Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsIR64_04g0007170 | OGI:04045230 | 16/16 | IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:13214066-13227100 | ||||||||
Gene Symbol | SDRLK-24, RLCK139, OsRLCK139 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RWZ5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsIR64_04g0007170 | OsIR64_04g0007170.01 | Chr04 | 13214066 | 13227100 | - | NAM | ||
CDS seq | ATGGAAGAACGGAATGCAAATGCCGTGGCATGCTTAATTACGAAGCTTCATATTACCATCCCGGTGTCTACTCTGAAAATGCTTGAATTTCTAAAATTAATGATATCAGCATGTGCTTTTCCCCATGATACGGCAGAAGGAAACTTGTTCACCAGAATCCATGGTAATCAAAGTTACATGGGAATGCCTGTAAAGCCAATTGTTGTCACTTTAGGATTAGAAGTGGTCAAGCCAATCGATCTTCAAAAGAAATTGAAAGCACCGAGTGGTATGCCCTATGACTATCCTATGGCTAACCTCTCGACACGATGGGTCAACAATGCTGCCATGCTCAAGCACAACTCCTACTCCGACGGGTCAGCAGTACGTGCCATTGTCCTCCGTTCACAAAAACAATTGCCTGGCATCTCCTTCGCTGCAGGGTTCTTCTGCGCCCCACCCTGCCAAGCATTCCTCTTCGCGGTCTTCATCCTATACTATACATATTTGGTGGATACAAACAAGAGCAGAAAAGATCCGACGAGAGTTACCTTTACGAATGGAAGCCTCAGCATCTTTCTACAGTCGACACAGGCAGGAAAGCCAGAAGCCATTATTGCACTGCCAGAAGCGAAGTCCACCCAGTACATAAGATTAGAGTACGATGGACATTTGAGGCTGTATGAGTGGTCCGATGAAAAGTGGACCATGGTATCTGATGTTATCAAGAAATACCCTGATGATTGTGCTTTCCCAACAGTCCAAACTATTGCAAATGCGAAAAACAGAGAGGATTGCAAGCAAGCTTGCTTGAAGAATTGCTCCTGCAGGGCTGTAATGTTCAGTAAGAAGCTCGGCGAAGGTGGATTTGGATCGGTCTTTGAAGGGAAAATAAGTGAAGAGAGAGTTGCAGTGAAATGTCTGGAAAGTGCTAGACAAGGAAACAAAGAATTCTTGGCAGAGGTCGAAACTATTGGCAGCATTGAACACATCAATCTTGTTAGGCTGATTGGATTTTGTGTAGAGAAGTCAAACCGGATCCTAGTATATGAATACATGCCAAGAGGGTCACTTGATAAGTGGATATATTACCGCCACAATAATACCCCCCTTGATTGGAACACAAGGTGTAGGATCATTCTGGATATTGCCAAGGGTTTATGTTATCTTCACGAGGAATGCAGACGAAAAATTGCTCATTTGGATATCAAACCACAGAATATTCTCTTAGATGAGAACTTCAATGCCAAATTGGCAGACTTTGGACTTTCAAAGCTAATGGATAGGGATCAAAGCAAGGTAATGACTGTGATGAGAGGCACACCAGGATATCTGGCACCTGAATGGTTAACATCACAAATCACTGAAAAAGTTGATGTCTACAGCTTTGGCGTTGTTCTTATGGAAATAATAAGTGGAAGAAAAAATATTGATTTCTCTCAGCCAGAGGAGAGTGTTCAGCTCATTAAGTTATTATGCGAAAAGGCTCAAAATAATCAGTTGATTGATATGGTCGATAAGCATAGTAATGACATGATCTCGCGCCAGGAGGAAGTGATTCAAATGATGAAGCTCGCAATGTGGTGCTTGCAGAATGATAGCTGCCAAAGGCCTTCTATGTCAATGGTTGTGAAGTCATGTCTCCTCAAGGCAATCCATCGATATATTCAGCTCCACCTCCTGCATCAGTATTATCTGCGCTCCGACTATCCCATGGCCAACCTCTCGACACTGTGGGTCAACAATAGAAACAGGCTCCCTGACAGCATCACATACGACGACGGGTCTATGGTACGCAGCATACTCCTCTTGTCACCACAAACCTTTTATGGCCCCTCCTTCGTCGCAGGGTTCTTCTGCACCCCACCCTGCCGAGAATTCGTCTTCGCTGTCTTCATTGTCTTCACCAGCAGCGGTGCTTTGTTCCCTGTAGCGGTAAACGAGGTTATCTGGTGTGCCAACAGGGGAAGCCCCGTAGGAGAGGATGCTACCCTTGAGCTGACTGGAGATGGTGACCTCGTCCTCCGTGAAAACGCCAATGGCAGACTCGTCTGGTCGAGCGGCACTTCAGGCCGATCCGTGCAAGGCATGGAGATCACTGAGAATGGCAACCTGGTGCTGTTTGATCAGAGGAATGGAACATTGTGGCAGTCATTTGATCATCCAACAGACGCATTGGTCCCAGGGCAGTCACTGCTGCAGGGCATGATGCTCAGAGCAAATACCTCCCCCACAAACTGGACTGAGAGTAAGATATATATAACTATTCTCCAAGATGGTGTATATGGCTATGTTGAATCCACACCACCACAACTCTACTATAACTATGTAGTGAGCACAAACAAGAGCAAGACAGTTCCAACAACGGTTACCTTCACAAATGGCTGCCTCAGCATCTTTGTGCAGTCCACACAACCAGGAAATCCAGATGGCCGTATCGCATTGCCAGAAGCTAAGTCCACCCAGTACATAAGGTTAGAGCCTGACGGGCACTTGAGGTTGTACGAGTGGTCTAGTGAAGAGAACTGGACCGTCGTGTCTGATGTAACCAAGCTATCCCTTGATGATTGTGATTTCCCAAAAGTCCAACCCATTGCGAATCCAACAAACAAAGATGATTGCAAGCAAGCATGCTTGAAGAATTGCTCCTGCAGGGCTGTAATGTTCATTAAAAAGCTAGGTGAAGGTGGGTTTGGATCGGTCTATGAAGGGAAAATTAGCGAAGAGAAAGTTGCAGTGAAACGGCTGGAAAGTGCTAGACAAGGAAAGAAAGAATTTTTGGCAGAGGTCGAGACTATTGGCAGCATTGAGCACATCAATCTTGTCAGACTGATCGGATTTTGTGCAGAGAAGTCAAATAGGCTTCTAGTATATGAATATATGTCAAGAGGATCACTTGATAGGTGGATATATTACCACCATAACAATGCGCCTCTTGATTGGAGCACGAGGTGTAGGATAATTCTCGATATTGCCAAGGGTTTATGTTATCTTCATGAGGAATGCAGGCGAAAAATTGCTCATTTGGATATCAAACCACAGAATATTCTATTAGATGATAACTTCAATGCGAAATTGGCAGATTTTGGACTTTCTAAGCTAATAGATAGAGATCAAAGCAAGGTAATGACTGTGATGAGAGGCACACCTGGATATCTGGCACCTGAATGGTTAACATCACAAATCACTGAAAAAGTTGATGTCTACAGTTTTGGCGTTGTTCTTATGGAAATAATTAGTGGAAGAAAAAATATTGATATCTCTCAGCCAGAGGAAGCTGTTCAGCTGATCAATTTATTACGAGAAAAGGCTCAGAACAATCAGTTGATTGATATGATTGACAAGCACAGTAATGACATGGTCTCACACCAGGAGGAAGTTATTCAAATGATGAAGCTTGCAATGTGGTGCTTGCAAAATGATAGTGACCGAAGGCCTCCTATGTCAATGGTTGTCAAGGTATTCCATCCACATATTCAGCCCCACCTCGTGCATCAATATTATCTAGTCCAAGATGAAATCAGTGGCGGAGCCACCACCAGCCTAGCCCGGGTAGCCGCCCAGGCTCACCGGCGAAAACTCCATTAA
