Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_06g0020770 OGI:06063770 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr06:22759320-22782761
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_06g0020770 OsCMeo_06g0020770.01 Chr06 22759320 22782761 + NAM
CDS seq

atggcctgtttgggtgtcctgtcttcaggcattgtatggctttctctgttcaccatctttgtcagtataccattagctaccagtgatgatcatgaaaatgatcgacaaactctcctttgcttcaagtcccagctctcaggtccaacaggagtactagattcatggagcaatgcatccttggagttctgcagttggcatggtgttacttgcagtacacaatctccccgtcgtgtcgcttcaatagacttggcatcagaaggcatctctggcttcatatcaccctgcattgccaacctcaccttccttacaaggttgcaactatcaaacaatagcttccatggcagcataccatctgagctcggcctactcagccaactcaacaccctcaacctcagcacgaacgctctagaaggtaacattccttctgaactttcttcgtgctcccaacttgaaatcctagatttgtcaaacaatttcatccaaggtgaaataccagctagcctaagtcaatgcaatcatcttaaagatattgacctcagcaagaacaagctcaaggggatgatcccttctgattttgggaacttgccaaagatgcaaataattgttctcgccagcaataggctcaccggcgacataccaccatctttaggaagtggccattcactcacatatgttgatcttgggagcaatgatctcacagggagcatcccagagtccttggtgaacagttcatctcttcaagtacttgtcctcacaagcaatacccttagtggagaactccctaaggctttgttcaactcctcatctcttattgctatttacctcgacgagaatagttttgttggttctataccacctgctactgccatttctctccctttaaaatatctttacttaggcggtaacaaactatcaggaacaataccttcctccttaggaaatctttcctccttacttgatctgagccttacacggaacaatttagtcgggaacgtcccagatagtttaggtcttattccaaaactagatctgctgaacttgaatgcaaacaacttaattgggcatgttccatcatctatcttcaacatgtcatccctgacaattctaaccatggcaaacaactcactcataggggaattaccatcaaacttaggttacacactcccaaacattgaaacattagttctgtccaataataggttcaaaggattcatcccacctactcttctgaatgcttccgacctgagtttgctttacatgcgcaataatagtcttactgggctcattccattctttggatcattgaaaaatttgaaggaacttatgctgtcatacaacaagctggaagcagctgactggagctttatttcttcactatcaaattgctccaaattgactaaactattgatagatgggaacaatctcaaaggcaaactgccccactccattggcaatctttccagtagtctcaagtggttgtggataagagacaacaaaatttctgggaatataccaccagagataggcaatctaaagagcttagaaatgttgtacatggattacaatcttttgacgggtgatatacccccaacgattggaaatttgcacaacttggttgttctagccattgcccaaaacaaattatcaggtcaaatccctgatacgattggcaaccttgttaagctaactgacctgaagttggatcggaataactttagtggaggaatacctgtgactctagagcattgtactcaactggaaatactcaaccttgcccataattcactagatgggagaataccaaaccagatcttcaaaatttcctccttttcccaggagttggacctgtcacacaactacttatatggaggaataccagaggaagttggcaatctcattaatctgaaaaaacttagcatctcagacaacaggttgtccggcaacattccatccactctcggccagtgtgttgttctggagtctcttgagatgcaaagcaacttgtttgcaggaagcataccaaattcttttgagaacttggtaggcatccagaagttagatatttcacggaacaacatgtctggaaaaataccagattttcttggaaacttcagtttactatatgatctcaatttatcattcaacaattttgatggagaagttccagcaaacggtatttttcgtaatgctagtgtggtatcaatggaaggtaataatggcttgtgtgcaagaacattaatagaaggtatacctctttgctcaacacaagttcacaggaaaagaagacacaagtctctgagaaaacaggtgaagccaaatttgccacagtgtaatgagcataagttgaagaatataacatatgaggacattgccaaggcgacgaatatgttttctccagataacttaattggctcaggatcatttgcaatggtttataagggtaatctagagcttcaggaagacgaagttgctatcaagatttttaaccttggtacatatggagcacataagagcttcattgcagagtgtgaaacactaagaaatgtccgccatcgaaatcttgtgaaaatagtgactttatgttcttcagtggatgccactggggcagacttcaaagccctggtgttccaatacatgcgaaatgggaacctagacacatggctacatccaaaggctcatgaacttagtcaaagaaaggctctaaatatttgccaaagagttaatatagccttggatgtggcgtttgcattagattatcttcataaccagtgtgcaactccactaatacattgtgacttaaagccaagcaatattcttttggacctcgacatggttgcatatgtcagtgactttggcctagcaagatttatatgcaatagattgactgccaatcaagatacctcgacaaagtatggcatgagcaaggatatctcaaccaagggtgatgtctacagttttggaatacttttgttagaaattattactgggagaagcccaactgatgaaatatttaatggaagcacaactctgcatgaatttgttgacagagcatttcccaacaatatcagcaaggtaattgatccaacaatgctacaagatgacctggaagcaactgatgtaatggagaattgtatcattccgttgatcaaaataggcctatcttgttctatgccactgccaaaagaacgaccggaaatgggacaactctcaggtccaactgtagttctagcctcatggagcaacgcatccttggagcattgcaactggcatggagtcacatgcagcatgagagttcctcgccgtgttatcgccattgatctcccatccgaaggcatcataggcccaatatcaccttgtattgccaacatcacctctcttacaaggctgcaactatcaaacaatagtttccatggtggcataccgtctgagctcggcctcctgaaccaactcagaaaccttaacctcagcaggaattccctagaaggtaacataccatcagaactctcttcatgttcacaacttcagatcctagatctgcagagcaattccctgcaaggagagattccaccaagtctaagtcaatgtgttcatcttgaaagaattttccttgccaacaacaagctccaagggagaatcccctctgcttttggggaccttcctaaactgcgtgctctactcaacacgttgtcacttatcagcatttacctcaaccagaacaatttttccggttctataccacctgttaaaaccgtgtctccacaagttcaatatcttgatttaggagaaaactgtctcacaggaacaataccttcctctgttgggaacctttcctccctactttatcttcgtctttcacagaattgtttagatgggagcataccagagagcttaggacatattccaacactagaagaattgaacttgaatttaaacaacttttctggagcagttccaccatctctcttcaatatgtcatccctgacatctctggtggcggcaaataactcactcaccggaagattacctctagacatcggctatacactcccaaacattgaaggcttaattctttcagcaaataagtttaagggctcaatcccaacttcccttctcaatttaacccatctacaaatgctatacctagctgacaacaagttaactgggatcatgccatcctttggatcactgacaaacttggaggaccttgacgtggcatacaacatgctagaagcaggcgactggggctttatctcgtcactttcaaattgcacaagattgactaagctgatgttggatgggaacaatcttcaaggaaatctgccaagttctgtaggcaatctgtctagtgatctccaaagattgtggctaacaaataataaaatttccggacctataccacaagagataggcaatcttaagagcctcactgaattgtacatggattacaatcaattgtcagaaaaaatacctctaacaatcggaaatttgcgcaaattaggcaaactgtcctttgctcgaaacagactctctggtcaaatcccagatgacattgggaaacttgttcagctgaataatctaaatttggattggaacaacttgagtggaagcatacctgtgagtatagggtattgtactcaactcgaaatactcaaccttgctcacaattcactagatggaacaataccagagacgatctttaaaatttcttcactttcaatagtgttagacttgtcatacaattacttgtccggaagcatatcagatgaagtaggcaaccttgtcagtctgaataagctcatcatttcatacaacagattgtctggagatatcccatccactcttagtcaatgcgtggttctagagtatcttgagatgcaaagcaatttctttgtaggaagcattccgcaaacatttgtgaacatggtaggcatcaaggtgatggatatatctcataacaatttatcaggagaaattccacagtttctaacgttgttacattc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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.061624 1.131939 2.054540

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0587200 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0020830 SBH 0.110276 1.396708 1.281622
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CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0020870 RBH 0.123358 0.0 1.377383
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0020560 RBH 0.029425 0.109404 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0021030 RBH 0.0 3.202118 2.678037
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_06G0367200 RBH 0.9524215 2.2402625 1.868109
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0020360 RBH 0.049028 0.118818 0.430636
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0344000 SBH 1.5736375 1.5182465 6.9441035
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0020780 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0020850 RBH 0.202952 1.683499 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0020470 RBH 0.656196 6.885436 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0021120 SBH 0.042714 0.133546 0.067458
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0020740 SBH 0.0 0.843503 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G020590 SBH 0.194280 0.0 0.547646
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0020790 RBH 0.397143 4.674325 2.058036
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