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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 19.200507 2.75178 0.152787

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0245500 SBH 2.927443 1.028032 1.520268
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g07450 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0245500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0002100 RBH 0.0 29.779106 11.041966
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0002090 RBH 0.000000 13.928058 2.348707
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_09g0002150 RBH 0.0 61.357327 6.828699
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0002030 RBH 0.0 1.332301 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0002200 RBH 1.851170 31.124575 6.462188
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0055500 SBH 3.7752 9.5905 8.6255955
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0002150 RBH 0.068767 4.206459 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0128700 SBH 0.025443 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0002150 SBH 0.0 0.392869 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0002160 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0002250 RBH 0.0 44.367184 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0002110 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0002180 RBH 0.0 18.521599 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G002190 RBH 0.0 9.204958 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0002230 RBH 0.0 22.605757 0.0
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