Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
Os01g0137400 OGI:01002250 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Chr01:1988716-2003083
Gene Symbol RLCK21, OsRLCK21, RLCK23, OsRLCK23
DNA seq

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Function LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FF31]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
Os01g0137400 Os01t0137400-00 Chr01 1988716 2003083 + irgsp1_rep
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Protein seq

MPASSMSPASLLLLFSSLTLVAAAISADEQGGGSCSPRTCGNVTISHPFGFVPEQETDTKCGRLGFEVHCSNNTPYLGYYRRKYRFQVLDIFYGNSSLLVADVHKLDDFRNSSSKGCHVMTANTSSKVGQPFSVSSANLNLIFYNCTAETAAAAVRRDGGLVETKCSGGGTLVRVGGHYSDSGSYEEYSVEGCGATLVPVLGTSSGEANASSYEELISDGFLLTWQPPSGNKSNGRKKTLIVLIPVAVSLLFPCAYVLIWHRKGQILCYLLCNKTRSRNESNIQKLIVSYGSLAPKRYKYSEVAKITSFLSNKLGEGGYGVVFKGKLQDGRLVAVKFLHDSKGNGEEFVNEVMSIGRTSHVNIVSLFGFCLEGSKRALIYDYMPNSSLDNYIYSEKPKETLGWEKLYDIAIGIARGLEYLHHGCNTRIVHFDIKPQNILLDQDFCPKIADFGLAKLCCTKESKLSMTGARGTIGFIAPEVLYRSFGVVSIKSDVYSYGMMLLEMIGGRKNVKSMVQNSSEKYFPDWIYDHFYQGDGLQACEVTSEVEEIAKKMTLIGLWCVQVLPMHRPTITQVLDMFEKALDELDMPPKQSFCESLEHPVHKLNAESTSSATDKAYAVSEILNVEEISLVNSEFLQ

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM None None None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0137400 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g04550 SBH 0.179368 0.323679 0.128419
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0137950 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0002590 SBH 0.146139 0.000000 0.280715
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0002490 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0002660 SBH 0.086951 1.405004 0.239140
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0002480 RBH 0.008902 0.005864 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0002610 SBH 0.428048 1.129574 2.189153
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0034000 SBH 0.461777 1.019504 0.7308405
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0002540 SBH 0.040325 0.0 0.025854
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0033800 RBH 0.4648405 0.345734 3.123703
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0002430 SBH 0.031298 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0002560 RBH 0.075790 0.585201 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0002640 SBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0002590 SBH 0.000000 0.000000 0.017706
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0002540 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G002700 SBH 0.364793 0.274939 0.455609
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0002580 SBH 0.259614 0.0 0.677685
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