Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_07g0001800 | OGI:07004740 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:1640311-1712905 | ||||||||
Gene Symbol | RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35, RLCK226, OsRLCK226 | ||||||||||
DNA seq | 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||||||||||
Function | L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_07g0001800 | OsPr106_07g0001800.01 | Chr07 | 1675254 | 1712905 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MRHMYKRLILCQLIFLGHDLASFTIAEEQFIYSGFSQANLSLDGTATITPEGLLQLTNGTFNLKGHALYPAPLQFRRHPTGDVQSFSLTFIFSILSAIPDKGADGMAFFISTNKSFSNALPAQYLGILNDQNNGNTSNHIFAVELDTIQNSEFQDISDNHVGININSLHSVQSRDAGFYDDKNGVFKNLTLVSRDVMQVWVEYDAGSTQIDVTLAPIKVAKPTLPLVSAIYNLSTVLPGTAYIGFSSATGVINSRYYVLGWSFSMGGTASGIDIRKLPKLPHVGPRPRSKVLKIIMPATIAASIFVAGALLVLLITCGQRPVKQNAQGDRFMLVDWVLEHWQKGSMVETIDKRLQGNCNINEACLVLKLGLLCSQPFARSRPSMNHVMLYLNGDMPLPEFTPTDTSLNMLALMENRGLDPSGLICLLLLAGASLAACTAGDGNDDDHQFVYSGFTGSNLTLDGAAVITRTGLLELTNGTLRQKAHAIHPAPFRLRGGSSSSSTATATATATRSFSASFVFAILCPDADACGHGIVFFVAPANHSFSGAFPSQYIGLFNGSSDGDAGNHLVGVELDTDQNNEFRDIDGNHIGVDINSLTSINSTSAGYYDDNDGGNSGDHGFHNLTLASHGEAMQVWVDYNGTAKQITVAMAPLKMAKPSKPLLSSTYDLSTVFVADEPYMVGFSSATGSFNSRHYVLGWSFAMDGPAPAIDIDKLPKLPRFAPKHKPKMVEIIPPLATATFIVALGTVSVLLIRRRMRYTELREDWEVEFGPHRFSYKDLFRATDGFKSMNLVGVGGFGRVYKGVLQSSKLEIAVKRVSHDSKQGMKEFIAEVVSIGRLQHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYEYMANGSLDKHLYSEGDKRVTCGRRPIMQVPEGEQHVLVDWVLEHWHKGSITEIVDTKLHGNYNVDEVCLVLKLGLLCSHPLSNARPNIRQVMKYLTGDMAMPELVPTHHSFHTLALMQNQGFDSYIALSFLLHILLFHGFNLVLAVSASDDQFVFSGFSGANVTLDGTATVTAGGLLELTNGTTQLKGHAFFPAPLSFRGSLNGTVQSFSASFVFAILTSYPNLSCHGIAFVVAPSNNLSTALAAQYMGLTNIDNNGNASNHIFAAEIDTMQNVEFQDINNNHIGVDINGLHSVESHYAGYYDKNGSFHNMNLISGDVMQAWVDYDGDIAQINITIGPIDMSKPGRSLISTTYNLSDVLMEPSFIGFSSATGPINSRHYILGWSFGMNKPAPNIDIAKLPKLPRLAPKPQSKVLVILLPIAIAAFILSVGIAMVFLVRRRQRYAELREDWEDEFGPHRFAYKDLLHATDGFSDKHILGAGGFGRVYKGILPKSKLEVAVKRVSHESRQGMKEFVAEVASIGRIRHRNLVQLLGYCRRKGELLLVYDYMSNGSLDRYLHYEGNKPVLDWVQKFQIIKDVASGLLYLHEKWDKVVIHRDIKASNVLLDKEMNARLGDFGLARLYDHGTDAHTTHMVGTMGYLAPELIHTGKASTLTDVFAFGTFLLEVICGQRPIKEDAHGNQILLVDWVLEHWHNESLLDTVDPRLQGDYNVEEACLVLKLGLLCSHPSTNARPCMQQVVDYLEGDTPVPELASTHRNFNELASMRKKGFDPYIMSYNPSSTEEDDIHVLCVVGANELLVVAASGNDGGGGRFVYSGFAGANLTLDGTATVTPAGLLELTNGTLQLKGHAFHPTPLRFGFGSGGGGGGDGVVVRSFSASFVFGILSAYPDMSAHGIVFLVSPTTDFSAALASQYLGLVNVTSNGDARNRIFAVELDTLQQDEFRDINDNHVGVDINGLVSLQSTSAGYYAADINGGGFRNLTLISHEAMRVWVDYDAGDARIDVTLAPLAVAKPVRPLISAAYNLSSVITDTAYVGFSSATGSFNSRHYVLGWSFAVDGGPAPAIDVAKLPKLPREGPKARSKFLEIFLPIASAAVVLAMGILVILLVRRRKRYTELREDWEVEFGPHRFPYKDLHHATQGFESKCLLGVGGFGRVYKGVLPNSNVEIAVKRVSHDSSQGVKEFVAEVVSLGRLQHCNLVRLLGYCRRKGELIPIYHDSHGTQVMLVDWVLDHWHKQSLVDTVDLKLHGEFDVGEACLVLKLGLLCSHPFINARPDMRRVMQYLKREVALPELMPTSMSFHMLALMQNDGFDSYFIYSGFHGSNLTVDGAASITPDGLLQLTDGAAYLKGHAFHPSPVRLRRDVSTSTTTTTVRSFSVTFVFGIVSVYPDFSAHGMAFVVSPTTNLSSSLPAKYLGLTNVQNDGNASNHMLAVELDTIQSVEFRDINANHVGVDINGLQSVRAYNAGYYDDVSGEFRSLKLISRQAMQVWVDYHGGEKKQLDVTMAPLRMARPVKPLLSVTHDLSTVLADVVYLGFSAATGRVNSRHCVLGWSLGINGPAPAIDIDKLPKLPRAGPKPRSRVLEIVLPIVTATIVLVVGGAIVMVVRRRSRYAELREDWEVEFGPHRFSYKELFRATDGFADKHLLGSGGFGKVYRGVLPKSKLEVAVKKVSHESRQGMKEFVAEIVSIGRIRHRNLVQLLGYCRRKGELLLKPIKEKNPQGSHIALVDWVLEHWRDGSLMDTVDGRLHGEYDAGEAALVLKLGLLCSHPFAAARPGMGQVTCCLAGEAPLPELTPADMGFDVLAMMQDKGFDTSVVSRKITRLFVYKFHTTSITNGDDNHQFVYNGFTSANNLSLDGVAMVTPDGLVELTNDGIRVKGHAFYPSPLHFRETPNGTVQSFSVSFVFGIVPTFSDLNSGHGITFVIAPSKNFSDAIAAQYFGLFNSETNGNDRGHIFAIELDTVKNTEFGDMNDNHVGIDINNLTSLQSYPAGYYEESGRFKNLTLASMEAIQVWVDYDREATRINVTMAPLAMAKPVRPLLSATYNLSGLLMERSYIGFSSSTGATSARHYLLGWSFSMNGGTALAIDIAKLPKLPRVGPKSDPSNLLQIILPVATAAFLVAVGATVFLLVRRRMRYTELREDWEIDFGPHRFAYKDLFHATEGFQNKNLLGTGGAGRVYKGMLLGSKQEIAVKKIPQNSKESMKQFVAEIVSIGCLDHRNLVHLLGYSRRKGELILVYEYMSNGSLEKYLYALEITCGQKPMKQNAQGIQQTLVGWVLECWKKGSVVDAVDANLQADYDNAEAGERVSNLYAMSYSSLPIPSPAMKYTFLLFLCLVSFVTSSEHQFVFSGFTGSNLVLDGAATITEDGLLELTNGANNIEGHAFYPTPLRFRKSPNDMVQSFSVSFAFSILQKYANRSNDGMAFFIAPSKNFSDASLPAQYLGLLNNQNNGNRSNDLFAVELDTFQNKEFQDMDDNHVGINVNSMKSLDAHYAGFYEDRSGIFRNLTLVIHEAMQVWFDYDGDAKKISVTLAPARLAKPKRPLLSVTYDLSTVVADSAYIGFSAATGGVVNTKHCVLGWSFRMNGPAQAIDISRLPKLPNLGSKKSHSSRILVIISPVATAALIFLVGVLLVLCVRRRLKYTEIQEDWEVEFGPHRFSYKVLYDATEGFKDKNLLGVGGFGKVYKGVLPVSKRVVAVKCVSHESSQGMKEFVAEIVSIGQLRHRNLVQLLGYCRRKVTCGQRPLNNNQQDNQPPMLVDWVLEHWQKGLLPETVDKRLQGNYNVDEACLVLKLGLLCSHPIAMERPTMSQVQRYLDGDAPLPELAPSELKFNMVALMQGQGFDSYVLPCLSLSSVVSIETSPEVDDDTASV
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_07g0001800 | OsPr106_07g0001800.03 | Chr07 | 1683300 | 1685632 | - | IsoSeq | ||
CDS seq | atgaagggttcaacccatatacactatcatcatatcctcctccagggactagcgtcggcacaatatctaacatctctggaggaagatgataaacttggtgctttcatgtgtacttgtgtggcatcagtgatattatgtaccgagtcatgtaatgttggggcagggcttagattattacagttcctttctttaatcttgttaaataacagtgtactgtttggcttactgcatgccagttttaccatttac
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|||||||
Protein seq | MKGSTHIHYHHILLQGLASAQYLTSLEEDDKLGAFMCTCVASVILCTESCNVGAGLRLLQFLSLILLNNSVLFGLLHASFTIY |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 6.989861 | 2.384900 | 3.853860 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0129900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g03900 | RBH | 0.203228 | 0.082914 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0575750 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0009620 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0009760 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.384915 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0009630 | RBH | 0.000000 | 1.416675 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0001840 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_03g0035910 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0027200 | RBH | 0.1850135 | 2.791356 | 0.0083665 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0001860 | RBH | 0.383437 | 0.079820 | 0.301511 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0023900 | RBH | 0.4230785 | 0.4166815 | 1.458169 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0002020 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0002000 | RBH | 0.155222 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0002010 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0020460 | RBH | 0.034479 | 0.0 | 0.455765 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0001980 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G020110 | RBH | 0.140949 | 0.0 | 1.207232 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0001850 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |