Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_02g0001380 OGI:02003970 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:927003-944383
Gene Symbol rNBS41, YR16, YR29, rNBS42
DNA seq

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Protein seq

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Function Disease resistance protein RGA2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XBQ9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_02g0001380 OsPr106_02g0001380.01 Chr02 927003 944383 + NAM
CDS seq

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Protein seq

MGLVGTVVDAAIGWMVQGILGSFFTGQMQVWSHEVGLAKDVEMLESEMKSVQMVLAAAEGRRIDNKPLSDSLDELKELFYDAEDVMDELDYYRLQQQIEGVLPLVGVGGVGKTTLARFVYHDERIKEHFDLRMWESLLDKIRHKRFLLVLDDIWEDKDRSRWDKLLAPLRFNEANGCMILATTQRTSVARMIGTMHKVEVNGLSDTEFWLLFKAWAFFGNENQEHDPTMQSIGQHIAKALKGNPLAARSVGALLNRNVSYEHWRKVQYKWRYLLEQDDDILTILKFSYEFLPVHLQQCFSYCSLFPKDHKLRGENLVRAWISQNFVECECHSKRLEETGKQYLDNLVDWGFLEEVESHYIMHDLMHDLAEKVSSNECAIIDGLGSKNIPPNVRHLSIITTAYDEKRSCDFPSSEKFENILHKIVPLQKLRTLMFFGESSIMLLRSLHTLCKESKESALNDCWCCNLTSLQELIFKVQDASNFNIGQLRSMNELVILGISQLENVKTKEEAKSARLIDKEHLQELSLSWDDKNMNSGPTAEKTRDGVFEGLEPHHNLKHLQLTRYSGATSPTWLASNVKSLQVLHLENCREWQIINSLEMLPVLRKLKLIRMWNLMSVSIPSYLEELILVNTPKLEKCVGTYGSDLTSGLRVLVVKDCPCLNEFTLFHSDYFHTNQKLWFPSLNKLTIGHYHRIISWKILPLEEMRALKELELMDVPVVEELSVPSLEKLVLIQMPSLQRCSGITTSSLPVSTSQIHQKKLVSSLHKLTIHDCPSLIVSLPIPPSLISDLSVKGISVFPTINLSHGTFSIESNELNELDNRILPFHNLKGLRSMYLQHCPNLSYVSSEVFSQLVALEHLSIEHCPNLFQPHSMSEPVHENSILNTDHLVLPSLRFLKISSCGIVGRWLTQMLPHLLSLEYFLLSDCPQIKLLSINQPTETEATSSLASVETASSRDEQILKIPCNLLRSLKWLRIWECADLEFSGVNRGFSGFTSLVMLQIRECPKLVSSLVTETNDTNVLLPQSLEHLDIGPLPANLQSYFPKGLPCLKKLSLNSGEYLKSVQLHSCSGLEYLQISRCPHLSVLEGLQHLSSLRRLCIQMNPELSAAWDLKLFPLSLVELGVRKVEGSFHSRSLSCLPSITKLEIQDSPELVSLQLGYCTSLEKLEITNCKSLASIKGIQSIRNLRYLKVLFAPSLPPYLHGVSGIWSRLETLQISNAAVLSTPLCKQLTALRELMFLGKQGEGYDGETMVSLTEEQERALQLLTSLRVLAFSHLQNLKSLPTNLQSLDCLDELYISVCPSILRLPQMGLPPSLRYLSLYRCSEELCVQCRMAETANLRVGIYSASAIPRPGYASREKNGRGETCLGGSVGWTAWRAAPSGTWYRLLGGLAQSSTRDWTTARRMYRYWLVGRRPIPFTTHVTVSHGIAFLCLHKYISISSAHMVYPALPVLIWQPACQPSIVKISMKTEFLSRFQYVSCFRQLYDLESCGFCGANITHRMLERKQESEMRCASQSSQAICPGISISACYLVTVLAQSCREWPPRNETLVHAHRGCCDCESAIRRAAFSRDPPVVWWWGFRAGENLRQMDWFKGLVFYFNSCDYWLDHGLGGPNRLFIVPSAPVLARSCDTYTGLVRSLLALAFTKLAQSRASGRARARRVHWGTMGLVSTAAEAAIGWVVQSILGSFFTGQMQVWTREVGLDKQVEELETEMRNMQMVLAEAEGTKIDNRPLSESLDEIKELIYDAEDFPYPGKGSSAAACTNPEESSASSSTPSYIQQISNRMNQNISWVMDGKKRKREEEEEPTHSVMLPPEVKHGISERINGIVNHLRIRGNPVQGVLQLEILRQIALPKQSQNGPRKSRLTISLMTEHKVYGRDAERDNIIELLTKGKSSDLDVVPLVGVGGVGKTTLARFVYNNNRIENHFDLRMWVCVSDNFNEKSLTCEMLDHVCKDRQEYGNISNFDALQKILLEKIRHKRFLLVLDDMWEDRDRKGWENLLAPLKCNEATGCMILVTTRRTSVARMTGTMSKIDVNGLDETEFWSLFKAWAFLGNENQERDPTLRSIGQHIAEALKGNPLAARSVGALLNWNVSFEHWRKIQYKWRSILEQDDDILAILKLSYEFLPVHLQYCFSYCSLFPKDHKFCGKKLVRAWISQNFVKCECHTKRLEEIGKQYLDKLVDWGFLEEVESHYVMHDLMHDLAEKVSSNEYATVDGLESKKISPGVRHLSIITTSYDKEEHCNFPSEKFEKIIQNIRSLQKLRTLMFFGQNNTMLLRFLHTLCKESKRAWKILPLEEMGALKELELIDVPVVEELSVPSLEKLVLIQMPSLQSCNGITASPPLQFSNSQVDQTEWVSSLCELKIHDCSNLVLPWPIPLVSYLSIKEVSAFPTLVIKQRKFTIKYSELSEMDGRIFPFHNLKSITSMRLENCPNLIYNWSEAFSQLIALKHLDISKCPSLLQRHVMSEFLHENTTPDTNYLVPSLKSLKIFSSGISGRWLTRTLPHLPSLEDFELRKCPQIKFLLISQSTGEATSSLASAETTSARDGQLLKMPCNLLRSLKRLCIYDCPDLEFCGGNGGFGGYTSLVELQIYGCPKLLSSPANEMDISLLPTSIQELWIGDLPSFFSPEGLSFLKRLWLSSSQDLKSLQLHSCTALEDLNIWGRQQLGVLEGLQGLSLLRRLNIEMNPELFAAWALKLQEQEQSGNQVGLFPPSLIELEISNLEGSIHPCFFSCLHSLTRLELGDSPELVTLQLGYCTALESLTIYDCKSLASIEGLQSIRNLRRLTTRDSPGVTPCLQLVSQQEGASGIWSRLEVLCTDGASVLTTSLCKHLTSLQSLVFWSRFNDDEPMVSLTEEQERALQLLTSLQQLEFSNHHYLESLPANLRSLDSLEALHINGCRSIRRLPEMGLPPLLTCLNLIGCSKELCLQGKMAQTEKLMVYTA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.333875 1.036077 4.709218

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0118900 RBH 0.451619 0.000000 1.232894
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g02670 RBH 0.146529 0.253938 0.266072
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0118900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0001360 SBH 0.057419 1.909588 1.050987
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0001430 SBH 0.0 0.577390 0.595032
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0001380 RBH 0.356905 2.888408 3.344306
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0001350 RBH 0.004316 0.021780 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0001390 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0016100 RBH 2.2675265 5.2563905 4.0025375
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0001340 SBH 0.000000 0.142351 0.725736
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0016300 RBH 1.3078815 13.5964565 4.45472
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0001360 SBH 0.016734 0.160614 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0001300 RBH 0.0 12.066147 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0001370 SBH 0.000000 6.383474 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0001420 SBH 0.034933 0.265393 0.107800
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0001410 RBH 0.050003 2.347372 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G001390 RBH 0.660084 0.434586 1.179133
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0001340 RBH 0.341320 8.698702 1.728364
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