Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLaMu_02g0002940 OGI:02006740 | 15/16 LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:1996694-2001798
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

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OsLaMu_02g0002940 OsLaMu_02g0002940.02 Chr02 1996694 2001775 + NAM
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OsLaMu_02g0002940 OsLaMu_02g0002940.03 Chr02 1996694 2000331 + NAM
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OsLaMu_02g0002940 OsLaMu_02g0002940.01 Chr02 1996694 2001798 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr02 1997183 1998350 + OsLaMu_02g0002940.04 OsLaMu_02g0002940.02,OsLaMu_02g0002940.03,OsLaMu_02g0002940.01,OsLaMu_02g0002940.04 All
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Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.990987 20.193205 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0137100 RBH 1.742719 2.223786 4.765030
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g04450 RBH 1.127206 1.589719 1.467687
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0137100 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0002890 RBH 1.040461 27.564034 8.607719
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0002970 RBH 0.135236 8.972445 3.443527
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0002910 RBH 4.146942 24.454168 10.384855
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0002880 RBH 0.245900 0.618790 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0002910 RBH 6.941238 16.239717 18.152382
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0002820 RBH 0.717730 1.629428 1.610757
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0034400 RBH 8.9232475 59.2251645 21.780398
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0002890 RBH 0.210006 0.686634 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0002820 RBH 0.428285 14.381923 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0002890 RBH 8.050609 41.849411 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0002980 RBH 1.023833 3.276208 2.312601
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0028310 SBH 0.121252 2.489928 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G002920 RBH 0.907162 4.360154 1.592274
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0002870 RBH 2.039359 66.375038 8.682402
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