Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_11g0023130 | OGI:11077650 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:29678052-29710088 | ||||||||
| Gene Symbol | Osh359-3, Osh359-5, YR2, YR6, YR9, YR10, YR21, YR23, DRP-RP13, OsDRP-RP13, Osh359-2 | ||||||||||
| DNA seq | tttgttggatggcaatgatagtagatactttggttggatcatgcatcaataagttgcaagcgatcattacagacgaggtaaaactcatttcagaggtaaaagatgagcttgaagaactgcagcgaagaacagatctcataagatcttctcttaaggatgctgaggaaaggaggattgaagatttggcagttgaaaaatggcttgaccagctaagaaatgttatgtatgatgttgatgatattattgatttggctagatttaaaggaagtgtccagcctgactatcctatgtcatcatcaaggaaatcaactacttgcagtggcctttcactttcctcttgcttttttaatattcatatacgtcatgaagttgctataaaacttaaaagcctcaacaaaaagatagatagcatttcaaaggataaggtattcttaaaactcaaccgcacacagcgtaatggaaatggttcaacgtggacaccaagagaaagctctagcctagttgaacccaaccttgtgggcaaggaggtcatacatgcttgcagagaagtggtggatttggtgcttgcacacaaggaaaagaatgtttataagcttgctattgttggaataggaggtgttggtaagacaacactagctcagaaaatattcaataataaaaaaatagaaagaagattcgacaagcgtgcatgggtttgtgtttccaaggagtattctagggattctcttttgagacaagttcttcataatatggggatacaacatgacaaatatgaatcagttggagagctccaaagcaatcttgcatcaaacattcaaggcaagaattttttcttgtgttggatgatgtgtggcactctgaagcatgggcagatttactaagaactcctttgcatgctgcagccacaggaatagttctagtaactactcgagatgatactattgctcgagtaattggggtggaccacactcatagagttgatttcatgtcagctgatgtaggatgggagttgctttggaggagcatgaacatcaaagaagagaaacaagtgcaaaatctaaaggatgtaggtattgagattgtttccaaatgtggtggccttcctcttgtaattagggttgttgcaaaagttttagcaacccatgatcaaacagagaatgaatggagaaagatgttggggaatagtgcctggtccatgagcaaacttcctcatgaattaagaggtgctttatatctaagttatgatgcactaccccaccagttgaagcaatgttttctttattgtgcactatatcccaaagatgcaatcatacaccgtgattatcttatatggatgtgggtagctgaaggatttatagagaaacaagaagaccaactactagaagacatagcagagaaatattattatgagctaatccatcggaatctcctccaaccagatggtataacatgcaagatgcatgatctcttaagacaacttgcttgttatttgtcaagagaagaatgctttgttggagatccagagtcaatagggagtgatagtatgtgcaaagtatgacgtatttcagttgtcactgagaaggacatggtggtgttacctagcgtggacaaggatcaatataaagtgaggtgttttacaaattacttatatgggacgtcacaaagaattgatgattcacttttcaagagacttgtatgtcttcgtgttttggatttgtctgactcacttctacataatatcccaggtgagattggatatttgattcatctgcgcttactcgatcttaataggacagacatatcttctctcccagagtccattggctcccttcaaaaccttcaaatattgaacttgctggagtgcgaatctttgcacagccttcctttggcaactactcagttgtgcaatataagacggcttggtcttcaagatacaccaataaacaacgtcccaaaagggataggaagactgaaattcctcaatgatctagtaggatttccagtcagccttggaagcgacaatactaaaatgcaagatgcatggaatttggaagagttggctcatctttaccagttgcatcggcttggcttgagtaatttggaaaaagcaactcctggcagtagtacagattcactgttactaatagacaaagtgcatctgaaagatctaattctatcctgcactgaaccagcagatgaagaatattcagaggaaggtgtcagcaatgttgagaagatctttgaccaactaacacctccccacaatgtgcaagaagtaaatattattgaatactttgggaagcggctccccatctggattggtactgcccatttgccttcactggaactcttgatccttgtaggttgcaagtcctgtgaccaccttccaccaattgggcggatctccaacttgaaatacctaagaattgagggagcaacctcaattaccaagattggaccagaatttgttggctacggggaggacaatctcagatcaagagatgcggttgctttcccgaagctcgaattgttgatcatcagagatatgcccaactgggaggagtgggcctttattgaagaggaggtcgaggtggaggaggaagcagctgcagcagctgaggaagggggagaagatggagctacttcgaagcaaaaggggaaagaagtactgtctccaaggtcgtcatggcggctctcccaccacagcttggacaacaggcaaccagtttgaagctactcattataggatatgcagggtgcttgaagagggtggagaatctctggttcctctctgatggccttcatattgaggggtgtgaaagcctggagagagtctccaacattccccacgtgagaaagttgtatgtaacttcttgcccaaatctgaggtgcgttgaagagttgggcagtttggagcagctatggctgatggaggatatgctggagatctcattgctatgggtccctagacttcaagagcaacaccgccaacaccacgaagatgagctagaggtcatcgagtggtttggttagccctattgaatggtacaaggtatgtacgctgatcggttgagatcttccacacaaatctgatgcttccttgggttgtacaatcatacccctgctatgctcttccattatgtgcaattattctagcatttgatggcctccatatttgcttagattgggcatttcttgtgctttgacatgtatgctgaacaccaacagattaggtggccataccccttatcattgcatggttttaccaacatcctgcatggcaatatgctaaattagtgtatcctacatgtactatgatatgtgcttacataacccagaaaacagataaattagtgctaccccaaataaatatgttaccggttttatcatatatgaccaaacatggatgaacgcattgttattcctatgtgccaataggccaagtctgtatgcatatctactgaaggactaggggaaatgtttagccttcgctattcaaactgcatgagttcaggaatagtagaaagcgctggagtagttcaacactgcagtgcaagtatgtagagcagctgttcaagtgcaagtgttttatgttggagcatgcttgtgtctatgagatatttaagttatcatgtatctagtaagaacacatgaattttcaggcaatgctttcagagtgcacgacacattaggtctacatattagtcattttagacctgaacaaaattagcaggtaaaatgttaatagatttttggccgtgcccaacatctgccctatgctaggacacctaggttagcttggcaaacaaagtccacctaaatcccattgcattagtacagattgatgactattttagtttatatccccacttatccaaataagtggggaatattgctgacatctacttaggtctagctgactttatccttttattccaatgtatgtttgacaaatttaattagaaaaagatatgatcattacgaaactgatgactcttatccttgcttttccttgattaagttcttaaattataaaatcacttacaatagagccatgctaaatttttgtgtgcttgtttattttgtaggttgttaatcatgaagacttgggcaactgaattgccttatccatttatcatcatcttttatacttatttaatggtccatggaaaaaatgcaaaagaaaaaaaaagactcatgataacaaaaaaaaaatcaaaaaccatccaaaaacgaaaaaaaaagtcaaaaatgAaaaaaaaggcatatgcaccttgtgtacggtatattttgtgatgatttttgtgtgctggagggaacaaattttggtcacatacaaaaaaaaatgcgtgaaaacaagtatagttgtaaacaattaatctggtatactccaatatttgatgaaaaaacttcttatatttacaatggcacagcctccaagagtctttgcagagttcccagtttccatcattagatagatgaagttagatcagcgacagagccttacgatctttccgcttctcctcagcggttcattcagtcgatttcttcttcccgaaactttccagcgcctcatcaagatccgaagtttgcgccagaacagcccgcatcttgacttgccacaatgagaatctcgtcttgtagtctagcagcggtagatcatacttcatcgatgccatcgtgaaaccctaatgtgggaacaaactctgataccacttgttaggaaacgataagcgaacaaacgataaagaaacaatagatcaatcacagaagacacgagatttaacgtggaaaaccctcccaaagtaggagagaaaaaaccacgggcgccaggcagcaaaatatcttcactatatctggggtgaggttacaatgccgcacggcggcttacaagaggtatatatatagtggaaccctaaaagggatgacgattcgttttgcgggggctccgcccccgcacccccgggcatccccaggtgcacggcccaatgggccagctt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| Protein seq | MALDSLVGSCANKLKEIITEEVILILGIQEELAELQRKTELIHCCISDAEARRMEESAVDNWLGQLKEVLYDVDDIIDLARFKGSILLTDHPSSSSRKSIACTGLSISTCFSNVQARHEVAVKIRSLNRKIENISKDRVFLTLKSMVPTGSSSVLRVRESSHLLEPNIVGKEIIHACRKMVDLVLEHKGRKHYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIYNDRKIKGRFNKKAWVCVSKVYSEASLLRELLRIIEVHHGQDESIGELQSKLEIAIEEKRWELLWKSMNISESIELQTLQDVGTEIVRKCGCLPLAIKVIARVLASKEQTENEWKKILSKNAWFMNKLPNDLREDANIYRDDLTRMWIAEGFIEDHGGQLLEETADEYYYELIHRNLLQPDGLYYDHSSCKMHDLLRQLACYLSREECFVGNPESLVGNTVSKLRRVSVVTDKNMVMLPSMDEVQYKVRTWKTSYEKTLRVDNSFFKRFPYLRVLDLTDSFVPSIPGCIGNLIHLRLLDLDGTNVSCLPESIGILKNLKILNLERCVALHSLPSAITQLCNLRRLGLNYSPIYQVPKGIGKLEFLNDVEGFPVYGGSSNTKMQDGWNLEELAYLYQLRRLHMIKLERAAYRTTYPLLTDKGFLKFLYLWCTERTDEPYTEKDFSNIEKIFEQLIPPCNLEDLAIVKFFGRQYPFWIDSTHLAYVKSLHLFNCKFCMHLPPVGQLPNLKYLKIEGAAAVTIIGPEFAGLRASKLGRTVAFPKLEELLIRDMPNWEEWFFIDEATSTAKERVDDGDSAMPKEKALPPRMQILSRLRRLELSGCPKLKALPRQLAQINSLKEIELRWVSSLKVVENFPLLSETLLIATCQALEKVSNLPQVRELRVQDCPNLRLVEELGTLEQLWLYEDMHEVSTLWVPGLQQQCRQCHGEDLDLQAIITDKTILILGVKDELEELQRRTNVIRSSLQDAEARRMEDLVVEKWLDQLRDVMYDVDDIIDLARFKGSVLLPDYPMSSSRKSTACSGLSLSSCFSNIRIRHEVAVKIRSLNKKIDNISKDEVFLKLNRRHHNGSGSAWTPIESSSLVEPNLVGKEVIRACREVVDLVLAHKKKNVYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIFNDKKLEGRFDHHAWACVSKEYSRDSLLRQVLRNMGIRYEQDESVPELQRKIKSHIANKSFFLVLDDVWNSGAWTDLLSTPLHAAATGVILITTRDDTIARVIGVDHTHRVDLMSADVGWELLWRSMNINQEKQVQNLKDIGIEIVRKCGGLPLAIRVIATVLASQEQTENEWRRILGKNAWSMSKLPRELSGALYLSYEVLPHQLKQCFLYCALFPEDATIFRDNLTRMWVAEGFIDEEEGQLLEDTAERYYYELIHRNLLQPDGLYFDYISCKMHDLLRQLACYLSREECFVGDPESLGTNTIRKVRRISVVTEKDTMVLPSINKDQYKVRTYRTSYQKALQVDSSLFEKLTYLCVLDLTNSHVQRIPTYIENMIHLRLLDLDGTDISHLPESIGSLQNLQILNLQRCKSLHRLPLATTQLCNLRRLGLGGTPINQVPKGIGIMKFLNDLQGFPIGGGSDNTKMQDGWNLEELAHLSQLRHLDMIKLERATPCSSTDPFLLTEKKHLKILNLYCTEQTDEAYSEEDVSNVEKIFDQLTPPHNVREVNIIAYFGKRLPIWIGTAHLPSLEVLILLGCKSCDHLPPIGRIPNLKFLRIEGATSITKIGPEFVGYGEDNLRSRDAVAFPKLECLIIRDMPNWEEWAFIEEEIQACEGLERVSNIPCVRKLYVTSCPNLRCVEELGSLEQLWLMEDMLEISLLWVPRLQEQHRQHHEDELEDIVVLPSRNKDQYKVRCFTNLYGKSPRIDNSLFKRLVCLRTLDLSDSLVHDIPGEIGNLIYLRLLDLDRTNICSLPEAIGSLPSLQILNLQGFESLHNLPLATTQLCNLRRLGLAGTPINQVPKGIGGLKFLNDLEGFPIGGGSDNTKIQDGWNLEELAHLPQLRRLKMIKLERGTPCSNESYSEENARNTEKIFEKLTPPHNLEDLFVGNFFGCRFPTWLGITCLPSVKIVILSECKSCLPNLKYLKIKGASAITKIGPEFVGCWEEEEEVQKEEASAAAKEGGEDGIAASKQKGEEAPSPRSSWLLPCLTRLQLVGCPKLRALPPQLGQQATNLKDLLIREAECLKKVEDLPFLPGVLSIGGCEGLERVSNLPQVRELLVGGCPNLRHVEDWAVWSSYGGLDEDMQEISQLWVPRLQEQHRQLHGDEHELEVNEWL |
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| Function | Putative disease resistance protein RGA4 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA39] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_11g0023130 | OsPr106_11g0023130.02 | Chr11 | 29687746 | 29710088 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcactagattctttggttggatcatgtgccaataagttgaaagagattattactgaagaggtgatacttattctagggatacaagaagagctcgcagagttgcagcggaagactgaactcatacattgttgtattagtgatgctgaggcaaggaggatggaagagtcagcagttgacaattggcttggtcagctaaaagaagttctatatgatgttgatgatattattgacttggctagatttaagggaagcattctactaactgatcatccttcatcgtcatcaaggaagtcaattgcttgcactggcctgtcaatttccacttgcttttctaatgttcaagcacgtcatgaggttgctgtgaagattagaagtctcaacaggaagatagaaaacatttcgaaggacagagtatttttgacactcaagagtatggttcctactggaagcagttcagtattgagagtgagagaaagttcccacctacttgagcccaacattgttggcaaggagatcatacatgcctgcagaaaaatggtagatttagtgcttgaacataaggggagaaaacattataagcttgcaattgttgggactgggggagttggtaagacaacattagctcagaaaatatacaatgatagaaaaataaaaggaagattcaacaaaaaggcctgggtttgtgtttccaaagtgtactctgaagcttctcttttgagagaacttcttcgaattatagaagttcatcacggccaagatgaatcaatcggagagctccagagcaagcttgaaatagcaattgaggagaaaagatgggagctactttggaagagcatgaatatcagtgaaagcatagaattgcaaactctacaggatgttgggactgagattgttcgcaaatgtggttgccttcctcttgcaatcaaggttattgctagagttttagcgagtaaagaacaaacagagaacgaatggaaaaaaatattgagcaaaaatgcttggttcatgaacaaacttcctaatgatttgagagaagatgcaaacatttaccgtgatgatcttacaaggatgtggatcgctgaaggctttatagaggaccacggaggtcaactactagaagaaacagcagatgagtattactatgagctgatccaccggaaccttcttcaaccagatggtttatattatgaccacagcagctgcaaaatgcatgatcttttaaggcagcttgcttgttatttgtcaagggaagaatgttttgttggaaacccagaatcattggtaggtaacactgtgtctaaacttcgacgtgtttcagtcgtcacagataagaacatggtaatgttacctagcatggacgaggtgcaatataaagtaaggacatggaaaacttcttatgagaaaacactcagagttgataattcatttttcaagagatttccttatcttcgtgttttagatttgactgattcatttgtaccaagcatcccaggttgcatcgggaatttgatccatctacgtttgcttgatcttgatggtaccaatgtatcttgtcttccagagtccattggcatcctgaaaaatcttaaaatattgaacttggagaggtgtgttgctttgcacagtcttccttcagcgatcacccaactgtgcaatttaaggcgccttggcctcaattattcaccgatatatcaagttccaaaagggattggcaaattggaatttctcaatgatgtagaagggtttccagtctatggtggcagcagtaatactaaaatgcaagatggatggaacttggaagagttggcttatctttaccagctaaggcggcttcatatgattaaattggaaagagcagcttaccgcactacttacccattgttaacagacaaagggtttctgaaatttttgtatctatggtgtactgaacgtacagatgaaccatacacagaaaaagatttcagcaatattgagaagatctttgagcagctaattccgccgtgcaacctggaagatcttgctattgttaaattcttcggtcgccagtatcccttctggatagattctacccatttggcttatgtaaaatccttgcatctcttcaactgcaaattctgtatgcaccttccaccagttggacagctacccaacttgaaatatctaaaaattgagggagcagctgcagttaccattattggacccgaatttgctggcctcagggcgagtaaacttggacgaacagttgctttccccaagcttgaagagttgctcatacgagatatgcccaactgggaagagtggttctttattgatgaagcaacgtcaactgctaaggaaagggttgatgatggagattctgcaatgccaaaagagaaagccttacctccaaggatgcagatactgtcacggttgaggaggctggaactttctggctgcccaaagctgaaagctcttccacggcagcttgcacagattaacagtctgaaggagatagagctaagatgggtaagcagcctgaaggtggtggagaacttccccctcctctctgagacgcttttgattgcgacatgtcaagccctggagaaagtctctaaccttcctcaagtgcgagagctgcgcgtgcaagattgtccaaacttgagacttgttgaggagttgggcactttggagcagttgtggctttatgaggatatgcatgaggtctctacattgtgggtgcctgggcttcaacagcagtgccggcaatgtcatggagaggatcttgatttgcaagcgatcattacagacaagacaatactcattttaggggtaaaagatgagcttgaagaactgcaacgaagaacaaacgtcataagatcttctcttcaggatgctgaggcaaggaggatggaagatttagtagttgaaaaatggcttgaccagctaagagatgttatgtatgatgttgatgatattattgatttggctagatttaaaggaagtgtcctactgcctgactatcctatgtcatcgtcaaggaaatcaactgcttgcagtggcctttcactttcatcctgcttttctaatattcgtatacgtcatgaagttgctgtaaaaattagaagcctgaacaaaaagatcgataacatttcaaaggatgaggtatttttaaaactcaaccgcagacatcataatggaagtggttcagcatggacaccaatagaaagctccagcctagttgaacccaaccttgtgggcaaggaggtcatacgtgcttgcagagaagtggtggatttggtgcttgcacacaagaaaaagaatgtttacaagcttgctattgttggaacaggaggagttggtaagacaacactagctcagaaaatattcaatgataaaaaattagaagggagatttgaccatcatgcatgggcttgtgtttccaaggagtattctagggattctcttttgagacaagttcttcgtaatatgggaattcgatatgagcaagatgaatcagttccagagctccaaagaaagattaaatcacacattgcaaataaaagtttttttctggtgttggatgatgtgtggaactctggagcatggacagatttactaagcactccacttcatgcagccgccacaggagtaattctaataactactcgagatgacactattgctagagtaattggggtggaccacactcatagggttgatttgatgtcagctgatgtaggatgggagctgctttggaggagcatgaacatcaaccaagagaaacaagtgcaaaatctcaaggacataggtattgagattgttcgcaaatgtggtggccttcctcttgcaatcagagttattgctacagttttagcaagccaagaacaaacagagaatgaatggagacggatattggggaaaaatgcctggtccatgagcaaacttcctcgtgaattaagtggtgctttatatctgagttatgaagtgctgccgcaccaactgaagcaatgttttctttattgtgcacttttccctgaagatgcaaccattttccgtgataatcttactaggatgtgggttgctgaaggctttatagatgaggaagaaggccaactactagaagacacagcagagagatattattatgagctgatacatcggaacttactccaaccagatggtttatattttgactacatcagctgtaagatgcatgacctcttaaggcagcttgcttgttatttgtcaagagaagaatgttttgttggggacccagagtcactagggactaatactatacgcaaagtacggcgtatttcggttgtcactgagaaggacacgatggtgttacctagcatcaataaggatcaatataaagtgcgaacgtatagaacctcctatcagaaggcactgcaagttgatagttcacttttcgagaaacttacatatctttgtgttttggatttgactaactcacatgtacaaagaatcccaacttacattgaaaacatgattcatctgcgcttgcttgaccttgatgggacagacatttctcatctaccggagtccattggttcccttcaaaaccttcaaatattgaacttgcagaggtgtaaatctctgcaccgccttcctttggcaaccactcagctgtgcaatttgaggcgacttggtcttggtggtacaccaataaaccaggtcccaaaagggataggaataatgaaatttctcaatgatttacaaggatttcctatcggtggtggaagtgacaatacaaaaatgcaagatggctggaatttggaagagttggctcatctttcacagttgaggcatcttgatatgataaaattggagagagctactccttgcagcagtacagacccatttctactaacagagaaaaagcatctcaaaattctgaatctatactgcactgaacagacagatgaagcatattcagaggaagatgtcagcaatgttgagaagatctttgaccaactaacacctccccacaatgt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| Protein seq | MALDSLVGSCANKLKEIITEEVILILGIQEELAELQRKTELIHCCISDAEARRMEESAVDNWLGQLKEVLYDVDDIIDLARFKGSILLTDHPSSSSRKSIACTGLSISTCFSNVQARHEVAVKIRSLNRKIENISKDRVFLTLKSMVPTGSSSVLRVRESSHLLEPNIVGKEIIHACRKMVDLVLEHKGRKHYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIYNDRKIKGRFNKKAWVCVSKVYSEASLLRELLRIIEVHHGQDESIGELQSKLEIAIEEKRWELLWKSMNISESIELQTLQDVGTEIVRKCGCLPLAIKVIARVLASKEQTENEWKKILSKNAWFMNKLPNDLREDANIYRDDLTRMWIAEGFIEDHGGQLLEETADEYYYELIHRNLLQPDGLYYDHSSCKMHDLLRQLACYLSREECFVGNPESLVGNTVSKLRRVSVVTDKNMVMLPSMDEVQYKVRTWKTSYEKTLRVDNSFFKRFPYLRVLDLTDSFVPSIPGCIGNLIHLRLLDLDGTNVSCLPESIGILKNLKILNLERCVALHSLPSAITQLCNLRRLGLNYSPIYQVPKGIGKLEFLNDVEGFPVYGGSSNTKMQDGWNLEELAYLYQLRRLHMIKLERAAYRTTYPLLTDKGFLKFLYLWCTERTDEPYTEKDFSNIEKIFEQLIPPCNLEDLAIVKFFGRQYPFWIDSTHLAYVKSLHLFNCKFCMHLPPVGQLPNLKYLKIEGAAAVTIIGPEFAGLRASKLGRTVAFPKLEELLIRDMPNWEEWFFIDEATSTAKERVDDGDSAMPKEKALPPRMQILSRLRRLELSGCPKLKALPRQLAQINSLKEIELRWVSSLKVVENFPLLSETLLIATCQALEKVSNLPQVRELRVQDCPNLRLVEELGTLEQLWLYEDMHEVSTLWVPGLQQQCRQCHGEDLDLQAIITDKTILILGVKDELEELQRRTNVIRSSLQDAEARRMEDLVVEKWLDQLRDVMYDVDDIIDLARFKGSVLLPDYPMSSSRKSTACSGLSLSSCFSNIRIRHEVAVKIRSLNKKIDNISKDEVFLKLNRRHHNGSGSAWTPIESSSLVEPNLVGKEVIRACREVVDLVLAHKKKNVYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIFNDKKLEGRFDHHAWACVSKEYSRDSLLRQVLRNMGIRYEQDESVPELQRKIKSHIANKSFFLVLDDVWNSGAWTDLLSTPLHAAATGVILITTRDDTIARVIGVDHTHRVDLMSADVGWELLWRSMNINQEKQVQNLKDIGIEIVRKCGGLPLAIRVIATVLASQEQTENEWRRILGKNAWSMSKLPRELSGALYLSYEVLPHQLKQCFLYCALFPEDATIFRDNLTRMWVAEGFIDEEEGQLLEDTAERYYYELIHRNLLQPDGLYFDYISCKMHDLLRQLACYLSREECFVGDPESLGTNTIRKVRRISVVTEKDTMVLPSINKDQYKVRTYRTSYQKALQVDSSLFEKLTYLCVLDLTNSHVQRIPTYIENMIHLRLLDLDGTDISHLPESIGSLQNLQILNLQRCKSLHRLPLATTQLCNLRRLGLGGTPINQVPKGIGIMKFLNDLQGFPIGGGSDNTKMQDGWNLEELAHLSQLRHLDMIKLERATPCSSTDPFLLTEKKHLKILNLYCTEQTDEAYSEEDVSNVEKIFDQLTPPHNVREVNIIAYFGKRLPIWIGTAHLPSLEVLILLGCKSCDHLPPIGRIPNLKFLRIEGATSITKIGPEFVGYGEDNLRSRDAVAFPKLECLIIRDMPNWEEWAFIEEEIQACEGLERVSNIPCVRKLYVTSCPNLRCVEELGSLEQLWLMEDMLEISLLWVPRLQEQHRQHHEDELEDIVVLPSRNKDQYKVRCFTNLYGKSPRIDNSLFKRLVCLRTLDLSDSLVHDIPGEIGNLIYLRLLDLDRTNICSLPEAIGSLPSLQILNLQGFESLHNLPLATTQLCNLRRLGLAGTPINQVPKGIGGLKFLNDLEGFPIGGGSDNTKIQDGWNLEELAHLPQLRRLKMIKLERGTPCSNESYSEENARNTEKIFEKLTPPHNLEDLFVGNFFGCRFPTWLGITCLPSVKIVILSECKSCLPNLKYLKIKGASAITKIGPEFVGCWEEEEEVQKEEASAAAKEGGEDGIAASKQKGEEAPSPRSSWLLPCLTRLQLVGCPKLRALPPQLGQQATNLKDLLIREAECLKKVEDLPFLPGVLSIGGCEGLERVSNLPQVRELLVGGCPNLRHVEDWAVWSSYGGLDEDMQEISQLWVPRLQEQHRQLHGDEHELEVNEWL
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_11g0023130 | OsPr106_11g0023130.01 | Chr11 | 29678052 | 29687813 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcaatgatagtagatactttggttggatcatgcatcaataagttgcaagcgatcattacagacgaggtaaaactcatttcagaggtaaaagatgagcttgaagaactgcagcgaagaacagatctcataagatcttctcttaaggatgctgaggaaaggaggattgaagatttggcagttgaaaaatggcttgaccagctaagaaatgttatgtatgatgttgatgatattattgatttggctagatttaaaggaagtgtccagcctgactatcctatgtcatcatcaaggaaatcaactacttgcagtggcctttcactttcctcttgcttttttaatattcatatacgtcatgaagttgctataaaacttaaaagcctcaacaaaaagatagatagcatttcaaaggataaggtattcttaaaactcaaccgcacacagcgtaatggaaatggttcaacgtggacaccaagagaaagctctagcctagttgaacccaaccttgtgggcaaggaggtcatacatgcttgcagagaagtggtggatttggtgcttgcacacaaggaaaagaatgtttataagcttgctattgttggaataggaggtgttggtaagacaacactagctcagaaaatattcaataataaaaaaatagaaagaagattcgacaagcgtgcatgggtttgtgtttccaaggattggagagctccaaagcaatcttgcatcaaacattcaaggcaagaattttttcttgtgttggatgatgtgtggcactctgaagcatgggcagatttactaagaactcctttgcatgctgcagccacaggaatagttctagtaactactcgagatgatactattgctcgagtaattggggtggaccacactcatagagttgatttcatgtcagctgatgtaggatgggagttgctttggaggagcatgaacatcaaagaagagaaacaagtgcaaaatctaaaggatgtaggtattgagattgtttccaaatgtggtggccttcctcttgtaattagggttgttgcaaaagttttagcaacccatgatcaaacagagaatgaatggagaaagatgttggggaatagtgcctggtccatgagcaaacttcctcatgaattaagaggtgctttatatctaagttatgatgcactaccccaccagttgaagcaatgttttctttattgtgcactatatcccaaagatgcaatcatacaccgtgattatcttatatggatgtgggtagctgaaggatttatagagaaacaagaagaccaactactagaagacatagcagagaaatattattatgagctaatccatcggaatctcctccaaccagatggtataacatgcaagatgcatgatctcttaagacaacttgcttgttatttgtcaagagaagaatgctttgttggagatccagagtcaatagggagtgatattgtcactgagaaggacatggtggtgttacctagcgtggacaaggatcaatataaagtgaggtgttttacaaattacttatatgggacgtcacaaagaattgatgattcacttttcaagagacttgtatgtcttcgtgttttggatttgtctgactcacttctacataatatcccaggtgagattggatatttgattcatctgcgcttactcgatcttaataggacagacatatcttctctcccagagtccattggctcccttcaaaaccttcaaatattgaacttgctggagtgcgaatctttgcacagccttcctttggcaactactcagttgtgcaatataagacggcttggtcttcaagatacaccaataaacaacgtcccaaaagggataggaagactgaaattcctcaatgatctagtaggatttccagtcagccttggaagcgacaatactaaaatgcaagatgcatggaatttggaagagttggctcatctttaccagttgcatcggcttggcttgagtaatttggaaaaagcaactcctggcagtagtacagattcactgttactaatagacaaagtgcatctgaaagatctaattctatcctgcactgaaccagcagatgaagaatattcagaggaaggtgtcagcaatgttgagaagatctttgaccaactaacacctccccacaatgtgcaagaagtaaatattattgaatactttgggaagcggctccccatctggattggtactgcccatttgccttcactggaactcttgatccttgtaggttgcaagtcctgtgaccaccttccaccaattgggcggatctccaacttgaaatacctaagaattgagggagcaacctcaattaccaagattggaccagaatttgttggctacggggaggacaatctcagatcaagagatgcggttgctttcccgaagctcgaattgttgatcatcagagatatgcccaactgggaggagtgggcctttattgaagaggaggtcgaggtggaggaggaagcagctgcagcagctgaggaagggggagaagatggagctacttcgaagcaaaaggggaaagaagtactgtctccaaggtcgtcatggcggctctcccaccacagcttggacaacaggcaaccaagggtggagaatctctggttcctctctgatggccttcatattgaggggtgtgaaagcctggagagagtctccaacattccccacgtgagaaagttgtatgtaacttcttgcccaaatctgaggtgcgttgaagagttgggcagtttggagcagctatggctgatggaggatatgctggagatctcattgctatgggtccctagacttcaagagcaacaccgccaacaccacgaagatgagctagaggtcatcgagtggcgtcttggtcttgctggtactccaataaaccaggttccaaaagggataggaggactgaaatttctcaatgatttagaaggatttcctattggtggtggaagtgataataccaaaatacaagatggatggaacttggaagagttggctcatcttccacagttgaggcggcttaagatgataaaattggaaagaggcattccttgcagcaatgaatcatattcagaggaaaatgctagaaacactgaaaagatcttcgagaagctaacacctccacacaacttagaagatctttttgttgggaatttctttggttgtagattccccacctggcttggtattacccatttgccttcagtgaaaatcctaccaaacttgaaatatctgaaaattaagggagcaagtgcaatcaccaagattggacccgaatttgttggctgctgggagggtaatctcagatccacagaagcagttgctttccccaagctcgaaatgttgatcttcaaggagatgcccaactgggaggagtggtcctttgttgaagaagaaaaagaggtgcaggaggaggaagcatctgcagcagccaaggaagggggagaggatggaactgctgcttcgaagcaaaaggggaaagaagccccgtctccaactccgaggtcgtcgtggctgctgccttgtttgacaaggttggaacttgacgactgccccaagctgagggctctcccaccacagcttggacagcaagccaccaacttgaaggacctccttataagagaagcagaatgcttgaagaaggtggaggacctccctttcctctctggtgtcctttcaattggtggctgtgaaggtctggaaagggtctccaaccttccccaagtgagagagctgcttgtaggtggttgcccgaatttgaggcatgttgaggattgggcagtttggagcagctatggcgggctggacgaggatatgcaggagatctctcagctgtgggtcccaaggcttcaagagcaacaccgccaactccatggagatgagcatgagctggaggtcaacgagtggctctga
