Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_05g0009110 OGI:05025080 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr05:9268796-9279127
Gene Symbol -
DNA seq

agcaatagtgtgagagagagagatgtggcgttgctgcagcagcaacagagcctctgggcttctcgtgtggctggtgcttgtgtgctcatggcagattgcagctgctcagcctcaacaagcagcaaaaactgatccaaccgaaggtaagaacgtaaccatgttccccgcaaaaaaaaagaacgtaaccatgttcttgggttttcttggcttaatttgtccgtggacactacatgattaatttagaggaatttgtgttgattcatcgcctaattctgcttacacatagtattaattaatgttgactttgttgagttaaccgtgcagtggcagccctgaacacgattttgggaagatggagcaagaaggcatcgtcggagtggaacatcagtggcgagccctgcagcggtgtggcctcggatccgagcaactgggataacttccccaacatcaaccccctcatcaagtgcgcttgcacttactacaacaacaccgtttgccacattaccaaactgtatgcacagtagcaattttgtgtctgacattttgctattgaagttaattagaacctgtacaaatcaattacaaattaaacaccAaaattacaaaatatttggctaaatttgaataaacttatgctaaattagaaaggaatgaaaattttgtcctgaagaacatcctagcagggaccgagtgacaaactgacaatcccaaaattctgaaactcttcccaaatatggaactgttagacacctcttctctcaacaaataacagcatatctaatacaagctcgacaagtacaaccagctgtttgaggtgaaactgaggaagaaaagggatagaggatacaagctctaaaaggtctagaagctaggaagagcaagtggagctaggaggagaggtagtggaaagatcgccgaggttccagcccggaaccaggacactgccatcgccgagccaccatggccaagtcaccgttttctgctctgttccatcgttgaagtcctcctgtttcggccttttctattcctctacattgcttgtttgagcctcggcatggattagcaattgagtaggccctacagcccaacgggttcctaataggaggcaactattttttgcacctgaagatccttaatagaaaaccccttatattttcagggcttcaggctggaaggcagaggcatttggtgtttcttccaatcagtaacttgggattcacatcgactaaccattacttctctcaaatgtttttagttggccatagaggaaatgttggtatgtcctttacaaaaaccgatggtgtattcagtcctccaggtcaagtggcatggttttgcatgcccttgcaggaaaatcaaacggtttataagttaggggtgaaaatttaactgtccctatagaagttgagagcagatgtcacgtcctgataaattcatcccgaaataaaaatcatcttctaaaaggaataatagaattaattaaaattcgaaaagaaattggcaaaccctaaaatacgtacaagaaaaattcaaatgtggcccggagaatttttgttaaattctccttggtctaaaaggagccctcaaattttagtggaattttcagagcacaaataataattattaagaaataaacaaagttgaaaaggttttataaaaagaaaaatccctaaaagtcttcttttccccccccttcctctcttgggccggctcggcccaactctccctccctctctctcctctccccccccccgcggcccatcggtctcccccgcgcacgcgccgctgacaggcgggcccgcccgccgccctcgctgacgggtggggcccacctgtcatcgccttcctcctgccgctcccgccgctcgcccgtgccctagcgccgccgccaccgccgaatccgccgcatcccgccgtccccgcacgccataatgaggggggaatcattccccgcgattccctctcccgattcccccgctttttccctctctctctccctcggtttcgttcggagttaatcccgcaagtttcgccggcgtcttcaagggcggccgagatctccgcgcccgtttcctccctctccggccgcgctctccccctccagacgctatataagagttccccgtgctctcctcctccgtttccgccactcgccgcctctcctccccgtcggaatcgagcccgcaccgtcgcaccttctctccgccgtcgccgccgagctccggttcgccgccgtcgtcgctccggacctcctccccactcggcgtcacctccatcggcttcgccgcgtccccgtcgacctcggccacccctccgcttcgctcgccgaccgccggagcaccgtcgccctcgccgtcccgaaccgcgccgccgccttcctccgcttcggccgccgttcccgtcgtcgccgtcgactcggggtgagccgaagaccgccctttcgcttccctctcctctccgctctctcgggcgccgctccgccgcgccggtggtcgccggcggtgaccatcggggcgcggtcgtgccgcctcccgtcggccgtgccggcgaggccgccttcgggcgcgccctcgcggctgccaagtgggcccggccgtcagccgcccgcgcccgcgggtgcggctgacgcgtgggacccacggcgccggccgccgccagccgcgtgctcccggtccaccgtggaccgagaggctgacgcgtgggccccactcccgtggacccggtccgcgcgccctctctcccggctgacgcaataaatgggtttttaattaaaatttaaatgaagaaattcgcaaatatccatttaaagagcatataaacttcaaatggccatatcttggccatttgaactcggaattggaccgttcaagtctctaatttttccttaagaagtcaagaacccatttttgtgctttgtttctgctgttatgtggagtttagtagagtaaaagccttttcttttccgtcggtcgtgtagacgctgcagcttcggaagatccgctcttcgtggaagttgaagccggtgtttgggaaagcgagcaaggcaagtcacatcatccttgaacatattgaatcccagtttgtaaaattatgttgatttaaattattgcattatcgctttatttaaattcccgcgttatcactgttttatctagccatacctatttacctttgttatgaccttattattattgttattgttattatttccttgttcaccctagagtaaacaaaaccccaactagtggacactctactcatggcaccactagtttaattttaggtagatgcttcgcaatttaattaggtaacattaggtggttttacaactctagactttgggaattctcatatcatttggacactatggaattgttggtttatggtggaattggacatacacctctcttcctctttcaaaacccctaaaacctgttttcggtggggtttgggtgcatgccagttgtgggaagtagcaccccggccactataaggattaagctcgggcctctgttgcaaagcactaccgtacttccacatgtctagtgggtaaggcttagtttgtggctcagtctggttataaacaaaagtacacggattggagatggatgaagtcgggggtcgatggacattctccagggcaaatgaaggctacacgagctgcggcccggtagtcgagatgtcatggcagagggttggtgccctgctgctaggggctcagtcctgcctgcctgtcccgggggtcccggccgtaggtgggattgggtcggtactcttgtctatggctaggatgggttggaaactatgtcacgtcttccgtctgtataccgtggtggtatgtggcacgtggttacacgtgaggaagatgtgtcttgtgggtaaagatgtacacctctgatcagagtataatctattcgaatagccgcgccctcggttatgggcaagccgagcaatgtacccaagtcagtgttttaattcttaaaatttgctcaacaactaaaatgtggaatggttggcctgggttggcttgggacgagctgggacccagggtcgggttgccagttcggtctgaatcatcgtaggccttgggttaaggcaggttcgtgagggttcacggccttgattaataatattgtatagctctaggatcgtgtttacaaaatagctttgggcaactaagtgacttttaaatgctgtttactgcaaaacttaacccctatattattatccccttgtacccccttgcattaatcatgcatccgccggtgtggcttgctgagtactgtggttgtactcattcttgctcaatctttccccccttcagtaagagaagctttggagaagatgtcttaggtggagtcctggcttataccccagttgagcgcctgtgaagatggagccgtaggccgctagtccgctgctgtttatttttgtttgtcaggcctgaagtgcctttgtaataatgtaaatattatcgatataataaagatgtgtcttttatatcatgtttgtgtggtgtaccccggcttttcctgggacggggattaatacactagcgttcgggaaaaggcgattttcccggtcgcgacagcagaaatgggggattttactgttaattcaatgatttggcctgaatggcatataaaagtctacaataatcacatatgaatattacttgtagttcttaaaataaaaagaatattactggtttgtttgggcaggaaggtatataagttggacgtggttggtcaaataccagcggagctgcagaatctcacctacctagaggacctgtacagtatctaagacttatcatcttatttcttgacaatgaaatgttaaaccgcccatctatgttgtgccAaaaaaaaatgctatctctggtttttaacagatgccaacatttactttttaatacatgtttgatcaatcatcttattaaaaaaattacataattataatttattttgttgcaacatggtttatcattaaaggtctattaagctgacttacatatttgcataaaactttttaatacgacatgatcaaacgtgtgtcaaaagtcaaaggcattgttcattttttaaaccagatgacaaattcagccccttcttttgaattctcaactctcagtttcctggtgaaaaccaaatatagctcgttgtgaggcatgcaagttttttttatatatgttggctaatggacttgatattctggtgttgtttcaggaacctaaattttaattacttgactggcgccattccgtcattcattggaaaatttccttccatgaaatatttgtaggagttatttatacatcaagttctagattcccctgtaccatcgattgcttggcattttgtcttaactactttttattatttaaaggggtttggctttgaatccactatctggactacttccaaaggagcttgggaacctcaccaatcttctttcattgtaagaaatattttcatagatggtggatcaatttttagctatataacggggactgcttgagctaatttaattatacaacaaatgttaatcacataaatccttaacaacaaagttatcaagaactctaactgttatatacattatccatgttaggaacttccctgtttcacgtggtgtttcatatgtttgagtaaaattgagctgacagggacttgaaaactaataatgatgaatattgtgggtcagatggctcagctggaaaaacaattcctgtttagattgcacctaaaatatttcatcttgattcaggggcatcagcttggacaattttactggtgaacttcctgaagagttgggcaacctgaccaaacttcagcagttgtactaaaacacccatcactaacttccgattcttacttctaaacaaactaaaatttagaatcgagaggtctattactgaacacaataattactacaaaatttctacaacaggtacattgatagttctggattcagcggtccattcccgccaacattctcaaagcttaagaatctaaataccttgtacgttcaataacagagagatccatctattatgtccgtcctcttcctatattctaaaggccaaatattttggtgtgctttcaggagggcatcagataatgaattcacagggaaaatacctgattatttggggagtttgactaatttgatagatctgtaagattatttaatattaaattctttatacttcatatgatgtaccttattcggagagatggaaatcatgaaacataaatcttctgtttccatttgaactcagataatatcatttttcacattggagccctttgaataaatatacacttctccatgccattatactagtttgcatggcatgtcgatgcggagattttcataaaaaatgttgatacacatggattactttcttttaccattttatgaaattatgaacttgtagggctttccaaggaaattcttttgaaggaccaatcccagcaagtttgtcgaatctaacaaaattgacaaccttgtgagtacatctgttttcgcggtgttgatcctttttcatggttgataacgtcatgcttgattgctgatttttgctacaaatgagcagaaggattggtgatatcgtagatgggacctcttctttggtctttatcagtaatctgacatctttgagcaccctgtatgtgatgcttttacctgtagatattataataatgacaaaattgcgagttcccgtgattaaatcctgttattacagaatactaaggaactgcaaggtatcaggtaatcttggaccagtagatttttccatgttcacagcattaatcttgttgtaagttttcattatggaccaccaatccagtttatgatgctattgattatttcctgaaaattgtgaagcatctgttcatttaatactgatatcatgtggtatagggacttgagttttaacaatattacaggcgaagttcctcaatccatcctcaatatgggaaagcttgaattcctgtaagaaattgtttttcgacattaattcaatttatacaaacacctcttaagatgatgtccttgtttcattattttgtctcgcttccaattcaggtttcttggtaataatagccttacaggaaagttgccagatgtgataagctcctcgttaaaaacaatttatgtaaaaaaacaagatagcagtatgacataattattttcgtagtacaacgatgtgttcattttggatgtaatagatatatattgtttgtagagatttctcctacaatcagctcactggaaactttccttcctgggctacccagaacaatttgcaattgtaagtgtaaaattatgagattcgtgttgcactgagaaatttgtggatattctaacattttatattgtacaaggaatttggtagcaaacaaatttgatgctggtagcaataaccgcaggtacttatgacattcattcatgatttttcaacagactaattgtaacaaaatatttgtcagtaacttgaagtttccgattcaaatgatgcacagaactcttccttctggattaaactgccttcagcaagacactccttgttttcgtggatctccagaatgtatttatctttttattcttcaaagattgtagtagtcaacatgattttaggaacttcaaaaataatggctatgtttttcacatcttaacagattattcctttgcggttgactgcggaagtaatagttctacacgaggatcagataatactatttatgaagcagagcctacaaaccttggggatgcatcatattatgttactagtcaaacaagatggggtgtcagcaatgtaggaaaattttccctggcctcaaatggaatgaatataatatctagctccgagcattttcagaatgcagttaattcaagattgttcgaaactgcaaggatgtcaccatcatcgctgagatactatggccttggacttgagaatggaaattacaccattcttcttcaatttgcagaggttgcttatccggactcacagacttggcaaagcttaggaaggagagttttcgacatatatatccaggtacaaatagagagtgtgtcctgtagcaatttgtttactaattttttttcattatctaaagatattgttgatatttgcatagggctctttaagagaaaaggattttgacataaggaagatggctggtggaaaatcttttatagtggttcacaggagttacacagctaccgtgtcaaacaacttccttgaaattcatctcttctgggctggcaagggcacttgttgcatacctactaatggttactacgggcctatgatctcagcattgagcgtctctccaagtaagtataattattaacttaacattgaaaaggactatgttggcttccactaagttggaccatttttttttcagattttactcctactgtgcgaaatggagtaccaaaaagaagaagtaaagtacacacaattgcaggaatattgattggtgcatcaattttaggattggcagccttatttggaatttttatgatggttaagaagagaagaacaatggcacaacagaaagaaggtatgtttattagtaacagtaatttagacatgaaatttccaaatgatttattctctcatctgtctggaaaaatgcagaactgtacaacctaattggacggcctgatgtcttcagtaacactgaactaaggctagctacagacaatttcagttctcaaaatattcttggggaaggcggatatgggatgctgtataaggttatcaatttccttctattagctatttgaaattgtgaatgaatgtttagctgtatttcataagggtctatttatctgattttgtatttaaaagcaactttagtaagcttctttttggcagggtaagctatctgatggaagagttatagctgttaaacaactttctcaatcatctcatcaagggaaaagccagtttgtggctgaggttacgacaatatctgctatgcagcataggaatcttgtgaaattgcatggcttctgcatcgacagtaatacacccttgttggtttatgagtaccttcaaaatggaagcttagacacagcactctttggtgagttcccttttacaaagtgacagctccactgaaattgcaatcactcgactttgttgataaaaccaccttatttctttctattttgccatcattttgtattgtcgtggccttactgagttatttctacttctacaggacatagtagattaaacctagactggggaacacgttttaatatcattttaggcattgcaagtggcctaacttaccttcatgaggagtccagtgtacgcatcgtgcatagagatatcaaagccagcaatatcctacttgaaaccgatctcactccaaagatatctgactttggactcgccaagctctatgatgagaagcagactcatgtaagcacaagaattgcgggcacactgtaagaacatttcaacatttctcttcttatgattgtaacatcaaaataaaagctacttttaacttgtgtggcctttgtcaagtggatatcttgctcctgaatatgcaatgagaggccgattgacggaaaaagttgatgtttttgcatttggggtggttgtgctggaaattgtcgccggtcgatccaacaccaataattccttggaggaaagcaagatctatctcttcgaatgggtaagttgatcaatgatgttcccatcgaagaacagataagtccattcattgttttatcttctatttataaacctatgttggttgacagctctgggacctgtatgaaaaggagcaagttcttggaatcgttgacccttctctcaaggatttcaacaacaatgaagcttttagggtcatccgtgttgcgctcctctgcacacagggctcaccgcaccaacgaccaccaatgtcgaaggccttggcaatgttgaccggagaagttgagctgtctgaggtggtcgtgaagccaagttacatcaccgagtggcagcttagggatgtaaatagaagctatgccactagcagctactcaggctctaccaaccctgagtttagcacacagaaagagatagagcctcttacccaatcatgatctctagagctagtcaagtcggaatgcgaatgaagaattgaactactgcagatgatcttgcaatgcgtattgaaccaagatatatacaaactaatgcacaaattttaagtttttcttggagccagtgatttcagttttcatgggatacctatatctaaacaataaacatataactgaacgaagttggcaagtggctcattttcacta

More
CDS seq

atgtggcgttgctgcagcagcaacagagcctctgggcttctcgtgtggctggtgcttgtgtgctcatggcagattgcagctgctcagcctcaacaagcagcaaaaactgatccaaccgaagtggcagccctgaacacgattttgggaagatggagcaagaaggcatcgtcggagtggaacatcagtggcgagccctgcagcggtgtggcctcggatccgagcaactgggataacttccccaacatcaaccccctcatcaagtgcgcttgcacttactacaacaacaccgtttgccacattaccaaactgtatgcacagaaggtatataagttggacgtggttggtcaaataccagcggagctgcagaatctcacctacctagaggacctgaacctaaattttaattacttgactggcgccattccgtcattcattggaaaatttccttccatgaaatatttgggtttggctttgaatccactatctggactacttccaaaggagcttgggaacctcaccaatcttctttcattgggcatcagcttggacaattttactggtgaacttcctgaagagttgggcaacctgaccaaacttcagcagttgtacattgatagttctggattcagcggtccattcccgccaacattctcaaagcttaagaatctaaataccttgagggcatcagataatgaattcacagggaaaatacctgattatttggggagtttgactaatttgatagatctggctttccaaggaaattcttttgaaggaccaatcccagcaagtttgtcgaatctaacaaaattgacaaccttaaggattggtgatatcgtagatgggacctcttctttggtctttatcagtaatctgacatctttgagcaccctaatactaaggaactgcaaggtatcaggtaatcttggaccagtagatttttccatgttcacagcattaatcttgttggacttgagttttaacaatattacaggcgaagttcctcaatccatcctcaatatgggaaagcttgaattcctagatttctcctacaatcagctcactggaaactttccttcctgggctacccagaacaatttgcaattgaatttggtagcaaacaaatttgatgctggtagcaataaccgcagaactcttccttctggattaaactgccttcagcaagacactccttgttttcgtggatctccagaatattattcctttgcggttgactgcggaagtaatagttctacacgaggatcagataatactatttatgaagcagagcctacaaaccttggggatgcatcatattatgttactagtcaaacaagatggggtgtcagcaatgtaggaaaattttccctggcctcaaatggaatgaatataatatctagctccgagcattttcagaatgcagttaattcaagattgttcgaaactgcaaggatgtcaccatcatcgctgagatactatggccttggacttgagaatggaaattacaccattcttcttcaatttgcagaggttgcttatccggactcacagacttggcaaagcttaggaaggagagttttcgacatatatatccagggctctttaagagaaaaggattttgacataaggaagatggctggtggaaaatcttttatagtggttcacaggagttacacagctaccgtgtcaaacaacttccttgaaattcatctcttctgggctggcaagggcacttgttgcatacctactaatggttactacgggcctatgatctcagcattgagcgtctctccaaattttactcctactgtgcgaaatggagtaccaaaaagaagaagtaaagtacacacaattgcaggaatattgattggtgcatcaattttaggattggcagccttatttggaatttttatgatggttaagaagagaagaacaatggcacaacagaaagaagaactgtacaacctaattggacggcctgatgtcttcagtaacactgaactaaggctagctacagacaatttcagttctcaaaatattcttggggaaggcggatatgggatgctgtataagggtaagctatctgatggaagagttatagctgttaaacaactttctcaatcatctcatcaagggaaaagccagtttgtggctgaggttacgacaatatctgctatgcagcataggaatcttgtgaaattgcatggcttctgcatcgacagtaatacacccttgttggtttatgagtaccttcaaaatggaagcttagacacagcactctttggacatagtagattaaacctagactggggaacacgttttaatatcattttaggcattgcaagtggcctaacttaccttcatgaggagtccagtgtacgcatcgtgcatagagatatcaaagccagcaatatcctacttgaaaccgatctcactccaaagatatctgactttggactcgccaagctctatgatgagaagcagactcatgtaagcacaagaattgcgggcacacttggatatcttgctcctgaatatgcaatgagaggccgattgacggaaaaagttgatgtttttgcatttggggtggttgtgctggaaattgtcgccggtcgatccaacaccaataattccttggaggaaagcaagatctatctcttcgaatggctctgggacctgtatgaaaaggagcaagttcttggaatcgttgacccttctctcaaggatttcaacaacaatgaagcttttagggtcatccgtgttgcgctcctctgcacacagggctcaccgcaccaacgaccaccaatgtcgaaggccttggcaatgttgaccggagaagttgagctgtctgaggtggtcgtgaagccaagttacatcaccgagtggcagcttagggatgtaaatagaagctatgccactagcagctactcaggctctaccaaccctgagtttagcacacagaaagagatagagcctcttacccaatcatga

More
Protein seq

MWRCCSSNRASGLLVWLVLVCSWQIAAAQPQQAAKTDPTEVAALNTILGRWSKKASSEWNISGEPCSGVASDPSNWDNFPNINPLIKCACTYYNNTVCHITKLYAQKVYKLDVVGQIPAELQNLTYLEDLNLNFNYLTGAIPSFIGKFPSMKYLGLALNPLSGLLPKELGNLTNLLSLGISLDNFTGELPEELGNLTKLQQLYIDSSGFSGPFPPTFSKLKNLNTLRASDNEFTGKIPDYLGSLTNLIDLAFQGNSFEGPIPASLSNLTKLTTLRIGDIVDGTSSLVFISNLTSLSTLILRNCKVSGNLGPVDFSMFTALILLDLSFNNITGEVPQSILNMGKLEFLDFSYNQLTGNFPSWATQNNLQLNLVANKFDAGSNNRRTLPSGLNCLQQDTPCFRGSPEYYSFAVDCGSNSSTRGSDNTIYEAEPTNLGDASYYVTSQTRWGVSNVGKFSLASNGMNIISSSEHFQNAVNSRLFETARMSPSSLRYYGLGLENGNYTILLQFAEVAYPDSQTWQSLGRRVFDIYIQGSLREKDFDIRKMAGGKSFIVVHRSYTATVSNNFLEIHLFWAGKGTCCIPTNGYYGPMISALSVSPNFTPTVRNGVPKRRSKVHTIAGILIGASILGLAALFGIFMMVKKRRTMAQQKEELYNLIGRPDVFSNTELRLATDNFSSQNILGEGGYGMLYKGKLSDGRVIAVKQLSQSSHQGKSQFVAEVTTISAMQHRNLVKLHGFCIDSNTPLLVYEYLQNGSLDTALFGHSRLNLDWGTRFNIILGIASGLTYLHEESSVRIVHRDIKASNILLETDLTPKISDFGLAKLYDEKQTHVSTRIAGTLGYLAPEYAMRGRLTEKVDVFAFGVVVLEIVAGRSNTNNSLEESKIYLFEWLWDLYEKEQVLGIVDPSLKDFNNNEAFRVIRVALLCTQGSPHQRPPMSKALAMLTGEVELSEVVVKPSYITEWQLRDVNRSYATSSYSGSTNPEFSTQKEIEPLTQS

Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_05g0009110 OsCMeo_05g0009110.01 Chr05 9268796 9279127 + NAM
CDS seq

atgtggcgttgctgcagcagcaacagagcctctgggcttctcgtgtggctggtgcttgtgtgctcatggcagattgcagctgctcagcctcaacaagcagcaaaaactgatccaaccgaagtggcagccctgaacacgattttgggaagatggagcaagaaggcatcgtcggagtggaacatcagtggcgagccctgcagcggtgtggcctcggatccgagcaactgggataacttccccaacatcaaccccctcatcaagtgcgcttgcacttactacaacaacaccgtttgccacattaccaaactgtatgcacagaaggtatataagttggacgtggttggtcaaataccagcggagctgcagaatctcacctacctagaggacctgaacctaaattttaattacttgactggcgccattccgtcattcattggaaaatttccttccatgaaatatttgggtttggctttgaatccactatctggactacttccaaaggagcttgggaacctcaccaatcttctttcattgggcatcagcttggacaattttactggtgaacttcctgaagagttgggcaacctgaccaaacttcagcagttgtacattgatagttctggattcagcggtccattcccgccaacattctcaaagcttaagaatctaaataccttgagggcatcagataatgaattcacagggaaaatacctgattatttggggagtttgactaatttgatagatctggctttccaaggaaattcttttgaaggaccaatcccagcaagtttgtcgaatctaacaaaattgacaaccttaaggattggtgatatcgtagatgggacctcttctttggtctttatcagtaatctgacatctttgagcaccctaatactaaggaactgcaaggtatcaggtaatcttggaccagtagatttttccatgttcacagcattaatcttgttggacttgagttttaacaatattacaggcgaagttcctcaatccatcctcaatatgggaaagcttgaattcctagatttctcctacaatcagctcactggaaactttccttcctgggctacccagaacaatttgcaattgaatttggtagcaaacaaatttgatgctggtagcaataaccgcagaactcttccttctggattaaactgccttcagcaagacactccttgttttcgtggatctccagaatattattcctttgcggttgactgcggaagtaatagttctacacgaggatcagataatactatttatgaagcagagcctacaaaccttggggatgcatcatattatgttactagtcaaacaagatggggtgtcagcaatgtaggaaaattttccctggcctcaaatggaatgaatataatatctagctccgagcattttcagaatgcagttaattcaagattgttcgaaactgcaaggatgtcaccatcatcgctgagatactatggccttggacttgagaatggaaattacaccattcttcttcaatttgcagaggttgcttatccggactcacagacttggcaaagcttaggaaggagagttttcgacatatatatccagggctctttaagagaaaaggattttgacataaggaagatggctggtggaaaatcttttatagtggttcacaggagttacacagctaccgtgtcaaacaacttccttgaaattcatctcttctgggctggcaagggcacttgttgcatacctactaatggttactacgggcctatgatctcagcattgagcgtctctccaaattttactcctactgtgcgaaatggagtaccaaaaagaagaagtaaagtacacacaattgcaggaatattgattggtgcatcaattttaggattggcagccttatttggaatttttatgatggttaagaagagaagaacaatggcacaacagaaagaagaactgtacaacctaattggacggcctgatgtcttcagtaacactgaactaaggctagctacagacaatttcagttctcaaaatattcttggggaaggcggatatgggatgctgtataagggtaagctatctgatggaagagttatagctgttaaacaactttctcaatcatctcatcaagggaaaagccagtttgtggctgaggttacgacaatatctgctatgcagcataggaatcttgtgaaattgcatggcttctgcatcgacagtaatacacccttgttggtttatgagtaccttcaaaatggaagcttagacacagcactctttggacatagtagattaaacctagactggggaacacgttttaatatcattttaggcattgcaagtggcctaacttaccttcatgaggagtccagtgtacgcatcgtgcatagagatatcaaagccagcaatatcctacttgaaaccgatctcactccaaagatatctgactttggactcgccaagctctatgatgagaagcagactcatgtaagcacaagaattgcgggcacacttggatatcttgctcctgaatatgcaatgagaggccgattgacggaaaaagttgatgtttttgcatttggggtggttgtgctggaaattgtcgccggtcgatccaacaccaataattccttggaggaaagcaagatctatctcttcgaatggctctgggacctgtatgaaaaggagcaagttcttggaatcgttgacccttctctcaaggatttcaacaacaatgaagcttttagggtcatccgtgttgcgctcctctgcacacagggctcaccgcaccaacgaccaccaatgtcgaaggccttggcaatgttgaccggagaagttgagctgtctgaggtggtcgtgaagccaagttacatcaccgagtggcagcttagggatgtaaatagaagctatgccactagcagctactcaggctctaccaaccctgagtttagcacacagaaagagatagagcctcttacccaatcatga

More
Protein seq

