Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_06g0015930 | OGI:06000850 | 15/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:16586338-16592597 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | atggctcctatgcataaatcaaggcttggcaaagctcctattgttattgactccgatgactctgatgatgtgaagaaacaaaaggctcatgctaatgcagaatcgtctttcacaagattctctatcagatatttttcagatgttatttccaagtcatctgactatcacaagtccatcatccacaaatatgagtttgattttttgttattgtttgagagcaactctgttcctgtcaaatttgcatcttggattgttaaacatgtcgatgtcaggacttctgaaataattctaaatgacaaaattatcccagtaacagttgaatcagtgcacgctgttctcggtgttcctttaagtggaatagaattcagcaaagattatgaagctggcaggcaatatgtcatgtatatgtttggtcaggatgctattccttcggttaaattttttggagatctactaattcagaagaaagacttgtctgaagatcaaataatcacctctttccttactgttgccttggcttgctttttatgccccaactcatctttgatcccaagtgtcaagtatttgactatcttcgaggatgctaacctgttgaaaagctatgattggtcaaaatttgtgtatgaatggctgatgacatatgctaagaagtttcagaagaacaacaccattggaggttgcttgttttactgggctgctctgtatcttgataacgttgattttggctcaagatatattgaccaaggtttgcctcgcatttctgtttggaaggatgacatgatttcagtattctctgacttagacaaaatagatgataacacctttggactaaggcctctcaaggatttccgagcaacatgctattttcagcccaaacctacacattctaggtcaaatgcaattagagctaaactagattcagccattggcagtatgattccagattgtctcaaggagaaaatttctgaattgttgagtagccatttctgcagtcaccatgtacttgacagtgagccatgtgaagatatattgatttctatattggctttacttgctgaatcaagtcaatttcatccactagaagttccaacaacccatatctctcctcaaataaacactgaagctggacctagtaaccgtgaacctacaagtccaaaagcaaggcaatctgatttttgtgttttaaatgatgatggtgttcgatctcctgctaaacacaccagtttaagcaatgttgaattgtatgagaaatctgtttcaagatctactggaaagggctgtacatctattgatagaatcgcagatttatatggttctatagccaactgcgatgatgacagcatgttgctgaataaactgtcagcacaccccaaggctgtcgttactccttgtggtaatgctaatgcttcaagctctcatgaagatgaacctttgttgactccagatgttgcatatttgagaactaggaacaacattttgaatgaaactaatgaaggtccttcttttgctgctctcagccttgtcaagaatgttgcaaataagtttaggtccagaataacacatttcaatagtagaactccttttttgggcgaagaaatgccatcatttaagttgttagattcagatgatgatattagtgattgtgacaaagagaatgaagttgctgaagctataacacctgcttgttctcaggattttctctcttttcattctgttgaggacactcctgatgatatgattcgtggcaattcaaatttgcatacatctctaagaaacaactgtggaaatatgagcaagagtgttatagtaaatttagtctcgaattctcctgaagttcagtttcttggcgagtcaaaatttaatgatcgttgtaagaaaatgtgcacaaagacagatgaattgtacaatgcatccaataatttgtctacaagcaatcaaaggttcagttccactggtggcaagttaccattatatggtccacggagagtattggttcctgccagacatgcaatagatccctttgttattgatagacctcgttttacagtcactgatgaagaaaatcgatacttcattgctctttgtcaacttgctgagagttccaagtggcaaagctttgacgcagttaacattggtaatgtgagagcaaaagtatatagttttggtaattcgctgaagaaaggtggctttgtctcaagtcctgtcatgtgtgttttttgccgagtaatgtttcatgacaaccatccttcaaaatctaagagaaattactttttcccttctattggtgaacaattgatagctgatccgtctatttgtgatatggagaaagttaaaaaatcttttcttggagctagtaaagctagggaattgcagctgtgcgacatgttacatttcccaatctacttcaaccagcattggttcctttttattgttgatatcaaggataggatgcttgtttttttggattcattacataatgagggtgacgacttctttcgacctattatggctcagcttaaagctaatttacaaacagcatgggataagtttgtttgctcacctatggattttcgaactttcaagactgttttccctccggtaccacgtcagaatttgagttgtgattctggagtatttgtgatgaagttcattgagctttggtctcccaggattttattatccaatttgctctcaaatgaaaatatttgcaacattcgtgtccaatacgcaaatcgaatattcttccacgaaaagaatcaaatgcttcaaacagaaattcaaaacgtggttttaaattggttcgattcggtcaaatttccttgttctcgccaagcaaccttcaaatga
