Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsARC_01g0002480 | OGI:01002250 | 16/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:1949909-1968951 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK21, OsRLCK21, RLCK20, OsRLCK20, RLCK23, OsRLCK23 | ||||||||||
DNA seq | 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||||||||||
Function | LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F4HQ20] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsARC_01g0002480 | OsARC_01g0002480.01 | Chr01 | 1949909 | 1968951 | + | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MHTKLLLLPILASLQLLPGAANGATVDPSCPPATCGNLTITYPFWLGSQNQSSCGPPSFQLTCNDRASGPFLRNSYIKVLGFDYGRRSLVAVHALLAADAACTVMFNVSSAFAITDRFSISQSNRELYVLSRCRERLPPPDAVPVTNCRANSSGMYAYLGGSYGTGQTPVNNGGCELSVFLVLGSSNAADMTAANYRQLIAGGFLLEWEPVGDCNACTASGGRCRYDASTSAFACLCSDGGMRPSICDGKNRGKLALIVSLSAAAGLVFAFLAWLMYRQRQKFRSAICGVYSGNTKNEEEMLKKCESLALKRYKYSELKKITKSFEDNLGEGGYGVVFKGRLQNGRMVAVKILTVSKGNGEDFLNEVMSISRTSHVNIVTLLGFCLEGPKRALVYEYMPNGSLKNYIHSESSNLATGWEMLLKIVIGIARGLEYLHQGCNTRIIHFDIKPRNILLDHEFCPKIADFGLAKLCHLNESILSMAEARGTIGFIAPEVFSRGFGVVSTKSDVYSYGMLLLEIVKVRKNIKGIADNFSETFFPHWVYDSLVSEMQCCETAYGTEEIARKMTIVGLWCIQMTPETRPSMSRVIEMLERSISELEMPPKPFLCSPIHSTNVSSYKSVNFTICMPASSMSPASLLLLFSSLTLVAAAISADEQGGGSCSPRTCGNVTISHPFGFVPEQETDTKCGRLGFEVHCSNNTPYLGYYRRKYRFQVLDIFYGNSSLLVADVHKLDDFRNSSSKGCHVMTANTSSKVGQPFSVSSANLNLIFYNCTAETAAAAVRRDGGLVETKCSGGGTLVRVGGHYSDSGSYEEYSVEGCGATLVPVLGTSSGEANASSYEELISDGFLLTWQPPSAQVLRPGVHDGSPHLCILDNSSRLPESSQAFRTSADANPEEGCAASTVCGKVTISSPFAVVPEQATESKCGWLGFQVICRNDTPYLGYYKLGYRIQVLDIFYGNNSLLVSDVHKLGGFDVFSGASKEYSCHVPRTNTSSKVALPFSISTTNLNLFLYSCSKALVPRDGDGDLVETRCGNKTFARVGGNYSDSGDYPAFYMEGCNATVVPVLGTDARSYEQLIRDGFLLTWQGPPSSGNSRRSKLKLIVIVSLSATTSLILTCLVWITCRQKEKGSLLTLQKYVANESKIEEALKEYDSLAPKRYNYSELKKITRSFKDKLGQGGYGMVFKGILQDGRIVAVKLLTGTKGNGEEFLNEVISIGRTSHVNIVSLLGFCLQGSKRALVYEYMANGSLDNYIYSEESKIVVGWGKLQQIAIGIARGLEYLHCRCNTRIIHFDIKPQNILLDEDFCPKVADFGLAKLCRLKDSALSMAEARGTVGFIAPEVFSRGFGVVSTKSDVYSYGMLLLELVGGRRHANELTTSHSTGNYFPNRIYDCLVKDLQTHAIITEEEEIAKLMTLVGLWCIQTNPGNRPSISRVIEMLEKNINEMELVLASFLLLLCHHAHADCEPATCGNLTINPPFWLDEPGRPPCGPPTFQLQCRGSEAFVAHSFFQTYQVVRIFTGNSSVVVVDRSLPLESGCPVPWFNISIGFVMGPFLISRANKELVFVHNCTTTKRRPPQGFRRMPCSPDESFVFLGDGRPRLLLPGCSMSVVPVLGLQDGDYVASMRRGLLLEWMLVPGDCQKCSASGGQCEYSSDGMGFSCKCPSGVHNPTSCVAGDSKSNGRKKTLIVLIPVAVSLLFPCAYVLIWHRKGQILCYLLCNKTRSRNESNIQKLIVSYGSLAPKRYKYSEVAKITSFLSNKLGEGGYGVVFKGKLQDGRLVAVKFLHDSKGNGEEFVNEGSKRALIYDYMPNSSLDNYIYSEKPKETLGWEKLYDIAIGIARGLEYLHHGCNTRIVHFDIKPQNILLDQDFCPKIADFGLAKLCCTKESKLSMTGARGTIGFIAPEVLYRSFGVVSIKSDVYSYGMMLLEMIGGRKNVKSMVQNSSEKYFPDWIYDHFYQGDGLQACEVTSEVEEIAKKMTLIGLWCVQVLPMHRPTITQVLDMFEKALDELDMPPKQSFCESLEHPVHKLNAESTSSATDKAYAVSEILNVEEISLVNSEFLQ
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g04480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.187849 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0137400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0002660 | SBH | 0.112014 | 0.0 | 0.373943 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0002490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0002650 | RBH | 1.453925 | 0.0 | 1.284384 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0002550 | RBH | 0.071853 | 0.034780 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0002550 | RBH | 0.595844 | 3.099725 | 1.351150 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0033300 | RBH | 0.3599865 | 0.7996085 | 1.4546695 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0002530 | RBH | 0.091198 | 0.084866 | 0.065209 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0034300 | RBH | 0.8415565 | 1.150537 | 1.5279845 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0002370 | RBH | 0.049578 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0002560 | RBH | 0.075790 | 0.585201 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0002640 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0002630 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0002480 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G002770 | RBH | 0.0 | 0.902375 | 0.522365 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0002580 | SBH | 0.259614 | 0.0 | 0.677685 |