0.166089 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0162800 | SBH | 0.369198 | 0.466939 | 1.049860 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g06900 | RBH | 0.594768 | 0.823849 | 0.519105 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0162800 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004530 | SBH | 0.0 | 1.509433 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0004260 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.215217 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0004510 | SBH | 0.072213 | 0.764565 | 1.948779 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0004200 | SBH | 0.012239 | 0.044104 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0004370 | SBH | 0.675431 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0057600 | SBH | 0 | 0 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0004310 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.131705 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0058900 | SBH | 0 | 0 | 0 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0004150 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004320 | SBH | 0.105607 | 0.975155 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0004390 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0004350 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0004290 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G004350 | SBH | 0.072881 | 0.481987 | 0.494161 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0004240 | SBH | 0.000000 | 1.917465 | 0.922602 |