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| Protein seq | MAMIVDTLVGSCINKLQAIITDEVKLISEVKDELEELQRRTDLIRSSLKDAEERRIEDLAVEKWLDQLRNVMYDVDDIIDLARFKGSVQPDYPMSSSRKSTTCSGLSLSSCFFNIHIRHEVAIKLKSLNKKIDSISKDKVFLKLNRTQRNGNGSTWTPRESSSLVEPNLVGKEVIHACREVVDLVLAHKEKNVYKLAIVGIGGVGKTTLAQKIFNNKKIERRFDKRAWVCVSKDWRAPKQSCIKHSRQEFFLVLDDVWHSEAWADLLRTPLHAAATGIVLVTTRDDTIARVIGVDHTHRVDFMSADVGWELLWRSMNIKEEKQVQNLKDVGIEIVSKCGGLPLVIRVVAKVLATHDQTENEWRKMLGNSAWSMSKLPHELRGALYLSYDALPHQLKQCFLYCALYPKDAIIHRDYLIWMWVAEGFIEKQEDQLLEDIAEKYYYELIHRNLLQPDGITCKMHDLLRQLACYLSREECFVGDPESIGSDIVTEKDMVVLPSVDKDQYKVRCFTNYLYGTSQRIDDSLFKRLVCLRVLDLSDSLLHNIPGEIGYLIHLRLLDLNRTDISSLPESIGSLQNLQILNLLECESLHSLPLATTQLCNIRRLGLQDTPINNVPKGIGRLKFLNDLVGFPVSLGSDNTKMQDAWNLEELAHLYQLHRLGLSNLEKATPGSSTDSLLLIDKVHLKDLILSCTEPADEEYSEEGVSNVEKIFDQLTPPHNVQEVNIIEYFGKRLPIWIGTAHLPSLELLILVGCKSCDHLPPIGRISNLKYLRIEGATSITKIGPEFVGYGEDNLRSRDAVAFPKLELLIIRDMPNWEEWAFIEEEVEVEEEAAAAAEEGGEDGATSKQKGKEVLSPRSSWRLSHHSLDNRQPRVENLWFLSDGLHIEGCESLERVSNIPHVRKLYVTSCPNLRCVEELGSLEQLWLMEDMLEISLLWVPRLQEQHRQHHEDELEVIEWRLGLAGTPINQVPKGIGGLKFLNDLEGFPIGGGSDNTKIQDGWNLEELAHLPQLRRLKMIKLERGIPCSNESYSEENARNTEKIFEKLTPPHNLEDLFVGNFFGCRFPTWLGITHLPSVKILPNLKYLKIKGASAITKIGPEFVGCWEGNLRSTEAVAFPKLEMLIFKEMPNWEEWSFVEEEKEVQEEEASAAAKEGGEDGTAASKQKGKEAPSPTPRSSWLLPCLTRLELDDCPKLRALPPQLGQQATNLKDLLIREAECLKKVEDLPFLSGVLSIGGCEGLERVSNLPQVRELLVGGCPNLRHVEDWAVWSSYGGLDEDMQEISQLWVPRLQEQHRQLHGDEHELEVNEWL
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 2.865955 | 0.108137 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0677000 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g44960 | SBH | 0.100980 | 0.000000 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0676100 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0023540 | SBH | 0.831547 | 9.639051 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0023440 | RBH | 0.068956 | 0.290150 | 0.153786 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023180 | RBH | 0.033781 | 12.385487 | 0.134590 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023020 | RBH | 0.000000 | 0.101189 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0023410 | RBH | 0.773612 | 0.000000 | 1.075399 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0420000 | RBH | 0.003606 | 0.123159 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0023960 | RBH | 0.470954 | 0.700124 | 2.179529 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0430000 | SBH | 0.0419675 | 0.0645025 | 0.058287 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0023740 | RBH | 0.024663 | 0.551611 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0023790 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023280 | SBH | 2.088418 | 9.239458 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023050 | SBH | 0.409612 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0023080 | RBH | 0.133654 | 20.057241 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G023560 | SBH | 0.051438 | 0.189383 | 0.174242 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0023750 | RBH | 0.152510 | 4.768662 | 0.673288 |