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Protein seq | MEERNANAVACLITKLHITIPVSTLKMLEFLKLMISACAFPHDTAEGNLFTRIHGNQSYMGMPVKPIVVTLGLEVVKPIDLQKKLKAPSGMPYDYPMANLSTRWVNNAAMLKHNSYSDGSAVRAIVLRSQKQLPGISFAAGFFCAPPCQAFLFAVFILYYTYLVDTNKSRKDPTRVTFTNGSLSIFLQSTQAGKPEAIIALPEAKSTQYIRLEYDGHLRLYEWSDEKWTMVSDVIKKYPDDCAFPTVQTIANAKNREDCKQACLKNCSCRAVMFSKKLGEGGFGSVFEGKISEERVAVKCLESARQGNKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGFCVEKSNRILVYEYMPRGSLDKWIYYRHNNTPLDWNTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDENFNAKLADFGLSKLMDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDFSQPEESVQLIKLLCEKAQNNQLIDMVDKHSNDMISRQEEVIQMMKLAMWCLQNDSCQRPSMSMVVKSCLLKAIHRYIQLHLLHQYYLRSDYPMANLSTLWVNNRNRLPDSITYDDGSMVRSILLLSPQTFYGPSFVAGFFCTPPCREFVFAVFIVFTSSGALFPVAVNEVIWCANRGSPVGEDATLELTGDGDLVLRENANGRLVWSSGTSGRSVQGMEITENGNLVLFDQRNGTLWQSFDHPTDALVPGQSLLQGMMLRANTSPTNWTESKIYITILQDGVYGYVESTPPQLYYNYVVSTNKSKTVPTTVTFTNGCLSIFVQSTQPGNPDGRIALPEAKSTQYIRLEPDGHLRLYEWSSEENWTVVSDVTKLSLDDCDFPKVQPIANPTNKDDCKQACLKNCSCRAVMFIKKLGEGGFGSVYEGKISEEKVAVKRLESARQGKKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGFCAEKSNRLLVYEYMSRGSLDRWIYYHHNNAPLDWSTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDDNFNAKLADFGLSKLIDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDISQPEEAVQLINLLREKAQNNQLIDMIDKHSNDMVSHQEEVIQMMKLAMWCLQNDSDRRPPMSMVVKVFHPHIQPHLVHQYYLVQDEISGGATTSLARVAAQAHRRKLH
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 0.044669 | 0.016819 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0303100 | RBH | 0.584076 | 0.886576 | 0.475064 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g23620 | RBH | 0.422020 | 0.070518 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0303100 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0007130 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.599005 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0007760 | RBH | 0.057529 | 0.0 | 0.204230 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0007510 | SBH | 0.062728 | 0.340377 | 0.757392 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0007220 | RBH | 0.000000 | 0.027271 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0007420 | RBH | 0.293478 | 0.000000 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0221300 | RBH | 0 | 0.0722155 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0007250 | RBH | 0.025579 | 0.163254 | 0.046080 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0219200 | RBH | 0.3666105 | 2.696672 | 3.212302 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0006950 | RBH | 0.019502 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0007230 | SBH | 0.018599 | 0.304985 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0007310 | RBH | 0.000000 | 4.545903 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0007150 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0007480 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G007160 | RBH | 0.022435 | 0.000000 | 0.000000 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0007240 | RBH | 0.099133 | 0.821855 | 0.000000 |