Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsKeNa_02g0004260 | OGI:02001240 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:2968825-2991527 | ||||||||
| Gene Symbol | LRK8, OsLRK8, OsPSKR1, PSKR1, LRK7, OsLRK7, OsPSKR3, PSKR3, LRK6, OsLRK6, OsPSKR4, PSKR4, LRK5, OsLRK5, OsPSKR5, PSKR5, LRK4, OsLRK4, OsPSKR6, PSKR6, LRK3, OsLRK3, OsPSKR7, PSKR7, LRK2, OsLRK2, OsPSKR8, PSKR8, LRK1, OsLRK1, OsPSKR9, PSKR9, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MQPPHSSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKNGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRPDRTVTDVSLASRRLEGHISPYLGNLTGLLQLNLSHNQLSGALPAELVFSSSLIIIDVSFNRLNGGLNELPSSTPVRPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWEVMKNLVALNASNNSFTGQIPTNLCTNSPSLAVLELSYNQLSGSIPSELGNCPMLRVLKAGHNNLSGTLPNELFNATSLECLSFPNNGLEGNIDSTSVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDSIGQLSRLQELHLDHNNMHGELPSALGNCKYLTTIDLRGNNFSGDLGKFNFSTLLNLKTLDIGINNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFHGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLLIAHNFLEEVIPQDETIDGFKNLQVLTVGQCSLSGRIPLWLSKLTNIELLDLSNNQLTGPIPDWIDSLNHLFFLDISNNSLTGEIPITLMGMPMIRTAQNKTYLDPSFFELPVYVDKSLQYRILTAFPTVLNLSQNNFMGVIPPQIGQLKMLVVLDFSYNNLSGKIPESICSLTSLQVLDLSNNHLTGSIPGELNSLNFLSAFNVSNNDLEGPIPTGAQFNTFPNSSFDGNPKLCGSMLIHKCKSAEESSGSKKQLNKKVVVAIVFGVFLGGTVIVLLLGHFLSSLRAAIPKTENKSNSSGDLEASSFNSDPVHLLVMIPQGNTEANKLTFTDLVEATNNFHKENIIGCGGYGLVYKAELPSGSKLAIKKLNGEMCLMEREFAAEVEALSMAQHANLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNREDETSSFLDWPTLVLLELLTGRRPVSILSTSKELVPWVLEMRSKGNLLEVLDPTLHGTGYEEQMLKVLEVACKCVNCNPCMRPTIREEKGSLHQFLTELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQIPDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSKAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIKVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQLLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGEIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLHGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSVSQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFGGNPKLCLSRFNHQCSSAEASSVSRKEQNKKIVLAISFGVFFGGICILLLVGFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKNMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDGIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLNNNNFSGELIYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLHGQLSKGLGNLKSLSFLSLAGNCLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDSFENLQVLSLSECSLSGKIPRWLSKLSRLEVLELDNNRLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNSLTGEIPMSLLQMPMLRSDRAAAQLDRRAFQLPIYISASLLQYRKASAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGLLKVLLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGTSTILDWPRRLKIAKGASHGLSYIHNICKPRIVHRDIKSSNILLDKEFKAYIADFGLSRLILPNKTHVTTELVGTLGYIPPEYGQAW |
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| Function | Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C7S5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsKeNa_02g0004260 | OsKeNa_02g0004260.01 | Chr02 | 2968825 | 2991527 | - | NAM | ||
