Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_02g0024890 | OGI:02001240 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:25982565-26013256 | ||||||||
| Gene Symbol | TMS10, OsSERK4, OsSERL9, OsSERK2, OsBAK1-5, OsTMS10, SERK4, SERL9, SERK2, BAK1-5, OsBAK1, BAK1, MAK3, OsGIRL1, OsGIRL1-1, OsGIRL1-2, OsGIRL1-3, LP2, OsLP2 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MHAVVDSRHGTGMLCAQPHGEKIAVLFDASLSLPFPDFSSTEVFYIYVSRLKTQRANLTTCKQTKDACPEGAAATALLRWQHRLLNGSTDMLSLLGFKEAITNDPLGVLSSWNKSIHFCSWKGVWCSPKHPGRVTALNLAGQGLSGTIAVSVGNLTSVRSVDLSSNNFSGQIPHLANLQKMQVLNLSFNTLDGIIQDTLTNCSNLRKLDLYTNLLKGMIPSAIGLLRNLVYIDLSRNNLTGIIPASLKNISLLETIYLQDNQLEGSIPDELGRFSNILVLVLGGNRLSDTRRIGFSKRSIDARHEASDSEWAIRSIVGTGSDFRFLTSEQWAGCRLAAAQSAADMARGARSTAAGEKISSPTCMGGASLSFPFPNSSSRLPVPAEQDKPACICQDGNREKRTYIVLDFWLGDPVPVMRPVKHSMFVVLQLLLLLFYGVCSIRCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTRKSLSGSISASVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQQLILRYNNFRSRIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNLSGIIPPTLGNMTSLVILALTTNHLRGRVPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPETLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASTLKQVVLQTNNFTGQIPTTFGKLFGLSRLDLQANMLEAKDSEGWGFLYALRNYSVLQILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLGYLMLGGNELSSIVPSCIGNLSGLVQLTLDANKLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRIERKRNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSEYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTTVASKCLRLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLNSNMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLNGTIGYIAPEYAQCGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVMQVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDDMLQRRELQCNESFMRAKQQLKITMVVLLALLLLTYGFGNVRCLPNHDDYSVDLQALLGFKQGITSDPNGALSNWNTSTHFCRWNGVNCSQVRPWRVTGLNLTRKNDLQQREVLNLRQNSLNGIIPDGLANCSSLTALALSSNNLMGRIPPTIGNLSMLLGLDLSQNNLAGIIPQDLGKIASLQYVDLSRNQLNGGIPNEFWQSQNIRVLYLNQNNLSVRLPQILPNVSYLTELSLASNMLVSTLPCNIGDAIPNIQLLYLGNNTFEGNIPDSIGNASELTELDLLSNNFDGRVPSPLGKLSRMSYLNLERNEFEANDSEGWEFFYGLANCSLEFLSLSTNQLQGVIPNSVGNLSKSLTRVLLGGNKLCGTVPQSIGKLHNLTQLSLDENNLTGKIEEWLQHLNLQSNNFIGIIPLSIGNLTQLASLILAENEFDGPIPSSLGNFSQLLKLNLSYNNFHGHMPKEVFSITTMTSCVLAYNDLDGPIPLDFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSSLKSLTMLNLSHNNLSSTIPTALGELKFLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYEGKLVQVKVQVAIKVFDLKMRCADKSYISKCEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISITANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSEYAQSWQPSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPVFDNGLNIVNFVERNFPYKIAQARWSSRPGAIARAMNDELNKTLSHCQEMDGFSGPCKTLASGRNTGLLLLEMENPSNTGGVGIFDSIRRRVEENYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTWLVLGQNKLSGGIPSALNLPLLTILGLEENMLGQVLPPKIGYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLMVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLSENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIRPSIVNLTLLIELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLQGEIPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAASLKIERKSDLVRLLIPIFGVMSLTVLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYNDLARATGNFCESNLIGRGSYGSVYTGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFISECEVLRTIQHRNLLSILTACSTIDNTGKDFKALVYEFMHNGNLDTWLHHEHAGVVRKRLSMDQRVSIAVNMADALIYLHHECGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSPLTSEGNSGCNSSIVVKGTIGYIAPGDFAR |
