Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_01g0023610 | OGI:01013090 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:25286191-25300749 | ||||||||
| Gene Symbol | OsSTA22 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_01g0023610 | OsLiXu_01g0023610.01 | Chr01 | 25286191 | 25300749 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgaaGggaatgatcaacgaaccagAatatttagacacatcgccacatcgAacggctagaactccagttcCtccacgatcctcctcgattgcagctgcagtcacttgccttttgctagtcgtctcccgagacgccatcaccagcgcagccgcatctcccaaagctccagcAtccaccGgtggctgcatcgcggccgagagggatgccctgctctcgttcaaggctggcatcacaagcgaccccaagaaaCGcctcAgctcatggctaggtgagaattgctgccAgtggagcggtgtgaggtgtagcaacaggacggggcatgttatcatccTCAacctcagcaacactatcttacagtatgatgatccgcattaTtacaagtacgccgatgttgattttcagttgtatgggaacataagttcgtctttggtaagcctgcgacaactgaaaaGcctggatcttagtGggaacatCcttGgagaaagtatgccagaGttctTGggctcccttcaaagtttgacccatctcaacctagcatgtatgggtttttacggcagagtacctcatcagcttggtaatctgtctaatttgcagtttcttgacataacatctgaagtttatgaccatcctcctatgcacacagctgacatctcatggttggcacgccttccttcattgaagtatcttgatatgagttatgtgaatctaagctcagtggttgattgggtccgTccagtgaatatgctttcccgtcttgaggttctacgccttacagggtgttggatcatgagttcatcatcaacaggactcaccaatctgacaagccttgaaacacttgacctctctgagaacactttgtttggcacggtaattcccAactGggtgtggagcatgaagacggttaagatgcttaacctggcctcatgccacttgtctGgttcatttcctgatGgattaggcaacttaactttgttggaaggccttaaccttggaggtgatagctacctTGgaagtaatagcttcgaagggacgctgccatcaacattaaacaacacttgcaatctgagggtcctatacctcaaTgagAatttgatcggcgtggaaatcaaagatctgatggataagcttccaaggtgtacttggaataaattggaggagcttgatttgtcttataatgacattactggaaacctggattggctggggagccaaactagcttaacaagcctttacctatcttggaacaaattcagtggtcatttgcccttgctaatcagagaaatggctaatttgacaactctaattctacataacaataatatcagtggtgtgatctcaaaccagcatctttcaggccttgagagtttggagagaatcattatgtcttataatcctttaaaggtagtgctggacgaaagttggagccctccctttggattgttcgatgtttattttgcatcttgccaaCTgggtccagaatttcctgtgtggatcaaatcgttgaataaTtgttactcaattgatgtttcaagttcaggcataaaagatgagcttcctaattggttctggaatttagtttctgacgttgcaaaCgtaaatatatctcataatcagatcagagggaagttaccagacagttttcaaggtatgtcaactgaaaagctcattctagcttcgaaccagctgactggtcgcctgccatcgttaccggaaaaTCtctattatttggacatttccagAaacttattgtctggtccgctgccatttaattttggtggcgcaaatcttgatacactcattctcttttccaaccatatcaatggcagcattccacagtccctttgcaagatgcacaaattgcgtgccttggaTttagcagacaattttctggtaggagaacttcctcactgtttgccgacagaactgaaaccatcgactggtggtagttttatacattccacaagtctgaacattcatatccttttactaagcaaaaatcagctttctggagagttccctatgctactgcaatcgtgccaaagcatcaccattcttgatctagcatggaacAaatattctggaaagttgccagagtggataggtgaaaagttgccatccatagtaattctgcgtatcaggtctaataagttctctggtcatatcccagGTgGttttaccaaacttgatcatctgcggtatttggatatagctaataatagtttttctggtactatcccacaatcccttccgtgcttgaaaggaatgatcaacgaaccagaaaatttagaaacattgttcctatttggagtggcactggaaaacggattcggagctttcgatgtattcggcctgttccattatagcatatcatttgttctgcaaggtcaacaacttgaatacagcaagggacttgtgtacttggtgggccttgatttttctagcaacaaattgtctggccatattccaaaggagattggttctcttgtcgaattggtaaaTttgaatctgtcctggaaccagttagcaggaaacattccggatcagattggtgagctgcaccaattaacctcccttgacctatcatataatcaattttctggagAaatcccTtcaagcctatcaaatttgacattcttgagctatctgaacttgtcttacaacaatttatcgggaaggattcctcggggacatcaactggacacactcaatgcagatgatccatctttgatgtacatcggcaacccaggtctttgtggttatccccttgcaaagaattgtcctgaaaaTgggacatctcaaggtcaaaccgttaaaagtcatcacgatggttcgttctgtgctggtctcagtgtggggtttgtgattggagtttggatggttcttgcgtcaCttttgttcaagaagagttggaggttttcttactttcaccactttgataggcagtatgacagattgaatacaggcacaaacaagcaaaggtcccattcccatccatcatccatggatgcctctgctgcatccatgctctggactctgatcatcatcctcgccgccgcagccgctgcctcctctgtccatccaccacagcagcagagctatggcgtcggctgcatcgcggcggagcgggcggcgttgctctccttcaaagaaggcgtcatggccgacccgctgaggctcctcgactcatggcacggtgcaggagactgctgccggtggaacggcgtcgggtgcagcaacaggaccggccatgtcgtcaagctcgacctccgcaacactctctactgggatgatcagcgccaagttagatcggacaaccctcacgccatgcgtggacaggtaagcacctccctgcttgccctgaggcgtctgaagtaccttgatctcagcgggaacaaccttggaggatcgggtatagccatgccatcgttcttggggtctctcgagagcctggtctatctcaacctctcctgcatcgatttctttggagaggtgcctcctcagcttggcaatctctcccggctgtcctacctcgacgttggcagcatgtattattctggacaggttttctcatcggatctctcctggctgggacgcctatcttcactgaagtatcttgacatgagcggtgtcaatctcagcacggtttctgactgggctcatgtggtcaatatgcttcccaatttgagagttctcaatctcaaactgtgtcaactcacgagatcaaacccaccacttctgcattccaaccttacagttcttgagaagcttgttctttctgccaacaatttctatggaccacttgcgactgactggttctggggtataagcacccttaaaaccctcgaactcgagttctgttccctatatggtcctcttcctgatagcttgggaaacatgactgcacttcaagttcttgccatgcaagatagcaataatatcacaggaatgttttcaccaactctgaagaatctatgcaatttgcaagaagttgtgttcactcagactaacctgggcggggacataacagaacagatggagcggctgccaaagtgtgcatgggacaaactacaggcgataaatctggatgcaaccaacatgacaggcaatattccagtttggttgggaaacatgaccaacttgacggactttagtgtctcagggaaccagcttagtggccctgtgcctttagggcttggagctcttactaagctgactgtattgtatctgggccaaaataacttgactggtatcatatcagaagaccatcttgccaatcttcgtaatatggtcatattggacttgagctacacttatttaaaggttgttgtcggttccacatggactcctccattcaagttaatcagagcacaactggcttcatgtcaactgggtcctggatttcctgccttgtttaaacactaa
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| Protein seq | MKGMINEPEYLDTSPHRTARTPVPPRSSSIAAAVTCLLLVVSRDAITSAAASPKAPASTGGCIAAERDALLSFKAGITSDPKKRLSSWLGENCCQWSGVRCSNRTGHVIILNLSNTILQYDDPHYYKYADVDFQLYGNISSSLVSLRQLKSLDLSGNILGESMPEFLGSLQSLTHLNLACMGFYGRVPHQLGNLSNLQFLDITSEVYDHPPMHTADISWLARLPSLKYLDMSYVNLSSVVDWVRPVNMLSRLEVLRLTGCWIMSSSSTGLTNLTSLETLDLSENTLFGTVIPNWVWSMKTVKMLNLASCHLSGSFPDGLGNLTLLEGLNLGGDSYLGSNSFEGTLPSTLNNTCNLRVLYLNENLIGVEIKDLMDKLPRCTWNKLEELDLSYNDITGNLDWLGSQTSLTSLYLSWNKFSGHLPLLIREMANLTTLILHNNNISGVISNQHLSGLESLERIIMSYNPLKVVLDESWSPPFGLFDVYFASCQLGPEFPVWIKSLNNCYSIDVSSSGIKDELPNWFWNLVSDVANVNISHNQIRGKLPDSFQGMSTEKLILASNQLTGRLPSLPENLYYLDISRNLLSGPLPFNFGGANLDTLILFSNHINGSIPQSLCKMHKLRALDLADNFLVGELPHCLPTELKPSTGGSFIHSTSLNIHILLLSKNQLSGEFPMLLQSCQSITILDLAWNKYSGKLPEWIGEKLPSIVILRIRSNKFSGHIPGGFTKLDHLRYLDIANNSFSGTIPQSLPCLKGMINEPENLETLFLFGVALENGFGAFDVFGLFHYSISFVLQGQQLEYSKGLVYLVGLDFSSNKLSGHIPKEIGSLVELVNLNLSWNQLAGNIPDQIGELHQLTSLDLSYNQFSGEIPSSLSNLTFLSYLNLSYNNLSGRIPRGHQLDTLNADDPSLMYIGNPGLCGYPLAKNCPENGTSQGQTVKSHHDGSFCAGLSVGFVIGVWMVLASLLFKKSWRFSYFHHFDRQYDRLNTGTNKQRSHSHPSSMDASAASMLWTLIIILAAAAAASSVHPPQQQSYGVGCIAAERAALLSFKEGVMADPLRLLDSWHGAGDCCRWNGVGCSNRTGHVVKLDLRNTLYWDDQRQVRSDNPHAMRGQVSTSLLALRRLKYLDLSGNNLGGSGIAMPSFLGSLESLVYLNLSCIDFFGEVPPQLGNLSRLSYLDVGSMYYSGQVFSSDLSWLGRLSSLKYLDMSGVNLSTVSDWAHVVNMLPNLRVLNLKLCQLTRSNPPLLHSNLTVLEKLVLSANNFYGPLATDWFWGISTLKTLELEFCSLYGPLPDSLGNMTALQVLAMQDSNNITGMFSPTLKNLCNLQEVVFTQTNLGGDITEQMERLPKCAWDKLQAINLDATNMTGNIPVWLGNMTNLTDFSVSGNQLSGPVPLGLGALTKLTVLYLGQNNLTGIISEDHLANLRNMVILDLSYTYLKVVVGSTWTPPFKLIRAQLASCQLGPGFPALFKH
More
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.082126 | 0.215587 | 0.227766 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0603800 | RBH | 0.640083 | 0.837041 | 0.999380 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g41930 | RBH | 0.330381 | 0.432374 | 0.217218 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0603800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0012610 | SBH | 3.314848 | 19.322317 | 18.064363 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0024010 | RBH | 0.087010 | 0.000000 | 0.256139 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024340 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.391598 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023730 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0023440 | RBH | 2.775532 | 0.472948 | 3.969628 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0398000 | RBH | 0.191121 | 1.761456 | 1.7623355 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0023340 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0023620 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0023520 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G023710 | RBH | 0.588999 | 0.462985 | 2.210793 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023430 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
