Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_02g0002910 OGI:02006740 | 15/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:1941429-1946594
Gene Symbol -
DNA seq

GAACCCTGCGGATTAACAGAGTAAACTGCAACAAACCACGCGACCCCCAAACCTCTCTCTCTCTCTCCTCGCCTCCGCCGTCGCCGTCGCCGTCCTCGACTGCTCCTCCGGTGTGATCCGATCACGCGCGGCCTCTCCGCCTCCCGCTCGCCCTTCTCCGCTTCGCGTGTTGTACTGTTCTCCCGCGGTCCCGCCCGAGCAGAGGTAAGAGGAGGAGGAGGTGGGTGAGAGACCGCGTTTGATCCCTGGGCCGAGGCGGCGCGGGATCGGGTGGGGGCGTGGTTGGAGGTGTTGTTTTTGTTTTTCGGGTGGAATCAGCTTCGTGCCGCGCGATTGATGGTTGTTTCGTGTGTTGTGGCTGTTATTTTTTTTTTTTAGGTTTGGGTTGGCCAGCGAGGGAGGTTGGCTAGGGCAGCGGGCTGATGAGAGAGGCGTCAGGCATGTCCGGGGGAGAAGACGTCCGCAAGGTTTCTCGCCAGGACATACAGCTCGTGAGCACCACAGGAACCCTGATCCCTAACCTTTTCTCTCCCCCTCAATTTTTTTTGAGCCTACCTTGGTTGTGCATGCGCTGTGCTGTTTGTCCCCCTTCTTCACGACGATTTTCAAGTTATACGTTATCATTCAGATGCAAGGAATAACCGAAACGCGTGTTGTCGTAGCTACCATGTTATCATTCAGATGCAAGGAATAACCGAAACGCATGTTGTCATAGCTACCATGCTATCATTCAGATGCAAGGAATAACAGAAACGCATGTTGTCGTAGCTACCATGCTATCATTCAGATGCAAGGAATAACCGAAACGCATGTTGTCGTAGCTACAATGCTATCATTCAGATGCAAGGAATAACCGAAACGCATGTTGTCGTATCTACCATGTTATTAATCAGATGCAAGGAACAACCGAAATGCATGTTGTCGTTGCTACCATGTTGTCATTCAGATCCAAGGAATAACCGAAACGCATGTTGTCGTAGCTACCATGTTTCCTTTATATGTATATTTATTAGTACCTTTTATGCCTTTCATAATTGAATGGATTGACATGGCTGGCGAATGTCTGTGTTGCTTTAATATGCCCTCATTTGGGCTTTTATGTACTAGGGTTAGTTCGTTATTTCAGTATATGCGCGATCCCGTGTTGGACTTTAGTTAAAGATCATGTGCTGGAGTCACTGCAGGACAAGGTTGTCGGAAGGAGAGAGAAAGGAGAGCAAAAGAGTTTGGGGATGAAGGGAAAAGGGGAAAGAAATTTAAGGAAAAACACGTGGCCCAATTTATTATTTGAAGCTGAAAATCTCATAAAGCAGAATTATGATGTCTAACGGCATAATTGAAAATTTGAAACTCTTTATGTGCGTTTCTTTCCTTTTCTTCAAGTCAAATGCTGAATAGGCAACCGCTCTTGCTTCAATATCCAATGCTTAAAAAAGAACTTCTGAAAAAAAATCATTGTAGTGTTCCCTTACCTTTCCTTTTTTAATATGCAAGATATGCTCTCTTTTTTTTGTCGGATGTCCTTTATCATTTCTTGTACTTTCTCATTTATTTTGACTCTGTTAACACTTTTGTGTGAACATATTGGAAACTCTGTAGTTGTACTTCTCTCTGCATACTTGAAGCAATAAGTCCTCATACAAAAATTGTTTTACAGGTCCAGAATCTTATTGAACGATGTCTTCAGCTTTATATGAACCAGAAAGAAGTGGTTGAGACCCTATCATTCCAGGCGAAAATTGAACCTAGTTTTACTGAGCTTGGTAATACCCTTATACAGATTTTCTTTTTCTTGTTGTGCACTGAATGTAGCATAACTATAACTTGGTTGACTTCCCATTGCATATTGACATAGCAATATAGCATTCATGGTGCACCAAGCCTTTGAATTTTTATGAGCCAATGGTTAATATCGGACAGGAATATGTGTGCTTTCTAATACAATTTGGAGGGCATTAATTTCATTCCGTCGTAATTCATAAACAATTGGTTCTCCGATTGCTGTTTTTAATGGTAAAACACAAACACGTTTGCCTCTATTTCTCACTGTTGTTTTTCTCCAGTCTGGCAGAAACTTGAGGAAGAGAATCGTGAGTTCTTTAAAGCATATTATGTGAGACTTATGCTTAAGAATCAAATAATGGTCTTCAACAAGCTCCTTGAGGATCAGTATCGGCTTATGTGTAAAGAGCAGCCTTCTGGAGTACCTTCTATGCCTCCTACTACTAATGGCTCCAACATGGGCACATGTAAGTATATGTTGTTTTTTTTTTCATCAGCTGTCTATACAATGATGTTACCTTGCTTACTGTTCAACAAATCCCTCTAAACTATTTCATTCTAAATTGATGCTAGAGGTTGTTTACCCTCTTATTCGGGTAATATAGCTGTTCCGTCTGTATATATTAAGACAGTAGTAAACTAGTAGAGTGATGTCCGTTTCTTTGTACTAGTGATACAGTATGAAGAATTTATGGGCTTGCCAGTAGTATATCTTGGGATTACCATCGAGTTTAGATGATTTGCAAGTTGCAACTTTGGTAGTTTGGCTCTCCTCAAGATCTAACATTTCCCGCCTTCCAACGAAAATCATAATATCATATTAAGTTGATTTTAGGCCACTTTATGTTTACTAGTTACTACTGTGCTTTTAGAGTTCTCTACTGGCAGTTTTGTTAGATCAGAACAGTATTTGAGAAAGTTTGTTCCCTAGTCCTGAATCCTGATACATAGCTTATTACTAAGTTTGTAATTTTTGTGATGTCCGGACCAAATTTTATTATGTTCTGACATAGTTCACTGTTGACTCTCAGTGAATCAAAATGCATGCTTTTTGCCAGACACTACTCCCAGCACTGCAATGCCAGATAGCTTGCTACCCAATGGAAGTTCCAGCGGTATTGTAAATGGCACTCCATCCAGTGACCAATTTATCTATGCTGGTAAAGTCATTCATGGTCTTCCTAGCAGTATGGATGCTTCATCTAGTCTACTGGCAGCACATAACTCAACTGCTGGGAGGTTTAATGGAGACAATGGAACAACAATCAAGACAGAAGCAAGCTACTCGGGCAACTCTGATTTTGGTTTCTGCAATGAGAGCGCTTTCCTAGAACCTTGCCAGTCAATTGGGGATGCCTCTGGTGGATCCTTCAGCAGCTCTGAGCTGAATGGACAGCCACTAGGTGATCCAATTATGGACATGGATTCATCATCTTTTGGTTTCTTGAGCCAAATTCCTCGGAATTTCAGTTTTTCAGATTTAACTGAAGACTTTAGCCAAAGTGCAGGTATTATTTTCTGTGATATTACCTTTTTTTTTTTTAGTTTTCCTTTTCTTCAGCATTGCTGTTTGCTGTGTAATGTATACATACACCTTTTATTTTGGGTTGTCTGCAGAAATATTGGAGAATTATGGCAGATCCCCTTTTATCCCTTCTGAACCAAATAATTTCTCAGAGTCTACTCCTGGAGACCATGCAGGTTAATTATCCCCTTCCCTCCAGTTTTCTGTTTCGTTCTTATCCACCACCACAGTACACCCCACCCCCACAACATGTAAGGCAAGCTAGACAAGGAAATATTGACTTGAACATACGGCACTGAGGCATTGATGTAACGCTCAATCTAGCTAATGTTTCTCTTGCTATTGTCAGAAATAGGAAATAGACGGCTAGATACCATATCCGAGGGTGTTAGTTATGAAGATTTTGGAAGCGATTAATCAGATATTGATGGTACTGCTTAAGGTAATCAAACTTTAGGCAAAATCACAACTAGACACATTTCCCCTTTTCTTCCATTTAATTTTCTGGTCTTGCATTGGATTGGATTGTGGGGGTTTGTGGCGGAAAATTAACTCTCTAAGTATTCCCGTGTTGATTGGTATGCATATGGCACTTCCATATTTAAGCGGTAATTTGTGGAATGTCTTCACATGGCTGTATGAGAACATTCTGCAGAAGTCTGCCTTGGTGGGATTCTGTCTTTCAGGCCCTTGAGTTTACCTGTTGTTTATCCTAAGCACAACAAAAAATGGGTCGAAGTTATTGCATCATGAGACAGTTGATTTGTGACAGCTAATAAACAGTGTTTATCGAACACTGTTCTTGCACCTTAGACATTTTGTCCACCGTGAGCTTCCTATTCCTCATGTGATGCTGAAGAAGATTGTAGCTGGATGTTAGTCCAATACTCCATCCTTAGGCACTCAACTAGGCATCAGCATGCATACTCTACTGTTACATGGGCTCGGTAGTTACTAGTTGCATTATTTTTCAACTTAAGAGCTAGTCTGAGCATGAAAAACTAAACAGAGAAGTACATAAATGGAACGGCCAGCTGAATAAAGAAAATTCATCTGATGTATTATCCTTTAGGTTGCCACAATACACTAACTTTAGATGGCACAAGGATTATTTAATTTAAAAACCTGATGATGGTGCCATCAGCCTGTGAATATGGTGGTGGTGTGTGGCAAGGGGATGAAGATGGGGGGTTTGCTTAGAGCATGCCCTCTCTTTTTCTATTCTTGAATAGCAAAATAGGGTGTTATCTATATGCTACTGGTTTAACTCTTCTAACTTGATTCATCGATCTCTATGTATGTGCAGGTTGAGCAGTGATGCATAACTTTGTACATAGTAGTTTGGGCAAGTGAGTCTATATTCGTGGCCATGGAACTCAGCTAATTTCATGGAAACTATTGCTTCGTCAGTTTTAGGTCTTGTTCTGTTGGACTACCAGCTTCGGTGACTTGTGTGAGAATATTTCATGGCCTAATAATGTGTCGCATTGACTGATGCAAGAAACCTATTGTCCCTGTGTCATTGCTGAAGATATTGTAGAAGTTAGCGTTAATGGTGACTGGAAGCTTTACATTGACATTTCGTGCTGTTGCACTTGATGTGTAGTTTGTACATGATGCTTAGTTAACATTTTCCCTCTGTTGCACTTGCTGCGGTTGGCCATGTCGCGCTCTGCACTCTTCGGTTGTTCAG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CDS seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_02g0002910 OsCMeo_02g0002910.01 Chr02 1941429 1946594 + NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_02g0002910 OsCMeo_02g0002910.03 Chr02 1941436 1946591 + NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_02g0002910 OsCMeo_02g0002910.02 Chr02 1941429 1945067 + NAM
CDS seq

