Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_04g0027190 OGI:04027370 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:32142022-32148890
Gene Symbol RLCK162, OsRLCK162, SDK6, SDRLK-53, RLCK164, OsRLCK164, SDK14
DNA seq

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Function Putative serine/threonine-protein kinase receptor [UniProtKB/Swiss-Prot:Q09092]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_04g0027190 OsNaBo_04g0027190.01 Chr04 32142022 32148890 + NAM
CDS seq

atggcctgcctgagccacaacctcccagttctcatccacttgctactactaatctctttctgcagatgcgatgaccagttgagacatgcgaagcgactaatctctcctagcgacatgctcatctccaaaggtggagactttgcgctcggattcttctccccggccacctccaaccagagcttattccttggtatatggtatcacaatatctccgagcgcacctatgtttgggttgccaaccgcgacgacccgatcgctgcatcttcatccgcgacgctctccatcagcaacaattctgctcttgtattgtcagattccaaaggccgcaccctatggacgacgatggcaagtcccaacagtattgtcaccgaagacgacggagtttacgcggtgctgctcgactcaggaaatttggttcttcggctatcgaacaatacaaccatatggcaaagctttgatcaaccaactgataccattctgcccaacatgaagtttttagtgagatcctacggacaagtcgccatgcggttcatcgcttggaagggcccagatgacccatccaccGgggatttctccttcagcggcgatcccacgtcaaactttcagatcttcatctggcacgagacaaggccatattaccgtttcattctgtttgatagtgtctcggtgtccggtgcaacatacttgcacaacagcacctcttttgtctatgaaacagtcgtgaacactaaggatgagttttacctcaagtacacaatctctgatgattcaccatacacgcgcgtcatgattgactacatgggcaactttaggttcatgagttggaacagcagcttgtcctcatggactgtcgcaaatcaactcccaagggcccctggctgcgatacctatggctcgtgtggcccattcggctactgcgacctcacgtcggccgtcccaagttgccaatgcctcgatgggtttgagcctgttggctccaattcttcttcaggatgccggagaaagcaacaattgagatgtggagatgaccattttgtgatcatgtctagaatgaaggttcctgacaagttcttgcatgtccagaacagaaacttcgacgagtgcacggacgagtgtacccgcaactgctcgtgcacggcctacgcctacaccaacttgaccgcaaccggcaccatggtcaaattctacagtaaacagaaagaagaagaggcacatggtggcgtccgacaaaacaaggaaaaaacgaaaagacctgtcattcaacagttgagcactattcatgatttgtgggatcaaaatctggaatttccatgtattagctttgaagacatcactgctgcaacagacagtttccatgacaccaacatgcttggaaaaggaggttttggcaaagtatataagggaacattggaggatggcaaggaaattgctgttaaaaggctcagcaagtgttctgagcaagggatggagcagttcagaaatgaactggttcttattgccaaactgcaacacaaaaacttagttagacttcttggttgctgtattcatggagatgagaagctgcttatttacgaatacttgcccaacaaaagcttagataaattccttttcaatcatacaacagaggctacacttgattggctgacaaggttcaacattatcaaaggggtagcaagaggacttctttatctccatcaagattcaagaatgaagataattcatagagatctcaaagcaagcaacatactgctcgatggagagatgaaccccaaaatatcggattttggtatggcgaggatatttggaggcaatgagcaacaagaaagtactagacgagttgttgggacatatggttacatgtcacctgaatatgcaatggaaggcaccttttcagtcaagtccgacacatatagctttggtattttgcttctagaaattgtaagtggattaaagatcagctcacctcatcatcttgtgatggattttccaaaccttatagcttacgcatggaacttatggaaagatggaagacaaagggattttgtggacaaatcaattttggagagctgttccctcagcgaagtttttaaatgcatccatattggactcatgtgtgttcaggacagcccaaatgctaggccactgatgtcattcgttgtgtctatgctggagaacgaggacatgccacacccaattccaacacaacctatatattttgtgcagaggcattatgaatcagaagaaccaagagaatactcagataaatctgtcatctaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 0.181934

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0633600 RBH 0.188416 0.343982 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g54110 RBH 0.122601 0.372555 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0633600 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0027890 RBH 0.000000 0.0 0.836688
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0028560 SBH 0.047108 0.229314 0.848784
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0028230 SBH 0.369437 0.739790 2.057186
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0028030 RBH 0.031282 0.013722 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0028290 RBH 28.615248 3.884939 5.803555
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0508000 RBH 0.2074425 0.4359805 0.457304
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0026980 SBH 0.129210 0.011754 0.285752
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0510900 RBH 3.4301045 2.6218555 4.6655365
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0027440 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0027200 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0027330 RBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0027820 SBH 0.128691 0.086759 0.434129
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0027880 SBH 0.0 0.604004 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G027290 RBH 0.343259 0.0 0.378354
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0005040 SBH 0.000000 1.020672 6.215721
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