Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_04G0082400 OGI:01056340 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr04:5264121-5271436
Gene Symbol -
DNA seq

TTAAAAAACACCAATACTAAGATCCGCTAAAACAAAACGATATCCCAAAGGAATAACTAAAAAACTTAATAAAATTGATATGACTGCTATAGATGGTCCAATGCTAAATAAGGGAATATCCCCTCGGGATGGCAAGATATCCTCTTTAAAAAGTAGCTTAGTCCCATCTGCTATAGCTTGAAGCAGTCCCAGGGGGCCAGCATATTCAGGACCAATACGTTGTTGTATCGATGCGGATATTTCTCTTTCTAACCACACAATTACGAGTACTTCTACTGTGATTCCCAGTAAGAGGGTCAAAATGGGTAGGATCCATATCAGTCCATAGACTTCTTTTAATAATTCCAAGTTCGAAAAAGAATTGATAGCTTCTACCTGTACCCTGTCTATTATGATTTTCTATTATCATTTCAACGATCAACTTCTCCCATAATGATATCTATACTAACTAATATCGTCATGATATCAGCCAATTTCATTTTTTTGACTAGCTGAGGAAGAATTTGCAAATTAATAAAACTGGGTGGACGAATTTTCCATCTCCAGGGGAAAAGACTATTATCTCCAACCAGATAAATTCCTAATTCACCTTTTGGGGCTTCCACTCTTGCATAAAGCTCTTGCTTTGACAATTCAAAATTGGGTGAAGGTTTTTTACCAAGAAATCGATATTCAAAATCATTCCATTCGGAATTCTTTGCTTTCTTAAAGCGTCAGACTTCTAAATTCTCATAAGGGCCCCCAGGAATATTTTCTACAGCCTGTTGAATAATTTTGGTTGATTCCCTCGTTTCACCGATTCGTACTAAATAGCGTGCTAATGAATCTCCTTCTTTTTGCCATTGGACTTTCCAATCGAATTGATTGTAAGACTCGTAAAGATCAACTTTATGAAGATCCCATTGTATTCCAGAAGCTCGTAACATGGGGCCCGATAAGCCCCAATTTACAGCTTCTCCGCTAATAAAACCAACTCCCTCAACTCGTTCCAAAAAAATGGGATTCTGTGTAATAAGTTGTTGATATTTAATAACTCCTCGTAAAAAAATAATCACAGATATCTAAACATTTATCGATCCATCCATAAGGCAGATCGGCAGCAACTCCTCCGATGCGAAAGTAATTATGCATCATTCGCAAACCTGTAGCAGCTTCAAATAGATCATATATTAATTCTCTCTCTCTAAAAATATAATAAAAAGGAGTATGCGCACCGAGATCTGCCATAAAAGGTCCAAGCCATAACAAGTGAGAAGCTATACGGCTCAATTCTAACATAATTACCCTAATATAGCTGGCTCTTTGGGGTATTTGAATATTCTCCAAGAATTCTGGTGCATTTACTGTTATTGTAGGCAAAAAAACCTAATAGGGAGTGAGGATAAAGAGACTTATCCATCTACAAATTCTAGATGTTCAATGGACCTTTGTCAATGGAAATACAATGGTAAGAAAAAAAATTAGATAGAAAAACTCAAAAAAATAATGGCTTATGTTGGATTGGCACGACATAAATCCAGTCAAAAATAGGATTAAGAAAGAGGCAAATTATTTCTAAATAGTTAGACAACAAGGGATACTAGTGATCTTTACCGATTAACCAATTTCTTGACGCTGGGGTTGATCTTAAGGAGATACCACTTCCTCATGAATTTATCTTGAATCGCGACCTTTTGGCTCAACTTTATCCTAGTTTTGACGAAGGAGCAACCCCTTTTTTCACCTTGAATTGGTCCAAATATGCAGAATTTCTTAGTTTTCGCAGAGGGCTAGATCCAATAACCGGCGGTCTATGGTCGAGCGATATTGCGCACCATCATTTAGCTATTGCTATTCTTTTCCTGATCGCAGGTCATATGTATAAGTTCAGTAGTTCCTCATAGAAAATTATTGACTCTAGAGATATGGTAATATGGAGAAGACAAAATTGTTTGAAGCACGCACAGAACCGGAAGCGCCCCTTGTTTCAAAGAGAGGAGGACGGGTTATTCACATTTAATTTGATGGTCAGAGGCGAATTGAAAGCTAAGCAGTGGTAACTAAGACCCCCGGGGGAAAATAGGGATGTCTCCTAGGACCAATACGTTGTTTTATCGATGCAGATATTTCTCTTTCTAACCACACAATTATGAGTACTTCTATTGTGATTCCCAGTAAGATGGTCAAAATGGGTAGAATCCATATCAGTCCATAGACTTCTTTTAATAATTCCAAGTTCAAAAAAGAATTGATAGCTTCTACCTGTACCCAGTCTATTATCATTTCAACGATCAACTTCTCCCATAATGATATCTATACTACCTAATATCGTCATGATATCAGCCAATTTCATTTTTTTGACTAGCTGAGGAAGAATTTGACATAGATCCGTTACTCATATTTTAAAAATTGGAATCCTTAATCCAATGCAAAATTATGCTTCGCGACTCTGTACTCATAATCCAAATCCTATTTGTTTTTTGGATGCAATTTCAATTAGTCTTTGGGTACAAATCGCGAAAATGCATATTCTTCCTCAATATGCTATTGAGAGAAAAAGGAGTAAATCCTTTCTAAGAACTAAAGTTTTCATCGGAATATAAAAAAACTTAAGGACGCCTTAAGTATATCATTTCAAATTCAATTTTTAATAGAACGAATCACACTTTTACCACTAAACTATACCCGCAACATGTAAATTATGATACTAACGCTACCCTTGACAGATAACCCCAAGGGGTTGTGGGTTTTTTTCTACCAATGGGGGCTTTCCCTTCACCGCCCCCATGGGGGTGGTCCACAGGGTTCATAACTACCCCTCTTACTATGGGGCGTTTACCTAGCCAACACTTAGACCCGGCTCTACCCAAACTTTTTTGGTTCACCCCAACATTACCCACTTGTTCGACTGTTGCTAAGCAGTTTTGGGATACCAAACGGACCTCGCCAGATGGTAATCTTATATTGGCCGATTTACCTTCTTTTGCAATCAGTTTCGCTATAGCACCTGCTCCACTATACCCCTCGTCTTCTAATTCCTTCCATTCGACCGAGGAATTCACTAAAATAATTCACAAATCCAAATCTGCTAATTGTTCTCTAATAGCACCTGCTCCTGTCGCAATTTCCCGATTTCGAAATGTTGTAAAGCCTAGGGTAGAAAAAAAAGGGGGAAATGCTAAAGTTACAGGATGAAATTTCATCCTCGAATAAACCTCGTAATCGTAAGAAAGTTGGTTTTTTAGCACTGGGCCTAGCAAAAGAGAAATCACCATATACTAGGCCCTCCAATTTCTTAAGGGGTTTATCTAAAAGATTCGCGATATAACTAGGAAGACCTTTTAAATACCACACATGAGTCACGGGACATGCGAGTTTGATGTATCCCATTTGATATCTTCGTATCCGAGAATCAACAAATTCTACTCCGTATTTTTGGCAAAATCTTTCGTCTTTGTTTTCAGCTCCGCTCGCTCGAGAATTTCCACAAGCACAAATTCTGCTTTTTATGGGTCCAAAGATACCTGAATCGGACTGAACCAACTATTTGTCAGGCGACTGTTCTCCTATTCTCTCGAATCCATGAAGTAAGACATTGATTTTGCAAGAAGATCCACAATGTTCATTGCATAATAAGCTCCCTTGAAAAGCATTGGCGCACGTGTAAACGAGTTGCTCTACCGAACTGAGCTATAGCCCTTGTGAGAGATATCTTAATATATAGAGAATTTCTTATCAAGATGAATATTCTCTAATAGTAGAGGATATCCTTTGATCTGTTTACTATAATAACATACCAATAACGAAGCGGTATTTGCTTATAAAAATGGATTCAATCTATAATGGATCGAAGTAAAGGGTCTTCCTTTGTAGTGATAAATTGCCTACTTAACTCAGTGGTTAGAGTATTGCTTTCATACGGCGGGAGTCATTGGTTCAAATCCAATAGTAGGTAGGTAGGTAGAAAAATTACTAGATAGCATTGGCCCTACTTCGCTTCGCTATCTAATAATTTTTTCTACCCCTCTTCCCTTTTTCTTTGTATCAACTAAACCATTGGGTTGTCTTCAATTAGATGGGGGAATCCAATTAACAGCCTCGACTCGTATCCTAGCTCATCTGAGAGCTACCTTCGCTTCAACCAATTCTTTCGTACCCTCAGCTCTACTCATGTTAGCTTCGGCTATTTCAAGTGCTTGTTGAGCTTCTTCCGGATCAATGTCACTACCCAGTTCCGCATCATTTCCTAAAATGATGATCTCATTATTAACTATTCTGGCAAAACCGCTCCACAGAACCGCTGTTAACCATTGATCGTTGAGGAGGCGTATTCTCAAGGGACCCATATCTACAGCTGTGTTAATGGGGGCGTGGTTTGGTAATACGCCAATTTGGCCACTATTAGTAGATAAAATGATTTCTTTCACTTCACAATCCCAAATAATTCGCTTAGGAGTCAGTACATAAAGATTTAATTACATTTCTTCAATTTGTTCTCCTCTTCTAAGTTTATAGCTTTCATGCTAGCTTCATCGATGTTACCCACCAAATAAAAAGCCTGTTCGAGTAGGCCGTCTAATTCTCCGGAAAGGATTAGTTGAAATCCCCTAATAGTTTCTGCAAGACCAACATACTTTCCCGGAGAACTGATAAAAACTTCTGCCAGGTTGTGATAAGAAGCGCTCAATTTTTCGTGCTCTTGCTACAGTTAAACGATCCTGCTCCGATAATTCATCCAACCCAAGAATTGCGATAGTGTCCTGAAGTTCTTTGTAACGTTGTAAAGTTTGCTTAACTCTTTGCGCAGTTTCATAATGTTCGTTGCCAACGATCCGAGGTTGTAACCTAGTTGAGGTTGAATCTAAAGGATCTACTGCAGGATAAATCCCTTTGGAAGCTAATCCTCTGGTAAGTACGGTAGTAGCATCCAAATGTGCAAATGTTGTAGCAGGAGCAGGGTCGGTCAAATCGTCCGCAGGTACATAAACCGCTTGGATCGAAGTTATAGATCCCTTTTTAGT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Function NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic [UniProtKB/Swiss-Prot:P12124]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_04G0082400 OsZS97_04T0082400-mRNA-1 Chr04 5264121 5268445 - makerRMon
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Protein seq

