Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsN22_05G009150 | OGI:05025800 | 14/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr05:10136057-10148552 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MESLINHAAAALNTILGRWGKKASPEWNISGELCSGFATDKTDWDYYPNINPFIKCDCTDSNNTLCHITRLNFRNNYLTGPIPPFIGKFTSMQYLSLSLNPLSGLLPKELGNLTNLVSLGIGSNNFTGGLPEELGNLTKLQRLYIDSSGFSGPFPSSFSKLQNLNTLKASDNGFNGKIPEYLGTITNLVEIPHSIEMRIYASQRIGDIVNGISPLAFISNMTSLSTIILRNCKISSDLGAIDFSKFEHLELLDLSFNNITGEVPQSILNLGNLKFLFLGNNSLTGRLPDGISSSLKAIDFSYNQLTGSFPSWASQNNLQLNLVANNFLLESTSDSTLPWGLNCLQQDTPCFRGSPKYYSFAVDCGSNGSTRGSDDTIYEADPTNLGAATYYVTGQTRWGVSSVGNYFQREDAKNIIYSSQNFQNVVHSELFQTARMSPSSLRYYGLGLENGNYTVLLQFAEFAFPDSQTWLSLGRRVFDIYIQGALKEKDFDIRKTAGGKSFRVVNRSFMVTVSKNFLEIHLFWAGKGTDAIPIKGYYGPMISALRVTPNFTPTVRNGIPKRESKAGAISGILIGAIVLVLAALFGVFTLIKKRRALAQQKEELYNLVGRPDVFSYAELKLATDNFNSQNILGEGGFGPVYKGKLPDERVIAVKQLSQSSHQGTSQFVTEVATISAVQHRNLVILHGCCIDTIYACKGDSNLNLDWVMRFEIILGIARGLIYLHEESSIRIVHRDIKASNVLLDTNLVPKISDFGLAKLYDENQTHVSTRIAGTLGYLAPEYAMRGHLSEKADIFAFGVVMLETVAGRPNTDNSLEESKICLLEWAWGLYEMDQALGIVDPSLKEFDKDEAFRVIYVALVCTQGSPHQRPPMSKVVTMLTGDVDVAKVVTKPSYITEWQLRGGGNSSNTTSS |
||||||||||
Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_05G009150 | OsN22_05G009150_01 | Chr05 | 10136057 | 10148552 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGGAGAGTTTAATTAACCATGCAGCGGCTGCTCTGAACACGATACTGGGGAGATGGGGCAAGAAGGCATCGCCGGAGTGGAACATCAGCGGCGAGCTCTGCAGCGGTTTTGCCACTGATAAAACTGACTGGGATTACTACCCCAACATCAACCCGTTCATCAAGTGCGATTGCACGGACAGCAACAACACCCTCTGCCACATTACCAGACTGAACTTTCGGAATAATTACTTGACTGGTCCCATTCCACCATTCATCGGGAAATTTACTTCAATGCAATACTTGTCATTATCTTTGAATCCACTATCTGGACTACTTCCAAAGGAACTAGGAAACCTCACCAATCTTGTTTCATTGGGCATTGGCTCAAACAATTTTACAGGAGGCCTTCCTGAAGAACTGGGTAACTTGACCAAACTTCAGCGATTGTACATTGATAGTTCTGGATTCAGTGGTCCGTTCCCTTCATCGTTCTCAAAACTTCAGAACCTGAATACATTGAAAGCATCAGATAATGGATTCAATGGGAAAATACCTGAATATTTGGGCACAATAACTAATTTGGTAGAAATCCCTCACTCAATAGAAATGCGCATATATGCATCACAACGGATTGGAGATATTGTAAATGGGATCTCTCCACTGGCTTTTATCAGTAATATGACATCCCTGAGCACCATAATATTGAGGAACTGCAAGATATCTAGTGATCTCGGAGCAATAGATTTTTCCAAGTTTGAACATTTAGAATTGCTGGACCTGAGTTTTAACAATATCACCGGGGAAGTTCCTCAATCCATCTTGAATTTGGGAAATCTCAAGTTCTTGTTTCTTGGGAACAATAGCCTTACAGGAAGGTTGCCAGATGGTATAAGCTCTTCATTAAAAGCGATAGATTTTTCATACAACCAACTCACTGGGAGCTTTCCTTCTTGGGCTAGCCAAAACAATTTACAGTTGAATTTGGTGGCAAACAACTTCTTACTCGAGAGCACCAGTGACAGTACGCTACCTTGGGGACTAAACTGCCTCCAGCAAGACACCCCTTGTTTCCGTGGGTCACCAAAATATTATTCCTTCGCAGTTGACTGTGGCAGTAATGGATCTACAAGAGGCTCAGATGACACTATTTATGAAGCAGATCCTACAAATCTTGGAGCTGCAACATATTATGTTACTGGTCAAACAAGATGGGGTGTCAGTAGTGTAGGGAACTACTTCCAGAGAGAAGATGCAAAGAATATTATATATAGCTCCCAAAATTTTCAAAATGTAGTTCATTCAGAATTGTTTCAAACTGCAAGGATGTCACCATCATCTCTAAGGTACTATGGCCTTGGACTTGAGAATGGAAATTACACTGTTTTGCTCCAATTTGCAGAATTTGCTTTTCCTGACTCACAGACTTGGCTAAGCTTAGGTAGAAGAGTTTTTGACATATATATCCAGGGTGCTCTAAAAGAAAAGGATTTCGATATAAGGAAAACAGCAGGTGGAAAATCTTTTCGCGTAGTTAATAGGAGTTTCATGGTAACTGTGTCTAAAAACTTCCTTGAGATCCATCTATTCTGGGCTGGCAAGGGCACAGATGCCATACCTATTAAAGGTTATTATGGGCCAATGATCTCAGCATTGAGGGTCACTCCAAATTTTACTCCTACCGTGCGAAATGGCATACCAAAAAGGGAAAGTAAGGCAGGTGCAATTTCCGGAATATTGATTGGTGCAATAGTTTTAGTATTAGCAGCATTATTTGGAGTATTTACACTGATAAAGAAGCGGAGAGCATTGGCACAACAGAAAGAAGAACTATACAACCTGGTTGGACGACCTGACGTTTTCAGTTACGCCGAGCTCAAGCTAGCCACAGACAATTTCAATTCTCAAAATATTCTAGGGGAAGGAGGATTCGGGCCAGTGTATAAGGGTAAGCTACCTGATGAAAGAGTTATAGCTGTGAAGCAACTTTCTCAGTCATCTCATCAGGGGACAAGCCAATTTGTGACAGAGGTTGCGACAATTTCAGCTGTTCAACATCGGAATCTTGTGATATTGCATGGATGCTGCATTGACACTATTTATGCTTGTAAAGGTGACAGCAACTTAAACCTAGACTGGGTAATGCGCTTCGAGATCATTTTAGGAATAGCAAGAGGCCTAATTTATCTTCATGAAGAGTCAAGTATACGCATTGTGCATAGAGACATCAAAGCTAGTAATGTTCTACTTGACACTAATCTCGTTCCAAAGATCTCTGACTTTGGACTTGCCAAACTCTATGATGAAAATCAAACTCATGTGAGCACTAGAATTGCGGGCACATTGGGTTATCTAGCTCCTGAGTATGCAATGAGAGGCCATTTGTCAGAAAAGGCTGATATTTTTGCATTCGGAGTGGTCATGCTGGAGACTGTCGCTGGGCGACCAAACACCGACAACTCCCTCGAGGAAAGCAAGATCTGTCTCCTTGAATGGGCATGGGGCCTGTATGAAATGGATCAAGCACTTGGAATTGTTGACCCAAGTCTCAAGGAATTTGACAAGGATGAAGCTTTTAGAGTCATATATGTTGCACTTGTCTGCACTCAGGGCTCTCCGCACCAGCGACCGCCAATGTCGAAGGTCGTGACAATGTTGACTGGAGATGTCGATGTGGCTAAGGTGGTCACCAAGCCAAGCTACATCACTGAGTGGCAGCTTAGGGGTGGTGGGAACAGCAGCAACACCACTAGCAGCTAA
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Protein seq | MESLINHAAAALNTILGRWGKKASPEWNISGELCSGFATDKTDWDYYPNINPFIKCDCTDSNNTLCHITRLNFRNNYLTGPIPPFIGKFTSMQYLSLSLNPLSGLLPKELGNLTNLVSLGIGSNNFTGGLPEELGNLTKLQRLYIDSSGFSGPFPSSFSKLQNLNTLKASDNGFNGKIPEYLGTITNLVEIPHSIEMRIYASQRIGDIVNGISPLAFISNMTSLSTIILRNCKISSDLGAIDFSKFEHLELLDLSFNNITGEVPQSILNLGNLKFLFLGNNSLTGRLPDGISSSLKAIDFSYNQLTGSFPSWASQNNLQLNLVANNFLLESTSDSTLPWGLNCLQQDTPCFRGSPKYYSFAVDCGSNGSTRGSDDTIYEADPTNLGAATYYVTGQTRWGVSSVGNYFQREDAKNIIYSSQNFQNVVHSELFQTARMSPSSLRYYGLGLENGNYTVLLQFAEFAFPDSQTWLSLGRRVFDIYIQGALKEKDFDIRKTAGGKSFRVVNRSFMVTVSKNFLEIHLFWAGKGTDAIPIKGYYGPMISALRVTPNFTPTVRNGIPKRESKAGAISGILIGAIVLVLAALFGVFTLIKKRRALAQQKEELYNLVGRPDVFSYAELKLATDNFNSQNILGEGGFGPVYKGKLPDERVIAVKQLSQSSHQGTSQFVTEVATISAVQHRNLVILHGCCIDTIYACKGDSNLNLDWVMRFEIILGIARGLIYLHEESSIRIVHRDIKASNVLLDTNLVPKISDFGLAKLYDENQTHVSTRIAGTLGYLAPEYAMRGHLSEKADIFAFGVVMLETVAGRPNTDNSLEESKICLLEWAWGLYEMDQALGIVDPSLKEFDKDEAFRVIYVALVCTQGSPHQRPPMSKVVTMLTGDVDVAKVVTKPSYITEWQLRGGGNSSNTTSS
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_05g0263100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os05g16824 | SBH | 1.396188 | 1.701065 | 1.434122 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os05g0263100 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_05g0009380 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_05g0009420 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_05g0009330 | RBH | 0.0 | 1.122401 | 0.979065 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_05g0009410 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_05g0009490 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_05G0142600 | SBH | 1.7083545 | 22.403785 | 0.557805 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_05g0009350 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0143500 | SBH | 2.045069 | 23.487054 | 4.33683 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_05g0009320 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_05g0009270 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_05g0009370 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_05g0009410 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_05g0009390 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G026010 | SBH | 0.146387 | 0.396267 | 0.890258 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_05g0009460 | RBH | 0.0 | 1.424525 | 0.0 |