ATGAGAGAGGCGTCAGGCATGTCCGGGGGAGAAGACGTCCGCAAGGTTTCTCGCCAGGACATACAGCTCGTCCAGAATCTTATTGAACGATGTCTTCAGCTTTATATGAACCAGAAAGAAGTGGTTGAGACCCTATCATTCCAGGCGAAAATTGAACCTAGTTTTACTGAGCTTGTCTGGCAGAAACTTGAGGAAGAGAATCGTGAGTTCTTTAAAGCATATTATGTGAGACTTATGCTTAAGAATCAAATAATGGTCTTCAACAAGCTCCTTGAGGATCAGTATCGGCTTATGTGTAAAGAGCAGCCTTCTGGAGTACCTTCTATGCCTCCTACTACTAATGGCTCCAACATGGGCACATTGAATCAAAATGCATGCTTTTTGCCAGACACTACTCCCAGCACTGCAATGCCAGATAGCTTGCTACCCAATGGAAGTTCCAGCGGTATTGTAAATGGCACTCCATCCAGTGACCAATTTATCTATGCTGGTAAAGTCATTCATGGTCTTCCTAGCAGTATGGATGCTTCATCTAGTCTACTGGCAGCACATAACTCAACTGCTGGGAGGTTTAATGGAGACAATGGAACAACAATCAAGACAGAAGCAAGCTACTCGGGCAACTCTGATTTTGGTTTCTGCAATGAGAGCGCTTTCCTAGAACCTTGCCAGTCAATTGGGGATGCCTCTGGTGGATCCTTCAGCAGCTCTGAGCTGAATGGACAGCCACTAGGTGATCCAATTATGGACATGGATTCATCATCTTTTGGTTTCTTGAGCCAAATTCCTCGGAATTTCAGTTTTTCAGATTTAACTGAAGACTTTAGCCAAAGTGCAGAAATATTGGAGAATTATGGCAGATCCCCTTTTATCCCTTCTGAACCAAATAATTTCTCAGAGTCTACTCCTGGAGACCATGCAGGTTAA

