Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
LOC_Os05g17604 OGI:05027070 | 15/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU Chr05:10112382-10126224
Gene Symbol -
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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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LOC_Os05g17604 LOC_Os05g17604.6 Chr05 10112481 10120793 - MSU_osa1r7
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ATGCGTGTAGGTATCTCGGAATTCCCGTGTCGCATCAGCGGCCGACCGCGGCAGAAGTGGAGGAGGATGGAGCGTTTCGTTGACGACCTACTCAGGTCTCTCAAGAAGAACGCCACGTTAAAGATAGAATCAATATATCGGATATGTAATGCTTGCGTCAACCCAAAAAGAATACCTGACTTAATCGAGAAAGTTCTTGCCACGGCGATACATGAAAAGTTGATAGAAATTACTTCCTCATTGGAGATCAAAACCAATGCAGCCCAACTCAAAATCCCACATGTTGGCAGGAGTGAGAGGAGGGAGGCGGTGGGCTGGAACTTATTCCGTAATTACTTGACTGGTCCCATTCCGTCGTTCATCGGAAAATTTACTTCAATGCAATACTTGTCATTATCTTTCAATCCACTATCTGGACTACTTCCAAAGGAACTAGGAAACCTCACCAATCTTCTTTCATTGGGCATTAGCTCAGACAATTTTACAGGAAGTCTTCCAGAAGAACTGGGTAACTTGACCAAACTTCAGCAATTGAGTGCATCAGATAATGTATTCAAAGGGAAAATACCTGCTTATTTGGGCACAATGACTAATTTGGAAGACATATGGATTGGAGATATTATAAATGGGGTCTCTCCGTTGGCATTTATCAGTAATATGGCATCCCTGAGCACACTAATATTGAGGAACTGCAAGATATCTAGTGATCTCGGAGCAGTAGAATTTTCCATGTTTAAACAGTTAAAATTGCTGTTTCTTGGGAACAATAGCCTTACAGGAAAGTTGCCGGATGGTATAAGCTCTTCATTAAAAGTGATAGATTTTTCGTACAACCAACTCACTGGGAGCATTCCTTCTTGGGCTAGACAAAACAATTTACAGTTGAATTTGGTGGCAAACAACTTCTTACTCGATACCACCAGTGAAAGTACGCTACCTTGGGGAATAAACTGCCTCCAACAAGACACCCCTTGTTTCCGTGGATCTCCAGAATATTATTCCTTCGCAGTTGACTGTGGCAGTAATGCATCCATAAGAGGCTCAGATGACACTATTTATGAAGCAGATCCTACAAATCTTGGAGCTGCAACATATTATGTTACCGGTCAAACAAGATGGGGTGTCAGTAGTGTAGGGAACGCCATAGATGCAAAGAATATTATATATAGCTCCCAACCTTTTCAAAATGTAGTTGATTCAGAGTTGTTTGAAACTGCAAGGATGTCATCATCATCTCTGAGGTACTATGGACTTGGACTTGAGAATGGAAATTACACTGTTTTGCTCCAATTCGCAGAATTAGCTTTTCCAGACTCACAGACTTGGCTAAGCTTAGGGAGAAGAGTTTTTGACATATATATCCAGGGTGCTCTAAAACAAAAGGATTTCGATATAAGGAAAACAGCAGGTGGAAAATCTTTTACCGTAGTTAATAGGAGTTTCATGGTAACTGTGTCTAAAAACTTCCTTGAGATCCATCTATTCTGGGCTGGCAAGGGCACTGTTGACATACCTACTAAAGATAATTACTATGGGCCAATGATCTCAGCATTGAGCGTCACTCCAAATTTTACTCCTACCGTTCGAAACGGCATACCAAAAAGGAAAAGTAAAGCAGGTGCAATTTCCGGAATATTGATTGGTGCAATAGTTTTAGTATTAGCAGCATTATTTGGAGTGTTTACACTAGTAAAGAAGCGGAGAGCATTGGCACAACAGAAAGAAGAACTATACAACCTGGTTGGACGACCTGACGTTTTTAGTTATGCTGAGCTAAAGCTAGCCACAGACAATTTCAGTTCTCAAAATATTCTAGGCGAAGGTGGATTCGGGCCAGTGTATAAGGTTCTTTATTTCCATAATTAA

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Protein seq

MRVGISEFPCRISGRPRQKWRRMERFVDDLLRSLKKNATLKIESIYRICNACVNPKRIPDLIEKVLATAIHEKLIEITSSLEIKTNAAQLKIPHVGRSERREAVGWNLFRNYLTGPIPSFIGKFTSMQYLSLSFNPLSGLLPKELGNLTNLLSLGISSDNFTGSLPEELGNLTKLQQLSASDNVFKGKIPAYLGTMTNLEDIWIGDIINGVSPLAFISNMASLSTLILRNCKISSDLGAVEFSMFKQLKLLFLGNNSLTGKLPDGISSSLKVIDFSYNQLTGSIPSWARQNNLQLNLVANNFLLDTTSESTLPWGINCLQQDTPCFRGSPEYYSFAVDCGSNASIRGSDDTIYEADPTNLGAATYYVTGQTRWGVSSVGNAIDAKNIIYSSQPFQNVVDSELFETARMSSSSLRYYGLGLENGNYTVLLQFAELAFPDSQTWLSLGRRVFDIYIQGALKQKDFDIRKTAGGKSFTVVNRSFMVTVSKNFLEIHLFWAGKGTVDIPTKDNYYGPMISALSVTPNFTPTVRNGIPKRKSKAGAISGILIGAIVLVLAALFGVFTLVKKRRALAQQKEELYNLVGRPDVFSYAELKLATDNFSSQNILGEGGFGPVYKVLYFHN

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.032379 0.000000 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0261700 SBH 0.168841 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g16824 SBH 1.396188 1.701065 1.434122
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0261700 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0009360 SBH 0.033656 6.550403 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0009400 SBH 0.000000 0.384760 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_05g0009300 SBH 0.000000 2.729673 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0009390 SBH 0.0 0.093094 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0009460 SBH 0.0 11.104769 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0150700 RBH 0.1864805 13.1699445 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0009330 SBH 0.0 0.609378 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0153700 RBH 0.2230125 87.1749115 0.025962
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0009300 SBH 0.0 1.053380 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0009250 SBH 0.0 19.745775 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0009350 RBH 0.0 36.334873 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0009390 SBH 0.0 0.922435 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0009390 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G009150 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0009450 RBH 0.0 100.423065 0.0
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