Rice Gene Index (RGI): a comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice.

Basic Info

Gene ID		OGI # \| Score			Accession \| Assembly \| Annotation			Location		Links
OsIR64_07g0001860		OGI:07004740 \| 16/16			IR 64 \| OsIR64RS1 \| Gramene(+IsoSeq)			Chr07:1522265-1594863		Homologues MicroCollinearity RGI-JBrowse
Gene Symbol		RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35
DNA seq		TCAAACACTAGCAGTGTCATCGTCTACCTCGGGTGAGGTTTCAATGCTCACCACCGACGACAAAGACAGACATGGCAAGACATACGAGTCGAAGCCTTGGCCCTGCATGAGAGCCACCATGTTGAACTTCAGCTCCGACGGTGCCAACTCTGGCAGCGGCGCGTCGCCGTCGAGGTATCTCTGGACTTGACTCATGGTAGGCCTTTCCATGGCGATTGGGTGAGAACACAATAGACCTAGCTTCAGCACTAGACATGCCTCATCAACATTGTAGTTGCCCTGCAATCTTTTGTCTACTGTCTCAGGCAGTAATCCTTTCTGCCAGTGCTCAAGGACCCAATCAACCAGCATTGGGGGTTGATTATCTTGTTGATTGTTGTTGAGTGGCCTTTGTCCACAAGTGACTTCGAGAAGGAATACGCCAAAGGCAAATATGTCTGTGGCAGGAGATGCCTTGCCTGTGAACACTAGCTCTGGGGCTAGGTACCCCATTGTGCCTACCAGGTGCGTAGTTTGTGGGTCGGTTCCGTGGTCATATAATCTTGAGAGGCCAAAGTCACCTAATCGTGCATTCATATCTTTATCAAGAAGCACGTTGCTTGCCTTGATATCTCGGTGGATTACAATCTTCCCCCATTTCTCATGGAGGTAGAGTAGTCCTGACGTGACACCTTTGACAATGTTAAATCTCTGTGCCCAATCCAATGTTGGCTCGGTCAAATCACAATACAAATAGTTGTCAAGGCTACCGTTTGACATATAGTCATAGACCAGAAGGAGTTCACCTTTCCTCCTACAATAACCGAGCAACTGCACAAGGTTTCGGTGTCGAAGTTGACCGATACTGACAATCTCAGCAACAAACTCCTTCATACCTTGGCTCGACTCATGCGAAACACACTTCACGGCAACCACTCGTTTAGACACCGGAAGCACTCCCTTATACACCTTCCCAAATCCTCCGACACCAAGTAAGTTCTTATCCTTAAATCCTTCAGTGGCATCATACAGAACCTTGTATGAGAAACGATGCGGACCAAACTCAACCTCCCAATCTTCTTGAATCTCTGTGTACTTGAGTCGCCTCCGTACACAGAGAACAAGGAGAACACCAACAAGGAAAATCAATGCAGCGGTTGCCACCGGTGATATGATTACCAAGATCCTAGAAGAATGGGACTTCTTGCTGCCAAGATTTGGCAGCTTGGGCAACCTGGAGATATCAATAGCTTGAGCAGGGCCATTCATCCTAAAGCTCCATCCAAGAACACAGTGTTTTGTGTTGACTACACCTCCAGTTGCAGCTGAGAAACCGATGTAGGCTGAATCTGCAACCACCGTTGAGAGGTCGTAGGTGACAGACAGTAGAGGTCTCTTGGGCTTGGCCAATCTGGCAGGAGCCAAGGTGACACTAATCTTCTTGGCATCACCATCATAATCAAACCAAACTTGCATTGCCTCATGGATGACAAGAGTAAGGTTCCTGAAGATGCCACTCCTGTCTTCATAGAAACCAGCATAGTGTGCATCCAAGGACTTCATGCTGTTGACATTGATCCCTACATGGTTGTCATCCATGTCTTGGAACTCCTTGTTTTGGAAGGTGTCGAGCTCGACGGCGAACAAATCGTTGCTTCTATTGCCATTGTTTTGGTTGTTGAGGAGGCCCAAATATTGTGCAGGCAATGATGCATCAGAGAAGTTCTTGCTTGGTGCTATGAAGAAGGCCATGCCATCGTTGCTCCGATTGGCATATTTTTGGAGGATGCTGAACGCAAATGAAACTGAGAAAGATTGTACCATGTCGTTTGGCGACTTGCGAAAGCGCAACGGAGTTGGGTAGAACGCATGGCCTTCGATATTATTCGCGCCATTGGTGAGCTCAAGGAGCCCATCTTCGGTGATGGTGGCGGCGCCATCAAGGACGAGGTTGCTGCCGGTGAAGCCGGAGAAGACAAACTGGTGCTCACTAGAAGTGACAAAGGATACAAGGCAAAGGAAGAGAAGAAAGGTGTATTTCATGGCAGGTGATGGAATGGGCTGTGAATTGAATTGCAGCAAATCAACAATGAACAATTAGAACTGCAGGGCAGCAATGTCTAGTTAGCTATTGTAATAGTTAGTGCAGAGAAAGTGACATTGTGAGCTACTGTATATAGTTTTGAGTTTTCTCCAGCATGCATTACAGACTTGAATTATTGAAACTTCCTCTCCCAAAAAGGTCAAAGTATAGTCTGGTAGCATCTAGCTTGGTCAAATTATATTTCGTGCACCTAACGAACATAATTAATTGCCACACGAAACTTCGTAGGAAAATTCCTTGTATGAAACATGTTGACGCCATGTTTGTACACATTCAAACTGGTTTACAGACATGTATATTAATACGTTCGTATTTTTTTTTGGAAGTAACTTGTTTTTATTTCTTCTGTACCTAGCAGCTTGTCGGCAACAAATCTTCAATGCTTTATATGAGAGATTTTATGGTCCTCTTAAGTACCATGGCTATAGGTACTAAAATTATACACTAAAATTTTAATACCTCGAGATCGATAACCTAGTTTCTGTAGGTATCAAGTTTTGTATAAAATAATATGATACCTTTCGGTATTTTTTTAAGGATGTTATAATTACCCATATAATATAGTTATATGAAAGATTTTTAATGAAAAATATGCTAATATCATTCTTACATATCAAATCTTAATATAGGTCTATATTTTGGTAATGTAAGATTTCAATATTTCACTACGTATATCTAAAAGGAAAAGTACTAATTACCCCCCCTCCTGACTATCGCAGTCGACCAAATTACCCTCCCTAAACCCAAAAACCAGACATAGTTAACCCTAGACTTTTAATACCGGACAAATTACCCCCATCGACCCAATCCAGAACAGTTTTATCCTACGTGGTATTCCAATCACCATTTTGTTTATAAAAAAAATGTGGGACCCACATGTCATACTCCTCTTCCTCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCACGGGTCGGCGGTAGGCGGTGGGCGGCGCTGCGGGACGCGGAGGCGGCGGGTGACAAGGCACCGGCGGCGGCACGGGAGGCGGCGGCGACGGCGGGTGATGCGGGATGCAGAGGCGACAACGGCAGTCACGACGAGTAGCCGCCCCCTCGACGCGGGGACGGACGGAGGCAGGGTCGGGCCGCGGGTGGTGGGCGGGCGTGGACGGCGGACGCGGAGGCGGCACACACGGTGCCGCGGAGACCCTCCTGCGCCGGAGGGAGTTTGCCGAAGTTCTCTCCCGCTTCCTCACGAAGTTCGCCGCTCCCTCCTCTATGTCCTGCCCCCATCACCGCTGCCTCCGCGTGAGAGAGAGAAAGAGTGAGTGAGTGAGAGAGAGAATGTGTGATCGATAGAGCAAGAGGAGTATGACATGTGGGTCTCACATTAAAGGAAAAAGTACGAATTACCCCCCCCGAACTATCGCGGTCGTCCGAATTACCCCCCTGAACCACAAAACCGGACATTCTTCACCCCCAACTATACAAACCAGACGAATTACCCCCCTCGAACCAATTCAGAGCGGTTTTGAACAACGTGGCAATCCGGTCAGCGTTTTTTTAATTAAAAAATTGTGGGACCCACATGCCATCCTCTTCTCTTCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTTTCTCTCTCGCGGCTCACGGGGACGGCGCGGGAGCGGCGAGGACGGCGACGGCGGAGGTAGCGGCGGCGGCGGCGAGGCGAGGCGGCGGCCGAGGCAGCGAGCGCGGGGAGGCGAGCGGCGGGGCTGGGCGGCGGAGGAGGCGAGCGGCGGCGGGAGCTCGCGTTGCTCGCGGAGGAGGCGAGGTGGCGGCGAGGCGAGGCGGCTGGCGAGCCTGGTCGAGCTGCACCCCCTCCGAGGCGGACCCACCGGCGGCGACGCCGACCGCCGCGCCTCTCCCCTCCCTATCTTTCGTCGGCCGCCGCCTCGCCTCGCCGCCGCCGCACCCTGCCGCTGCTCGCCTCTTCCGCCGCCGCCGCCTCGCCTCCTCCGCAAGCAGCGCGAGCTCCCGCCGCCGCTCGCCTCCCCGCGCTCGCTGCCTCCCCCGCCGCCTCTGCCTCCGCCGCCGCCTCGCCTCGCCGCCGCCGCCGCCTCGCGCTCTCCGCCGCCGCTGCCTCCGTCGTCGCCGTCCCCGCGCCATCCACCGCGAGAGAGAAAAGCGAGAGAGAGAGAATAGAGAGAGAGGGGAAGAAGAGAAGAGTATGGCATGCGGGTCCCACATTTTTTTTTAATTAAAAAACACTGACTGGATTGCCACGTGTGCGCCACGTTGGATAAAACCGCTCTAAATTGATTCGAGGGAGGTAATTCGTCCGGTTTACATAGTTGGGGGTGAAGAATGTCCAGTTTTGTGGTTCAGGGGGTAATTCGGACGACCGCGATAGTTCGGGGGGGGGGTAATTCGTACTTTTTCCAAAATAAAATGCTAACTGAACTGTCACGTGTACGCCACGTAGGACAAAACCAACGATGTCTGGTTTTCAGGTTTAGAGGGGTAATTCGGTCGACCGCGATAGTTCGGGGGGAGGGTAATTCGTACTTTTTCCTATCTAAAATGACATCTATTGATTTATAAACGACCAGGTAATGTCCGGACATTTTTCATAGATCCAAGACATATGGGAGGATATATATGCTCCTTGTAGACTTTCACAGGCGCCAGACAGATCGACAGGTGACAGCCTAGAGTCGTTGGAAGGAACTTGATTGCTTCAAGCAATTGTTAGCATTATTATTTCTCCATGACCAGATTCCACATTAATTATCTAGTGGTTAAGTACAAACTAGTCCTCTTTTTGCCCAATTAAATAGCTAGTTTACCTACCAAAAGTTCAAAAATTAAGTGCCGGACGGTGCATATATTATATCAAGCTGAGTTATACTAACCCATTTTTTCTTAAAAGTTACACTTTGGGGGTTAAATTTAAGTTAACCCTT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seq		ATGAATGTACGCTTAGGTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTATACGATCATGGCACCGACATGCAAACCACACACCTGGTTGGCACCATAGGGTATCTTGCCCCTGAGCTAGCAAACACAGGTAAGGCTTCACCCGCCACCGATGTTTTCTCCTTCGGCATATTTGTTCTTGAGGTTACTTGTAGACGAAGGCCCATTGAGCACGGGATGAATAGTGAGTACAAGTTCACGTTGGTAGATTGGGTGATTGATCGTTGGCACGAGGGATCACTTCTTGAGGCAATGGATCCAAAGCTCCAAAATAACTATGATGATGATGAAGCATGCCTTGCTCTAAAACTAGGATTGCTTTGCTCACACCCATCATCTATTGCAATTGCAAGGCCAACCATGTGGCATGTAATGCAGTATCTTAACCATGACTTGCCATTTCCAGAGTTGATGGCGACGGACATGGTGCGAAACCGATGCGTGGACTCACCTATTTCATATTGCCAATCAGTGGCTTTCGTTAGAGCCATGCCTGTCGTGAATCGCTGGTGCTTCCTTCCAATACTCTTTTTCATCTCCATACTGCTAGTTATCATTCTGCCATCCTTGGCTACAACCCTAGGAGACGGCCAATTTGTGTACTACGGCTTCGCTAACAGTAATCTCATCGTCGATGGAGCTGTCACGGTGTTACCAGAGGGCTTGCTCGAGCTGACCAATGGTACGGTCAATCAGAAAGGCCATGCCTTCCACCCGACTCCTTTCCGGCTCCGTAAGTCGCCCAACTCCGCGGTGCAGTCCTTCTCCGCCTCCTTGGTGTTTGGCATCGTCTCTCCCTTGTTGCATGCCAGCACAGAGGGCATGGCCTTCTTTCTTGCCCCAAGCTCTAATTTTTCTGATGTGTTACCGGCACAGTACCTAGGACTGTTCAATTACAGTAACAACGGCAATTTGAGCAACCATATTTTTGCTGTTGAGATCGACACTGCACAAAACAACGAGTTTATGGACATAGATGGCAACCATGTCGGCATCGACATCTGCGATCTTCACTCGGCAACATCTTCTTCTGCAGGCTACTACGATGACATCACTGGTTCCTTCCGAAACTTGAGTCTGATTAGTGGCGAGGCCATGCAAATTTGGATCAACTACGATGGAGAGGCAACATGGATTGATGTGGCTTTAGCTCCATTCAAAATGGCCAGACCCACCAAGACACTCCTGTCAATGTCCTATAACCTCTCAGCCGTGCTCACAGACGTTGCATACGTTGGTTTATCAGCTGCAACAGGTCAAATAGAATCGAGGCACTATATCCTAGGCTGGAGCTTTAGTATGAATGGACCAGCCCCGCCTTTCTTCACAGCTCATCTACCAAATCTACCTAAAGCTCGTGTAGATAGAAAAGCTACTCAGCTCATCTTGCTGCCACTAATTTTTCCTCTAGCAACTCCCACATTTGTCTTTTTGGTGATCTTGGCCATCTTCTTCTTTGTGCGGAGAAGGCTGAGGTATGCTGAGTTGCGAGAAGATTGGGAAATTGAGTTTGGACCACATAGGTTCTCATTTAAGGACCTATATTTAGCCACTGAAGGGTTTAAGAATAGTCATCTCTTAGGCACTGGAGGATTTGGAAGGGTGTACAAGGGTCTTCTTTCCAAGTCTAAGTCACAAATTGCAGTGAAGAGGGTGTCCCATGAGTCGAGACAAGGCATAAGGGAATTTGTTGCTGAGGTTGTTAGCATCGGCCGCCTTCGACACCGGAATATTGTACAGCTACTTGGCTATTGCCGGCGTAAAGACTGGATTCAACGGTTTCGAATAATCAAGGGTGTTGCATCTGGTTTATGGTACCTTCATGGAGAGTGGGAGCAAGTTGTCATCCACAGAGACATCAAAGCCAGTAATGTGCTTCTTGATGAAGAGATAAATGCACGCTTAGGTGATTTTGGCCTTGCAAGATTATATGACCATGGCACTGACATGCAAACAACACGCCTGGTTGGAACTATAGGATATCTTGCCCCTGAGTTGTTACAAAAAGGTAAGGCTTCACCCCTAACTGACGTGTTCGCCTTTGGCATATTTGTTCTTGAGGTTACTTGTGGACGACGACCCATTGAACACAAGATGAATAGTGATCAGCTCAAATTAGTAGACTGGGTGATTGATTGTTGGAACGAGAGATCACTTCTTGAGGCAATGGATCCAAAGCTCCAAAATGAGTATGATGCTGATGAAGCATGCCTAGCTTTGAAACTAGGATTGCTTTGCTCACACCAATCACCTGCTGCAAGGCCAAGCATGTGGCATGTCATGCAGTATCTTAACCATGACTTGCCATTTCCCGAGTTGGCGCCAATGGACATGGTGCAGAACCGTCAGGTGGACTCACCCGTTGCATATTGCCAATCAGTGGTGAGCGATGGCACCATCTCTGGCCTCTCCGAAAGGAGCATGAAGCAGTATACTTTGCCTATCATCCTCTTCCTTACCATAAGCATTAGCCTTTTAGCCATCAGTGCTAGTGGAGATCATGACCAATTCATCTACACCGGCTTCACCGGTAGCAATCTAACTCTAGATGGTGCAGCAAAAATCACAGCCACCGGCCTTCTTGGGCTGACAAATGATACATTCCGGATCAAAGGCCATGCATCTCACCCAGCTCCGCTACGCTTCCGCAAGTCCCCCAATGGCACGGTGCAATCTTTCTCTGTCTCCTTTGTATTTGGTATTCTCTCTTCATTTGGTGATATAAGAGGCCATGGATTTGCTTTCTTCATTGCCCCAAGCAATGATTTCTCCACTGCCTTTCCAATCCAATTTTTGGGTCTTCTTAATGATATAAACAATGGCAGTTCGACCAATCACCTCTTTGCAATTGAGCTTGATACCATTAGGAATGATGAGTTCGGGGACATCGACAATAATCATGTCGGGATTGATATCAACAGTCTCAACTCAGTAAGATCCTCTTATGCCGGCTTCTATAATGACAACAATGGCGCGCTCACAAACGTGAGCCTCATTGGAGATAAGCCAATGCAAGTTTGGGTAGAGTATGATGGGAATGCCACACAAATTGATGTGACATTAGCTCCTCTTGGTATTGGAAGACCTAAGAGACCACTACTCTCTGTAGTCCATAACCTCTCAACAGTGCTAACAGATCAAGCATACCTTGGCTTCTCATCCTCAACAGGCTTAAGCACAGGACATCACTATATTGTTCTACCAATAGCATCAGCAATATTCGTACTAGCTATTGGTGTTGCTATTGTTTTACTCGTGAGGAGACATTTAAGGTATAAGGAGGTACGTGAAGATTGGGAGGTTGAGTATGGCCCGCACCGTTTCGCTTACAAAGATTTATTTGATGCCACTAAAGGATTTAAGAACAAAAACTTGGTAGGCACAGGTGGGTTTGGAAGGGTGTACAAAGGGGTGCTTCCTAACTCTAGACTAGAAGTTGCTATAAAGCGGGTTTCGTATGAATCGAAGCAAGGTATAAAAGAATTTGTCGCTGAAGTTGTAAGTATAGGCCATCTTCAACACCGCAATGTTGTGAAATTGCTTGGATATTGTAGGAGAAAAGGTGAACTTCTTCTTGTGTATGACTACATGGCAAATGGAAGTCTAGACAAATACTTGTATCGACAAGAGGGCAAACCAACTTTAAATTGGGGACAAAGGTTTCAAATTATCAAAGACATTGCATCTGGTTTGCTCTACCTCCATGAAGAATGGGATAAAGTTGTCATTCATCGTGATGTCAAGGCAAGCAATGTGCTTCTCGACAAACAACTGAATGGACGACTGGGAGATTTCGGTCTTGCAAGATTATATGACCACGGCACTGACCCACAAACCACACATGTTGTTGGCACAATAGGATACCTAGCTCCAGAGCTAGTACACAGAGGAAAGGCAACCACTCTTACTGATGTCTTCTCATTTGGCATATTTATTCTTGAGGTTACTTGTGGGCAAAAGCCTATCAAGGAAGACTCACAAGGCAGACAACTTATCTTGGTTGATTGGGTGCTTCAGAACTGGCACAAAGGATCACTTCTTGATACAGTGGATATCAAGATCCAAGGTAACTATGATATAGGAGAAGCATGTCTTGTACTAAAGCTGGGATTGATGTGTTCGCACCCATTTCCTAATGTTAGGCCCAATGTGCGACAAGTTATGCAATATCTCGATGGGGATGTGCCACTACCAGAGCTTAAACCGGAGCACTTCAGCTTTGACATGTTAGCATTGATACAAAAGCAAAATGAAGCAAACATACCTCATATGGAGCATCTGTCCCTCCTTTTACCCCTCATCGCCCTAGCCCTAAACCTTGCCATCACCATGAGCGAGGACCAGTTCGTCTATTCGGGCTTCTCCGGCAGAAACCTCACCCTTGATGGTGCAGCAACAGTTACAGATGATGGGGTTCTTGAGCTGACCAATCGCACCGTCCACATCAAAGGCCATGCGTTCTACCCAACTCCATGGCAATTCAGGAAGACGCCCAATGGGACGGTGCAATCCTTCTCAATTAACTTTGTGTTTGGCATGATTCCTGTCTACTCTAATGAAAAATGTACCGATGGCATGACTTTCGTGATCTCTCCAACCAGTGATATGTCAAGTGCTCAGGACTCCCAATACTTGGGTCTACTCAACAAAACATCAGATGGAAAAGCAAGCAACCACATTTTTGCAGTCGAGCTTGATAGTAGCCAAAATACCGAGTTCCACGACATCGACGACAACCACGTTGGCATCGACATCAACAATCTCACCTCAGTTCAATCTCGGCCAGCTGGTTTCTATAGTGATAACAAGAGTATCTTCAACAATTTGTCCCTCTGTAGCTACAAGCCAATGCAAGTATGGGTTGACTACAACGAAGACACCACACAGATCAAGGTGACCATGGCTCCCATTGAGGTAGGCAAACCATTGAGGCCACTGTTGTCAGAAATTCATAACCTCTCACTTGTG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Protein seq		MNVRLGDFGLARLYDHGTDMQTTHLVGTIGYLAPELANTGKASPATDVFSFGIFVLEVTCRRRPIEHGMNSEYKFTLVDWVIDRWHEGSLLEAMDPKLQNNYDDDEACLALKLGLLCSHPSSIAIARPTMWHVMQYLNHDLPFPELMATDMVRNRCVDSPISYCQSVAFVRAMPVVNRWCFLPILFFISILLVIILPSLATTLGDGQFVYYGFANSNLIVDGAVTVLPEGLLELTNGTVNQKGHAFHPTPFRLRKSPNSAVQSFSASLVFGIVSPLLHASTEGMAFFLAPSSNFSDVLPAQYLGLFNYSNNGNLSNHIFAVEIDTAQNNEFMDIDGNHVGIDICDLHSATSSSAGYYDDITGSFRNLSLISGEAMQIWINYDGEATWIDVALAPFKMARPTKTLLSMSYNLSAVLTDVAYVGLSAATGQIESRHYILGWSFSMNGPAPPFFTAHLPNLPKARVDRKATQLILLPLIFPLATPTFVFLVILAIFFFVRRRLRYAELREDWEIEFGPHRFSFKDLYLATEGFKNSHLLGTGGFGRVYKGLLSKSKSQIAVKRVSHESRQGIREFVAEVVSIGRLRHRNIVQLLGYCRRKDWIQRFRIIKGVASGLWYLHGEWEQVVIHRDIKASNVLLDEEINARLGDFGLARLYDHGTDMQTTRLVGTIGYLAPELLQKGKASPLTDVFAFGIFVLEVTCGRRPIEHKMNSDQLKLVDWVIDCWNERSLLEAMDPKLQNEYDADEACLALKLGLLCSHQSPAARPSMWHVMQYLNHDLPFPELAPMDMVQNRQVDSPVAYCQSVVSDGTISGLSERSMKQYTLPIILFLTISISLLAISASGDHDQFIYTGFTGSNLTLDGAAKITATGLLGLTNDTFRIKGHASHPAPLRFRKSPNGTVQSFSVSFVFGILSSFGDIRGHGFAFFIAPSNDFSTAFPIQFLGLLNDINNGSSTNHLFAIELDTIRNDEFGDIDNNHVGIDINSLNSVRSSYAGFYNDNNGALTNVSLIGDKPMQVWVEYDGNATQIDVTLAPLGIGRPKRPLLSVVHNLSTVLTDQAYLGFSSSTGLSTGHHYIVLPIASAIFVLAIGVAIVLLVRRHLRYKEVREDWEVEYGPHRFAYKDLFDATKGFKNKNLVGTGGFGRVYKGVLPNSRLEVAIKRVSYESKQGIKEFVAEVVSIGHLQHRNVVKLLGYCRRKGELLLVYDYMANGSLDKYLYRQEGKPTLNWGQRFQIIKDIASGLLYLHEEWDKVVIHRDVKASNVLLDKQLNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELVHRGKATTLTDVFSFGIFILEVTCGQKPIKEDSQGRQLILVDWVLQNWHKGSLLDTVDIKIQGNYDIGEACLVLKLGLMCSHPFPNVRPNVRQVMQYLDGDVPLPELKPEHFSFDMLALIQKQNEANIPHMEHLSLLLPLIALALNLAITMSEDQFVYSGFSGRNLTLDGAATVTDDGVLELTNRTVHIKGHAFYPTPWQFRKTPNGTVQSFSINFVFGMIPVYSNEKCTDGMTFVISPTSDMSSAQDSQYLGLLNKTSDGKASNHIFAVELDSSQNTEFHDIDDNHVGIDINNLTSVQSRPAGFYSDNKSIFNNLSLCSYKPMQVWVDYNEDTTQIKVTMAPIEVGKPLRPLLSEIHNLSLVLEEPSYIGFSASTGPINTLYCVLGLSLGINRPAPAIDLSKLPKLPRVSPKPRTKLLEIILPIATATFILIVGTTIVLLVRRRMRYAELHEDWEAEFGPHRFSYKDLFHATDGFKNRNLLGLGGFGKVYKGVLPTSKLHVAVKRVSHDSKQGMKEFIAEIVSIGRLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMPNGSLDKYLYCEDSKPTLDWAQRFQIIKGVASGLFYLHDRWEKIVIHRDVKASNVLLDGEMNGRLGDFGLAKLYDHGADPQTTHVVGTMGYLAPELARTGKATPLTDVYAFGIFILEVTCGQRPIDNYADDNSQMLIDCVVEHWHKGSLTNMLDKRLLGDYDADEFSFFNTFTSYARVLLLDLFFFLFISNLSALATGEDQFIYSGFNGANLTLDGVASVTPDGLLKLTNGTLRLQGHAFHPTPFSFKKKPNGTVNSFAVSYIFAIYCLRPVICGHGIAFVVSVSKNFSTAMASQYLGLINDHNNGDPTNHFFAIELDTNQNDEFNDVNNNHVGIDINSLTSLNSSSVGYYTDSNGNFNNITLTSYKMMQVWLEYNGDNRQINVTLAPIKMAKPVKPLLSTYYDLSTVLTDMAYVGFSSSTGSFVARHYVLGWSFGINKPAPAIDISKLPKLPYEGEKTHSKVLEITLPIATATFVLAMIALIILLIRRRLRYAEIREDWEVEFGPHRFSYKDLFCATEGFKNKNLLGIGGFGRVYKGLLPTSKLEIAVKRISHDSNQGMKEFVAEIVSIGHLQHRNLVQLHGYCRRKSELILVYDYMSNGSLDKHLYGQENNSTLTWAQRFQIIKDIASGLLYLHEEWEKVILHRDIKPSNILLDDNMNGRLGDFGLARLYDHGTDPQTTHVVGTIGYLAPELARTSKATPLTDVFAFGMFVLEVTCGRKPIDHTAQDNQLMLVDWVLHCWHQGFLNDAVDIKLQGVYNIDEACLALKLGLLCAHPFINKRPSMRHVTQILNREMELPELTPTHMSFNMLSLMQNQGFDPETMTNQFLISNSTLSDLSEVRQTSHTKFFFLFLLVSFGINCASFTNTSDDQLLYLGFTSANLITDDTTVVTSNGLLELTNGTINRKGHAFYPSPLHFRKPHNNKVHSFAVSFVFAIRSSYPRMSLHGLAFVVSPSINFSNALAIQYLGLLNSKNRGSKSNHILAIEFDTILNIEFEDIDDNHVGIDINDLHSIKSHSAGYYDDRNSSFQNMSLISGDAMQAWVDYNGEDKKISVTMAPIKMAKPKRPLILISYDLSTVLKEPSYIGFSASTGLVDSRHYILGWSFGMNKPAPMINVNKLPKLPRQGPNPQPKLLAITLPIASATFVILFCGVFITIVRRRLRYVELKEDWEIEFGPHRFSYKDLFHATHGFDNKNLLGAGGFGKVYKGVLPSSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVVSIGRIRHRNIVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDAYLYNNELKPTLSWDQRFRIIKGIASGLFYLHDKWEKVVIHRDIKASNVLLDTEMNGRLGDFGLARLYDHGTDLQTTHVVGTMGYLAPELVCTGKASPLTDVFAFGAFLLEVTCGQRPVNHSSQDSPGVLVDWVLEHWQKGLLTNTVDARLQGDYNIDEACFVLKLGLLCSHPFTNMRPNMQQVMQYLDGDVPLPELTQMDMSFSIISMMQDEGFNPYTLSSYPPPGTSIVRCLTEQTKEQLGSLHVSLAVSLSDKDRKGIEDYAEDSCSLASYMIRVKPGLLPVQPSPKHLCTFWHLNSLVLHKLHMENQPVLFSAVFILYVSFLGPFCASSGEESFVYSGFASTGAANLTLDGSAMVTTTGLLQLTDSMPNIQGHAFYPTPLRFKKQSNGIVQSFSVAFMFGIISPYSDASTDGMAFVVAPNKGFPDAKAAQFLGLLNISSDNSTSNHMFAVEIDTAQNTELDDIDGYHVGIDINSLHSKKSQHIGFYNDQHGGLLKNLTLTGSNCKPVQVWVDYDGETTQINVTLAPIKVTKPTRPLLSVPFNLSTVLTDQAYIGFSAATGPLTSHYYVLGWSFAMNAPAPPIEISRLPRLPCPGDNRLQKILQILLPIVAVALIFIVVMILVRRQQRYAELREDWEVEFGPHRFSYKDLFNATEGFKSKHILGVGGFGKVYKGVLRTSKLEVAVKKVSHGSNQGMKEFISEVVSIGHLRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGEDNKPVTCGRWPISNSAHHGRKMLVDWVLQHWHQGSLPETVDPKLHGIYNVDEACLVLTLGLMCSHPIPGARPIMRQVMQYLDGDAPLPEFTPATLNSSLLAIMHNEGVDPYVAQYPWSGNSLGTMTPDIFMKIMLFGLLAVLAGCSDAVDQFVYSGFTGSNLTLDGGARVTPSGLLELTNGMVRLKGHAFHPTPLHLHESPNGTVQSFSISFVFAILCDYPDSCGHGLAFFIAPSKNFASAFWTQYLGLFNNKNNGDPNNHIFAIELDTVQNDDLQDISNNHIGININSLYSMKSRDAGFYDDKSGDFKNLTLISQKAMQVWVNYDREITQINVTMAPLNVEKPVKPLLSTTYNLSTVLTDSAYIGFSSSTGTVSGKHYVLGWSFGMNSPAPSIDIAKLPRLAVVFLLSAGTTIFLCMRRNLRYAELREDWEVEYGPRRFCYKDLFDATEGFKNKHLLGTGGFGSVYKGVLPISRLDIAVKRVSHDSTQGMKEFIAEIVSIGCLQHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMPNGSLDKYLYGKEGKPTLDWTQRFQIIKGVASGLLYLHEESEKVIIHRDIKASNVLLDNDTNARIGDFGLARLYDHGTDPETTRVVGTIGYLAPELARGGKATPLTDVFAFGMFILEVTCGQKPVMQNTEDDQLVLIDWVLEHWHKGSLADTVDIKLQGEYNIDEACLALNIGLLCSHPLISVRPNMRQVVQYLNKDIPLPESMPTHLSFYVMALIQNKGFSPCTITDPSSATSFGTISSTSLSEGR
Function		L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6]

