Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsCMeo_04g0007510 | OGI:04045230 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr04:12929900-12948831 | ||||||||
Gene Symbol | SDRLK-24, RLCK139, OsRLCK139 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MCPANLLSFDIVAAAVVVVLMLATAAPAISVQQLYDYPTANLSTRWVNNAAVLQHSVDFTDGSAVRSIILRSPETIFGPSFAAGFFCAPPCKAFLFAIFIVYTDGGASITSVRNGIPQVVWSANRAHPVGENATLELTGDGILVLREADGRLVWSSGTSGRSVVGMQITEQGNLVLFDQRNVTVWQSFDHPTDALVPGQSLLQGMRLRANTSNTNWTESKLYMTVLSDGLYGYVESTPPQLYYEQTTNKRGKYPTRVTFMNGSLSIFIRTTQAGKPEAIIALPEAKSTQYIRLESDGHLRLYEWFDAGSNWTMVSDVIQKFPDDCAFPTVCGDYGICTSGQCICPLQANSSSSYFHPVDERKANLGCAPVTPISCQEMQYHQFLSLTDVSYFDEGQIIANAKNRDDCKEACLKNCSCRAVMFRYYGQNDSDGECQSVTEVFSLQSIQPEIVHYNSSAYLKVQLTPSSAAPTQNSSSAPTQTSSFALTQNKSNKMKAILGSTLAASITLVLVAIIVVYVRRRRKYQETDEELDFDILPGMPLRLSLEKLRECTEDFSKKIGEGGFGSVFEGKLSEERVAVKRLESARQGKKEFLAEVETIGSIEHINLVRMIGFCAEKSNRLLVYEYMPGGSLDKWIYYRHNNAPLDWSTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIVHLDIKPQNILLDENFNAKLADFGLSKLIDRDHSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDISQPEEAVQLINLLREKAQNNQLIDMIDKHSSDMVSYQEEVIQMMKLAMWCLQNDSGRRPSMSTVVKVLEGVMRVENCLDYSFFNANSVISVQGNPSTYSAPPHASILSKRNANAVACLIMKLHITIPVSTLKMLELLKLMISACAFPHDTAEGNLFTRIHGNQSYMGMPVKPIVVTLGLEVVKPINLQKKLKAPSAPFVSGQPYDYPMANLSTRWVNNAAMLKHNSYTDGSAVRAIVLRSQKQLPGISFAAGFFCAPPCQSFLFAVFILYYTYLVDTNKSRKDPTRVTFTNGSLNIFLQSTQAGKPEAIIALPEAKSIQYIRLEYDGHLRLYEWSDEKWTMVSDVIKKYPDDCAFPTVCGEYGICAGGQCICPLQTNTSSGYFHPVDERKANLGCAPMNPISLQLTASSSAPKQTSLSAPTQKKSYKIKTILGSTVAAIITLVLVVIVGIYKLGEGGFGSVFEGKISEERVAVKCLESARQGNKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGFCVEKSNRILVYEYMPRGSLDKWIYYRHNNTPLDWNTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDENFNAKLADFGLSKLMDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKVDVYSFGVVLMEIISGRKNIDFSQPEESVQLIKLLCEKAQNNQLIDMVDKHSNDMISRQEEVIQMMKLAMWCLQNDSCQRPSMSMVVKVLEGAMSVENCLDYSFFNAIAVMSPQGNPSIYSAPPPASNHMHPANLFAGFTVLVVMVLAVAAGTLPRQRSDYPMANLSTLWVNNRNRLPDSITYDDGSMVRSILLLSPQTFYGPSFAAGFFCTPPCREFIFAVFIVFTSSGALFPVAVNEVIWCANRGSPLGEDATLELTGDGDLVLREKANGRLVWSSGTSGRSVQGMEITENGNLVLFDQRNGTVWQSFDHPTDALVPGQSLLQGMILKANTSPTNWTESKIYITILQDGVYGYVESTPPQLYYNYVVSTNKSKRVPTTVTFTNGCFSIFVQSTQPGNPDGRIALPEAKSIQYIRGILLENNTTSNCYLQLYCLPQSATYSLFFCPYTKQKLQTKTILVSILAAIGALILVVVVAIYVQKRRKYRERDEELDFDIMPGMPTRFSFQKLRKSTEDFSKKLGEGGFGSVYEGKISEEKVAVKRLESARQGKKEFLAEVETIGSIEHINLVRLIGVCVEKSNRLLVYEYMSRGSLDRWIYYHHNNAPLDWSTRCRIILDIAKGLCYLHEECRRKIAHLDIKPQNILLDDNFNAKLADFGLSKLIDRDQSKVMTVMRGTPGYLAPEWLTSQITEKPEEAVQLINLLREKAQNSQLIDMIDKHSNDMVSHQEEVIQMMKLAMWCLQNDSDRRPSMSMVVKVLEGAMRVENCLDYSFFNANSVISVQGIPSTYSAPPRASILSSPR |
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Function | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RWZ5] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsCMeo_04g0007510 | OsCMeo_04g0007510.01 | Chr04 | 12929900 | 12948831 | - | NAM | ||
