Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_Ung0002710 | OGI:99008930 | 1/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | ChrUN-Ctg99:14098-28886 | ||||||||
| Gene Symbol | MRKc, MRKc, RKc, TRKc | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FIZ3] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_Ung0002710 | OsCMeo_Ung0002710.01 | ChrUN-Ctg99 | 14098 | 28886 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgggtgttggtcctcattgtactactagtctgctaataatactggccgtcgtcatcacgtcgtctttgctcacgacgacgatcaaggcagatgagccgagcaatgataccgacatcgccgcgctgcttgccttcaaggcacagttctctgaccctctgggtttcctccgtgacggctggagggaggacaatgcatcctgcttctgccagtggatcggcgtgtcgtgcagccgccgccggcagcgcgtcaccgccctggagctgccgggcattcccctgcaagggtcgatcacccctcacctcggtaacctctctttcctctacgtcctcaacctcgccaacaccagcctcacggggacactcccgggtgttataggaaggctgcatcgcctggagctccttgatcttggctacaatgccctgtcaggtaacatcccagccaccataggaaacctcaccaaacttgagcttcttaatctcgagtttaaccagctatctggtccaatcccagcagagctgcagggcctgcgaagccttggcagtatgaatctccgtaggaactatctcagtggcttgattcccaacagtctattcaacaacaccccattgttaggttatctcagcattggcaacaacagcttgtcagggccaataccgcacgtgatattctcgttgcacgtgctgcaggtccttgttctagagcacaatcaattgtccggctcactgcccccagccatcttcaacatgtccagacttgaaaagctgtatgccactcgaaacaatctcactggacctatcccatacccagctgaaaaccagaccttgatgaacatccccatgattcgggtgatgtgtctctctttcaacggattcataggccgaattccacctgggcttgcggcatgccggaaactccagatgcttgagttaggtgggaatctcttgacggatcatgtgccggaatggttagcgggcttgtccctgctaagcaccttggttataggtcagaatgagcttgtcggttcgatcccagttgtgctaagcaatctcaccaagctcaccgtgcttgatctgtcatcttgcaagctaagtggaatcattccattggaactaggaaagatgacacaactcaacatcttgcacctctcatttaatcgcctaactggtccttttcctacctcccttggtaacttgacaaaattatcttttctaggattagaatctaacctgctgaccggacaagtacctgagacccttgggaacctcaggtctctacacgaccttggtattggaaaaaatcatctgcaagggaaacttcacttctttgccgttctctccaactgtagggaactccaattcctcgacataggaatgaattctttctcagggagcattcctgcgagtttacttgcaaacctctctaacaatttagaatctttttatgcaaacaataacaacttgactggcagtattcccgctaccatatcaaatctgactaacctgaatgtaataagcctttttgacaaccaaataagcggcacaattccagattctatcgtgctaatggagaatctacaggcattggacctctctataaacagtttgtttggaccaatcccaggacaaattggtaccctaaaaggcatggtcgcattatatctcggtgccaacaaaatttctagttccatccctaacggtgttggcaacctaagcacgttgcagtacttatttatgtcatataataggttgtcatcagttatacccgcaagcttagttaatcttagtaatcttctccaactagatatatctaataataacttaactggttcattgccttctgatctcagtcccttgaaagccataggcctaatggacacctctgcaaataatttggttggtagcctcccaacttcgttgggacagcttcaactgttaagctacctgaatctatctcaaaacacattcaatgatttaattccagactctttcaaaggtctaattaatttagaaacattggacctgtctcataacagtctttcaggaggcataccaaaatatttcgccaacttaacctatcttacttctttgaacctctcctttaacaatctacaaggtcagataccaagtggaggtgttttttcaaacatcactctgcaatctttaatcggaaatgctggactctgtggtgctccacgcttgggatttcctgcatgtctggagaagtcccactcgactagcacaaaacacttgctgaagattgtgctccctgctgtcattgctgcgtttggtgccattgttgctattaggacttttgatgcggagtgccatgtcttgcggatggccagacatcggaacctgattaagatattgaatacctgttccaacttggattttagagcattgctgcttcagttcatggccaatggtagcttggagtcatatttgcacactgaaaacatgccttgcataggatcattcctgaaaaggatggagattatgctagatgtgtcaatggctatggaatatctgcaccatgagcactatgaggttgtcctgcattgtgatttgaaacctagcaacgtgctatttgatgaagagatgactgcacatgtagcagactttggcatagcaaagatgctgttaggggatgataattcagcagtttcagcaagcatgccaggcacagttgggtacatggcaccagagtatgcactcatgggaaaggcatcacggaagagcgatgtcttcagcttcggaatcatgctgctcgaggtgttcactgggaagaggcctacagatcccatgttcattggtggattgaccctgaggctgtgggtttctcaatcttttccagagaatcttattgatgttgccgatgagcacctactgcaagacgaagaaacacgtctttgttttgatcaccagaacacttcattgggatcttcctcgactagcaggaataacagcttccttacgtcgatatttgagctaggcctgttgtgttcgagcgagtcacctgagcagatgatgtctatgaaagatcgcgtcacctcgctggcgttgccggggactccgctgcacggacagctctcgcctcaccttgccaacctctcattcctcgccgtcctcaacctcacaggcgccggcatcaccggtccaatcccacccgacctcggccggctgcgtcgcctcaggtacctcaacctcggccgcaactccctgtctctctccatcccatccgccattgccaacctcacgagcatccagtttcttgatttgagcatcaactcgctctccggcgagatcccagctcagcttttcaacaccacgcctgagctcagccatgtcaacttcgccaacaacaccttgtcgggatcgataccacctgccattgcatccttgcccaagctcgacttcctcaacatgcagatcaaccatctctccggcgagatacctccggccatcttcaacatgtccggcctccgaatgctctacatggccaacaacaacttgaccggccctatacctgacaacaacatcagcttcaacctcccaatgctgcaggtgatatcactctctctgaacaacttcaccggcccgattccgataggcctcgcgtccagcaagcaagccaggatcatctctctgtcgcagaatttgtttactggtcctataccgacatggctggcagagttgcctcttcttactggaattttatttggtggaaatgagcttgtcgggacaatcccagctgttcttggcaacctcaccatgctcagtaggcttgacttctcattctgcaagctctatggagagatccctgtgcagctagggaagctgaagaatctcaccattctggagctttcagtcaatcggttatctggttccttccctgcttttcttggtaatttttctgaattatctgccgtagggctgggtgccaaccagttaattggatcagtaccagcttcatttggaagcaacatgatatcacttgagcaatttgatgttggagagaaccacctccaaggggatctcggtttctttgctgctctctccaattgcagggagctccagctcttgagcttgcacaccaattctttcactggtaggcttccagattatgtcggcaatctctctaggaatctcgtggttttcgatgtagatagcaacaggttgaccggaggaattccgtcgacaatatcaaatctaagtagtctcagctcgttgatccttctgaacaatcaactaagccaggagatcccagaatctgtcatgaccatggagagtcttgagaggattgacattgcaagaaataattttgctggtcccatcccggcaaaaattggttttctcgggaggcttgtacaattgtatctctacaacaatgagttctccggatcaatacctgaaggtattggtaatctcactaatttagagtacatttctttatctcaaaataatttatcatctggtttgccaactggtttgtttcatcttgatgaacttgtccacctaaatctgtcccacaactctctgactggtgcattgcctgctgatcttggccacatgaagcagattgataaaatagatctttctgacaacagcttggttggcagcatcccagattcttttggacagctcacaatgctaacttacctaaacctgtctcacaactcatttgaaggttcagttccatacactttgcgcaattcaattagcttagctgctttggacctctcttctaacaacctctctggtaccattccaaagttcttggcaaacttgacttacctaaccattttgaacctttccttcaatgaattacatggtccagtaccagatgaaggtgttttcagaaacatcaccatgcaatctttgacagggaacgatggattgtgcggtgctccccgtctaggattttctccgtgcccgggaaattctcggtcgactaatagatacttgctaaaatttatactcccgggtgttgctttagtact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| Protein seq | MGVGPHCTTSLLIILAVVITSSLLTTTIKADEPSNDTDIAALLAFKAQFSDPLGFLRDGWREDNASCFCQWIGVSCSRRRQRVTALELPGIPLQGSITPHLGNLSFLYVLNLANTSLTGTLPGVIGRLHRLELLDLGYNALSGNIPATIGNLTKLELLNLEFNQLSGPIPAELQGLRSLGSMNLRRNYLSGLIPNSLFNNTPLLGYLSIGNNSLSGPIPHVIFSLHVLQVLVLEHNQLSGSLPPAIFNMSRLEKLYATRNNLTGPIPYPAENQTLMNIPMIRVMCLSFNGFIGRIPPGLAACRKLQMLELGGNLLTDHVPEWLAGLSLLSTLVIGQNELVGSIPVVLSNLTKLTVLDLSSCKLSGIIPLELGKMTQLNILHLSFNRLTGPFPTSLGNLTKLSFLGLESNLLTGQVPETLGNLRSLHDLGIGKNHLQGKLHFFAVLSNCRELQFLDIGMNSFSGSIPASLLANLSNNLESFYANNNNLTGSIPATISNLTNLNVISLFDNQISGTIPDSIVLMENLQALDLSINSLFGPIPGQIGTLKGMVALYLGANKISSSIPNGVGNLSTLQYLFMSYNRLSSVIPASLVNLSNLLQLDISNNNLTGSLPSDLSPLKAIGLMDTSANNLVGSLPTSLGQLQLLSYLNLSQNTFNDLIPDSFKGLINLETLDLSHNSLSGGIPKYFANLTYLTSLNLSFNNLQGQIPSGGVFSNITLQSLIGNAGLCGAPRLGFPACLEKSHSTSTKHLLKIVLPAVIAAFGAIVAIRTFDAECHVLRMARHRNLIKILNTCSNLDFRALLLQFMANGSLESYLHTENMPCIGSFLKRMEIMLDVSMAMEYLHHEHYEVVLHCDLKPSNVLFDEEMTAHVADFGIAKMLLGDDNSAVSASMPGTVGYMAPEYALMGKASRKSDVFSFGIMLLEVFTGKRPTDPMFIGGLTLRLWVSQSFPENLIDVADEHLLQDEETRLCFDHQNTSLGSSSTSRNNSFLTSIFELGLLCSSESPEQMMSMKDRVTSLALPGTPLHGQLSPHLANLSFLAVLNLTGAGITGPIPPDLGRLRRLRYLNLGRNSLSLSIPSAIANLTSIQFLDLSINSLSGEIPAQLFNTTPELSHVNFANNTLSGSIPPAIASLPKLDFLNMQINHLSGEIPPAIFNMSGLRMLYMANNNLTGPIPDNNISFNLPMLQVISLSLNNFTGPIPIGLASSKQARIISLSQNLFTGPIPTWLAELPLLTGILFGGNELVGTIPAVLGNLTMLSRLDFSFCKLYGEIPVQLGKLKNLTILELSVNRLSGSFPAFLGNFSELSAVGLGANQLIGSVPASFGSNMISLEQFDVGENHLQGDLGFFAALSNCRELQLLSLHTNSFTGRLPDYVGNLSRNLVVFDVDSNRLTGGIPSTISNLSSLSSLILLNNQLSQEIPESVMTMESLERIDIARNNFAGPIPAKIGFLGRLVQLYLYNNEFSGSIPEGIGNLTNLEYISLSQNNLSSGLPTGLFHLDELVHLNLSHNSLTGALPADLGHMKQIDKIDLSDNSLVGSIPDSFGQLTMLTYLNLSHNSFEGSVPYTLRNSISLAALDLSSNNLSGTIPKFLANLTYLTILNLSFNELHGPVPDEGVFRNITMQSLTGNDGLCGAPRLGFSPCPGNSRSTNRYLLKFILPGVALVLGVIAICICQLIRKKVKKQGEGTAPVDGDDIISHRLVSYHEIVRATENFNEGNMLGGGSFGKVFKGRLDDGMVVAIKVLNMQVEQAMRSFDIESSMPGTIGYMAPEYAFMGKASRKSDVFSFGIMMLEVFTGKRPTDPMFAGDMSLRKWVSEAFPVLADVADDILLQGEILIQQGVLENNVTSLPCSTTWANEDPLVAVFEVGLMCCSSSPAERLEINDVVVKLKSIRKDYSTCKKVM
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g47310 | SBH | 0.046286 | 0.0 | 0.043063 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0695800 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0024590 | SBH | 0.0 | 5.368335 | 1.046873 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0029590 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0008690 | SBH | 0.252032 | 0.000000 | 6.477416 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0024120 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0003470 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_06G0360500 | SBH | 0.014929 | 0.119307 | 0.139784 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024840 | SBH | 0.000000 | 0.052658 | 0.247680 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0283800 | SBH | 2.5881425 | 13.5405615 | 5.512146 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0024680 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0024850 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0024120 | SBH | 0.0 | 9.149888 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024860 | SBH | 32.739056 | 0.000000 | 2.989254 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0008140 | SBH | 0.070698 | 13.849082 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G016140 | SBH | 0.0 | 0.588280 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0024490 | SBH | 0.0 | 2.211889 | 0.0 |
