Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_01g0023330 | OGI:01013090 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:24676555-24690205 | ||||||||
Gene Symbol | OsSTA22, OsLRP, OsLRR1, LRR1 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Receptor-like protein EIX2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q6JN46] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_01g0023330 | OsPr106_01g0023330.01 | Chr01 | 24676555 | 24690205 | - | NAM | ||
CDS seq | 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Protein seq | MVADQKPFNMTAPPRLLAQGATATTAVLLFFLVFQAQSASPFDRANTTTTPGAVGGICVPSERKALTSFKNSFLDPSGRLSSWRGEDCCQWKGVRCDSTTGHVIELDLRNTFVTENWDWCGGLNEGGGHRLTLQTDEMSPSIVELQHLRYLDLSNNEFKGTSLPSFIGSLNNLRYLNISFTCFGGTTPSQLGNLSNLHYLDIRSSIYESVSDLSWLLGLPLLRYLDMSEVDLSSVRNWVHAVNKLPALQVLVLSSCGLNSTVSTLPNSNLTNLEVLDLSDNPFCSPLQHNWFWDLTTLKKLVLSDCGWSIGPIPDALGNMSTLEVIVLSSNYDFYPSNSYLLGNIPTTLKNMCNLQVFDLHGINIYAPISELMERLPKCSWNKLHEMDLQDANLTGELPFWIGNLTSLSYLDLSQNMIGGSIPGGVEKLTSLKYLDLSRNMLVGHLPIGMGYLTGLTFLDLSQNRLVGHLPVGIGSLTGLTILDLSQNRLVGHLPVGMGNLTGLTILDLSQNRLIGNIPVGIGALGNLTELSFFQNRLTGVLSEHHFANLKRLEFLDLSGNSLKLDFKEGWIPPFRLTTGYFTSCDLGPQFPTWIRWVTDKANQPTLDISNTGINDDLPSWFWTFLSNVYRLDLSMNQLRGSLPEKLPANLTIPILKVLRLHYNQISGTIPACFCQFSGLEEINLSHNRLTGEIPQCSIDTFGSSFGVIDMSSNNLSGKFPSFLRKARSLSFLDLSYNKLSGNMPTWIAERMPSLEVLILRSNMFCGNLSMNFSESNQLHFLDIAHNNISGSLPSSVRNLTAMKYSKSDYLNYTGASISISIKNRELNYTFQSTNYIVLIDLSYNSLTGHIPREISELKGLQSLNLSGNQLNGKIPYNIGALRRLESLDVSYNELVGEIPSSLSDLTFLSSLNMSYNNLSGRIPSGQQLQTLNNLYMYIGNPGLCGPPLPTNCSTNKTNQIVHGEHDDASHDTIYLYLSTSAGFAVGLWAVFCTFLFKKAWRIAYFQLNDQIYDKIYVQMAINNIGALRRLESLDLSYNELVGEIPLSLSGNQLNGKIPDNIGALRRLESLDLSYNESMAPLKLLGHAILLAPLYLLFLQSPSTTTAAPPPSWGSHRCITGERDALLSFKAGITDPGHYLSSWQGEDCCQWKGVRCSNRTSHVVELRLNSLHEVRTSIGFGGGELNSTLLTLPHLMHLDLRVNDFNGARIPEFIGGLNNLLYLYLYGANFSGLVPPNLGNLSKLIHLDLNSMSNYGSVYSTDLAWLSRLTKLQYVDISGVNLSTAVNWVHVVNKLSSLVTLNLRFCELQNVIPSPLNANLTLLEQLDLYGNKFSSSLGAKNLFWDLPNLRYFDMGVSGLQGSIPDEVGNMTSIIMLHLHDNKLTGTIPATFRNLCKLEELWLSTNNINGPVAVLFERLPARKNLQELLLYENNLTGSLPDQLGHLSNLTTLDISNNMLSGEIPTGISALTMLTELLLSFNSLEGTITESHFVNLTALNHLDLCDNSLTMVFQQGWVPPFKLDIVDLRSCMLGSDFPEWLRSQNSVYVLDISNTGITGSLPHWFWITFSKTQHLVLSNNQISGMLPPRMFRRMEAETMDFSNNILVGPMPELPRNLWSLDLSRNNLSGPLSSYLGAPLLTVLIIFENSLSGKIPNSFCRWKKLEFLDLSGNLLRGTLPNCGVQSNTGKLPDNNSSRVNQLKVLNLNGNNLFGEFPLFLQKCQNLLLLDLGHNQFYGNLPTWIGEKLPTLAFLSLRSNFFSGHIPPQIANLTELQYLDIACNNMSGSIPESFKKLRGMTLSPADNDSLSYYGSNSEGIDEIDLDVFPNTLPVITKGQQLEYLTGIMYMVNFDLSCNSLTGQVPAEISKLVALKSLNLSYNLLSGIIPNSIGGLHALESLDLSDNEFSGEIPASLSFLTSLSHLNLSYNNLTGKVPSGYQLQTLDDQPSIYIGNPGLCGPPLSKSCSETNASPADTMEHDNGSDGGFFLLAVSSGYVTGLWTIFCAILFKKEWRVVCFSFSDFLFDWIYVRVVMCWASLARKRRAVTLSGSI
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
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Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g41780 | RBH | 0.188767 | 0.0 | 0.329391 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0279800 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0024300 | RBH | 0.097523 | 0.0 | 0.252339 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0024050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0024360 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0023750 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0023300 | SBH | 0.352614 | 0.000000 | 0.306255 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0395700 | RBH | 0 | 0 | 0 |
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Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0385000 | RBH | 0.532811 | 2.1341495 | 0.6791565 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0012140 | SBH | 0.391875 | 0.322095 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0036330 | SBH | 1.919805 | 83.656090 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0023480 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0012280 | SBH | 2.698003 | 2.435953 | 4.170121 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0012090 | SBH | 0.687408 | 10.825159 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G036920 | SBH | 1.021385 | 31.786877 | 25.667589 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0023430 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |