Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsGoSa_08g0006350 | OGI:08015860 | 16/16 | GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr08:5959556-5985415 | ||||||||
| Gene Symbol | SHR5 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsGoSa_08g0006350 | OsGoSa_08g0006350.01 | Chr08 | 5959556 | 5985415 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgggtggtgttagtggtaagctggtgtgggtgttgctcgtgatgtgctcctcatggctgatcgccgctgttcatgcccagcaagcggcaacaactgatccaatcgaagtggcggcgctggaggcgatcctggggagatggggcaagacgacgtcgccgctgtggaggatgagcggcgagccatgccgcggcgtccccgtcgacggcagcaccgacctcgacggcaaccccaagaacaaccccggcatcaagtgcgactgttcctacaacagcggcaccgtctgccatattacccagctgaacctggatcaaaattacttgtcaggccccataccatcattcattgggcaattgactgccttgacagaattgcacgtgggattcaatccactctcaggatcacttccaaaggaacttggaaatctcacgaacctcaatttgctaggcattagtttgaccaatttttctggtcaacttcctgaagaattgggcaacttgaccaaacttcgacaattgtatactgatagtgctgggttgagtggcccattcccttctacgctctcaaggcttaagaacctaaaactcctgcgggcatcagataacaattttactggaacaatacctgattttattgggagcttgtctaatttggaagatctggctttccaaggtaattctttcgaaggaccgatcccagcaagtttgtctaatctaaccaaattgacaaccttgcggattggtgatattgtaaatgggagctcttcattggcctttatcagcagtctgacatctctggataccctcgtactgaggaactgcaagatatctggagaccttggagcagtagatttttcgaagttcgcaaacttaactttcctggacttgagttttaacaatatctcggggaatgttcctaaatcaattctgaatctacaaaagcttatattcctgtttcttggcaacaacagcctaacaggagaattgccagatgggataagcccttcgctaacgaacttagatttctcatacaaccagctcactggtagctttccctcctgggttacccagaacaatctgcaattgaatttggtggcaaacaactttattcttggcagcaccaacattggcatgctacctccagggctaaactgcctccaggaagatactccatgttttcgtggttctccaaaatattattcctttgcggtagactgtggtagtaatagatctatcagagtttcggataatactatgtacgaattggattccacaaaccttggggactcatcatattatgttacaagtcaaacaagatggggcgttagtaatgtaggaaaattattccaggccccaaatgacagtaagataatacatagtggtgagaagatccagaatgcagtggattcagaactattccaaactgcaaggatgtcgccgtcgtctctgagatactatggccttggacttgagaatggaaattacaccgttctgcttaaatttgcagagttaggttttccagacacgccaacttggcaaagcttaggaaggagattttttgacatatatatccagggtgaactAaaagaaaaggacttcaatataaggaagatggctggtggaaaatctttcactgctgtttacaagagttacacaacaactgtgtcaaaaaactttcttgaaatccatctattctgggctggaaagggcacttgttgtattcctattcaaggttactacggaccattgatctcagcattaagcatcactccaaattttagtcctactgtgcgaaacggtgtacccaaaaagaaaagtaaagcaggtgcaattgttgggattgtgattgctgcctcggttttaggatcagctatcttattcggaatatttatggtcataaagaagagaagaagaatggcaaaacagcaagaagaattatacaacctagttggacagcctgatgtcttcagtaatgctgaactcaagttagctacagacaatttcagttctcaaaacattcttggggaaggtggatatggtccagtctataagggtgtgctacctgatggaagagttatagctgtaaaacaactttcccaatcatcccatcagggcaaaagtcagtttgtgacagaggttgcaactatttctgctgtgcaacatcggaatcttgtaaaattgcatggttgctgcattgatagtaacacacctttattagtttatgagtatcttaagaatggaagcttggataaagcattatttgctaacttaaacttatctaaccttttgtcaagtggttatctggctcctgagtatgcgatgagacgacatttgactgaaaaggttgatgttttcgcattcggggtggtcgcactagagattgttgctggtcggtcgaacaccgacaattctcttgaggaaagtaagatctatctctttgagtgggcttggagcttgtatgaaaaggagcaagcactcgggattgttgacccaagacttgaggaattcagcagggatgaagtgtatagagtcatccatgtcgcactcgtctgcacacagggctcaccctatcagcgaccaccgatgtcaaaggttgtggcaatgctaactggagatgttgaggtggcagaggtagtgacgaagccgaactacatcaccgagtggcagttcaggggtgggaataccagctatgttaccagccactcaggatcaactacccctgagctcagcaggcagaaagagattgatcctctcactcaatcaccaacaatcaccggagttagccatgagcatgagggaaggtga
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Expression
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Homologues
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g10310 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.082026 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0203400 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_08g0006640 | RBH | 0.0 | 12.641209 | 1.108051 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0006590 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.880411 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0006710 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_08g0006560 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_08g0006600 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 11.541100 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0091400 | RBH | 10.8169235 | 14.028789 | 0.731616 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_08g0006320 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 1.159389 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0093900 | RBH | 0.8972265 | 5.352218 | 1.558977 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_08g0006260 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_08g0006310 | SBH | 0.039458 | 1.308960 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_08g0006360 | RBH | 2.114534 | 3.288301 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0006480 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_08g0006300 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G006430 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0006280 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