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| Function | Receptor kinase-like protein Xa21 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q2R2D5] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_02g0024890 | OsNaBo_02g0024890.01 | Chr02 | 25982565 | 26013256 | + | NAM | ||
| CDS seq | 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ttctctcgagtttctttcgttatcaaccaatcagctgcagggagtcataccaaattcagttggtaacctttcaaaaagtctgacacgtgtgttgttgggtggaaacaaattatgtggaactgttccacaaagcataggaaaacttcataatttaactcaactctcactagatgaaaacaatcttactggcaaaatcgaagaatggctacaacatttaaatctccaatcgaacaacttcattgggataattccactttccattggcaatcttacacaattggcatcgctcattctagcagaaaatgaattcgatggtcccataccatctagcctaggcaatttttcacaactcttgaagttgaaccttagctacaacaatttccatggtcatatgcctaaggaggtctttagcatcacaacaatgacatcatgtgtattggcctataacgatttagatgggccaatacctctggattttgctgagctgcaacagcttacaaagttacatctttcatcaaacaggttaactgggaaaattcctgaaagcttgggccaatgccatgagctagaaaatatccagatggaccaaaaccttctaacaggaaacattccaatatcattcagtagcctcaaaagcttgaccatgcttaatctttcccataacaacttatctagcaccatacctacagctttaggtgagctaaaatttctcaaccagctggacttatcgtacaacaatctcaatggagaagtaccaacaaatggagtattcgaaaacaccacggcggtgtctataattgggaattggggtatctgtggaggaccatcaaatctacagatgccaccatgccctactacttaccccagaaaaggaatgctatactacttggtcagaatactaattccattattgggcttcatgtcagttataccgttgctctacttaacacaagttaaaaacaagacgtcaaagggaacatatttgttgttactttcattcggcaagcaattccccaaagtctcctaccatgatctggctcgagctacaggagacttctccaagtcaaacttaattgggagtggcagctacggttcagtgtatgaaggaaagttagttcaagttaaagtgcaagtggctattaaagtatttgaccttaagatgagatgtgcagacaaaagctatatatcaaaatgtgaggttttgaggagtattcggcatagaaatctcctacctatcctaacagcatgttcaacaatagataatctagggaatgatttcaaagctctagtttatgaattcatgccaaatgggaatttggacaaatggttacataagaaatcatcttatgaagctccaaatagtttgggcctagggcaaagaataagcataactgctaatatagctgatgcattaagctatttgcaccatgacagcagaacatccattgtccattgtgatttgaagcctagcaatatcctcctagatgctgatatgaatgcttatttgggcgactttgggatttcgaaccttgtccataattctacatcaacatcggcttgccattcagagtatgctcaaagttggcaaccatcaatttgtGgggatgtttacagtttcggaatagtacttctagagatagtgctcggcaaaagacctacggatcccgtgtttgacaatggactgaacattgtcaattttgtcgagaggaactttccgtataagatagcacaggcgcggtggagtagccggcctggtgcaattgcgcgggcgatgaacgacgaactgaacaagacattgagccattgccaagagatggatgggttttctgggccgtgtaaaactttggcaagcggacgtaatactggtctactgctactggagatggaaaatccgagtaacaccggaggagtcggcatcttcgattctatccgtagaagggtagaagagaattatctcagtggaaccatccctgcaactgttggaaacatcacccagttaagcgttctcaaccttaaatccaatcagttagaagggaatatcccagatggggtctggcaattgtcaaatctaacatggcttgtcctaggtcagaataagctatcaggtggaattccatcggccctaaacctgcctcttctcacgatacttggtttggaggaaaatatgttgggccaagttttgccaccaaagattggctatgccctcccaagtctccaactgataagcatgtattctaacaagtttgaaggtcagattccaacttctataggcaatgcttcaggtctgcaattaatggatttctcagcaaataattttactggtcaaatccctagttctattggaaggctttcaaagctgtcgcgactaaaccttgagcgaaaccagcttgaagcaagtgacaatcaaggctgggaattcttatatttgttaagaaattccacatctctgatggtgttctcccttgctcaaaatcatctgcagggatctctaccacattccgtggctaatctgtctagcaatctcaagattttactgttgagtgaaaacaaactaacagggatagtccccccaagtatagggaacttatgtaacttaagtaaactcgggctagagcaaaataattttagtggggaaattggagaatggattgggaagctgaaaaatctgcaaggtttaaatcttggagggaacaccttcttcgggccaattcggccctccattgtaaatcttactctgttgatagagctctttctagataataataaattcgaagggaccataccaactgctctgagttacctacaactcctcagtaagctagacctttcacacaatcatctgcaaggagaaataccaagaaatggaatcttcggaaatgccacagctgtttcacttgacggcaacttgaggctttgtgggggagtggtggattttcatatgcctttgtgctctgcagcttctctaaaaatagaaaggaagagtgatttggtgagattgttgattccaatatttggcgtcatgtccctcaccgtgttgatttacattataacccttggaaagaagacaccaagaagaacctatttatttctgttttcttttggtaagcaattccctaaagtttcttacaatgatctagctcgagctacaggaaacttctgtgagtcaaacctaattggaagaggaagctatggttcggtatatacagggaagttaacacaggccaaaatagaagtggctattaaggtttttaatcttgagatgagacgtgcagatagaagttttatatcagaatgtgaggttttgagaaccattcagcaccggaaccttctttctatactaactgcatgctcgacgatagacaatacaggaaaagatttcaaagctctagtttatgagtttatgcataatggtaatttggatacatggttgcatcatgaacatgctggtgtagttcgcaaacgtttgtccatggatcaaagagtaagcatagctgttaacatggctgatgctttgatctatttacaccatgaatgtggaaggcctattgtccattgtgatgtgaagcccactaatatccttctggatgaggatatgagtgcccatttgggtgacttcggcattgcaagtcttgttcttgattctccattgacatcagaagggaattctggttgtaacagttcaatagttgtgaagggaaccattggatacatagctccaggtgattttgctagataa
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| Protein seq | MHAVVDSRHGTGMLCAQPHGEKIAVLFDASLSLPFPDFSSTEVFYIYVSRLKTQRANLTTCKQTKDACPEGAAATALLRWQHRLLNGSTDMLSLLGFKEAITNDPLGVLSSWNKSIHFCSWKGVWCSPKHPGRVTALNLAGQGLSGTIAVSVGNLTSVRSVDLSSNNFSGQIPHLANLQKMQVLNLSFNTLDGIIQDTLTNCSNLRKLDLYTNLLKGMIPSAIGLLRNLVYIDLSRNNLTGIIPASLKNISLLETIYLQDNQLEGSIPDELGRFSNILVLVLGGNRLSDTRRIGFSKRSIDARHEASDSEWAIRSIVGTGSDFRFLTSEQWAGCRLAAAQSAADMARGARSTAAGEKISSPTCMGGASLSFPFPNSSSRLPVPAEQDKPACICQDGNREKRTYIVLDFWLGDPVPVMRPVKHSMFVVLQLLLLLFYGVCSIRCATAPDNSTDISSLLDFRQAINDPTGALNSWSTAVPHCQWKGVSCSRRHVGRVTALNLTRKSLSGSISASVGNLTFLHTLDLSHNNLSGQMPHLNNLQKMQVLNLSYNSLDGIIPDTLTNCSNLQQLILRYNNFRSRIPPQIGLLTNLVYMSMSNNNLSGIIPPTLGNMTSLVILALTTNHLRGRVPDEIGKLPNISIVVLGDNMLSGSIPETLSNSSITGIELRANLLTGTLPINMGDNLPKLKSLFLGHNMLEGHIPASLGNASTLKQVVLQTNNFTGQIPTTFGKLFGLSRLDLQANMLEAKDSEGWGFLYALRNYSVLQILELTENQLQGIIPNSIGSLSNTLGYLMLGGNELSSIVPSCIGNLSGLVQLTLDANKLTGSISPWIGNLKYLEYLHLGKNRFTGPIPYSIGRLTRLTELYLENNAFEGTIPISLGNLKGLSVLNLSHNILSGTIPAVLGDLPLLSKLDLSYNNLQGEIPRIELFRNATSVYLEGNRGLCGGVMDLHMPSCPQVSHRIERKRNLTRLLIPIVGFLSLTVLICLIYLVKKTPRRTYLSLLSFGKQFPRVSYKDIAQATGNFSQSNLIGRGSYGSEYKAKLSPVKIQVAIKVFDLEMRWADKSFVSECEILRSIRHRNLLPILTACSTIDYSGNDFKALIYEYMPNGNLDMWLHKKNTTVASKCLRLSQRVNIAVDIANALSYLHHECERSIIHCDLKPMNILLNSNMNAYLGDFGISSLVLESKFASLGHSCPNSLIGLNGTIGYIAPEYAQCGNASTYGDVYGFGIVLLETLTGKRPTDPMFENELNIVNFVEKNFPEQIPHIIDAQLQEECKGFNQERIEQENRFYKCLLSVMQVALSCTHPIPRERMDIREIAIKLQAIRTSYAEATKRDDMLQRRELQCNESFMRAKQQLKITMVVLLALLLLTYGFGNVRCLPNHDDYSVDLQALLGFKQGITSDPNGALSNWNTSTHFCRWNGVNCSQVRPWRVTGLNLTRKNDLQQREVLNLRQNSLNGIIPDGLANCSSLTALALSSNNLMGRIPPTIGNLSMLLGLDLSQNNLAGIIPQDLGKIASLQYVDLSRNQLNGGIPNEFWQSQNIRVLYLNQNNLSVRLPQILPNVSYLTELSLASNMLVSTLPCNIGDAIPNIQLLYLGNNTFEGNIPDSIGNASELTELDLLSNNFDGRVPSPLGKLSRMSYLNLERNEFEANDSEGWEFFYGLANCSLEFLSLSTNQLQGVIPNSVGNLSKSLTRVLLGGNKLCGTVPQSIGKLHNLTQLSLDENNLTGKIEEWLQHLNLQSNNFIGIIPLSIGNLTQLASLILAENEFDGPIPSSLGNFSQLLKLNLSYNNFHGHMPKEVFSITTMTSCVLAYNDLDGPIPLDFAELQQLTKLHLSSNRLTGKIPESLGQCHELENIQMDQNLLTGNIPISFSSLKSLTMLNLSHNNLSSTIPTALGELKFLNQLDLSYNNLNGEVPTNGVFENTTAVSIIGNWGICGGPSNLQMPPCPTTYPRKGMLYYLVRILIPLLGFMSVIPLLYLTQVKNKTSKGTYLLLLSFGKQFPKVSYHDLARATGDFSKSNLIGSGSYGSVYEGKLVQVKVQVAIKVFDLKMRCADKSYISKCEVLRSIRHRNLLPILTACSTIDNLGNDFKALVYEFMPNGNLDKWLHKKSSYEAPNSLGLGQRISITANIADALSYLHHDSRTSIVHCDLKPSNILLDADMNAYLGDFGISNLVHNSTSTSACHSEYAQSWQPSICGDVYSFGIVLLEIVLGKRPTDPVFDNGLNIVNFVERNFPYKIAQARWSSRPGAIARAMNDELNKTLSHCQEMDGFSGPCKTLASGRNTGLLLLEMENPSNTGGVGIFDSIRRRVEENYLSGTIPATVGNITQLSVLNLKSNQLEGNIPDGVWQLSNLTWLVLGQNKLSGGIPSALNLPLLTILGLEENMLGQVLPPKIGYALPSLQLISMYSNKFEGQIPTSIGNASGLQLMDFSANNFTGQIPSSIGRLSKLSRLNLERNQLEASDNQGWEFLYLLRNSTSLMVFSLAQNHLQGSLPHSVANLSSNLKILLLSENKLTGIVPPSIGNLCNLSKLGLEQNNFSGEIGEWIGKLKNLQGLNLGGNTFFGPIRPSIVNLTLLIELFLDNNKFEGTIPTALSYLQLLSKLDLSHNHLQGEIPRNGIFGNATAVSLDGNLRLCGGVVDFHMPLCSAASLKIERKSDLVRLLIPIFGVMSLTVLIYIITLGKKTPRRTYLFLFSFGKQFPKVSYNDLARATGNFCESNLIGRGSYGSVYTGKLTQAKIEVAIKVFNLEMRRADRSFISECEVLRTIQHRNLLSILTACSTIDNTGKDFKALVYEFMHNGNLDTWLHHEHAGVVRKRLSMDQRVSIAVNMADALIYLHHECGRPIVHCDVKPTNILLDEDMSAHLGDFGIASLVLDSPLTSEGNSGCNSSIVVKGTIGYIAPGDFAR
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.206270 | 0.000000 | 0.311611 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0614966 | SBH | 1.016674 | 1.391367 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g40180 | RBH | 1.164243 | 0.429848 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0614966 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0025000 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0025190 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0025050 | SBH | 0.778974 | 0.000000 | 0.521185 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0024680 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0024780 | RBH | 8.651113 | 0.0 | 4.050574 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0396800 | RBH | 0.89135 | 0.030226 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0024480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.116930 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0425700 | SBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0024730 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0017820 | RBH | 0.544686 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0024960 | RBH | 65.593323 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0024760 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0024420 | RBH | 4.755641 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G024890 | RBH | 0.0 | 1.775304 | 0.840148 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0024910 | SBH | 5.407691 | 0.0 | 2.932688 |