| CDS seq | 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| Protein seq | MQPPHSSYKTQSNRLPIPVLSLALVLLLNFTSPTSSCTEQEKNSLLNFLTGLSKNGGLSMSWKDGVDCCEWEGITCRPDRTVTDVSLASRRLEGHISPYLGNLTGLLQLNLSHNQLSGALPAELVFSSSLIIIDVSFNRLNGGLNELPSSTPVRPLQVLNISSNLLAGQFPSSTWEVMKNLVALNASNNSFTGQIPTNLCTNSPSLAVLELSYNQLSGSIPSELGNCPMLRVLKAGHNNLSGTLPNELFNATSLECLSFPNNGLEGNIDSTSVVKLSNVVVLDLGGNNFSGMIPDSIGQLSRLQELHLDHNNMHGELPSALGNCKYLTTIDLRGNNFSGDLGKFNFSTLLNLKTLDIGINNFSGKVPESIYSCSNLIALRLSYNNFHGELSSEIGKLKYLSFLSLSNNSFTNITRALQILKSSTNLTTLLIAHNFLEEVIPQDETIDGFKNLQVLTVGQCSLSGRIPLWLSKLTNIELLDLSNNQLTGPIPDWIDSLNHLFFLDISNNSLTGEIPITLMGMPMIRTAQNKTYLDPSFFELPVYVDKSLQYRILTAFPTVLNLSQNNFMGVIPPQIGQLKMLVVLDFSYNNLSGKIPESICSLTSLQVLDLSNNHLTGSIPGELNSLNFLSAFNVSNNDLEGPIPTGAQFNTFPNSSFDGNPKLCGSMLIHKCKSAEESSGSKKQLNKKVVVAIVFGVFLGGTVIVLLLGHFLSSLRAAIPKTENKSNSSGDLEASSFNSDPVHLLVMIPQGNTEANKLTFTDLVEATNNFHKENIIGCGGYGLVYKAELPSGSKLAIKKLNGEMCLMEREFAAEVEALSMAQHANLVPLWGYCIQGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNREDETSSFLDWPTLVLLELLTGRRPVSILSTSKELVPWVLEMRSKGNLLEVLDPTLHGTGYEEQMLKVLEVACKCVNCNPCMRPTIREEKGSLHQFLTELSQDGNLSMSWRNDRNCCVWEGITCNRNGAVTDISLQSKGLEGHISPSLGNLTSLLRLNLSHNSLSGYLPWELVSSSSISVLDVSFNRLRGELQDPLSPMTAVRPLQVLNISSNSFTGQFPSTTWKAMKNLVALNASNNRFTGQIPDHFCSSSPSLMVLDLCYNLFSGGIPPGIGACSRLNVLKVGQNNLSGTLPDELFNATSLEHLSVPNNGLNGTLDSAHIMKLSNLVTLDLGGNNFNGRIPESIGELKKLEELLLGHNNMYGEVPSTLSNCTNLKTIDIKSNSFSGELSKINFSTLPNLQTLDLLLNNFNGTIPQNIYSCSNLIALRMSSNKFHGQLPKGIGNLKSLSFLSISNNSLTNITDTLQILKNSRSLSTLLMGVNFNGELMPEDETIDGFENLQFVSIDDCSLIGNIPFWLSKLTNLQMLDLSNNQLTGQIPAWINRLNFLFYLDISNNSLTGGIPTALMEIPRLISANSTPYFDPGILQLPIYTGPSLEYRGFRAFPATLNLARNHLMGAIPQEIGQLKMLRTLNISFNSISGEIPQPLCNLTDLQVLDLSNNHLIGTIPSALNNLHFLSKLNVSNNDLEGSIPTGGQFSTFQNSSFVGNSKLCGSNIFRSCDSSKAPSVSRKQHKKKVILAITLSVSVGGIIILLSLSSLLVSLRATKLMRKGELANNRNEETASFNPNSDHSLMVMPQGKGDNNKLTFADIMKTTNNFDKENIIGCGGYGLVYKAELPDGSKLAIKKLNSEMCLMEREFTAEIEALTMAQHDNLVPLWGDIYSFGVVLLELLTGRRPVPLLSTSKELVPWVQEMRSVGKQIKVLDPTVRGMGYDEQMLKVLETACKCVNYNPLMRPTIMEKTMQLLHYKKHSNKFPIPVLALALVLLINLASLTSSCTEQDRSSLLKFLRELSQDGGLSASWQDGTDCCKWDGIACSQDGTVTDVSLASRSLQGNISPSLGNLTGLLRLNLSHNMLSGALPQELVSSSSIIVVDVSFNRLNGGLNELPSSTPIRPLQVLNISSNLFTGQFPSSIWDVMKNLVALNVSSNKFTGEIPTRFCDSSSNLSVLELCYNQFSGSIPSGLGNCSMLKVLKAGHNKLSGTLPGELFNDVSLEYLSFPNNNLHGEIDGTQIAKLRNLVTLDLGGNQFIGKIPDSVSQLKRLEELHLDSNMMSGELPGTLGSCTNLSIIDLKHNNFSGDLGKVNFSALHNLKTLDLYFNNFTGTIPESIYSCSNLTALRLSGNHFHGELSPGIINLKYLSFFSLDDNKLTNITKALQILKSCSTITTLLIGHNFRGEVMPQDESIDGFGNLQVLDINSCLLSGKIPLWLSRLTNLEMLLLNGNQLTGPIPRWIDSLNHLFYIDVSDNRLTEEIPITLMNLPMLRSTSDIAHLDPGAFELPVYNGPSFQYRTLTGFPTLLNLSHNNFIGVISPMIGQLEVLVVLDFSFNNLSGQIPQSICNLTSLQVLHLSNNHLTGEIPPGLSNLNFLSAFNISNNDLEGPIPTGGQFDTFPNSSFGGNPKLCLSRFNHQCSSAEASSVSRKEQNKKIVLAISFGVFFGGICILLLVGFGVVLLELLTGRRPVPILSTSEELVPWVHKMRSEGKQIEVLDPTLRGTGCEEQMLKVLETACKCVDCNPLKRPTIMEVVTCLDKQDRSSLLRFLRELSQDGGLAASWQNGTDCCKWDGITCSQDSTVTDVSLASRSLQGHISPSLGNLPGLLRLNLSHNLLSGALPKELLSSSSLIAIDVSFNRLDGDLDELPSSTPARPLQFPSSTWAVMKNMVALNVSNNSFSGHIPANFCTNSPYLSVLELSYNQFSGSIPPGFGSCSSLRVLKAGHNNLSGTLPDGIFNATSLECLSFPNNDFQGTLEWANVVKLSKLATLDLGENNFSGNISESIGQLNRLEELHLNNNKMFGSIPSNLSNCTSLKIIDLNNNNFSGELIYVNFSNLPNLKTLDLMRNNFSGEIPESIYTCSNLTALRVSSNKLHGQLSKGLGNLKSLSFLSLAGNCLTNITNALQILSSSSNLTTLLIGHNFMNERMPDGSIDSFENLQVLSLSECSLSGKIPRWLSKLSRLEVLELDNNRLTGPIPDWISSLNFLFYLDISNNSLTGEIPMSLLQMPMLRSDRAAAQLDRRAFQLPIYISASLLQYRKASAFPKVLNLGKNEFTGLIPPEIGLLKVLLSLNLSFNKLYGDIPQSICNLTDLLVLDLSSNNLTGTIPAALNNLNFLSEFNISYNDLEGPIPTGGQLDTFTNSSFYGNPKLCGPMLVRHCSSADGHLISKKQQNKKVILAIVFGVFFGAIGISFGRSGGNSRLLIYSYMENGSLDDWLHNKDDGTSTILDWPRRLKIAKGASHGLSYIHNICKPRIVHRDIKSSNILLDKEFKAYIADFGLSRLILPNKTHVTTELVGTLGYIPPEYGQAW
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| CDS seq | tgctcttcattgattagtcctatccagtcaggaacaaagctcagcatcaggtttttcatgttagtttcaccagaaaaccatgcagctacttcattacaagaaacacaGCAacaaatttcccatacctgttcttgcccttgccctggtgctgctcatcaacctcgcctctctcaccagttcatgtacagagcaggacaggagctccctcctcaagttcctcagggagctctctcaggatggaggcctctctgcatcatggcaggacggcacagattgctgcaaatgggacgggatcgcctgcagccaagatgggacagt
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|
|||||||
| Protein seq | CSSLISPIQSGTKLSIRFFMLVSPENHAATSLQETQQQISHTCSCPCPGAAHQPRLSHQFMYRAGQELPPQVPQGALSGWRPLCIMAGRHRLLQMGRDRLQPRWDS |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.069201 | 0.845967 | 0.776244 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0155600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06240 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0155600 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004270 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.509504 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0027040 | RBH | 0.624004 | 4.118770 | 0.942979 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004290 | RBH | 0.0 | 1.360732 | 0.431390 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004310 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0018590 | RBH | 0.660883 | 0.000000 | 2.376410 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0052100 | RBH | 1.692904 | 1.7057825 | 0.3595345 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004230 | RBH | 0.101042 | 0.0 | 0.119829 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0054700 | RBH | 1.783247 | 2.5954695 | 5.951546 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0004730 | RBH | 0.038568 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0018560 | RBH | 0.236361 | 4.223491 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004370 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004320 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.227547 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004290 | RBH | 0.032945 | 0.534010 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004120 | RBH | 0.060698 | 0.000000 | 0.206064 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.650414 |
