Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsKeNa_04g0007760 | OGI:04045230 | 16/16 | KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:12108310-12127240 | ||||||||
Gene Symbol | SDRLK-24, RLCK139, OsRLCK139 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MCPANLLSFDIVAAAVVVVLMLATAAPAISVQQLYDYPTANLSTRWVNNAAVLQHSVDFTDGSAVRSIILRSPETIFGPSFAAGFFCAPPCKAFLFAIFIVYTDGGASITSVRNGIPQVVWSANRAHPVGENATLELTGDGILVLREADGRLVWSSGTSGRSVVGMQITEQGNLVLFDQRNVTVWQSFDHPTDALVPGQSLLQGMRLRANTSNTNWTESKLYMTVLSDGLYGYVESTPPQLYYEQTTNKRGKYPTRVTFMNGSLSIFIRTTQAGKPEAIIALPEAKSTQYIRLESDGHLRLYEWFDAGSNWTMVSDVIQKFPDDCAFPTVCGDYGICTSGQCICPLQANSSSSYFHPVDERKANLGCAPVTPISCQEMQYHQFLSLTDVSYFDEGQIIANAKNRDDCKEACLKNCSCRAVMFRYYGQNDSDGECQSVTEVFSLQSIQPEIVHYNSSAYLKVQLTPSSAAPTQNSSSAPTQTSSFALTQNKSNKMKAILGSTLAASITLVLVAIIVVYVRRRRKYQETDEELDFDILPGMPLRLSLEKLRECTEDFSKKIGEGGFGSVFEGKLSEERVAVKRLESARQGKKEFLAEVETIGSIEHINLVRMIGFCAEKSNRLLVYEYMPGGSLDKWIYYRHNNAPLDWSTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIVHLDIKPQNILLDENFNAKLADFGLSKLIDRDHSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDISQPEEAVQLINLLREKAQNNQLIDMIDKHSSDMVSYQEEVIQMMKLAMWCLQNDSGRRPSMSTVVKVLEGVMRVENCLDYSFFNANSVISVQGNPSTYSAPPHASILSKRNANAVACLIMKLHITIPVSTLKMLELLKLMISACAFPHDTAEGNLFTRIHGNQSYMGMPVKPIVVTLGLEVVKPINLQKKLKAPSVLLLLATAAPFVSGQPYDYPMANLSTRWVNNAAMLKHNSYTDGSAVRAIVLRSQKQLPGISFAAGFFCAPPCQSFLFAVFILYYTYLVDTNKSRKDPTRVTFTNGSLNIFLQSTQAGKPEAIIALPEAKSIQYIRLEYDGHLRLYEWSDEKWTMVSDVIKKYPDDCAFPTVCGEYGICAGGQCICPLQTNTSSGYFHPVDERKANLGCAPMNPISLQLTASSSAPKQTSLSAPTQKKSYKIKTILGSTVAAIITLVLVVIVGIYKLGEGGFGSVFEGKISEERVAVKCLESARQGNKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGFCVEKSNRILVYEYMPRGSLDKWIYYRHNNTPLDWNTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDENFNAKLADFGLSKLMDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDFSQPEESVQLIKLLCEKAQNNQLIDMVDKHSNDMISRQEEVIQMMKLAMWCLQNDSCQRPSMSMVVKVLEGAMSVENCLDYSFFNAIAVMSPQGNPSIYSAPPPASNHMHPANLFAGFTVLVVMVLAVAAGTLPRQRSDYPMANLSTLWVNNRNRLPDSITYDDGSMVRSILLLSPQTFYGPSFAAGFFCTPPCREFIFAVFIVFTSSGALFPVAVNEVIWCANRGSPLGEDATLELTGDGDLVLREKANGRLVWSSGTSGRSVQGMEITENGNLVLFDQRNGTVWQSFDHPTDALVPGQSLLQGMILKANTSPTNWTESKIYITILQDGVYGYVESTPPQLYYNYVVSTNKSKRVPTTVTFTNGCFSIFVQSTQPGNPDGRIALPEAKSIQYIRGILLENNTTSNCYLQLYCLPQSATYSLFFCPYTKQKLQTKTILVSILAAIGALILVVVVAIYVQKRRKYRERDEELDFDIMPGMPTRFSFQKLRKSTEDFSKKLGEGGFGSVYEGKISEEKVAVKRLESARQGKKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGVCVEKSNRLLVYEYMSRGSLDRWIYYHHNNAPLDWSTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDDNFNAKLADFGLSKLIDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKPEEAVQLINLLREKAQNSQLIDMIDKHSNDMVSHQEEVIQMMKLAMWCLQNDSDRRPSMSMVVKVLEGAMRVENCLDYSFFNANSVISVQGIPSTYSAPPRASILSSPR |
||||||||||
Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RWZ5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsKeNa_04g0007760 | OsKeNa_04g0007760.01 | Chr04 | 12108310 | 12127240 | - | NAM | ||
CDS seq | 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aggccgatccgtgcaaggcatggagatcactgagaatggcaacctggtgctgtttgatcagaggaatggaacagtgtggcagtcatttgatcatccaacagacgcattggtcccagggcagtcactgctgcagggcatgatcctcaaagcaaatacctcccccacaaattggactgagagtaagatatatataactattctccaagatggtgtatatggctatgttgaatccacaccaccacaactctactataactatgtagtgagcacaaacaagagcaagagagttccaacaacggttaccttcacaaatggctgcttcagcatctttgtgcagtccacacaaccaggaaatccagatggccgtatcgcattgccagaagctaagtccatccagtacataagaggtattctccttgaaaacaatacaacctcaaactgctacttacaactctactgcttacctcaaagtgcaacttactccctcttcttctgcccctacacaaaacaaaagttacaaacaaagacaattttagtttccatactcgcagcaattggtgctcttattttggttgttgttgttgctatttatgtccaaaagaggaggaagtatcgagaaagagatgaagaattagattttgatataatgcctggaatgccaacgagattctcatttcaaaaactgagaaaaagcactgaagacttcagtaaaaagctaggtgaaggtgggtttggatcggtctatgaagggaaaattagcgaagagaaagttgcagttaaacggctggaaagtgctagacaaggaaagaaagaattcttggcagaggtcgagactattggcagcattgagcacatcaatcttgtcagactgatcggagtttgtgtagagaagtcaaataggcttctagtatatgaatatatgtcaagaggatcacttgataggtggatatattatcaccataacaatgcgcctcttgattggagcacgaggtgtaggataattctcgatattgccaagggtttatgttatcttcatgaggaatgcaggcgaaaaattgctcatttggatatcaaaccacagaatattctattagatgataacttcaatgcgaaattggcagattttggactttctaagctaatagatagagatcaaagcaaggtgatgactgtgatgagaggcacacctggatatctggcacctgaatggttaacatcgcaaatcactgaaaaaccagaggaagctgttcagctgatcaatttattacgagaaaaggctcagaacagtcagttgattgatatgattgacaagcacagtaatgacatggtctcacaccaggaggaagtgattcaaatgatgaagcttgcaatgtggtgcttgcaaaatgatagtgaccgaaggccttctatgtcaatggttgtcaaggtattggagggtgcaatgagggtggaaaattgcctagattacagctttttcaatgcaaattcagtaatatctgttcaaggcattccatccacatattcagccccacctcgggcatcaatattatctagtccaagatga
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Homologues
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0303100 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0007180 | RBH | 0.142678 | 0.0 | 0.354866 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0007820 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0007570 | RBH | 0.0 | 1.674835 | 0.757839 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0007310 | RBH | 0.0 | 0.079575 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0007500 | RBH | 1.852823 | 5.266086 | 2.777840 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0218100 | RBH | 0.6932125 | 1.2774035 | 0.5752455 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0007170 | RBH | 0.000000 | 0.044669 | 0.016819 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0219800 | RBH | 0.56171 | 1.676841 | 2.3873615 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0007020 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0007270 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0007380 | RBH | 0.000000 | 2.436045 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0007200 | RBH | 0.0 | 0.091082 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0007560 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G007220 | RBH | 0.117159 | 1.003413 | 0.000000 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0007320 | RBH | 1.005413 | 6.819118 | 0.729526 |