MWRCCSSNRASGLLVWLVLVCSWQIAAAQPQQAAKTDPTEVAALNTILGRWSKKASSEWNISGEPCSGVASDPSNWDNFPNINPLIKCACTYYNNTVCHITKLYAQKVYKLDVVGQIPAELQNLTYLEDLNLNFNYLTGAIPSFIGKFPSMKYLGLALNPLSGLLPKELGNLTNLLSLGISLDNFTGELPEELGNLTKLQQLYIDSSGFSGPFPPTFSKLKNLNTLRASDNEFTGKIPDYLGSLTNLIDLAFQGNSFEGPIPASLSNLTKLTTLRIGDIVDGTSSLVFISNLTSLSTLILRNCKVSGNLGPVDFSMFTALILLDLSFNNITGEVPQSILNMGKLEFLDFSYNQLTGNFPSWATQNNLQLNLVANKFDAGSNNRRTLPSGLNCLQQDTPCFRGSPEYYSFAVDCGSNSSTRGSDNTIYEAEPTNLGDASYYVTSQTRWGVSNVGKFSLASNGMNIISSSEHFQNAVNSRLFETARMSPSSLRYYGLGLENGNYTILLQFAEVAYPDSQTWQSLGRRVFDIYIQGSLREKDFDIRKMAGGKSFIVVHRSYTATVSNNFLEIHLFWAGKGTCCIPTNGYYGPMISALSVSPNFTPTVRNGVPKRRSKVHTIAGILIGASILGLAALFGIFMMVKKRRTMAQQKEELYNLIGRPDVFSNTELRLATDNFSSQNILGEGGYGMLYKGKLSDGRVIAVKQLSQSSHQGKSQFVAEVTTISAMQHRNLVKLHGFCIDSNTPLLVYEYLQNGSLDTALFGHSRLNLDWGTRFNIILGIASGLTYLHEESSVRIVHRDIKASNILLETDLTPKISDFGLAKLYDEKQTHVSTRIAGTLGYLAPEYAMRGRLTEKVDVFAFGVVVLEIVAGRSNTNNSLEESKIYLFEWLWDLYEKEQVLGIVDPSLKDFNNNEAFRVIRVALLCTQGSPHQRPPMSKALAMLTGEVELSEVVVKPSYITEWQLRDVNRSYATSSYSGSTNPEFSTQKEIEPLTQS

More
Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.588125 0.0 0.205621

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_05g0253200 RBH 0.0 0.0 0.173666
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g16420 RBH 0.0 0.0 0.358893
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0253200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0009170 RBH 0.188039 0.814950 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0009220 RBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_05g0009220 RBH 0.775595 37.370052 2.390502
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0009200 RBH 0.006028 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0009250 RBH 0.0 2.592178 0.344113
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0140200 RBH 0.4547805 2.347724 0.0045095
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0009120 RBH 0.029445 0.694205 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0140400 RBH 0.9392435 6.2197055 0.004043
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0009100 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0009050 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0009150 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0009200 RBH 0.059003 0.000000 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0009280 SBH 0.086092 24.981190 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G009000 RBH 0.868261 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0009270 RBH 1.980855 27.920137 0.0
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.