Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsZS97_01G0176400 | OGI:01032410 | 3/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr01:10683326-10702406 | ||||||||
Gene Symbol | prx16, OsPOD1, POD1, prx14, prx8, - | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | ATGCAGGGGGTTAACGTGGTGAACCTCAACTCCGACTGGCAGCTGCTGACGCAGGACGAGGCACGCGGCCACGTGCACGAGTACGTCGACAACGGCACCCGCTGGGACCTCGACTTCGCCGAGTCGCTGCTCAAGCTCAGCAAGCTGCCCATGCCGGCGGGGAGCAAGGAGGAGATCAGGAACAAGTGCAGCTCCATCAACCATCGCTACAGGGGGATGAAGCTAATTCTCATGGTAGCCTTCCAGGCTATGAGCCTCATCTCCATATCAACTGCAAGTCTGCAGTACAATTTCTACGGATCGTCGTGCCCAAATGCCGAGCAGACGATCAGCAATGTCGTCTACGGCTTGATCGATGCTGACCCTTCCATGGCCCCAGCGCTGCTTCGTTTACATTTCCATGATTGCTTTGTCATGGGTTGTGATGCGTCCATCCTTCTTGATCCCACCAAGGCAAACGGCTCGCCGGAGAAGACAGCGATCCCGCTCCGCGGGTACGACGCCGTGAACAAGATCAAGGCGGCCGTGGAGGCCGTCTGCCCCGGCAAGGTCTCCTGCGCCGACATCCTCGCCTTCGCCGCCCGCGACTCGGTGGCCAAGTCCGGCGGCTTCGTCTACCCGGTCCCCTCCGGCCGCCGCGACGGCAACGTGTCGTCCGCCTTCTCCGTCTTCTCCAGCATCCCGTCGCCGTTCTTCGACGCGGACGAGCTCGTCCAGAGCTTCGCCGCCAAGGGGCTCACCGTCGACGACCTGGTGGCGCTCTCGGGTGCGCACTCCATCGGCACCGCGCACTGCTCGGGGTTCAAGAACCGGCTGTACCCGACGGTGGACGCCTCCCTGGACGCGAGCTACGCGGAGGCGCTGAGGGCGGCGTGCCCTGACGGCGGCGGCGCCGCCGACGACGGCGTGGTGAACAACAGCCCCGTGTCGCCGGCGACGCTGGGCAACCAGTACTTCAAGAACGCGCTCGCCGGGCGGGTGCTGTTCACGTCGGACGCGGCGCTGCTGGCCGGCCGGAACGACACGGCGGAGAAGGTCCGGGAGAACGCCGGCGACCTGACCGCGTGGATGGCGCGGTTCGCGGCGTCGATGGTGAAGATGGGAGGCATCGAGGTGCTCACCGGGGCGCGGGGGGAGGTCAGGAGCGCAGCACGCGGTGTTCGTCGTCACGGCTCGCCGGTGATCATAGCGTGGGCGATCGTGTTCTTCTCCGTTTTTGCGTCGTCGGAGGCGCAGCTGCAGGTCGGATACTACAACTATACTTGCCCCAGGGCGGAGGACCTCGTCCGCAACGTCGTCCACGCCGCCATCCTCCGCGACCCCGGCAATGGCCCCGGCCTCGTCCGCCTCTTCTTCCACGACTGCTTCGTCAGGGGGTGTGACGCGTCCGTGCTGCTGGACGCCGTCCCGGGCAGCAACGCGACGGTGGAGAAGATGTCGCAGGCGAACAACCCCAGCCTCCGGGGCTTCGCCGTCATCGACCGCGCGAAGCGCGTCCTGGAGCGGCGTTGCCGGGGCACCGTCTCCTGCGCCGACATCGTCGCGTTCGCGGCGCGCGACGCCTGCGGCATCATGGGCGGGATCGACTTCGCCGTGCCGTCGGGGAGGCGCGACGGAGCCGTCTCCGCCGAGTCCGACGTGCTCAACAACCTCCCGCCGCCGTTCTTCAACGCCACCCAGCTCGTCGCCGGCTTCGCCGCCAAGAACCTCACCGCCGACGACATGGTGGTGCTCTCCGGCGCGCACTCCTTCGGCCGCTCCCACTGCTCCGCCTTCTCCTTCCGCCTCTACCCGCAGGTCGCGCCCGACATGGACGCCGCCTACGCCACGCAGCTCAGGGCGCGGTGCCCGCCGCCGGCGGCGCCGCCGGCGACGGGGAGGCGGGACAGGGTGGTGGACCTTGACCCGGTGACAAAGCTAGTGCTCGACAACCAGTACTACAAGAACATCCAGAGAGGGGAGGTGCTGTTCACGTCGGACGCCACGCTCGTCAGCCAGAGCGACACGGCGGCGCTCGTCGACCTGTACGCGCGGAACCGGAAGCTGTGGGCGTCGCGGTTCGCCGCCGCCATGGTCAAGATGGGCAACCTCGACGTACTCACGGGAAGCCAAGGGGAGATCAGGAAATTTTGCAATAGAGTACTCGCCAGGGCTGTTCAGACTGAAGTTGAAAAGGACATGGTCATCAGCAATTGGAGTCAATTGGATTCAGCAGTTAGCACTCAGATGACAGCAACAGGCTTCTGA