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Protein seq

MREASGMSGGEDVRKVSRQDIQLVQNLIERCLQLYMNQKEVVETLSFQAKIEPSFTELVWQKLEEENREFFKAYYVRLMLKNQIMVFNKLLEDQYRLMCKEQPSGVPSMPPTTNGSNMGTLNQNACFLPDTTPSTAMPDSLLPNGSSSGIVNGTPSSDQFIYAGKVIHGLPSSMDASSSLLAAHNSTAGRFNGDNGTTIKTEASYSGNSDFGFCNESAFLEPCQSIGDASGGSFSSSELNGQPLGDPIMDMDSSSFGFLSQIPRNFSFSDLTEDFSQSAEILENYGRSPFIPSEPNNFSESTPGDHAG

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_02g0002910 OsCMeo_02g0002910.04 Chr02 1941436 1946466 + IsoSeq
CDS seq

ATGGCACTCCATCCAGTGACCAATTTATCTATGCTGGTAAAGTCATTCATGGTCTTCCTAGCAGTATGGATGCTTCATCTAGTCTACTGGCAGCACATAACTCAACTGCTGGGAGGTTTAATGGAGACAATGGAACAACAATCAAGACAGAAGCAAGCTACTCGGGCAACTCTGATTTTGGTTTCTGCAATGAGAGCGCTT

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Protein seq

MALHPVTNLSMLVKSFMVFLAVWMLHLVYWQHITQLLGGLMETMEQQSRQKQATRATLILVSAMRAL

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
SE Chr02 1944911 1946042 + OsCMeo_02g0002910.01,OsCMeo_02g0002910.04 OsCMeo_02g0002910.03,OsCMeo_02g0002910.01,OsCMeo_02g0002910.04 All
A5 Chr02 1941632 1941807 + OsCMeo_02g0002910.04 OsCMeo_02g0002910.03,OsCMeo_02g0002910.02,OsCMeo_02g0002910.01,OsCMeo_02g0002910.04 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 4.146942 24.454168 10.384855

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0137100 RBH 1.742719 2.223786 4.765030
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g04450 RBH 1.127206 1.589719 1.467687
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0137100 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0002890 RBH 1.040461 27.564034 8.607719
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0002970 RBH 0.135236 8.972445 3.443527
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0028400 RBH 1.196730 3.488731 9.460806
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0002880 RBH 0.245900 0.618790 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0002910 RBH 6.941238 16.239717 18.152382
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0002820 RBH 0.717730 1.629428 1.610757
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0034400 RBH 8.9232475 59.2251645 21.780398
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0002890 RBH 0.210006 0.686634 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0002820 RBH 0.428285 14.381923 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0002890 RBH 8.050609 41.849411 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0002980 RBH 1.023833 3.276208 2.312601
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0002940 RBH 0.990987 20.193205 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G002920 RBH 0.907162 4.360154 1.592274
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0002870 RBH 2.039359 66.375038 8.682402
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