MGPLRIRLLNDQWLTAVLWSGFARIVNNEIIILGNDAELGSDIDPEEAQQALEIAEANMSRAEVNAPEFLENIQIPQRASYIRNPIFLERVEGVGFISGEAVNWGLSGPMLRASGIQWDLHKVDLYESYNQFDWKVQWQKEGDSLARYLVRIGETRESTKIIQQAVENIPGGPYENLEVEAINSFSNLELLKEVYGLIWILPILTLLLGITVEVLVIVWLEREISASIQQRIGPEYAGPLGLLQAIADGTKLLFKEDILPSRGDIPLFSIGPSIAVISILLSFLVIPLGYRFVLADLSIGVF

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_04G0082400 OsZS97_04T0082400-mRNA-2 Chr04 5268167 5270305 - makerRMon
CDS seq

ATGGAGGGGCTAACTGGAGAGCAGCTCATGCTAATAGGGGTGGTTGGTCTTTTTGGAAAGCTGGACTATTGGCAAGAGGTTGATGTTGTTCCTGGAAGGCTCCTGTTGAGGGCTTATTTTGATGATGTTGATTTAGTGTCCAAGAAAATAGTGCTTAAGCAGATCCGAAATCAAGGTGGTCAAGGGGAATCTTGGGCTTTTGAGCATTTCGTCGCTTGCTATGCCCTTCCTCGTCTCTGGGTACCTAGGTATCCACCGCAAGCCTTTCCTCTTGGGGGTTATCAACCAACTCTTAGTACAGAAATGGGTTCTTTGCAAGAAAGAATTACTTCTACTAAAAAGGGATCTATAACTTCGATCCAAGCGGTTTATGTACCTGCGGACGATTTGACCGACCCTGCTCCTGCTACAACATTTGCACATTTGGATGCTACTACCGTACTTACCAGAGGATTAGCTTCCAAAGGGATTTATCCTGCAGTAGATCCTTTAGATTCAACCTCAACTAGGTTACAACCTCGGATCGTTGGCAACGAACATTATGAAACTGCGCAAAGAGTTAAGCAAACTTTACAACGTTACAAAGAACTTCAGGACACTATCGCAATTCTTGGGTTGGATGAATTATCGGAGCAGGATCGTTTAACTGTAGCAAGAGCACGAAAAATTGAGCGCTTCTTATCACAACCTGGCAGAAGTTTTTATCAGTTCTCCGGGAAATGGCCAAATTGGCGTATTACCAAACCACGCCCCCATTAA

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MEGLTGEQLMLIGVVGLFGKLDYWQEVDVVPGRLLLRAYFDDVDLVSKKIVLKQIRNQGGQGESWAFEHFVACYALPRLWVPRYPPQAFPLGGYQPTLSTEMGSLQERITSTKKGSITSIQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLTRGLASKGIYPAVDPLDSTSTRLQPRIVGNEHYETAQRVKQTLQRYKELQDTIAILGLDELSEQDRLTVARARKIERFLSQPGRSFYQFSGKWPNWRITKPRPH

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_04G0082400 OsZS97_04T0082400-mRNA-3 Chr04 5264834 5271436 - makerRMon
CDS seq

ATGGAGGATTTCTCTTTTGCAGATGGCTTGGATTTCTCTCCCGGAGTTATTAAATATCAACAACTTATTACACAGAATCCCATTTTTTTGGAACGAGTTGAGGGAGTTGGTTTTATTAGCGGAGAAGCTGTAAATTGGGGCTTATCGGGCCCCATGTTACGAGCTTCTGGAATACAATGGGATCTTCATAAAGTTGATCTTTACGAGTCTTACAATCAATTCGATTGGAAAGTCCAATGGCAAAAAGAAGGAGATTCATTAGCACGCTATTTAGTACGAATCGGTGAAACGAGGGAATCAACCAAAATTATTCAACAGGCTGTAGAAAATATTCCTGGGGGCCCTTATGAGAATTTAGAAGTCTGA

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Protein seq

MEDFSFADGLDFSPGVIKYQQLITQNPIFLERVEGVGFISGEAVNWGLSGPMLRASGIQWDLHKVDLYESYNQFDWKVQWQKEGDSLARYLVRIGETRESTKIIQQAVENIPGGPYENLEV

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.785881 0.108515 0.472864

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0003540 RBH 0.000000 0.000000 1.160400
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0003240 RBH 0.134497 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0003160 RBH 481.906342 27.525896 206.294907
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0003250 RBH 16.091660 0.510934 7.719723
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0003070 RBH 3.442496 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0003120 RBH 22.328974 29.166216 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0002990 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G003370 RBH 2.454788 2.142269 3.607090
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0003140 RBH 1.572830 0.000000 5.126241
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