Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLiXu_02g0001420 | OGI:02003970 | 16/16 | LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:1036824-1059381 | ||||||||
| Gene Symbol | rNBS41 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MHGKKRKREEEEEQTHSTMLPLEIKHDISKRINEIVNCLRTRCKPVQGVLQLEILRQIAMPKHSQSEPRKLRQTTSLAIEHKVYGRDTERDNIIELLTKVKSCDLGVLPLVGVGGVGKTTLARFVYHDQRIKDHFDLRMWVCVSDNFNEKNLTHEMLELVCKDRQGYKNIISFDVLQNTLWEEIRGKRWDRSGWDKLLAPLKCNEVSGCMVLATTRRASVARMIGTMSKVEVNGLDETVFWLLFKEWAFLGNEKLECNPTLQSIGKHIAKALKGNPLAARSVAILKFSYEFLPVHLQHCFSYCSLFPKDHKFNGKKLVRAWISQNFVKCECRAERLEETGKQYLDNLVDWGFFEEVESHYVMHDLMHDLAEEVSSDECATVDGLESKKISPGLQHLSIITTAYDREEPCNFPREKFENILQSIGSLPKLRTLMFFGENSIMLLRSLNTICKESKRLRLLKIYVTAADISSTHNLFKPNHLRYLEFIVVPTNNMFGSRGIVNTSIPQALTKFYHLQVLDVSSKGNLAVPTGINNLINLRHLIAHEKVHSTIAGLGNLTSLQELIFKVQDADNFNIGQLRALNELVILGISQLENVKTKQEASSARMIDKEHLEELSLLWNDNSMNPEPTAEKSRDDVIEGLEPLQNLKHLQLIRYSGATSPTWLASRVTSLQVLHLENCRQWQIVQSLEMLPLLRKLKLIRMWNLMEVSIPSCLEELDLVNVPKLEKCVGTYGLDLTSGLRVLIVKDCPILNEFTFFHKDYFHAEQKSWFPSLNKLIVSRCHRIITIAEVSYTYFVKLCYRAWKILPLEEMQALKKLELMDVPVVEELSVPSLEKLVLIQIPRLQSCRGITTAPSPHFSTSQGDQRELVCGLRELTINDCPSFLVQFPIPPSSLISFLSIKGLSSFPTMVINRRVLTIESNELSELDGRILPFHNLKGITWVNLRRCPNLTRISIDGFSQPHVMSKPVHDNSIPITSYPVLPSVNSLSIQSCGIAGGWLTLMLPHLQSLENLELRDCPQIKLLSTSQCTKIEAPNSLASAETTSARDKYLLQIPYNLLRSLKRLIIWACRDLEFSGVNEGFGGFTSLVELQIRDCPRLVPSLEQEQGSNQVGLFPLSLVHLGITNLEGSVHSRFLCLPSITKLDLWNSPDLKSLQLGYCTALVDLAIDSCKSLASIEGFQSIRNLRSLRVGDSPSVYPCLQLMSQQQGASDGLHRDGYSGKSMVSLTEEQERALQLLTSLRQLNFYSYQNLEFLPANLRSLDSLEELHIVRCPRILRLPEMGLPPSLKYLLLCGCSEELCMQCRMAETEKLKMVLAAAESSKIDNRPLSESLDELKELLYDAEDVMDELDYYRLQQHIEGWMVQGILGSFFTGQMQVWSHEVGLAKDVEMLESEMKSVQMVLAAAEGRRIDNKPLSDSLDELKELFYDAEDVMDELDYYRLQQQIEVSGKMNEIITWVIHGRKRKRDEDEPTHSIMLPLEIKHDISQRINGIVNCLRIRNKSVQGVLQLEISRPIVVPKQTQSVARGARLTTSIPIERKVYGRDAEKENIIKLLTSGKPSDLGVLPLVGVGGVGKTTLARFVYHDERIKEHFDLRMWVCVSDYFSEERLTREMLEVLCKDRRGYENITSFDALQESLLDKIRHKRFLLVLDDIWEDKDRSRWDKLLAPLRFNEANGCMILATTQRTSVARMIGTMHKVEVNGLSDTEFWLLFKAWAFFGNENQEHDPTMQSIGQHIAKALKGNPLAARSVGALLNRNVSYEHWRKVQYKWRYLLEQDDDILTILKFSYEFLPVHLQQCFSYCSLFPKDHKLRGEKLVRAWISQNFVECECHSKRLEETGKQYLDNLVDWGFLEEVESHYIMHDLMHDLAEKVSSNECAIIDGLGSKNIPPNVRHLSIITTAYDEKRSCDFPSSEKFENILHKIVPLQKLRTLMFFGESSIMLLRSLHTLCKESKGLRLLRIYVTADDICTTHNLLNPYHLRYVEFIVVPTTNIFGSLDFVNTPIPQALTKFYHLQVLDASSRVNLVVPTDMNNLVNLRHLIAHEKVHSTIAGVGNLTSLQELIFKVQDASNFNIGQLRSMNELVILGISQLENVKTKEEAKSARLIDKEHLQELSLSWDDKNMNSGPTAEKTRDGVFEGLEPHHNLKHLQLTRYSGATSPTWLASNVKSLQVLHLENCREWQIINSLEMLPVLRKLKLIRMWNLMSVSIPSYLEELILVNTPKLEKCVGTYGSDLTSGLRVLVVKDCPCLNEFTLFHSDYFHTNQKLWFPFLNKLTIGHCHRIISWKILPLEEMRALKELELMDVPVVEELSVPSLEKLVLIQMPSLQRCSGITTSPLPVSTSQIHQKKLVSSLRKLTIHDCPSLIVSLPIPPSPLISDLSVKGISVFPTINLSHGTFSIESNELNELDNRILPFHNLKGLRSMYLQHCPNLSYVSSEVFSQLVALEHLSIEHCPNLFQPHSMSEPVHENSILNTDHLVLPSLRFLKISSCGIIKLLSINQPTETEATSSLASVETASSRDEQILKIPCNLLRSLKWLRIWECADLEFSGVNRGFSGFTSLVMLQIRECPKLVSSLVTETNDTNVLLPQSLEHLDIGPLPANLQSYFPKGLPCLKKLSLNSGEYLKSISRCPHLSVLEGLQHLSSLRRLCIQMNPELSAAWDLKLFPLSLVELGVRKVEGSFHSRSLSCLPSITKLEIQDSPELVSLQLGYCTSLEKLEITNCKSLASIKGIQSIRNLRYLKVLFAPSLPPYLHGVSGIWSRLETLQISNAAVLSTPLCKQLTALRELMFLGKQGEGYDGETMVSLTEEQERALQLLTSLRVLAFSHLQNLKSLPTNLQSLDCLDELYISVCPSILRLPQMGLPPSLRYLSLYRCSEELCVQCRMAETANLRVGIYSASAIPRPGYASREKNGRGETCLGGSVGWTAWRAAPSGRRPIPFTTHVTVSHGIAFLCLHKYISISGAHMVYPALPVLIWQPACQPSIVKVLARFFWASDRFHADYLVTVLAQSCREWSPRNETLVHAHRGCCDCESAIRRAAFSRDPPVVWWWGFRAGENLRQMDWFKGLVFYFNSCDYWLDHGLGGPNRLFIVPSAPVLARSCDTYTGRSNTQNTVC |
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| Function | Disease resistance protein RGA2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XBQ9] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLiXu_02g0001420 | OsLiXu_02g0001420.01 | Chr02 | 1036824 | 1059381 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.034933 | 0.265393 | 0.107800 |
Homologues
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0118875 | RBH | None | None | None |
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| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0001350 | SBH | 0.004316 | 0.021780 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0001360 | SBH | 0.0 | 2.597426 | 0.468538 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0001300 | RBH | 0.0 | 12.066147 | None |
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| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0006400 | SBH | 0.110859 | 0.0 | 0.058863 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0001400 | RBH | 0.000000 | 5.480076 | None |
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| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0001340 | RBH | 0.341320 | 8.698702 | 1.728364 |