Transcripts

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
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CDS 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Protein seq	MKGSTHIHYHHILLQGLASAQYLTSLEEDDKLGAFMCTCVASVILCTESCNVGAGLRLLQFLSLILLNNSVLFGLLHASFTIY

Event Type

Chromosome

Start

End

Strand

Alternative mRNAs

Total mRNAs

Source

Expression

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Homologues

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Genome & Annotation	Homologs	Type	Leaf	Root	Panicle
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Azucena \| AzucenaRS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsAzu_07g0001950	RBH	0.138186	0.0	0.493449
KETAN NANGKA \| Os128077RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKeNa_07g0001920	RBH	0.0	0.0	0.0
CHAO MEO \| Os132278RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsCMeo_07g0001880	RBH	0.280276	0.0	0.0
ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsARC_07g0001790	RBH	0.008926	0.007383	None
PR 106 \| Os127742RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsPr106_07g0001800	RBH	6.989861	2.384900	3.853860
Minghui 63 \| MH63RS3 \| HZAU	OsMH63_07G0027200	RBH	0.1850135	2.791356	0.0083665
IR 64 \| OsIR64RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsIR64_03g0035680	RBH	0.0	0.067270	0.593011
Zhenshan 97 \| ZS97RS3 \| HZAU	OsZS97_07G0023900	RBH	0.4230785	0.4166815	1.458169
LIMA \| Os127564RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLima_07g0001840	RBH	0.053163	0.000000	None
KHAO YAI GUANG \| Os127518RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKYG_07g0002000	RBH	0.155222	0.0	None
GOBOL SAIL \| Os132424RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsGoSa_07g0001870	RBH	4.694378	0.000000	None
LIU XU \| Os125827RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLiXu_07g0001920	RBH	0.0	0.0	0.0
LARHA MUGAD \| Os125619RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLaMu_07g0001930	RBH	0.0	0.0	None
N22 \| OsN22RS2 \| Gramene(+IsoSeq)	OsN22_07G001960	RBH	0.0	0.0	0.0
NATEL BORO \| Os127652RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNaBo_07g0001920	RBH	0.470775	0.000000	0.283206

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