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Protein seq | MAPMHKSRLGKAPIVIDSDDSDDVKKQKAHANAESSFTRFSIRYFSDVISKSSDYHKSIIHKYEFDFLLLFESNSVPVKFASWIVKHVDVRTSEIILNDKIIPVTVESVHAVLGVPLSGIEFSKDYEAGRQYVMYMFGQDAIPSVKFFGDLLIQKKDLSEDQIITSFLTVALACFLCPNSSLIPSVKYLTIFEDANLLKSYDWSKFVYEWLMTYAKKFQKNNTIGGCLFYWAALYLDNVDFGSRYIDQGLPRISVWKDDMISVFSDLDKIDDNTFGLRPLKDFRATCYFQPKPTHSRSNAIRAKLDSAIGSMIPDCLKEKISELLSSHFCSHHVLDSEPCEDILISILALLAESSQFHPLEVPTTHISPQINTEAGPSNREPTSPKARQSDFCVLNDDGVRSPAKHTSLSNVELYEKSVSRSTGKGCTSIDRIADLYGSIANCDDDSMLLNKLSAHPKAVVTPCGNANASSSHEDEPLLTPDVAYLRTRNNILNETNEGPSFAALSLVKNVANKFRSRITHFNSRTPFLGEEMPSFKLLDSDDDISDCDKENEVAEAITPACSQDFLSFHSVEDTPDDMIRGNSNLHTSLRNNCGNMSKSVIVNLVSNSPEVQFLGESKFNDRCKKMCTKTDELYNASNNLSTSNQRFSSTGGKLPLYGPRRVLVPARHAIDPFVIDRPRFTVTDEENRYFIALCQLAESSKWQSFDAVNIGNVRAKVYSFGNSLKKGGFVSSPVMCVFCRVMFHDNHPSKSKRNYFFPSIGEQLIADPSICDMEKVKKSFLGASKARELQLCDMLHFPIYFNQHWFLFIVDIKDRMLVFLDSLHNEGDDFFRPIMAQLKANLQTAWDKFVCSPMDFRTFKTVFPPVPRQNLSCDSGVFVMKFIELWSPRILLSNLLSNENICNIRVQYANRIFFHEKNQMLQTEIQNVVLNWFDSVKFPCSRQATFK |
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Function | - |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_06g0015930 | OsPr106_06g0015930.01 | Chr06 | 16586338 | 16592557 | + | NAM | ||
CDS seq | atggctcctatgcataaatcaaggcttggcaaagctcctattgttattgactccgatgactctgatgatgtgaagaaacaaaaggctcatgctaatgcagaatcgtctttcacaagattctctatcagatatttttcagatgttatttccaagtcatctgactatcacaagtccatcatccacaaatatgagtttgattttttgttattgtttgagagcaactctgttcctgtcaaatttgcatcttggattgttaaacatgtcgatgtcaggacttctgaaataattctaaatgacaaaattatcccagtaacagttgaatcagtgcacgctgttctcggtgttcctttaagtggaatagaattcagcaaagattatgaagctggcaggcaatatgtcatgtatatgtttggtcaggatgctattccttcggttaaattttttggagatctactaattcagaagaaagacttgtctgaagatcaaataatcacctctttccttactgttgccttggcttgctttttatgccccaactcatctttgatcccaagtgtcaagtatttgactatcttcgaggatgctaacctgttgaaaagctatgattggtcaaaatttgtgtatgaatggctgatgacatatgctaagaagtttcagaagaacaacaccattggaggttgcttgttttactgggctgctctgtatcttgataacgttgattttggctcaagatatattgaccaaggtttgcctcgcatttctgtttggaaggatgacatgatttcagtattctctgacttagacaaaatagatgataacacctttggactaaggcctctcaaggatttccgagcaacatgctattttcagcccaaacctacacattctaggtcaaatgcaattagagctaaactagattcagccattggcagtatgattccagattgtctcaaggagaaaatttctgaattgttgagtagccatttctgcagtcaccatgtacttgacagtgagccatgtgaagatatattgatttctatattggctttacttgctgaatcaagtcaatttcatccactagaagttccaacaacccatatctctcctcaaataaacactgaagctggacctagtaaccgtgaacctacaagtccaaaagcaaggcaatctgatttttgtgttttaaatgatgatggtgttcgatctcctgctaaacacaccagtttaagcaatgttgaattgtatgagaaatctgtttcaagatctactggaaagggctgtacatctattgatagaatcgcagatttatatggttctatagccaactgcgatgatgacagcatgttgctgaataaactgtcagcacaccccaaggctgtcgttactccttgtggtaatgctaatgcttcaagctctcatgaagatgaacctttgttgactccagatgttgcatatttgagaactaggaacaacattttgaatgaaactaatgaaggtccttcttttgctgctctcagccttgtcaagaatgttgcaaataagtttaggtccagaataacacatttcaatagtagaactccttttttgggcgaagaaatgccatcatttaagttgttagattcagatgatgatattagtgattgtgacaaagagaatgaagttgctgaagctataacacctgcttgttctcaggattttctctcttttcattctgttgaggacactcctgatgatatgattcgtggcaattcaaatttgcatacatctctaagaaacaactgtggaaatatgagcaagagtgttatagtaaatttagtctcgaattctcctgaagttcagtttcttggcgagtcaaaatttaatgatcgttgtaagaaaatgtgcacaaagacagatgaattgtacaatgcatccaataatttgtctacaagcaatcaaaggttcagttccactggtggcaagttaccattatatggtccacggagagtattggttcctgccagacatgcaatagatccctttgttattgatagacctcgttttacagtcactgatgaagaaaatcgatacttcattgctctttgtcaacttgctgagagttccaagtggcaaagctttgacgcagttaacattggtaatgtgagagcaaaagtatatagttttggtaattcgctgaagaaaggtggctttgtctcaagtcctgtcatgtgtgttttttgccgagtaatgtttcatgacaaccatccttcaaaatctaagagaaattactttttcccttctattggtgaacaattgatagctgatccgtctatttgtgatatggagaaagttaaaaaatcttttcttggagctagtaaagctagggaattgcagctgtgcgacatgttacatttcccaatctacttcaaccagcattggttcctttttattgttgatatcaaggataggatgcttgtttttttggattcattacataatgagggtgacgacttctttcgacctattatggctcagcttaaagctaatttacaaacagcatgggataagtttgtttgctcacctatggattttcgaactttcaagactgttttccctccggtaccacgtcagaatttgagttgtgattctggagtatttgtgatgaagttcattgagctttggtctcccaggattttattatccaatttgctctcaaatgaaaatatttgcaacattcgtgtccaatacgcaaatcgaatattcttccacgaaaagaatcaaatgcttcaaacagaaattcaaaacgtggttttaaattggttcgattcggtcaaatttccttgttctcgccaagcaaccttcaaatga
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Protein seq | MAPMHKSRLGKAPIVIDSDDSDDVKKQKAHANAESSFTRFSIRYFSDVISKSSDYHKSIIHKYEFDFLLLFESNSVPVKFASWIVKHVDVRTSEIILNDKIIPVTVESVHAVLGVPLSGIEFSKDYEAGRQYVMYMFGQDAIPSVKFFGDLLIQKKDLSEDQIITSFLTVALACFLCPNSSLIPSVKYLTIFEDANLLKSYDWSKFVYEWLMTYAKKFQKNNTIGGCLFYWAALYLDNVDFGSRYIDQGLPRISVWKDDMISVFSDLDKIDDNTFGLRPLKDFRATCYFQPKPTHSRSNAIRAKLDSAIGSMIPDCLKEKISELLSSHFCSHHVLDSEPCEDILISILALLAESSQFHPLEVPTTHISPQINTEAGPSNREPTSPKARQSDFCVLNDDGVRSPAKHTSLSNVELYEKSVSRSTGKGCTSIDRIADLYGSIANCDDDSMLLNKLSAHPKAVVTPCGNANASSSHEDEPLLTPDVAYLRTRNNILNETNEGPSFAALSLVKNVANKFRSRITHFNSRTPFLGEEMPSFKLLDSDDDISDCDKENEVAEAITPACSQDFLSFHSVEDTPDDMIRGNSNLHTSLRNNCGNMSKSVIVNLVSNSPEVQFLGESKFNDRCKKMCTKTDELYNASNNLSTSNQRFSSTGGKLPLYGPRRVLVPARHAIDPFVIDRPRFTVTDEENRYFIALCQLAESSKWQSFDAVNIGNVRAKVYSFGNSLKKGGFVSSPVMCVFCRVMFHDNHPSKSKRNYFFPSIGEQLIADPSICDMEKVKKSFLGASKARELQLCDMLHFPIYFNQHWFLFIVDIKDRMLVFLDSLHNEGDDFFRPIMAQLKANLQTAWDKFVCSPMDFRTFKTVFPPVPRQNLSCDSGVFVMKFIELWSPRILLSNLLSNENICNIRVQYANRIFFHEKNQMLQTEIQNVVLNWFDSVKFPCSRQATFK
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|
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_06g0015930 | OsPr106_06g0015930.02 | Chr06 | 16592401 | 16592597 | + | IsoSeq | ||
CDS seq | atgcatagtacaagtaaatgtgaaaacatttttctgcctggt |
|||||||
Protein seq | MHSTSKCENIFLPG |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 9.494448 | 21.551466 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_10g0009230 | SBH | 1.089063 | 22.967749 | 20.505877 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0000480 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0009140 | SBH | 2.097970 | 20.222458 | 23.682117 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_06g0015790 | RBH | 0.633446 | 0.456944 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0223500 | SBH | 10.6692925 | 19.3029355 | 67.4645425 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0015420 | RBH | 0.000000 | 0.213631 | 0.437877 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0234400 | RBH | 12.485711 | 27.693477 | 43.932577 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0009070 | SBH | 0.296149 | 0.892168 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0000460 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_06g0000450 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0034440 | RBH | 0.527733 | 0.0 | 2.215516 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0009560 | SBH | 0.895590 | 10.006795 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G000440 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0031650 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |