Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_05g0015640 OGI:05050890 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr05:19510112-19518043
Gene Symbol OsNADK3
DNA seq

gcccatcagtttgtcgcgtccgtccatccatccatccattgcgggccttcgatccatccccaaccgtgccacccatcctcgccgacgctcgcgcagccgcacccgcacagcgccgccgatcgaccccgtcgcggatccgctctcctcgccgccggcgaaccgccgtccgccccgccccgccccaccgcagtgcccgcgcacgcactgcccccctcgtgccgcagcccgcagtcggcgacggtccctcctccggtggcggtgatctcgtcgctggacgtacggtgcttcgctcgaccagccacgacagcgcgggccccgcgtggccgcgtcgagggtccttccctccctccctcatccacctccaggctccccgtcgccgcccgaggctatggatggccggcgcttggttggtacatcttcttttgctttgcttaattgctgcttggagtggaagggagattcttgggtcggtgtagatcacatcatcacttccaaatcccaaatgagcagatggaagtagtgttgttgttggagatggtacacttaaaaaatgcagttaaacgtgcctgcaaagttctcccgaaattttctgttttacctatagtattcatagttacagtgaagttttcacccaaaaataaaaaataaaaataaaatcaaaacataagatttcaaattaatatatgttttccttgtcagatttcctgttttcttaatggtgttttgtatattttaggattgttatgggagagtaaaccttagtgtggctacctcagatcagaccttagatagttcaatggaatcagagagggcagcttatgcgtttcttccccaaactccaatcaagtcaaccgatgcacacctcgttgagttctcggaggctatgagaggtgataatacaaacacttaggtgtcatttgaagcttttcactctattatttaatatacttgtgcgtgcatgtaccatactgatgggcacaacatgactcacaatttgcatgtggaagctgttgcgaaaacattgcgacaagttgcagaagggaaagctgctgctcaagcagaggcagctgagtggaagcgcaagtatgaattagaaaaggcagtcaaggcacacaggcataatactgtaaccaaaggtctgatttacacattgaagcttcagttttactatttcttcattgctgttaccagacataaatatgctaagaaagtggttgactcttagtttgatatcatcttgctcgaaaagctgtcaacaaataagagcatgatctccatttcattttcctaagatttataaattgctgatccctatcctgtaatataccggtatgcatctgagtttgatgggcatacatctagtttacatgggaagaaataaattactgtggaatcatttctacatgagtattgtgcagtttacaattttgaaatgttagatgaagagtggcatgcaacatttatgcttctgaatgctccatcacatatagccttcaacacaatttttaagatattagaatttgtgatgatgatggtggtggttgtcttcccacctcccctgaaaaattgagttggtgtaatcttttgtgacaaagtttatgcatatgctgtggatgattgaatcatccacgcgtgtggtttgtgctaagatcctgtttaacatagaaactgcacgaatcactcatgcagttttcatatttagagaatttctaccgcacattcattttctgagtatgcaacttgtgatatagtagtttgttcatccgagatcagtttcagtgcacaggttatcggcagtactatttaatattcaaaatttgattcatcatgatcatcattttcagaaaatgaaccaattcattacgtgccttcctagttcctattctatcactatgattttgtgagcaaaatgctctagaaacttgcaaataggtcagtcatgcaattctgcgagcaagacaataaatattaaatatctcatcttggttcttgttctgttattgccattagcactgaagttctcgttgaaacctatctgaatctcaaaatgacctctatattaactgtttaccacccaataaaaggtattggccaccctacattcattttgcatctgtgatcatggaaatagtcaaccatcaagtattatttgttgctcaggcaaggatgtatatatatatgtccttgcgtttgttacatggttttatgattatataagttgagttttaattccttctaatcttgtatcttcaaataagaagtcacaagtgaagaactcagcggtaattaactccatatAaaattctaaacatagtaaacatattacatgagcaaccttacaaattacatcaaagattgggttggatatacagtagtaatattctccagctaattagcaaattgatctttttctcttaccatgcacatggatttctacaataaatatgaagtgtaacatgtgcaggctgcagtaactgtgacaaggaaaagttagagcagttggctagtcagctgacattggagaccacgtcggttgatccaacaagttgctgcggaaatcatgagatctgttcacgtcaaattctccaggacgaatgccctggaactaataaaatttcgcatgacaagattgctgcaagaaaggtatcctttaggcaagaatatcgaatacattttttctgcaacggatagttacaaccctgctagatgtttttttttatataacatgatgtgctgctgaaaccaactcacacccaggcttccatccttctgttaatgcctagaataatgaaagggaactgataaaaatgtattgaaggatgaaataagtcaaattgctggaaagaaaatctggtcttgttctgtccgtaggttggtcgttgttttgctgtaacatatctgtttcagtatgtctgcctactctgttatcttgatctcattatttcctgaacttagtattggcagctcaactaatatcaaaagacaattgcttgtatagcttgattcacatattcaagactcaactaatatggacgtggtgagtaccatccttggtgaggactgaggttggtacttacactgtaatggaaccatgtttggatggccttttgtctctttgtatattatatatttagttcatgaaaaatctgtgggccttttttgaacatttacgatgcaatgttgaatttgcaaaattagatatttttatatcatttgcttgacttcttattctatatgcactcaatatcttcaagttggagagaaatttcttcatgagcacaagtagtctattatggcgttttattttattttgttacaccgaaaagaggaatatcttccaatcatagccaatttattaagaaacaccttttttttgcaggcaccatttaaactttcatggggatgcaatggggataataatggtcagcacaagcatgattttgtatccttcgaaaaaggggatataacaacagctgaacgcagcaataagcaggtagctatttgaggtttgagctatatgatccattttttaaaaaaattgtcttaactagttggaaatgattgttggataattccattgctgccgtatttttttaatggcaaaaaattaccgtgcctcagattttgctaaagtgggaatcccctccacaaactgttcttttcgtgactaaacctaattccaactccgtgcacgctctctgtgctgaaatggttaggtatgttttctttctgctctgtctgccaacatggtcaggtatgtcaaaggttttatattttatcaatcatctgagttcggcattaaaaatagcttcttttttgtttctggaacttgtcctctcctaatttacttatgttaagcagattttgttgataaataatgttgcatggaattgtatatttttcattcaatatcgttgtttcacttgtgctaatgtctgccgttctccgcagatggcttaaagagcacaataatataaacatctttgtagagccacgagttagcaaggaactagtgactgaagattcatacttcaactttatccaaacatgggataatggtaattatttttgcctatattagaatcattagactttgtatcttggaacgtcagggtgtgaagaatatcttgtcacaacctagataacctgatatctgatttatttttttaaatatcaataatctggcactgaaataaatggttatggtcactgtttatgagaatgaaaagcagtatgctgtgataatttcataatttaaggactacattggttcatttaactcatggacaaccaatagacattcccctctacttttaagtaacctgctaaatttcttctcattggcccttgcaatgaagttcttctttcatacctaatgacccttgcaatgaagttttctttcatacctaatgacatgctgctgctggtggctgtgtgtttgttaatgtgataaattcattacagtggtctaatatctactacgagaaatgtatcctttcctttaccattatacattaagttggttaatgttaatttcctttaccgataaaatactaaaaacaaaacagtctagtgtctcaactctcaacagttgcttgagtttctattagtgcttgaatggatcgtctatcattaaatagctccttttctgttgatgagttctgtcaatagagttcccttgcgctgtctttctctgtggtttaaaatatccccattccataatatacttgttttgttaacctatgcccttagaaatatgcccctttgtttttggtgtccaacttactggaaatctttgacagatgaggaaatgaagacattacacacgaaggttgatctcattgtaactcttggaggtgatggaacagttttatgggtatgtggtccaaactacatgacaatttactgaatctgaatactgtgtggttaattttgaaatttaagctataaatatgagtttggaaataactaacactctgatggtatacaaagagatgaaa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CDS seq

