Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_11g0023880 OGI:11076340 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:29664592-29674520
Gene Symbol -
DNA seq

gtgagccaagctttggtacgcgcagcacttcttctcatcccttccccgaactcacgaacgcacgccgccaccaccgcccaccgtcgtctcgtcggagatggcctcctccgcctcatggccggcgttcggagtgtaatgtgccttctcctcctcctcctctttctcagctgtacaggagcttgattcgttatcacgtcgtttccttagatcgatatagaccccccaacatttttggtggcttgttgctttggttcgaatctctcgccttcgatttcctacttgtagatgatggataacatggaggaatgcttgtgattttgaggaTtttttttaatgcctactttgtttgtccccccttccttattctaatgggttttagggttaagaatttgtagatctgaacatgatcttgcatgattAaaatatgggtaaagtagcattgaagcatttgttgcatctttggtgtggtatatgtgggccatgtggcattacattacttgggttgcaaaaccctatatttgtgtgaatttgtagatctgattgtttagatagaaaaaaaatgacctggatttgtgaacctgaatgagttttagttaataattttcacatctggacatgaacaggaataattaaaatttgggcaaagtaaaaagtggtgtctttctactttctagggtagcttgaatggcagtacattccttgctgtggcataaacccatctaaaatcctagatttctgatgtaatggggtttacaccaagaatgtgtggatctggatgcgaaatatctgatgctatgagactaaaattccttcagtaattaccgttcttatgaaaattattaggttgcttatatatactgcacttgctcgtagatctgtgggattataattggttttagttaataatttgcagattttggacatgaatatgaatggttaaaatttggtttaagcaactgatgtattttgagggtaccaccgatggcagtatattctttgtggtagcattttttgtagtgaaaaatcttaggggtggcataaattcaccaaaagtctagatttctgatattctaatggggtttatgtcaagaatttatagattagaaacaaaatctgatgctaatatttcaccaccgattgacacacttaaattcctcatcattcttgaaaacagaaaactattctaactagcctgtaccattctttgactgcttacaattcattcgctagtaaatcaattcctaacctgcctactcttgcttgctattatctccagaagcccagaggaagcagggaagggtaaatggtacatcgcaactgctgctaccaaccacatgaccaatgacaagagcctcatctccgacctcaagcctgtcgccgatggccgtaatatcattgctgatggcaatggtgcagggttgaaggtgcagggcaggggagctgtgaacacagaaactgtggttctccctgcagaagtgtggtatgtgccggagattgatgaaaacttggtttctgttgaccagctcaatgaacttggcctcagtatttcgattggccgaggtgtatgcaccgtcactagagttagtgatggatctgtagttggcaaagcgcgtagatcaggtggagtctatgaggtggaattcctcagcctgtgagcagaactgaggattttaccatgttggtttgaccttgtcttttaccactgtttttaagttcctgtagcctgttgagctgttcatatccatcgacttgcaattgccatttcagtttcagtgttcctgccctgctgatttattggtgatcattttcaatcttgtgctgtaacctgtaacttcagtatgtcaatgattatctttgcaaggttctctcttgtcgaccaattttccatgcatgatgttacacgttacagcaaagctctttaggctgtgtgtgtggaggttggcgcacgcaaaatgatgggatagattagcgtatgtaattaataacaatgggatagattagcatatacttcctccgtcagggcatttgcaaatttgccaccgtttttttcaattttgcaaggatgctattcgaatgacagttctagtggtatttttacaaTtttttagtggtagtcttgcaataacaattcaaagtagtggtaaatttgcaattgctcatcctccgttttatattataagactttttagcattgcccctgaatttcagaggtagtaattaatttcatacttaattttttttaaaaagaattagtatgaaattttaaaaacaactttcctataaaacatttttataaaaaatataccgtttgacggtttaaaaaatgtgcacgaaaaacgagagaaaaagtaggaaacattgacaaaataacacaacttatacctccattcatgacaaatttggttcagaaaaatagtaattactctaaaataataatagcaatctcataatatttgccgttcaaaaaaaaacaatagcaataatattagtaataataacccttcaaaacaattaataatagcaataatactccctatgacaaccggggcccaccaggagtcgactagtcgaggatactggatactcctacatatatgcggtgtgcgaaccagcttgtgtgtacacgtagcagtttctctcgtcttctccccgagctctcgccgcctcgccgccctcggcctcgccaccgcccgccgactcgtcggagatggcctcctacccggtgttccaagtgtaatgtgccgtctttcccctcccatctcctccccctgcacacgtgctctgtacatatgagtttgattccttgtcacgcgtgcgtcgtttctttggatcgatctggaggaccccatcctttttttggtgggttgtgctttgtttcaagtcttccatgttcagatttcatttgttggaagatgttgtgcaagatggaggaatgctttgggatttgatgatttcttgggaatacctactactttgtttgtttccccttttatattctagtgggttttaggtttaagaatttgtaggtttggacatggtcttacatgattaaaatatgggtaaagtaggatggaagcatttggtatacctttggtgtggcattgcattctttatagtagcacttctaaagtttcaattttttttttttggggggggggggtgattgttgtagcaaagccctagatttgtgagaTttttTAGGGGTTTTATGCCACGAATTTGTAGATCTGATCATTACCCAGAACCACGAAGCCCTAGATTTGTGTGTATTGAATGGTCTTTACTTATAAACTTGCAGATCTGGACATGAACAGGAATAATGAATTTGGGAAAAGTATTGCATTTTTGCCTATTTCTATGGTAGCTTGAATGGCAGTGTATTCCTTGCTGTGGCATAAATCCATCCATAACCCTAGTTTCAAGTGTTGTATTTTCAGGGTAGCATGAATTGCAGTACATTCTTTGTTGTATCAAATTGTACGAATGCTCAGAACCTAGTTTCTGAGATTTAGTGGGGTTTATGCCAAGAATTTGTAGTTCTGGATGCGAAAAATCTGATTCTGATGGTTGCGATCTAATCTAAGCTAGCCTTCATCATTCATAGATTTCTTGCGCTGCATTCGCTCCTAGATTTGTGGGATTTTAATGGGTTTTTAGTTAATAATTttcgaaattgagacatgaacatgattgaaaattaggtaaagtagcaagtgatgtgcttttagggtagcatcaatggtgtacattctttgcaatttcattttttaaatcttgggagagaataaagccacccataagcctagatttatgagactgcaatggcgtttatgtcaagaatctgtagattaagaagtgaaaatctgatgctaatgttttgccaacagtctaaatttccttcagtgattaacgattattgtttttgtgcactaatgtagctagcctgtaccttcttgattgacattcattcctgaatcaagtcctaacctgctactgttgcttgttactatctccagaagCccagaggaagcagcgaagggtaaatggtacatggcaactgctgctaccaaccacatgactcgcgaccagagcctcatctccgacctcaagcctgtgaccggccgtgtcgttagccgtggcaacggcgcagggttgaaggtgcatggcagtggagctgtgaacacagagacggtagcatgtgccggggatcaacgcgaacctggtttctgttccccagctctctctacttgggctcaacatttcgttcgaccgtggtggctgcactgtcactagagctagtgatggatctgtagttggcaaagcgcgtagatcaggtgcgatctatgaggtggaattcctcaaagttccgcttaattagcaccagaaattcctcgctgcagtatcagttgtggtagtcagactcatatggtggctaatatcgcgtactgtttccaatgcttgttgggttagaacttaagtgggatctttcagttgttagttaaggatctgggggtttttctgaatgtaaaaagtgaaagaaggatgatgttggttatgtcgctggctatgagcagaactgatgagtttaccatgttggattgaccttgtcttttaccactgttgttaagttcctgtagcccgttgggctgttcatatccatcgacttgcaattgttattccagtttcagtcttcctgcatcgctgaattatgtctgattatctttgcaagattctctCccgtcgaccaaatctccattcatgttgcatggtagtatggtacatgatagagttccatcggtagtcctagaatgaataagctaaagccaaaatttaaattttaaaatttaattttgaagttggatttaaggtatttttaacataactaggaaggaagcccgcgcagatgcgcagacatctaatttattgttttatgatttatgaaataatgctaaaagatgtcatgtctcatcttttttatgctgtgagataaactgacttta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CDS seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_11g0023880 OsNaBo_11g0023880.01 Chr11 29664592 29674520 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.595548 2.476848 2.937780

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0678200 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g45290 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0678200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0023930 RBH 0.0 0.0 1.393465
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0023620 RBH 0.0 0.0 3.443123
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0023270 RBH 0.0 0.0 4.110581
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0023220 RBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0023850 RBH 0.000000 1.390832 8.885913
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0401200 RBH 0 0 0.0030355
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0024160 RBH 0.000000 0.000000 1.106125
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0433500 SBH 3.2534245 0.035568 64.2402305
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0023900 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0023900 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0023470 RBH 0.0 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0023160 RBH 0.0 0.0 1.546784
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0023380 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G023450 SBH 0.000000 1.297925 5.818026
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0023890 RBH 0.0 0.0 0.0
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