Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_07g0001800 OGI:07004740 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:1640311-1712905
Gene Symbol RLK, RLCK221, OsRLCK221, YK35, RLCK226, OsRLCK226
DNA seq

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Function L-type lectin-domain containing receptor kinase SIT2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XUN6]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_07g0001800 OsPr106_07g0001800.01 Chr07 1675254 1712905 - NAM
CDS seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_07g0001800 OsPr106_07g0001800.03 Chr07 1683300 1685632 - IsoSeq
CDS seq

atgaagggttcaacccatatacactatcatcatatcctcctccagggactagcgtcggcacaatatctaacatctctggaggaagatgataaacttggtgctttcatgtgtacttgtgtggcatcagtgatattatgtaccgagtcatgtaatgttggggcagggcttagattattacagttcctttctttaatcttgttaaataacagtgtactgtttggcttactgcatgccagttttaccatttac

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Protein seq

MKGSTHIHYHHILLQGLASAQYLTSLEEDDKLGAFMCTCVASVILCTESCNVGAGLRLLQFLSLILLNNSVLFGLLHASFTIY

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 6.989861 2.384900 3.853860

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0129900 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g03900 RBH 0.203228 0.082914 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0575750 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0009620 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0009760 RBH 0.0 0.0 0.384915
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0009630 RBH 0.000000 1.416675 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0001840 RBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0035910 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0027200 RBH 0.1850135 2.791356 0.0083665
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0001860 RBH 0.383437 0.079820 0.301511
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0023900 RBH 0.4230785 0.4166815 1.458169
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0002020 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0002000 RBH 0.155222 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0002010 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0020460 RBH 0.034479 0.0 0.455765
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0001980 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G020110 RBH 0.140949 0.0 1.207232
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0001850 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
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