Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_05G009000 | OGI:05025080 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr05:9264166-9271227 | ||||||||
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Transcripts
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| OsN22_05G009000 | OsN22_05G009000_01 | Chr05 | 9264166 | 9271227 | + | NAM | ||
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| Protein seq | MWRCCSSNRASGLLVWLVLVCSWQIAAAQPQQAAKTDPTEVAALNTILGRWSKKASSEWNISGEPCSGVASDPSNWDNFPNINPLIKCACTYNNNTVCHITKLYAQKVYKLDVVGQIPAELQNLTYLEDLNLNFNYLTSAIPSFIGKFPSMKYLGLALNPLSGPLPKELGNLTNLLSLGISLDNFTGELPEELGNLTKLQQLYIDNSGFSGPFPPTFSKLKNLNTLRASDNEFTGKIPDYLGSLTNLIDLAFQGNSFEGPIPASLSNLTKLTTLRIGDIVDGTSSLVFISNLTSLSTLILRNCKVSGNLGPVDFSMFTALILLDLSFNNITDEVPQSILNMGKLEFPFLGNNSLTGKLPDVISSSLKTIDFSYNQLTGNFLSWKVMRFAIVRIWLQTNLMLVAITAVSDSNDAQNSSFWIKLPSARHSLFSWISRMNFKNNGYVFHILTDYSFAVDCGSNSSTRGSDNTIYEAEPTNLGDASYYVTGQTRWGVSNVGKFSLASNGMNIISSSEHFQNAVNSRLFETARMSPSSLRYYGLGLENGNYTILLQFAEVAYPDSQTWQSLGRRVFDIYIQGSLREKDFDIRKMAGGKSFIVVHRSYTATVSNNFLEIHLFWAGKGTCCIPTNGYYRPMISALSVSPNFTPTVRNGVPKRRSKVHTIAGILIGASILGLAALFGIFMMVKKRRTMAQQKEELYNLIGRPDVFSNTELRLATDNFSSQNILGEGGYGMVYKGKLSDGRVIAVKQLSQSSHQGKSQFVAEVTTISAVQHRNLVKLHGFCIDSNTPLLVYEYLQNGSLDTALFGIASGLTYLHEESSVRIVHRDIKASNILLETDLTLKISDFGLTKLYDEKQTHLWDLYEKEQVLGIVDPSLKDFNNNEAFRVIRVALLCTQGSPHQRPPMSKALAMLTGEVELSEVVVKPSYITEWQLRDVNRSYATSSYSGSTNPEFSTQKEIEPLTQS
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| A3 | Chr05 | 9268576 | 9268668 | + | OsN22_05G009000_02 | OsN22_05G009000_01,OsN22_05G009000_02 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.868261 | 0.000000 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_05g0253200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.173666 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os05g16420 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.358893 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os05g0253200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_05g0009170 | RBH | 0.188039 | 0.814950 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_05g0009220 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_05g0009110 | RBH | 0.588125 | 0.0 | 0.205621 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_05g0009200 | RBH | 0.006028 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_05g0009250 | RBH | 0.0 | 2.592178 | 0.344113 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_05G0140200 | RBH | 0.4547805 | 2.347724 | 0.0045095 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_05g0009120 | RBH | 0.029445 | 0.694205 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0140400 | RBH | 0.9392435 | 6.2197055 | 0.004043 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_05g0009100 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_05g0009050 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_05g0009150 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_05g0009200 | SBH | 0.059003 | 0.000000 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_05g0009280 | SBH | 0.086092 | 24.981190 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_05g0009270 | RBH | 1.980855 | 27.920137 | 0.0 |