CDS seq | atgtgtcctgcaaatctcttgtccttcgacatcgttgctgcggcggtggtggtggtgctgatgcttgcaactgcagcaccggccatctccgtgcagcagctctacgactatccgacggcaaacctctcgacgcggtgggtcaacaacgccgcggtgctccaacacagcgtcgacttcaccgacgggtcagccgtgcgctccatcatcctccgctcaccagaaaccatatttggcccctccttcgccgcggggttcttctgcgctccaccctgcaaagcgttcctcttcgccatcttcattgtctacactgacggtggtgccagtatcacctcggtacgaaacggtattccgcaggttgtctggtcggccaaccgggcacaccctgttggagagaatgctaccctggagctgactggagatgggatcctggtcctccgtgaagccgatggcagactcgtctggtcgagcggcacttcaggccgatctgttgtaggcatgcagatcacagagcaaggaaacctggtgctgtttgatcagaggaatgtgacagtgtggcagtcatttgatcatccaactgatgcattggtccctgggcagtctttgctgcagggcatgaggctgagagcaaatacctccaacacaaattggactgagagtaagttgtatatgactgttctttcagatggtttatatggttacgttgaatccacaccgcctcaactctactatgagcagacaacaaacaagagaggaaaatatccgacaagggttaccttcatgaatggcagcctcagcatctttatacgtaccacccaggcaggaaagcctgaagccattattgcactgccagaagcaaagtccacccaatacataaggttagagtctgatggacacttgaggttgtatgagtggtttgatgcaggatcaaattggaccatggtatctgatgtaatccagaaattccctgatgattgtgctttcccaacagtgtgtggggattacgggatatgcacaagtggccaatgcatctgtcctcttcaggctaattctagttcaagttacttccatccagttgatgagcggaaggctaatcttggttgtgcaccagtgactccaatatcttgtcaagaaatgcaataccatcaattcttgagtcttacggatgtttcttactttgatgaaggccaaattattgccaatgcaaaaaacagagatgattgcaaggaagcctgcttgaagaattgctcctgcagagctgtgatgttcaggtattatgggcagaatgattctgatggagaatgccagtcagtgacagaggtcttctccttgcaatcaatacaacctgaaattgttcattacaactcttctgcttacctcaaagtgcaacttactccctcctcagcagcccctacacaaaactcctcttctgcacctacacagacctcctcttttgcccttacacaaaacaaaagtaacaaaatgaaggcaattttaggttctacacttgcagcaagtattactcttgttttggttgctattattgttgtctacgtacgaaggaggagaaaatatcaagagacagatgaagagttagattttgatatattgcctggaatgcccctgaggttatcacttgaaaaattgagagaatgcactgaagacttcagtaaaaagataggtgaaggtggatttggatcagtatttgaagggaaattaagtgaagagagagttgcagtgaaacgtctagaaagtgctagacaaggaaagaaagaattcttggcagaggtcgagactattggcagcattgagcatatcaatcttgtcaggatgatcggattttgtgcagagaagtcaaataggcttctggtatatgaatatatgccaggagggtcacttgataagtggatatattaccgccataacaacgccccacttgattggagcacaaggtgtaggatcattctggatattgccaagggtttatgttatcttcatgaggaatgcaggcgaaaaattgttcatttggatatcaaaccacagaatattctcttagatgagaacttcaatgccaaattggcggattttggactttccaagctaatagatagagatcatagcaaggtaatgactgtgatgagaggcacacctggatatctggcacctgaatggttaacatcacaaatcactgaaaaagttgatgtgtacagctttggcgttgttcttatggagataataagtggaagaaaaaatattgatatctctcagccagaggaagctgttcagctcatcaatttattacgagaaaaggctcaaaataatcagttgattgatatgattgataagcacagtagtgacatggtctcataccaggaggaagtgattcaaatgatgaagcttgcaatgtggtgcttgcagaatgatagtggccgaaggccttctatgtcaacagttgtcaaggtattggaaggtgtaatgagggtggaaaattgcctagattacagctttttcaatgcaaattcagtaatatctgttcaagggaacccatccacatattcagctccacctcatgcatcaatattatctaaacggaatgcgaatgccgtggcatgcttaattatgaagcttcatattaccatcccggtgtctactctaaaaatgcttgaattgctaaagttaatgatatcagcatgtgcttttccccatgatacggcagaaggaaacttgttcaccagaatccatggtaatcaaagttacatgggaatgcctgtaaagccaattgttgtcactttaggattagaagtggtcaagccaatcaatcttcaaaagaaattgaaagcaccgagtgcaccgttcgtctccgggcagccctatgactatcctatggctaacctctcgacgcgatgggtcaacaatgctgccatgctcaagcacaactcctacaccgacgggtcagcagtacgtgccattgtcctccgttcacaaaaacaattgcccggcatctccttcgctgcagggttcttctgcgccccaccctgccaatcattcctctttgctgtcttcattctatactatacatatttggtggacacaaacaagagcagaaaagatccgacgagggttacctttacgaatggaagcctcaacatctttctgcagtcgacacaggcaggaaagccagaagccattattgcactgccagaagcgaagtccatccagtacataagattagagtacgatggacatttgaggctgtatgagtggtctgatgaaaagtggaccatggtatctgatgttatcaagaaataccctgatgattgtgctttcccaacagtgtgcggagagtacgggatatgtgcaggtggacaatgcatctgtcctcttcagactaatactagttcaggttacttccatccagttgacgaacggaaggctaatcttggttgtgcaccaatgaatccaatatctttgcaacttactgcctcctcttctgcgccaaaacaaacatccttatctgcccctacacaaaagaaaagttacaaaataaagacaattttaggttctacggttgcagcaattattactcttgttttggttgttattgttggtatctataagctcggcgaaggtggatttggatcggtctttgaagggaaaataagtgaagagagagttgcagtgaaatgtctggaaagtgctagacaaggaaacaaagaattcttggcagaggtagaaactattggcagcattgaacacatcaatcttgttaggctgattggattttgtgtagagaagtcaaaccggatcctagtatatgaatacatgccaagagggtcacttgataagtggatatattaccgccacaataataccccccttgattggaacacaaggtgtaggatcattctggatattgccaagggtttatgttatcttcacgaggaatgcagacgaaaaattgctcatttggatatcaaaccacagaatattctcttagatgagaacttcaatgccaaattggcagactttggactttcaaagctaatggatagggatcaaagcaaggtaatgactgtgatgagaggcacaccaggatatctggcacctgaatggttaacatcacaaatcactgaaaaagttgatgtctacagcttcggcgttgttcttatggaaataataagtggaagaaaaaatattgatttctctcagccagaggagagtgttcagctcattaagttattatgcgaaaaggctcaaaataatcagttgattgatatggttgataagcacagtaatgacatgatctcgcgccaggaggaagtgattcaaatgatgaagctcgcaatgtggtgcttgcagaatgatagctgccaaaggccttctatgtcaatggttgtcaaggtattggaaggtgcaatgagtgttgaaaattgcttagattacagttttttcaatgcaattgcagtcatgtctcctcaaggcaatccatcgatatattctgctccacctcctgcatcaaaccatatgcatcctgccaatctctttgccggcttcacggtgctggtggtcatggttcttgcagttgcagcagggacgctccccaggcagcgctccgactatcccatggccaacctctcgacactgtgggtcaacaatagaaacaggctccctgacagcatcacatatgacgacgggtctatggtacgcagcatactcctcttgtcaccacaaaccttttatggcccctcctttgccgcagggttcttctgcaccccaccctgccgagaattcatcttcgctgtcttcattgtcttcaccagcagcggtgctttgttccctgtagcggtaaacgaggttatctggtgtgccaacaggggaagccccctaggagaggatgctacccttgagctgactggagatggtgacctcgtcctccgtgaaaaagccaatggcagactcgtctggtcgagcggcacttcaggccgatccgtgcaaggcatgga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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
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Homologues
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---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0303100 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0007210 | RBH | 0.073051 | 1.428085 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0007820 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0007590 | RBH | 0.0 | 3.506759 | 0.931212 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0007250 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0007500 | RBH | 1.852823 | 5.266086 | 2.777840 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0218200 | RBH | 0.5172755 | 1.231219 | 0.8014485 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0007250 | RBH | 0.025579 | 0.163254 | 0.046080 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0219200 | RBH | 0.3666105 | 2.696672 | 3.212302 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0007040 | RBH | 0.063677 | 0.000000 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0007270 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0007380 | RBH | 0.000000 | 2.436045 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0007220 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.100873 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0007550 | RBH | 0.100653 | 3.448607 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G007250 | RBH | 0.181262 | 0.686288 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0007240 | RBH | 0.099133 | 0.821855 | 0.000000 |