Basic Info |
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Transcripts
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Protein seq | MASDFKAIPLIDISPLVEKIDDPNMANDKDLLQVVRLLDDACREAGFFYVKGHGIAESLMKEVRDVTHKFFQLPYEEKLKIKMTPQNGYRGYQRLGENITNGKPDMQEAIDYYAPIEPGKYGDLAKPMEGTNLWPKYPSNFDALLKNYISLLRDLSRKIMQGIALALGGPVDAFEGRTAGDPFWVCRLIGYPVSTDILEEHRTDTGCGAHTDYGLLTLVNQDDDICALEVKNQSGEWIYAKPIPGTFVCNIGDMLKVWSNGIYQPTLHRVVNNSPRYRVSVAFFYESNFDAAIEPVEFCRERTGGVAKYEKMDLDSTHQYIVHQRTRTLGVLAVVLAIIRWRRRIRNRRHPRKYGPLVDRDLVRKTRLDDLYNGSDTTCISQLRMRKEVFWKLASKLRDNGLLCDTIHVSVEEQLAMFLHTVGHNLRNRVIGFYVIRSSETVSRYFNEVLKALCCLAKDMIQIRSIETHSKIVSNPGRFYPYFEDCIGALDGTHIPAFVPENIVNRFRGRKSYPTQNVLAAVDFDLRFTYVLAGWEGSAHDLVVLKAALRRSSGIQIPEGKYYLADAGYAARLGILPPFRGVRYHLKEYEGGKSPETPQELFNLRHSSLRTSVERAFGTLKNRFKVLASKPFFPYKVQVKIVIACCVLHNWILDNGPDNIIYDEARWYIHNMDIGGSNKHGKGKSKARKGVGGSGVRSKPINWPPAFSEFLLDWYIEKKLELPPKGVIKKMHHTACTSAINAKYGSTYNVDQVQRHYRCHKETWALVARHLNESGGGWDETNKMLSLSQSTLDSLSINDRGILSKPIQFFDKLQELFSGSSADGAFMEDPSSVADFDDEADELDNFNDMSTYAETKYPQGEDSDKLEADSDDCKEVAALNAATAALNAATSQVSSSHTSGLKPNKKSFKKCGKPKTLPQSHNDKDCSPSRSKCPSMGHAQEDCLRT
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 19.200507 | 2.75178 | 0.152787 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0245500 | SBH | 2.927443 | 1.028032 | 1.520268 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g07450 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0245500 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0002100 | RBH | 0.0 | 29.779106 | 11.041966 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0002090 | RBH | 0.000000 | 13.928058 | 2.348707 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0002150 | RBH | 0.0 | 61.357327 | 6.828699 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0002030 | RBH | 0.0 | 1.332301 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0002200 | RBH | 1.851170 | 31.124575 | 6.462188 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0055500 | SBH | 3.7752 | 9.5905 | 8.6255955 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0002150 | RBH | 0.068767 | 4.206459 | 0.000000 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0128700 | SBH | 0.025443 | 0 | 0 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0002150 | SBH | 0.0 | 0.392869 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0002160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0002250 | RBH | 0.0 | 44.367184 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0002110 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0002180 | RBH | 0.0 | 18.521599 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G002190 | RBH | 0.0 | 9.204958 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0002230 | RBH | 0.0 | 22.605757 | 0.0 |