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Protein seq

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Function Putative NAD kinase 3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q60E60]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_05g0015640 OsPr106_05g0015640.02 Chr05 19510907 19518043 + NAM
CDS seq

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_05g0015640 OsPr106_05g0015640.01 Chr05 19510112 19517653 + NAM
CDS seq

atggatggccggcgcttggattgttatgggagagtaaaccttagtgtggctacctcagatcagaccttagatagttcaatggaatcagagagggcagcttatgcgtttcttccccaaactccaatcaagtcaaccgatgcacacctcgttgagttctcggaggctatgagagaagggaaagctgctgctcaagcagaggcagctgagtggaagcgcaagtatgaattagaaaaggcagtcaaggcacacaggcataatactgtaaccaaaggctgcagtaactgtgacaaggaaaagttagagcagttggctagtcagctgacattggagaccacgtcggttgatccaacaagttgctgcggaaatcatgagatctgttcacgtcaaattctccaggacgaatgccctggaactaataaaatttcgcatgacaagattgctgcaagaaaggcaccatttaaactttcatggggatgcaatggggataataatggtcagcacaagcatgattttgtatccttcgaaaaaggggatataacaacagctgaacgcagcaataagcagattttgctaaagtgggaatcccctccacaaactgttcttttcgtgactaaacctaattccaactccgtgcacgctctctgtgctgaaatggttagatggcttaaagagcacaataatataaacatctttgtagagccacgagttagcaaggaactagtgactgaagattcatacttcaactttatccaaacatgggataatgatgaggaaatgaagacattacacacgaaggttgatctcattgtaactcttggaggtgatggaacagttttatggtgtcatgtaatctacgattcagctaaaaatgaagttgatacggaggagccaattctagtgctgaatgaggttacaattgaccgtgggatgtcatcgtaccttacctacttagaatgctattgtgacagttcttttgtcacacgtgttcaaggagatgggttaataatatcaacaacatctggaagcacagcttattcattggcagctgggggatcgatggttcatccacagggcctccactggaacctgaggaagagccagtcgtttgatggccctgttgcatga

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Protein seq

MDGRRLDCYGRVNLSVATSDQTLDSSMESERAAYAFLPQTPIKSTDAHLVEFSEAMREGKAAAQAEAAEWKRKYELEKAVKAHRHNTVTKGCSNCDKEKLEQLASQLTLETTSVDPTSCCGNHEICSRQILQDECPGTNKISHDKIAARKAPFKLSWGCNGDNNGQHKHDFVSFEKGDITTAERSNKQILLKWESPPQTVLFVTKPNSNSVHALCAEMVRWLKEHNNINIFVEPRVSKELVTEDSYFNFIQTWDNDEEMKTLHTKVDLIVTLGGDGTVLWCHVIYDSAKNEVDTEEPILVLNEVTIDRGMSSYLTYLECYCDSSFVTRVQGDGLIISTTSGSTAYSLAAGGSMVHPQGLHWNLRKSQSFDGPVA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr05 19511001 19511149 + OsPr106_05g0015640.02 OsPr106_05g0015640.01,OsPr106_05g0015640.02 All
A3 Chr05 19516859 19517600 + OsPr106_05g0015640.02 OsPr106_05g0015640.01,OsPr106_05g0015640.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 15.147030 5.148681 16.265917

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0388400 RBH 3.180142 3.693697 2.337466
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g32210 RBH 2.310258 3.519169 0.759763
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0388400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0015600 RBH 0.748887 4.178707 6.712551
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0015600 RBH 0.324861 1.047339 2.843571
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_05g0015430 RBH 0.861863 4.112751 6.999372
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0015450 RBH 0.144408 0.201073 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0046450 RBH 7.172562 41.338669 26.521933
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0288100 RBH 6.0703225 4.811532 6.1247995
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0015200 RBH 0.696279 0.237521 3.020835
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0298800 RBH 9.90827 4.901887 16.9551835
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0015450 RBH 0.426245 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0015450 RBH 1.768865 4.678818 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0015480 RBH 17.738092 12.749970 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0015520 RBH 0.000000 0.000000 0.557990
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0015590 RBH 0.260150 3.142590 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G015090 RBH 0.961191 0.775101 2.464751
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0015400 RBH 3.542896 4.243744 11.457457
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