Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_12g0015200 OGI:12055600 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:19364253-19373457
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_12g0015200 OsPr106_12g0015200.01 Chr12 19364253 19373457 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 3.372707 5.182240 9.576188

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0535300 RBH 0.685219 1.817895 9.587988
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g34970 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0535300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0015840 RBH 0.431466 8.147379 3.067378
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0015970 RBH 0.403328 1.393050 3.415756
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0016370 RBH 1.472260 0.840071 6.747892
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0015670 RBH 0.055835 0.090832 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0015150 RBH 16.143864 17.862076 26.636202
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0279300 RBH 4.3491805 13.6903635 4.9328225
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0015330 RBH 0.328623 1.470930 2.641357
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0311400 RBH 4.0481535 14.409247 10.8223305
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0015590 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0015710 RBH 0.269329 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0015810 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0015640 RBH 0.352581 0.0 1.252563
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0015810 RBH 0.370695 3.056272 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G015850 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0015540 RBH 0.0 0.0 0.0
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