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Function | Peroxidase 5 [UniProtKB/Swiss-Prot:A7QEU4] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsZS97_01G0176400 | OsZS97_01T0176400-mRNA-1 | Chr01 | 10683326 | 10702406 | - | makerRMon | ||
CDS seq | ATGCAGGGGGTTAACGTGGTGAACCTCAACTCCGACTGGCAGCTGCTGACGCAGGACGAGGCACGCGGCCACGTGCACGAGTACGTCGACAACGGCACCCGCTGGGACCTCGACTTCGCCGAGTCGCTGCTCAAGCTCAGCAAGCTGCCCATGCCGGCGGGGAGCAAGGAGGAGATCAGGAACAAGTGCAGCTCCATCAACCATCGCTACAGGGGGATGAAGCTAATTCTCATGGTAGCCTTCCAGGCTATGAGCCTCATCTCCATATCAACTGCAAGTCTGCAGTACAATTTCTACGGATCGTCGTGCCCAAATGCCGAGCAGACGATCAGCAATGTCGTCTACGGCTTGATCGATGCTGACCCTTCCATGGCCCCAGCGCTGCTTCGTTTACATTTCCATGATTGCTTTGTCATGGGTTGTGATGCGTCCATCCTTCTTGATCCCACCAAGGCAAACGGCTCGCCGGAGAAGACAGCGATCCCGCTCCGCGGGTACGACGCCGTGAACAAGATCAAGGCGGCCGTGGAGGCCGTCTGCCCCGGCAAGGTCTCCTGCGCCGACATCCTCGCCTTCGCCGCCCGCGACTCGGTGGCCAAGTCCGGCGGCTTCGTCTACCCGGTCCCCTCCGGCCGCCGCGACGGCAACGTGTCGTCCGCCTTCTCCGTCTTCTCCAGCATCCCGTCGCCGTTCTTCGACGCGGACGAGCTCGTCCAGAGCTTCGCCGCCAAGGGGCTCACCGTCGACGACCTGGTGGCGCTCTCGGGTGCGCACTCCATCGGCACCGCGCACTGCTCGGGGTTCAAGAACCGGCTGTACCCGACGGTGGACGCCTCCCTGGACGCGAGCTACGCGGAGGCGCTGAGGGCGGCGTGCCCTGACGGCGGCGGCGCCGCCGACGACGGCGTGGTGAACAACAGCCCCGTGTCGCCGGCGACGCTGGGCAACCAGTACTTCAAGAACGCGCTCGCCGGGCGGGTGCTGTTCACGTCGGACGCGGCGCTGCTGGCCGGCCGGAACGACACGGCGGAGAAGGTCCGGGAGAACGCCGGCGACCTGACCGCGTGGATGGCGCGGTTCGCGGCGTCGATGGTGAAGATGGGAGGCATCGAGGTGCTCACCGGGGCGCGGGGGGAGGTCAGGAGCGCAGCACGCGGTGTTCGTCGTCACGGCTCGCCGGTGATCATAGCGTGGGCGATCGTGTTCTTCTCCGTTTTTGCGTCGTCGGAGGCGCAGCTGCAGGTCGGATACTACAACTATACTTGCCCCAGGGCGGAGGACCTCGTCCGCAACGTCGTCCACGCCGCCATCCTCCGCGACCCCGGCAATGGCCCCGGCCTCGTCCGCCTCTTCTTCCACGACTGCTTCGTCAGGGGGTGTGACGCGTCCGTGCTGCTGGACGCCGTCCCGGGCAGCAACGCGACGGTGGAGAAGATGTCGCAGGCGAACAACCCCAGCCTCCGGGGCTTCGCCGTCATCGACCGCGCGAAGCGCGTCCTGGAGCGGCGTTGCCGGGGCACCGTCTCCTGCGCCGACATCGTCGCGTTCGCGGCGCGCGACGCCTGCGGCATCATGGGCGGGATCGACTTCGCCGTGCCGTCGGGGAGGCGCGACGGAGCCGTCTCCGCCGAGTCCGACGTGCTCAACAACCTCCCGCCGCCGTTCTTCAACGCCACCCAGCTCGTCGCCGGCTTCGCCGCCAAGAACCTCACCGCCGACGACATGGTGGTGCTCTCCGGCGCGCACTCCTTCGGCCGCTCCCACTGCTCCGCCTTCTCCTTCCGCCTCTACCCGCAGGTCGCGCCCGACATGGACGCCGCCTACGCCACGCAGCTCAGGGCGCGGTGCCCGCCGCCGGCGGCGCCGCCGGCGACGGGGAGGCGGGACAGGGTGGTGGACCTTGACCCGGTGACAAAGCTAGTGCTCGACAACCAGTACTACAAGAACATCCAGAGAGGGGAGGTGCTGTTCACGTCGGACGCCACGCTCGTCAGCCAGAGCGACACGGCGGCGCTCGTCGACCTGTACGCGCGGAACCGGAAGCTGTGGGCGTCGCGGTTCGCCGCCGCCATGGTCAAGATGGGCAACCTCGACGTACTCACGGGAAGCCAAGGGGAGATCAGGAAATTTTGCAATAGAGTACTCGCCAGGGCTGTTCAGACTGAAGTTGAAAAGGACATGGTCATCAGCAATTGGAGTCAATTGGATTCAGCAGTTAGCACTCAGATGACAGCAACAGGCTTCTGA
