Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsARC_06g0015790 | OGI:06000850 | 15/16 | ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr06:16530461-16540006 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | - | ||||||||||
Transcripts
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| OsARC_06g0015790 | OsARC_06g0015790.01 | Chr06 | 16530499 | 16540006 | + | NAM | ||
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| Protein seq | MYMFGQDAIPSVKFFGDLLIQKKDLSEDQIITSFLTVALACFLCPNSSLIPSVKYLTIFEDANLLKSYDWSKFVYEWLMTYAKKFQKNNTIGGCLFYWAALYLDNVDFGSRYIDQGLPRISVWKDDMISVFSDLDKIDDNTFGLRPLKDFRATCYFQPKPTHSRSNAIRAKLDSAIGSMIPDCLKEKISELLSSHFCSHHVLDSKPCEDILISILALLAESSQFHPLEVPTTHISPQINTEAGPSNREPTSPKARQSDFCVLNDDGVRSPAKHTSLSNVELYEKSVSRSTGKGCTSIDRIADLYGSIANCDDDSMLLNKLSAHPKAVVTPCGNANASSSHEDEPLLTPDVAYLRTRNNILNETNEGPSFAALSLVKNVANKFRSRITHFNSRTPFLGEEMPSFKLLDSDDDISDCDKENEVAEAITPACSQDFLSFHSVEDTPDDMIRGNSNLHTSLRNNCGNMSKRLFRDLTNSPEVQFLGESKFNDRCKKMCTKTDELYNASNNLSTSNQRFSSTGGKLPLYGPRRVLVPARHAIDPFVIDRPRFTVTDEENRYFIALCQLAESSKWQSFDAVNIGNVRAKEQLIADPSICDMEKVKKSFLGASKARELQLCDMLHFPIYFNQHWFLFIVDIKDRMLVFLDSLHNEGDDFFRPIMAQLKANLQTAWDKFVCSPMDFRTFKTVFPPVPRQNLRSNFLVLAKQPSNERV
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsARC_06g0015790 | OsARC_06g0015790.02 | Chr06 | 16530461 | 16539971 | + | IsoSeq | ||
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| Protein seq | FSLFFLFSFIVFSVKREGERHLAAARERGLAGGRERARRREGSGLPACGREFVFVRWLLCINQGLAKLLLLLTPMTLMMMIKSMIVQNLMISFLECRG |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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| A5 | Chr06 | 16536452 | 16536667 | + | OsARC_06g0015790.01 | OsARC_06g0015790.01,OsARC_06g0015790.02 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.633446 | 0.456944 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_06g0019810 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_06g0000480 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_06g0019750 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0009530 | RBH | 0.449267 | 0.710699 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_06g0015930 | RBH | 0.000000 | 9.494448 | 21.551466 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0223500 | SBH | 10.6692925 | 19.3029355 | 67.4645425 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_06g0015420 | RBH | 0.000000 | 0.213631 | 0.437877 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_06G0234400 | RBH | 12.485711 | 27.693477 | 43.932577 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_06g0000460 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_06g0000460 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0009450 | SBH | 8.714168 | 35.698872 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0034440 | RBH | 0.527733 | 0.0 | 2.215516 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0009560 | SBH | 0.895590 | 10.006795 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_06G000440 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0000450 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
