Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_12g0016370 OGI:12055600 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:21704731-21713688
Gene Symbol -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_12g0016370 OsCMeo_12g0016370.01 Chr12 21704731 21713688 + NAM
CDS seq

atgaggccacgtgatggcagcgaggaggaagagctgctcaacaagctctcccgctattgccgctactggacggatctgtggtccgacgattccagcgacatcgccaaaagaactgagattggtcccatgcggtacacggaggaaccgccccggttcgcgatgctcctagatttactagaggttttttctttcgaggtgacggagcttacaggtattctacgctggccaattgatgtgtttggtctcatctccgttcgtgactctctggatcggaaccgcaactatatctttgagcgcaccaggaacaactgccagactctcactgcaaagctaagagtcaaggggacaagtccctccgaagataagatcttgagcgctgaagcatttgggtataatggaactgctcagagacatagatgtggctcactgcgcagtatgatgttatcaggagcacgcagcacattggagttcaattatgcacacattcctgtggcattggaggctacaatcagtgtcaggattacaggaggtttaactggtttctgtggaaagttcattgcacatactgctagtatcaaggaagatgtcatattgctggactctggggaagaaatggtggctatctcccatgatggagccattgatttctgccgcagtgtagttgcattggaaggaaatggcggagttctgactgttagtgttcatgcaaggcagagtgggccaagccggagcggagggatggcggcggcggcgaagccggaggcgggggagggggaggcgacgaattgccacaggagatcggcggcggggcaggaggaggaggaggaggagtcgaagaggccacgcgatggcaacgatgaggaggaagagctgctcaccgagctctcccgctaccgccgctactggacggatctttggtccgacgattccggcgacattgacagaagaactgagattggtcccatgcggtacacggaggaatcgccccggttcgcaatgctcctggatttacttgaggttttttcttttgaggtgaccgagctgaaaggtattctacgctggccaatagatgtgtttggtctcatctccgttcgtgactctctggaccggaaccgcaactatatctttgagcgcaccaggaacaactgccagactctcactgcaaaggattcatctctggttcttactggtccaagccgtgcaatcctattgatggaccctattgaatttgaaattgagctaagagtcaaggggacaagtccctccgaagataagatcttgagcgctgaagcatttgggtataatggcaccgctcagagacacagatgtggctcactccgcagtatgttgttatcaggagcacgcagcacattggagttcaagtatgctcacattcctgtggcattggaggctacaatcaaggtcaggattacaggaggtttaactgatttctgtggaaagttcattgcacatactgctagtatcaaggaagatgtcgtattgctggactctggagaagaaatggtggctatctcccatgatggagccattcatttctcccgcagtgtggttgcagttgaaggaaatggtgtgctgactgttggtgttcatgcaaggcagagtggtgatgagaataacagctgtgattacaagaattttatcccggtaagatgtggacggagtcatgacacacttgatgttggattttgccagatgagtgttgaagttgcttggtcgctcatgctttcatattga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 1.472260 0.840071 6.747892

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0535300 RBH 0.685219 1.817895 9.587988
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g34970 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0534700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0015880 RBH 1.045491 14.038821 4.204903
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0015970 RBH 0.403328 1.393050 3.415756
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0016320 RBH 1.691952 11.585996 7.548234
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0015670 RBH 0.055835 0.090832 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0015200 RBH 3.372707 5.182240 9.576188
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0278700 RBH 3.262631 8.219285 11.454176
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0015370 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0311300 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0015590 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0015820 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0015750 RBH 6.279427 19.506279 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0015640 SBH 0.352581 0.0 1.252563
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0015810 RBH 0.370695 3.056272 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G015770 RBH 0.865831 1.370143 1.370202
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0015470 RBH 1.531822 10.896912 4.944697
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