Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_11G004200 OGI:11009080 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:3004040-3027670
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Putative disease resistance protein RGA3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA40]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G004200 OsN22_11G004200_03 Chr11 3008792 3027282 + NAM
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G004200 OsN22_11G004200_01 Chr11 3004040 3006369 + NAM
CDS seq

ATGGATAGCCGGAGAGGAAGGTGGTTGGCAGGAGGCGTGCGCGGTGGTTGGATTTCTCGGCGTTCCCTGGGATTCCCGTCGGAGGCCGCCGGATTCAAGCTGGTTCATCTCTTCGGTAGCACAAAATTACAGCAACCATGTAAGGAGGAGGATCATAAACGGCTGGAACGCGTCTTGCTAAGAATGCACTCTGTTGTCGAGGAAGCAGATGGATGCCACATCACAAATCAAGGAATGCTCCTACAGCTAAAGGGACTTACTGAGGGATTCTACCTCGGATACTACATGCTTGACAATATCAAGTTCCAACCCCCTGAAGAAGAGAGCATCAAAGATGAGGTTGTAGTCATTGGTAGAACAGAGGATGTTCCTAAGTTTGGGACAACCCAACCCATTAGGGTGAAGAGGCTGTCTGAGGAAGACGACTGGTACTACTTCAAGGCGCTTGCCTTTGGAATTATGGATCCTGATGAGCATCCAAAACTAGCATCTCTGGCCATGCAGCTATGTCACGCACGTGGGCCAGGTTGGAATGCAGAGAATCTTATTATTCGTAAGAGAGGTGGGCAGGTGGCACAGAAGCACTTGTCTTCCTCTGGTGTACACCCTGACTATCTTTTCGAAAGAAATACCCCAGTTGATTTCAGCAGGATAGCCTTTGTGGATGGTCAAGTTCAAGGTTTCCTAGTTTATGATGTTAGGGTGGCTTCCCCTGCAGAAGGTCAGCTACCAAAGCTGACGTCATGA

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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G004200 OsN22_11G004200_04 Chr11 3013780 3017015 + IsoSeq
CDS seq

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Protein seq

SETEFCGKVPTVFANHPAAAASGRSPGCSAGGGGGGGGGGGEVFAIGRPRISIERWNKRKS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 1.073598 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0161100 RBH 1.054059 1.859172 1.226377
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g06220 RBH 0.844879 1.186281 0.326336
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0161133 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0004250 RBH 0.000000 0.0 1.058541
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0004310 RBH 0.0 0.0 0.899215
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0004220 RBH 1.473024 0.0 2.514467
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0004170 RBH 0.000000 0.056272 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0004130 SBH 0.0 0.0 2.690060
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0052300 RBH 0.1005865 2.026358 3.168913
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0004220 SBH 0.000000 0.0 0.281950
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0052200 RBH 1.484537 1.9957225 5.355819
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0004140 SBH 0.039922 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0004220 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0004220 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0004120 RBH 0.0 0.0 0.228124
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0004240 RBH 0.0 1.522199 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G002200 SBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0004210 SBH 0.311328 0.662633 1.232794
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