Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_09g0002150 OGI:09005370 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr09:3853951-3865819
Gene Symbol -
DNA seq

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Transcripts

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Protein seq

MANDKDLLQVVRLLDDACREAGFFYVKGHGIAESLMKEVRDVTHKFFQLPYEEKLKIKMTPQNGYRGYQRLGENITNGKPDMQEAIDYYAPIEPGKYGDLAKPMEGTNLWPKYPSNFDALLKNYISLLRDLSRKIMQGIALALGGPVDAFEGLLTLVNQDDDICALEVKNQSGEWIYAKPIPGTFVCNIGDMLKVWSNGIYQPTLHRVVNNSPRYRVSVAFFYESNFDAAIEPVEFCRERTVHNMDIGGSNKHGKGKSKARKGVGGSGVRSKPINWPPAFSEFLLDWYIEKKLELPPKGVIKKMHHTACTSAINAKYGSTYNVDQVQRHYRCHKETWALVARHLNESGGGWDETNKMLSLSQSTLDSLSINDRGILSKPIQFFDKLQELFSGSSADGAFMEDPSSVADFDDEADELDNFNDMSTYAETKYPQGEDSDKLEADSDDCKEVAALNAATAALNAATSQVSSSHTSGLKPNKKSFKKCGKPKTLPQSHNDKGKLKAKSSSGLHDDDDIDVLITSTLVGIKDNLAKPIQTAAPQDPNAPLWDMLKKIALEPEDKMRVGLHLCKPEFQAHRSFLISMGQEYLERWVYKFLSGDDTGL

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_09g0002150 OsCMeo_09g0002150.03 Chr09 3857720 3865819 - IsoSeq
CDS seq

ATGGATATAGAGGATACCAAAGACTGGGCGAAAATATTACCAACGGTAAACCTGACATGCAGGAAGCAATTGATTATTATGCGCCTATTGAACCTGGTAAATATGGAGATCTTGCCAAACCAATGGAAGGAACTAATTTGTGGCCAAAATATCCATCAAATTTTGATGCAC

Protein seq

MDIEDTKDWAKILPTVNLTCRKQLIIMRLLNLVNMEILPNQWKELICGQNIHQILMH

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr09 3862968 3863050 - OsCMeo_09g0002150.02 OsCMeo_09g0002150.03,OsCMeo_09g0002150.01,OsCMeo_09g0002150.02 All
SE Chr09 3861752 3862901 - OsCMeo_09g0002150.01,OsCMeo_09g0002150.03 OsCMeo_09g0002150.03,OsCMeo_09g0002150.01,OsCMeo_09g0002150.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 61.357327 6.828699

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_09g0248900 RBH 0.0 0.0 0.193475
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os09g07450 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os09g0248900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_09g0002090 RBH 0.0 3.967942 2.001586
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_09g0002080 RBH 0.0 5.312442 1.908455
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0018350 RBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_09g0002030 SBH 0.0 1.332301 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_09g0002200 SBH 1.851170 31.124575 6.462188
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_09G0063600 RBH 17.2050565 4.1318795 1.8084185
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_09g0002150 RBH 0.068767 4.206459 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_09G0065500 RBH 19.200507 2.75178 0.152787
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_09g0006840 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_09g0002160 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_09g0006680 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_09g0002110 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_09g0002180 RBH 0.0 18.521599 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_09G002190 RBH 0.0 9.204958 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_09g0007010 RBH 0.0 0.0 0.0
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