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Protein seq | MQGVNVVNLNSDWQLLTQDEARGHVHEYVDNGTRWDLDFAESLLKLSKLPMPAGSKEEIRNKCSSINHRYRGMKLILMVAFQAMSLISISTASLQYNFYGSSCPNAEQTISNVVYGLIDADPSMAPALLRLHFHDCFVMGCDASILLDPTKANGSPEKTAIPLRGYDAVNKIKAAVEAVCPGKVSCADILAFAARDSVAKSGGFVYPVPSGRRDGNVSSAFSVFSSIPSPFFDADELVQSFAAKGLTVDDLVALSGAHSIGTAHCSGFKNRLYPTVDASLDASYAEALRAACPDGGGAADDGVVNNSPVSPATLGNQYFKNALAGRVLFTSDAALLAGRNDTAEKVRENAGDLTAWMARFAASMVKMGGIEVLTGARGEVRSAARGVRRHGSPVIIAWAIVFFSVFASSEAQLQVGYYNYTCPRAEDLVRNVVHAAILRDPGNGPGLVRLFFHDCFVRGCDASVLLDAVPGSNATVEKMSQANNPSLRGFAVIDRAKRVLERRCRGTVSCADIVAFAARDACGIMGGIDFAVPSGRRDGAVSAESDVLNNLPPPFFNATQLVAGFAAKNLTADDMVVLSGAHSFGRSHCSAFSFRLYPQVAPDMDAAYATQLRARCPPPAAPPATGRRDRVVDLDPVTKLVLDNQYYKNIQRGEVLFTSDATLVSQSDTAALVDLYARNRKLWASRFAAAMVKMGNLDVLTGSQGEIRKFCNRVLARAVQTEVEKDMVISNWSQLDSAVSTQMTATGF
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.024655 | 0.176975 | 0.309878 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0293900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g18890 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0293900 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0013360 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0013110 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0013380 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.243327 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0012860 | RBH | 0.0 | 0.732414 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0012970 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0177200 | RBH | 0.0272225 | 0.1674925 | 0.158645 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0012910 | RBH | 0.306652 | 4.224185 | 0.0 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0030200 | RBH | 1.310006 | 0.183724 | 0.4886 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0012900 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0013000 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0012960 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0013060 | RBH | 0.0 | 1.005049 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0012750 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G013050 | RBH | 0.0 | 1.806657 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0012810 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |