Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsCMeo_07g0001790 | OGI:07004740 | 16/16 | CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:1863020-1890151 | ||||||||
| Gene Symbol | RLK, RLCK221, OsRLCK221, RLCK226, OsRLCK226, RLCK237, OsRLCK237 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6] | ||||||||||
Transcripts
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| OsCMeo_07g0001790 | OsCMeo_07g0001790.02 | Chr07 | 1863020 | 1874002 | - | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsCMeo_07g0001790 | OsCMeo_07g0001790.03 | Chr07 | 1864472 | 1866712 | - | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgaatgctcctgctccgcctattgaaatctccaggttgccgaggctcccttgccctggagataataggttgcagaagatcttgcagatcctattgccaattgtcgctgtagcattgatcttcattgtagtcatgatacttgtgaggaggcagcagagatatgcggaattaagggaagattgggaggtcgagttcgggccacaccggttctcatacaaggatctGttcaatgccacagaaggtttcaagagtaagcacatactcggcgtgggagggttcggaaaagtgtacaaaggagtgcttcggacatccaaacttgaggttgctgtgaaaaaggtatcacatggttcaaaccaagggatgaaagagtttatctctgaggttgttagcattggtcaccttcggcaccgcaaccttgtgcagctacttggttattgtcgacgaaagggcgaactcctactagtgtatgactatatgccaaatggtagccttgacaagtatctatatggtgaagacaacaaAcctgttttaaattgggctcagaggatgcaaatcatcaaagacgtggcttctggcttattctacctccatgagaagtgggacaaggttgtcatccaccgtgacatcaaagcaagcaacgtgctcctggatagtgaaatgaatGcccggttaggcgactttggtcttgcaagattatatgaacatggcaccaacccacagaccacgcacctggttggaaccatgggattcatagccccagagctggcacgcacaggaaaggcatcccctctcaccgacgtgttcgccttcggcacgttccttcttgaggtcacctgtggccggtggccgatcagcaacagtgcgcaccacggccgaaagatgttggttgactgggttctccagcactggcaccagggttcgctgccagagacagtggacccgaagctgcacggcatctacaacgtcgatgaggcatgcctggtgttgacacttggGctgatgtgctcacacccaaTacccggagcaaggcctatcatgcggcaggtcatgcaataccttgatggagatgcaccgctgccggagtttacaccGgcaaccctgaactccagcttgctggcaataatgcacaatgaaggggtcgacccatacgtcgcacagtacccgtggtcagggaatagcttgggcacaatgacaccagacatcttgtctgga
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| Protein seq | MNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMILVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKLEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVLNWAQRMQIIKDVASGLFYLHEKWDKVVIHRDIKASNVLLDSEMNARLGDFGLARLYEHGTNPQTTHLVGTMGFIAPELARTGKASPLTDVFAFGTFLLEVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDILSG
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.789320 | 0.0 | 3.406892 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0132500 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.042393 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g03780 | SBH | 0.077187 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0283050 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0001930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0001920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0001880 | SBH | 0.280276 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0001790 | RBH | 0.008926 | 0.007383 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0009570 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0027600 | RBH | 0.722201 | 0.488704 | 0.0441795 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0001860 | SBH | 0.383437 | 0.079820 | 0.301511 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0023800 | RBH | 0.226334 | 1.6050545 | 0.026653 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0001900 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0010410 | SBH | 0.805792 | 0.689577 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0009510 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0001990 | RBH | 0.421375 | 0.000000 | 0.099593 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0001870 | SBH | 0.079346 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G001980 | RBH | 0.155308 | 0.000000 | 0.175752 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0002040 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
