Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_01G023710 OGI:01013090 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:23448511-23460058
Gene Symbol OsSTA22
DNA seq

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Protein seq

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Function Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_01G023710 OsN22_01G023710_01 Chr01 23448682 23460058 + NAM
CDS seq

ATGGGTCCATCTTCATCCTGCTGCCTGGTGCTCATCACGATGATCACCGTAGCCATGATCACTGCCAATTCCTATGTCCACGCTCAGCGCGGATCTGGCGGCGGCGGCAAGTGCATCGCGGCAGAGAGGGCCGCGCTGCTCTCCTTCAAAGCCGGCATCACGAGCGACCCGGCGAAGCTGCTGAAATCATGGCGCGGCGATGACTGCTGCAGCTGGAGCGGCGTCAGGTGCAGCAACGAGACCGGCCATGTCGTCGGGCTCGACCTCCGCGCCGCCTTCTTCTTGAGCAACGAGACCTTCGTTTGGTGCTTCTCCGGCGTAGCACCTAACGGGATGCTCGGCGAGATAAGTTCCTCTTTGCTTGCTCTGAAGCACTTGAAGCATCTCGATCTTAGTGGGAACTACCTTGGTGGCGTAGGCTTGCCGATGCCTAGTTTCTTGGGCTCTTTCAAGAGCTTGACGTATTTGAACCTTGCTTGCATGAACTTTGATGGTAGATTGCCACCTCAGCTTGGAAACCTCTCCAGATTGCAACATCTCAACCTTGCAACTTACCAAGAAAACACCATGCGTCCTGGTGATGTATCATGGTTACAGCACCTCGGTTTGCTCCGATTTCTCGACATGAGTGGATTGAACCTCACTTCCAATGGCGACTGGGTTCGGTTAGTGACCGGCCTTTCTTATTTGAAGGTCCTTCAACTCGGTGGCTGTGGGCTTAGTTTACCACATGAACCAACAGCACATTCAAATATAAGTTCACTTGAAATTCTTGACCTATCAAGCAACAGAGTCGACACAATTAATCCAGCCTATTGGTTTTGGGATGTCCGGACCATCAGGGAGCTGCAACTTGGAAGAAATCAAATTACTGGTCCATTTCCAGCTGCAATCGGAAACATGACATCACTTGAGGTACTTACTCTAGGTGGCAATTACATCACAGGTGTGAAGTCTGAAATGATGAAAAACTTCTGCAACTTGTGGTGGCTAGAGCTGTGGTCGAATGAGATTAATCAAGATATGGCAGAATTTATGGAGGGATTGCCTCGGTGTACAAAGAGTTCTTTACATGTCTTAGATCTATCTGCTACCAATATCACTGGAGGCATCCCGAGCTGGATGAACCACTGGAGAAATTTACGTTCTCTTCAACTCTCGGCTAATAAGCTTGAAGGATTAATACCTTTGGAAATTGGTAAGATGACTAATCTCTCCACATTGTATCTAGACAACAACCAACTCAACGGTTCAGTGTCAGAGGAACATTTTGCAGGTTTAGCGTCATTGGAAGATATAGACTTGTCTTACAATTCAATACACATTACGATCAACTCAGATTGGGTTCCCCCATTTAGCCTATATCAGGCTTTATTTGCACGTAGCAAAATGGGACCTCATTTTCCACTGTGGCTTAAAGGGCAGAGTAATGTTTACTTCCTTGACATTTCTGATGCCGGCATAACTGACAATCTTCCAGACTGGTTTTGGACTGTATTTTCGAATGTTCAATATTTGAACATCTCTTGTAATCAAATAAGTGGCACACTGCCAGCAACTCTTGAATTTATGACTTCAGCAATGACACTTGACCTCAACTCGAACAGGCTAACAGGTTTGCTGCCACAGCTACCACAATATTTGCGAACATTGGACATCTCCAACAACTCTTTGTCAGGACCACTACCGCTAATCTTTGGAGCTCCAATGCTTACACAACTAGTACTGTCCATAAATAAAATCAACGGCACCATTCCATCTTATATTTGTGAATTGAAGTATTTAGAGGTATTAGACCTGTCAGATAACTTTCTAGTTGGAAAACTTCCTCGATGCTCCAACGGTTCAGAGGCTAAGCAAGAACTTAACATGTCCCCTGATTCTACACAAATGCAACTGTCTGCTTTGATTTTGTACAACAATGACCTGTCAGGCAAATTTCCTGAATTTTTGCAACATAGCCAAGAGTTGACTCTTCTTCACCTCGCCCACAATAAGTTTGTTGGAGAGTTGCCAATATGGATAGCAGAGAAATTACCGCGTTTGTCATATCTTCAATTGCGGTACAATTTGTTCTCTGGCTCTATTCCAGTTCAGCTAACAAAACTTGAAAATCTCCGATATTTGGACCTTGCATATAACAGGATATCAGGAAGTATACCTCCTACCTTAGGAGGTTTAAAAGCAATGATTCAAGGTAATAGTACAAAATATACTAATCCCTTGGTGTGGAATTACTATAGGCCAAGAAATCCAAACGACTTCAATGATGGGTACTACGTAAAATATCATAATAGCCTACTGGTTGTGGTAAAAGGTCAGGAACTTTATTACACCAGTACACTCATATATATGGTTGGTCTTGATTTTTCCTGCAACAATTTAGGAGGAGATATCCCAGAGGAAATAACATCTCTTGTTGGACTGAAGAACTTGAACTTCTCCCATAACCATTTAACAGGAAATATTCCAGAGAAGATTGGTCTCCTGAGATATGTGGAGTCTCTTGACCTATCATTCAACATGATATCAGGCGAAATCCCTTCAAGTCTCTCAGACATGGCTTCACTGAGCTACTTGAACCTGTCATTCAACAATTTGTCTGGAAGAATACCATCAGGGAATCAGCTACAGACACTTGGTGATCCAGATTTCATATACATCGGCAATTACTATCTCTGTGGACCTCCTCTTTCAAGGAATTGTTCTGGACCGGAGAGTGGTTTCACAAATCACAGAGGATTCAAAACAAGAAGGGACAAGGCCAGGCATCTAACGGCTAGAACTCCAGTTCATCCACGATCGTCCTCGATTGTAGCTGCATTCACTTACCTTTTGCTAGTCCTCTTCCGAGACGCCATCACCACCGCAGCTGCATCTCCCAAAGCTCCGGCATCCACCAATGGCTGCATTGCAGCCGAGAGGGATGCCCTGCTCTCGTTCAAGGCTGGCATCACAAGAGACCCCAAGAAACGCCTCAGCTCATGGCTAGGTGAGAATTGCTGCCAGTGGAGCGGTGTGAGGTGTAGCAACAGGACGGGGCATGTTATCATCCTCAACCTCAGCAACACTTACTTATATTATGATGATCCGCATTATTACAAGTGCGCCCATGTTGATTTTCCGCTGTATGGGTACATAAGTTCGTCTTTGATCTTTAGTGGGAACGTCCTTGGAGAAAGTATGCCAGAGTTCTTGGGCTCCTTTCAAAGTTTGACCCATCTCAACCTAGCACGTATGGGTTTTTACGGCAGAGTACCTCATCAGCTTGGTAATCTGTCTAATTTGCAGTTTCTTGACATAACATCTGAATTTTATGACCATCCTCCTATGCACACAGCTGACATCTCATGGTTGGCACGCCTTCCTTCATTGAAGTATCTTGATATGAGTTATGTGAATCTAAGCTCAGTGGTTGATTGGGTCCGTCCAGTGAATATGCTTTCCCGTCTTGAGGTTCTACGCCTTACAGGGTGTTGGATCATGAGTTCATCATCAACAGGACTCACCAATCTGACAAGCCTTGAAACACTTGACCTCTCTGAGAACACTTTGTTTGGCACGGTAATTCCCAACTGGGTGTGGAGCATGAAGACGGTTAAGATGCTTAACCTGGCCTCATGCCAGTTGTCTGGTTCATTTCCTGATGGATTAGGCAACTTAACTTTGTTGGAAGGCCTTAACCTTGGAGGTGATAGCTACCTTGGAAGTAATAGCTTCGAAGGGACGCTGCCATCAACATTAAACAACACTTGCAATCTGAGGGTCCTATACCTCGATAACAATTTGATCGGCGTGGGAATCAAAGATCTGATGGATAAGCTTCCAAGTTGTACTTGGAATAAATTGGAGGAGCTTGATTTGTCTTATAATGACATTACTGGAAACCTGGATTGGCTGGGGAGCCAAACTAGCTTAATAAGCCTTTACCTATCTTGGAACAAATTCAGTGGTCATTTGCCCTTGGTAATCAGAGAAATGACTAATTTGATAACTCTATTTCTAGATAACAATGATATCAGTGGTGTGATCTCGAAGCAGCATCTTTCAGGCCTTTTGAGTTTGGAGGAAATCGATATGTCTTTTAATCCTTTGAAGGTAGTCCTAGACGAAAGTTGGAGCCCTCCTGCTGAATTGTCCAAAGTTTATTTTGCATCTTGCCAACTGGGTCCAGAATTTCCTGTGTGGATCAAGTCGTTGAATAATTGTTACTCAATTGATGTTTCAAGTTCAGGCATAAAAGATGAGCTTCCTAATTGGTTCTGGAATTTAGTTTCTGACGTTACAAACGTAAATATATCTCATAATCGGATCAGAGGGAAGTTACCAGACAGTTTTCAAGGTATGTTAACTAAACAGCTCATTCTAGCTTCGAACCAGCTGACTGGTCGCCTACCCTCGTTACCGGAAGATCTCTATTATTTGGACATTTCCAGAAACCTATTGTCTGGTCCGCTGCCATTTAATTTTGGTGGCGCAAATCTTGATACACTCATTCTCTTTTCCAACCATATCAATGGCAGCATTCCACAGTCCCTTTGCAAGATGCACAATTTGCGTGCCTTGGATTTAGCAGACAATTTTCTGGTAGGAGAACTTCCTCACTGTTTGCCAACAGAATTGAAACCATCGACTGGTGGTAGTTTTATACATTCCACAAGTCTGAACATTCATATCCTTTTACTAAGCAAAAATCAGCTTTCTGGAGAGTTCCCTATGCTACTGCAATCGTGCCAAAGCATCACCATTCTTGATCTAGCATGGAACAAATATTCTGGAAAGTTGCCAGAGTGGATAGGTGAAAAGTTGCCATCCATAGTAATTCTGCGTATCAGGTCTAATAAGTTCTCTGGTCATATCCCAGGTGGTTTTACCAAACTTGATCATCTGCGGTATTTGGATATAGCTAATAATAGTTTTTCTGGTACTATCCCACAATCCCTTCCGTGCTTGAAAGGAATGATCAACGAACCAGAAAATTTAGAAACATGGTTCCTATTTGGAGTGGCACTGGAAAACGGATTCGGAGCTTTCGATGTATTCGGCCTGTTCCATTATAGCATATCATTTGTTCTGCAAGGTCAACAACTTGAATACAGCAAGGGACTTGTGTACTTGGTGGGCCTTGATTTTTCTAGCAACAAATTGTCTGGCCATATTCCAAAGGGGATTGGTTCTCTTGTCGAATTGGTAAATTTGAATCTGTCCTGGAACCAGTTAGCAGGAAACATTCCGGATCAGATTGGTGAGCTGCACCAATTAACCTCCCTTGACCTATCATATAATCAATTTTCTGGAGAAATCCCTTCAAGCCTATCAAATTTGACATTCTTGAGCTATCTGAACTTGTCTTACAACAATTTATCGGGAAGGATTCCTCGGGGACATCAACTGGACACACTCAATGCAGATGATCCATCTTTGATGTACATCGGCAACCCAGGTCTTTGTGGTTATCCCCTTGCAAAGAATTGTCCTGAAAATGGGACATCTCAAGGTCAAACCGTTAAAAGACATCACGATGGTTCGTTCTGTGCTGGTCTCAGTGTGGGGTTTGTGATTGGAGTTTGGATGGTTCTTGCGTCACTTTTGTTCAAGAAGAGTTGGAGGTTTTCTTACTTTCACCACTTTGATAGGCAGTATGACAGATTGAATCAGTGGCCAAAAGATGAATGA

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Protein seq

MGPSSSCCLVLITMITVAMITANSYVHAQRGSGGGGKCIAAERAALLSFKAGITSDPAKLLKSWRGDDCCSWSGVRCSNETGHVVGLDLRAAFFLSNETFVWCFSGVAPNGMLGEISSSLLALKHLKHLDLSGNYLGGVGLPMPSFLGSFKSLTYLNLACMNFDGRLPPQLGNLSRLQHLNLATYQENTMRPGDVSWLQHLGLLRFLDMSGLNLTSNGDWVRLVTGLSYLKVLQLGGCGLSLPHEPTAHSNISSLEILDLSSNRVDTINPAYWFWDVRTIRELQLGRNQITGPFPAAIGNMTSLEVLTLGGNYITGVKSEMMKNFCNLWWLELWSNEINQDMAEFMEGLPRCTKSSLHVLDLSATNITGGIPSWMNHWRNLRSLQLSANKLEGLIPLEIGKMTNLSTLYLDNNQLNGSVSEEHFAGLASLEDIDLSYNSIHITINSDWVPPFSLYQALFARSKMGPHFPLWLKGQSNVYFLDISDAGITDNLPDWFWTVFSNVQYLNISCNQISGTLPATLEFMTSAMTLDLNSNRLTGLLPQLPQYLRTLDISNNSLSGPLPLIFGAPMLTQLVLSINKINGTIPSYICELKYLEVLDLSDNFLVGKLPRCSNGSEAKQELNMSPDSTQMQLSALILYNNDLSGKFPEFLQHSQELTLLHLAHNKFVGELPIWIAEKLPRLSYLQLRYNLFSGSIPVQLTKLENLRYLDLAYNRISGSIPPTLGGLKAMIQGNSTKYTNPLVWNYYRPRNPNDFNDGYYVKYHNSLLVVVKGQELYYTSTLIYMVGLDFSCNNLGGDIPEEITSLVGLKNLNFSHNHLTGNIPEKIGLLRYVESLDLSFNMISGEIPSSLSDMASLSYLNLSFNNLSGRIPSGNQLQTLGDPDFIYIGNYYLCGPPLSRNCSGPESGFTNHRGFKTRRDKARHLTARTPVHPRSSSIVAAFTYLLLVLFRDAITTAAASPKAPASTNGCIAAERDALLSFKAGITRDPKKRLSSWLGENCCQWSGVRCSNRTGHVIILNLSNTYLYYDDPHYYKCAHVDFPLYGYISSSLIFSGNVLGESMPEFLGSFQSLTHLNLARMGFYGRVPHQLGNLSNLQFLDITSEFYDHPPMHTADISWLARLPSLKYLDMSYVNLSSVVDWVRPVNMLSRLEVLRLTGCWIMSSSSTGLTNLTSLETLDLSENTLFGTVIPNWVWSMKTVKMLNLASCQLSGSFPDGLGNLTLLEGLNLGGDSYLGSNSFEGTLPSTLNNTCNLRVLYLDNNLIGVGIKDLMDKLPSCTWNKLEELDLSYNDITGNLDWLGSQTSLISLYLSWNKFSGHLPLVIREMTNLITLFLDNNDISGVISKQHLSGLLSLEEIDMSFNPLKVVLDESWSPPAELSKVYFASCQLGPEFPVWIKSLNNCYSIDVSSSGIKDELPNWFWNLVSDVTNVNISHNRIRGKLPDSFQGMLTKQLILASNQLTGRLPSLPEDLYYLDISRNLLSGPLPFNFGGANLDTLILFSNHINGSIPQSLCKMHNLRALDLADNFLVGELPHCLPTELKPSTGGSFIHSTSLNIHILLLSKNQLSGEFPMLLQSCQSITILDLAWNKYSGKLPEWIGEKLPSIVILRIRSNKFSGHIPGGFTKLDHLRYLDIANNSFSGTIPQSLPCLKGMINEPENLETWFLFGVALENGFGAFDVFGLFHYSISFVLQGQQLEYSKGLVYLVGLDFSSNKLSGHIPKGIGSLVELVNLNLSWNQLAGNIPDQIGELHQLTSLDLSYNQFSGEIPSSLSNLTFLSYLNLSYNNLSGRIPRGHQLDTLNADDPSLMYIGNPGLCGYPLAKNCPENGTSQGQTVKRHHDGSFCAGLSVGFVIGVWMVLASLLFKKSWRFSYFHHFDRQYDRLNQWPKDE

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_01G023710 OsN22_01G023710_02 Chr01 23448511 23451786 + IsoSeq
CDS seq

ATGGTAGATTGCCACCTCAGCTTGGAAACCTCTCCAGATTGCAACATCTCAACCTTGCAACTTACCAAGAAAACACCATGCGTCCTGGTGATGTATCATGGTTACAGCACCTCGGTTTGCTCCGATTTCTCG

Protein seq

MVDCHLSLETSPDCNISTLQLTKKTPCVLVMYHGYSTSVCSDFS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.588999 0.462985 2.210793

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0603800 RBH 0.640083 0.837041 0.999380
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g41930 RBH 0.330381 0.432374 0.217218
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0603800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0024430 RBH 0.793975 0.798093 0.961234
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0024010 RBH 0.087010 0.000000 0.256139
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0024320 RBH 0.000000 0.362509 0.276520
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0023690 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0023440 RBH 2.775532 0.472948 3.969628
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0398000 RBH 0.191121 1.761456 1.7623355
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0023280 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0386600 RBH 0.194691 1.8841515 2.7185955
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0023380 RBH 0.048732 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0023340 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0023590 RBH 0.000000 1.506554 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0023610 RBH 0.082126 0.215587 0.227766
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0023510 RBH 0.042830 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G023750 RBH 0.402195 0.509954 1.096366
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0023420 RBH 0.877057 0.810886 3.737909
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