Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_11g0019000 | OGI:11067340 | 13/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:24395166-24416375 | ||||||||
| Gene Symbol | XA39, Xa39, - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MGDIRELSYDIEDNIDTFMLRVDGLEPAKKQNFTWLINKCRKSLSKIKIRHKIANEIKDIKSQVREVMERRDRYKIDDITTNLPTFVDPRILALYERVTKLVGVDKASDDLMKKLYVGHEAPKKLKMVSVVGIGGLGKTTLSKVVFDKLKLQFDCAAFVPVGQNPEIKKVLKDILVELNKDKYMSFDVTTVCERHMINEIREYLDNRRYLIVIDDVWEPSKWTIIRFALIDSNCGSRVITTTRICQVADEVAKGFGDIYKMEPLSDDNSKKLFYNRIFGVTCNGPTSNQSVEATEKILKRCGGIPLSIITIASLLVDKPAREWLSSRRSNIRRIALYKSWNPGKDNDLSVGMTHLRSFNAIKCTIGMMPSLLSFQVLRVLELHDCNVTGGLHLKHIGKLRQLRLGVRVPMGVGNLSSLQDLELQSGSIKSKEDFAMEVGKLMELRILKICVYYKIDEGTKKALLESLCGLRRLQNLVIKFDRNTTRIWEGWDHWEPPLRLREFHIFHTDLPRLPAWVYSMCVPYLSKLQLDVLAMEARDLDMLSMMPALRALILRTQQRISWTVGGSMPMLVELRLGLWASEDGAASDVGLGHLPLLNHIMVLLYCEGAMARQVEEVDAVWRRMGNAHPNCPAIAVYRFGELLMKRDDDQDDEEISTKDHVDENGDDENSARTKSRTMIQPKKRMRRRKLRTNLEPALCTHPVMLSDLTQFRDIRELSYNIEDNIDTFMLRVDSLEPSKKNKFTWLIDECKKSLSKVKIRHKIANDIKDVKSQVKIVMERRDRYNINNVIARLPTTVDPRILTLYEKATKLIGIEKASNDLIKRLSVEGEASKKLKMKPNIKNVLKGILIDLNKHKYMEFDSAILSERHLIDELREYLGNRRYTLDHFTNPYHFYSLVGRYLIVVDDIWETSTWKIIKCALIDSNCRSRVIATTRISQVAKEVAEEFGDIYIMEPLSEDNSKKLFYSRMFGVNHKDAADNQSIEVTKNILKKCGGIPLSITTIASLLIDKPMGEWSTVYDSIGFGPTDENEVVQNTRKILSFSYYDMPSHLKTCMLYLSIYPEDHWIEKDSLIWKWIAEGFIHEEQGKGLFEVGERYFTELINKNMIQPTEMYGSVYGCRIHDMVLDLIRILAIEGNFVKILNRVHEEHNSSSQSNTVRRLALHKRENLYENDSMAKDLTQLRSLQELDLGMGTIESYENFGMEVGKLTELRMLNIKGIDEGKWKALIESVFMLPRIQKLEISFFSLGKMITWDGWDHWEPSRQLQQYLIVIDDVWEIFTWKRINCALVDSNCGSKVITTTRISEVAEEVGDVYRMKPLSSDNSKRLFNNRIFGIGSNGPTNNQSVEATEKILKKCNGMPLSIVTMASLLVNKPVEDWIEVYDSIGFGPTGQNQEVENMRKILSFSYYELPCLLYLSIYPEDHWIMKKPLIWKWIAKGFVQEEQQTWLFEVGERYFTELINRSMIQPIEMYGRVFACRIHDMVLYLIRILATEENFVKILDRLYDVHSSSSQSSTTRRVAWHKSLNQDKMDNLTTRMAQLRSLNAIECPISMIPPLVGFEVLHVLALESCDIITGYHLKHIGKLQRLRYLGLRDTHLRKLTIRSLQLDEGSLKTLVECLCTLRKLQSIKIAGGSWKVLNGWEGWEPPRQFCKFNTYEFYLPRQPTWVDSVRIPHLSHLNLHLLAVDQRDLDALAMMPELRVLEVSTKLSISWTIAGGGLFPSLRCFSTDIEIMFLQGAMPMLTNIDFWASGDDSANDIGLGYLPQLNDVFIYLVQSDLTARQVYNPLEVDEDDGDGEEISDTEEDDINDDEEEEQNSDPEETDRNDGEEEISATDQKQDSGAAEEAKRRRLS |
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| Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_11g0019000 | OsNaBo_11g0019000.01 | Chr11 | 24395166 | 24416375 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGGggGACATTAGGGAGTTGTCCTATGACATTGAGGACAACATTGATACCTTCATGCTACGGGTGGATGGCCTTGAGCCAGCCAAGAAACAAAATTTCACATGGTTAATTAACAAGTGTCGTAAGTCGTTGTCCAAGATAAAGATCCGCCACAAAATAGCCAATGAAATCAAAGATATCAAGAGCCAAGTCAGGGAGGTGATGGAACGACGCGATAGGTACAAGATTGATGATATCACTACTAATCTTCCAACATTTGTGGATCCTCGCATCTTGGCATTATATGAGCGTGTCACCAAACTTGTTGGCGTTGATAAGGCAAGTGATGATCTAATGAAGAAGTTGTACGTGGGACATGAGGCGCCCAAGAAGCTCAAGATGGTCTCTGTTGTTGGAATCGGAGGATTGGGCAAGACAACTCTTTCCAAAGTAGTGTTTGACAAACTTAAACTGCAATTTGATTGTGCTGCTTTTGTTCCTGTCGGTCAAAACCCTGAAATCAAGAAAGTCCTGAAGGACATCCTAGTTGAACTTAACAAGGACAAGTACATGTCATTTGATGTAACAACAGTATGTGAAAGGCATATGATTAATGAGATTCGAGAATACCTGGACAATAGGAGGTACTTGATTGTTATTGATGACGTATGGGAGCCATCAAAATGGACCATTATTAGATTTGCTCTGATTGATAGTAATTGTGGAAGTAGAGTAATCACAACAACTCGGATTTGTCAAGTTGCCGATGAAGTTGCTAAAGGATTTGGTGATATTTACAAGATGGAACCACTTTCTGATGATAACTCAAAAAAGTTATTCTACAATAGAATATTTGGTGTTACCTGCAATGGTCCAACTAGTAATCAATCGGTTGAGGCAACCGAAAAGATCTTAAAGAGATGTGGTGGCATACCTCTCTCTATAATTACAATAGCTAGTTTGTTAGTTGATAAACCTGCGAGGGAATGgctatcttcacggaGgagtaatattcgtaGgataGcactgtacAaGagttggaacccaggcaaagacaatgacctatctgttggcatgacAcacttgaggtcattcaatgccattaaatgtactattggcatgatgccctcgcTtttgagcttccaagttctacgtgtgctagagctacatgactgtaatgtcacgggaggtttacacctcaagcatatcggGaaactacgtcagttgaGactgggcgtgcGtGtaccgatgggtgttgggaatctgagttcactgcaagacctaGagttgcagagtgggtccatcaaaagtaaggaagacttcgccatgGAggtgggcaagctgatGgagctgagaatcctcaagaTttgcgtatattacaagattgacgaGggcacgaagaaggcTttgctagagtctttgtgtggcctacgtagactccagaatctGgtgataaagttcgacagaaatacaacgaggatctgggaaggctgggaccactgggagcccccgctacggcttcgtgagttccATatattccacacagacctgcctcGgctgccagcgtgggtgtactccatgtgcgttccatatctatccaagctacaacttgatgtgttaGccatggaagcacgggacctggacatgctttcaatgatgccagcacttcgcgcactcatcctgagaacccagcagagaatttcgtggacgGttggtggatccatgccgatgctcgtggagcttcgattagggctatGggcgtctgaagatggtgccgccaGtgatgttggcttGgggcacctccctctgctcaatcacatcatggttctcctctactgcgagggtgcgatggccaggcaggtggaGgaagtggatgcggtgtggaggcgcaTggggaatgctcacccgaactgtcctgccattgctgtgtaccgatttggagagttactgatgaaaagagatgatgatcaagacgacgaggagatttcaactaaggatcacgtcgacgAaaatggtgacgatgaGaattcagcacggaccaagagccggacaatgatccagccaaagaagaGgatgaggaggagGAaactacgaactaatctagaaccggctctctgcactcatccggtcatgctttcagatttgactcaGtttagggacattaGggagttgtcctacaacattgaggacaacatcgataccttcatgttgcgtgtcgatagtcttgaaccaagcaaGaaaaacaaattcacatggttaattgatgaGtgcaagaagtcattgtccaaggtaaagattcgccacaaaatagccaatgacatcAaagatgtTaagagccaagtcAaGatagtgatggaacgccgcgataggtacaacatcaataatgtgattgctaggctgcctactactgttgatcctcgtatcttgacactatatgagaaggccacaaagctcattggcattgagaaggcaagtAatgatctaatcAagaggttgtcagtggagggcgaGgcatccaagaagcttaagatgaaacctaacatcaagaatgttctcaagggcatcTtgattgatcttaacaagcacAaatacatggaattcgattcagcaatactaagtgaaaggcatctcattgatgagctccgagaatatcttggaaatagaagatatactctagatcattttactaatccataccatttctactctcttgtcggtaggtacttgattgttgttgatgatataTgggagacatcaacctggaaaattattaaatgtgccctgattgatagcaattgtagaagcagagtaatcgcaacaactcgtatctctcaagttgctaaagaagttgctgaagagtttggtgatatttacatcatggagccgctttctgaagataactcgaagaagttattctacagcagaatgtttggtgttaatcacaaagatgcagctgataatcaatcaattgaggtaactaaaaatatcttaaagaagtgtggtggcataccattatctataactacaatagctagtttgttgattgataaaccaatgggcgagtggtccactgtttatgactctattggttttggaccgacagatgAaaatgaGgtagttcaaaacacgagAaagatattgtcttttagctattatgatatgccctcacacttgaagacttgtatgttgtatctaagcatatatccagaagatcattggattgagaaggatagtttgatatggaagtggatagctgaaggctttatccatgaggaacaagggaaggggttattcgaggttggagagaggtacttcactgagcttataaataaaaacatgatccaaccaacagagatgtatggcagcgtgtatggttgccgcatccacgacatggttctagatctcattcgcatattggcaatagaaggaaactttgtaaaaatattgaatagagtacacgaggagcacaactcgtcttcacagagcaatactgtccgcagattagcgttgcataaaagggaaaacctatatgaaaatgatagcatggctaaagacttaacacaattgaggtcattacaagagctagacctgggcatgggaaccattgaaagttatgAaaactttggcatggaggtgggcaagctgacggagctgaggatgctcaatattaaggggatcgacgagggcaagtggaaggctctaatagagtctgtgttcatgttgccgagaattcaaaagctggagattagtttcttctcactcgggaagatgatcacctgggatggttgggaccactgggaaccctcgcggcagctccaacagtatttgattgttattgatgacgtatgggagatattcacatggaaaaggattaattgtgctttggtggatagtaattgtggaagtaaagtaattacaacaactcgtatttctgaagttgctgaagaagttggtgatgtttataggatgaagccgctttccagtgacaactccaaaaggttattcaacaatagaatatttggtattggttccaatggaccaactaataatcaatcagttgaagcaactgagaagatcttaaagaaatgtaatggcatgcctttgtctatagttacaatggctagtttgttggttaatAaaccagtggaggactggatcgaagtgtacgactctattggttttgggcctacaggtcaaaatcaagaagttgagaacatgagaaagatattatcttttagctactacgagttgccttgtctactatacctaagcatatatccagaagaccactggatcatgaaaaaaccattgatatggaagtggatagctaaaggctttgtccaagaggaacaacAaacctggttatttgaggttggcgagaggtatttcaccgagcttataaatagaagcatgatccaaccaattgagatgtatggccgggtgtttgcctgccgcatccatgacatggtgctatatcttattcgcatcttggcaaccgaagagaactttgtaaagatactagacaggttatatgatgttcatagctcatcttcacaaagcagcactacccgtagggtagcatggcacaagagcttgaaccaagataaaatggataacttgaccacaaggatggcacaactgaggtcactcaatgccattgagtgtcctattagcatgattcccccattagtgggctttgaggttctacacgtgctagcactggaatcgtgtgatatcataacaggatatcacttgaagcatatcgggaagctacAaaggttgcgttacctgggacttagagacacacacctgaggaagctcaccattcgttcgttgcagctagatgagggctcactgaagacactggtggagtgcctatgcaccctgcgcaaactacagagcatcaagattgctGggggcagttggaaggtgttgaacggttgggaaggctgggagcccccacggcagttctgcaagttcaatacatatgaattctacctgcctcggcagccaacatgggt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| Protein seq | MGDIRELSYDIEDNIDTFMLRVDGLEPAKKQNFTWLINKCRKSLSKIKIRHKIANEIKDIKSQVREVMERRDRYKIDDITTNLPTFVDPRILALYERVTKLVGVDKASDDLMKKLYVGHEAPKKLKMVSVVGIGGLGKTTLSKVVFDKLKLQFDCAAFVPVGQNPEIKKVLKDILVELNKDKYMSFDVTTVCERHMINEIREYLDNRRYLIVIDDVWEPSKWTIIRFALIDSNCGSRVITTTRICQVADEVAKGFGDIYKMEPLSDDNSKKLFYNRIFGVTCNGPTSNQSVEATEKILKRCGGIPLSIITIASLLVDKPAREWLSSRRSNIRRIALYKSWNPGKDNDLSVGMTHLRSFNAIKCTIGMMPSLLSFQVLRVLELHDCNVTGGLHLKHIGKLRQLRLGVRVPMGVGNLSSLQDLELQSGSIKSKEDFAMEVGKLMELRILKICVYYKIDEGTKKALLESLCGLRRLQNLVIKFDRNTTRIWEGWDHWEPPLRLREFHIFHTDLPRLPAWVYSMCVPYLSKLQLDVLAMEARDLDMLSMMPALRALILRTQQRISWTVGGSMPMLVELRLGLWASEDGAASDVGLGHLPLLNHIMVLLYCEGAMARQVEEVDAVWRRMGNAHPNCPAIAVYRFGELLMKRDDDQDDEEISTKDHVDENGDDENSARTKSRTMIQPKKRMRRRKLRTNLEPALCTHPVMLSDLTQFRDIRELSYNIEDNIDTFMLRVDSLEPSKKNKFTWLIDECKKSLSKVKIRHKIANDIKDVKSQVKIVMERRDRYNINNVIARLPTTVDPRILTLYEKATKLIGIEKASNDLIKRLSVEGEASKKLKMKPNIKNVLKGILIDLNKHKYMEFDSAILSERHLIDELREYLGNRRYTLDHFTNPYHFYSLVGRYLIVVDDIWETSTWKIIKCALIDSNCRSRVIATTRISQVAKEVAEEFGDIYIMEPLSEDNSKKLFYSRMFGVNHKDAADNQSIEVTKNILKKCGGIPLSITTIASLLIDKPMGEWSTVYDSIGFGPTDENEVVQNTRKILSFSYYDMPSHLKTCMLYLSIYPEDHWIEKDSLIWKWIAEGFIHEEQGKGLFEVGERYFTELINKNMIQPTEMYGSVYGCRIHDMVLDLIRILAIEGNFVKILNRVHEEHNSSSQSNTVRRLALHKRENLYENDSMAKDLTQLRSLQELDLGMGTIESYENFGMEVGKLTELRMLNIKGIDEGKWKALIESVFMLPRIQKLEISFFSLGKMITWDGWDHWEPSRQLQQYLIVIDDVWEIFTWKRINCALVDSNCGSKVITTTRISEVAEEVGDVYRMKPLSSDNSKRLFNNRIFGIGSNGPTNNQSVEATEKILKKCNGMPLSIVTMASLLVNKPVEDWIEVYDSIGFGPTGQNQEVENMRKILSFSYYELPCLLYLSIYPEDHWIMKKPLIWKWIAKGFVQEEQQTWLFEVGERYFTELINRSMIQPIEMYGRVFACRIHDMVLYLIRILATEENFVKILDRLYDVHSSSSQSSTTRRVAWHKSLNQDKMDNLTTRMAQLRSLNAIECPISMIPPLVGFEVLHVLALESCDIITGYHLKHIGKLQRLRYLGLRDTHLRKLTIRSLQLDEGSLKTLVECLCTLRKLQSIKIAGGSWKVLNGWEGWEPPRQFCKFNTYEFYLPRQPTWVDSVRIPHLSHLNLHLLAVDQRDLDALAMMPELRVLEVSTKLSISWTIAGGGLFPSLRCFSTDIEIMFLQGAMPMLTNIDFWASGDDSANDIGLGYLPQLNDVFIYLVQSDLTARQVYNPLEVDEDDGDGEEISDTEEDDINDDEEEEQNSDPEETDRNDGEEEISATDQKQDSGAAEEAKRRRLS
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.085491 | 1.135887 | 0.549001 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0589800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g37790 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0589800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0018800 | SBH | 0.0 | 2.681500 | 1.106877 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0018940 | RBH | 0.0 | 2.536103 | 0.116736 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0018730 | RBH | 0.0 | 3.846479 | 1.008017 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0018310 | SBH | 0.000000 | 0.310080 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0018770 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0344600 | SBH | 0.028829 | 0.8824205 | 0.0846545 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0019280 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0356800 | SBH | 1.8868395 | 5.834602 | 6.9888025 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0019070 | RBH | 0.029859 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0019190 | SBH | 0.130008 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0018720 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0018410 | SBH | 0.276143 | 0.0 | 0.944027 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0018620 | RBH | 0.0 | 0.535392 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G018730 | SBH | 0.222103 | 2.844661 | 3.268044 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0019010 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
