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Function TATA-binding protein-associated factor BTAF1 [UniProtKB/Swiss-Prot:B5BT18]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_02G004730 OsN22_02G004730_01 Chr02 3167537 3180282 + NAM
CDS seq

ATGTGCAAATTAGCTGGGCTAAAACGTACAGTCTATGCTTTTGCAGTCGAACATATATCATTTGATATCCCCTTTGGTTTATCTATCTATTGTGCAAAGTTTCCTTTAACACAACTAGCTGGTTCCACGCAAGCGACAAGGTTCGCTGCTGCACGGCAAATTGGAGAAATTGCCAAGTCCCACCCCCAGGAGCTAAATGTCTTACTCAAAAAGGTATACCAACAATTCCACCACCTGCTAGTTTTGTGGATCCTTCTACCTGAAAATGTTTCTCCATATTTACTTAGTAAGAATTGGGACACAAGGGTCGCAGCAGCCCATGCGATTGGTGCCATAGCAGAGAACGTCAAACACACATCGGTGAAAGACTTGTTCGCATCTGCAGAAGCAGAAAAACATGCTTCTGGGTTGTCTGGAATTGGTGATGTTGGGTCAACGTTGCGGCATGCTGATACTACTGCAACATCTGAGCTTGCTTTTGGAAGCTTCGATATAAACAGGGTGTTGGAATTTGGATCTCCTTTATTGGCATCAGGTGGACAGGAATATGACATTGCAAATGATAACGGCAAAAATCCAGCAGAGCGTTTAGCTCGCCAAAAGCAAAATCTCCGGCGTCGTTTAGGTCTGGATGTATGTGAGCAGTTCATGGATTTCAATGATGTTATCAAAGACGAGGACCTTCTTGCCCAAAAGAATTATTGGGGTGCAAATATGCAAAACAATGGATTCTATTCATTTAATACTGGTCAGAATATTCAGCACTTGGTTGCATCTATGGTTCCCAGGTATCCCAAACATTCCAATTTTCGCTCCAGGCGATTAAGCGCCAGGGAGCTCAATATGCTGAAGCGTAAAGCAAAAAGCAATGCAAAAGATCATACAAAGGCTGTACCCGAGGATGATGACGTTGTGCCAAAAAGTTCTGGACCGTCTAACGGGGCCTCTTCTGATCAAGATACAGTTGATGCAATCACAGATGAGGACAATCTGGAGTACAGTGAGAATGGGAGATGGCCTTTTCAACAGTTTGTAGATCAACTTATTCATGACATGTTTGACCCTATTTGGGAAGTTCGCCATGGCACCATTATGGCTTTGAGGGAAATTTTGACGCATCAAGGTGCTTGTGCTGGAGTATATTTTCCTGATCTGAACTCGCCTTTCGCTGACCTTGATGATAAAAACAATTTGGACTCCCTGAAAAGAGCACATGGTATTGATCTTAATGAAGACATTGATTCGGGACAGCTCGAGCCAGTTTTGAAAAGACAAAAGAAAGAGGAGTCTAATCCAGAGGTTATGGACATTCAGTTGGATAAGGAGCCAAGTAACGGTGATTATTCCAAAACAGAGGCAAGTCTGAGTACTGAGCCTACTGTATCTAGTGGTGAACCAAATCTTGCTCATGCAAAGGTTGAATCACCCTTCCAGGTTGATGGTTCAGCTAACCCATCTAAGGTGGATCCATATTGTACACCACCTCACGAAACACTCAACTCCATGCCCAAACTGAGTTCTACCCATCTCCCTGAAAATTCAAAATTTATAAAGCTGATGAAACTAGCGAACTACTCAGCGGTAAAAAATTGGGAATTTCTTCAAGACTGTGCAATTCGTTTCCTTTGTGTACTTTCATTGGACCGCTTTGGTGATTATGTATCTGATCAAGTGGTTGCTCCTGTTCGTGAAACTTGTGCTCAAGCTCTTGGTGCAGTTCTGAAGTACATGCATCCGACTCTAGTATGCCATACACTGAATATTTTGCTGCAAATGCAGCGCAGGCAGGAGTGGGAAGTTCGTCATGGGAGTCTCCTTGGAATTAAGTATTTAGTTGCTGTTCGTCAGGAAATGCTTAAAGACTTGCTTAATTATGTTCTTCATGCCTGTAAAGCTGGTCTGGAGGATCCAGATGATGATGTCCGGGCTGTGGCTGCAGAGGCTCTGATCCCAGCTGCTGCTTCTTTAGTTAGACTAAATGATCAAATGCTACATTCAATTGTGATGTTGCTTTGGGATATATTGCTTGACCTTGATGATCTAAGCCCTTCTACAAGCAGTGTGATGAATTTGTTAGCTGAGATATATTCTCAACCAGAGATGGTTCCAAAGATGCTTGGCACAACAGCCATAGGTGAAGACAACGAATTTGATCTAAACAGTGTAACTCTGGTTGCCGGTGAAGAAAAAATGGGTTCTAATGATAATCCTTATGTCTTAGCCGCTCTGACACCCCGATTGTGGCCTTTTATGAGACATAGTATTACATCAGTCCGGCGTTCTGCTGTACGAACATTGGAGAGGCTTCTCGAGGTTGGGAACACCAGGAATTCAGCTAAACTATGGCTTGCATCTATATTAGGTGATGCGCTGCAAGTTGTCTTCCAGAATCTTCTTTTGGAGTCAAATGATGAGATTATTCGATCTTCTGAAAGGGCTTGGAAACTTTTACTTCAGTGCCCTACGGAGGACCTTGAGTCTGCTGCAAGTTCATATTTTAGTAATTGGGTGCAACTTGCCACTACTCCATATGGCACAGCATTGGATTCTGCAAAAATGTTTTTGCCAGTTGCACTTCCACGAGGAAGTCGTTCAAGAGCTGCTGCAAAGATCAAATCTGCAAGGTTAGAACATGAAAATACGAGAATGATATCTTTTGGTTCTACCGGAGAGAACACTTCACAGGAAAAGCATTCTGAAGCTTCCTTGAGTGTTTCAAAAATAATTGTGGGGTCTGATTCGGACAAATCTGTTACTCATACGCGAGTGCTTACGTCAATGGCCCTTGGTCTGTTTGCCTCTAAGTTGCCAGAGGGGTCGTGGCAAGTTGTTCTTGGTCCACTAGCAAGCGATCTCATGTCTCTCTCAGGAGTCCAGAGACAGGTGGCTTCTATGGTTATTGTTTCTTGGTTTAAAGACCTCAGAAAAAGTGATCCTGCTGCGGTGGGTACATTGCTAGCTTTCTTATCCTCCCTGAAAGGGTGGATGTTGGACTTACTGGCTTGCTCTGACCCTTCATTTCCTACAAAAGATTCTCCGCTTCCATATGCTGAGCTTGCAAGAACATACAGGAAGATGCGCAATGAAGCCAATAATTTGTTCCAGTCAATAGAATCTTGTGCTCTTCTTAAAGAGTATACAAGCAACTTAAACTTTGAAGCTGACATGCTGAGTGTTGATGATGCTATTAACTTCGCTTCAAAGCTTTTGTTACCATCTGAACCTGATTTTAGTTTGGACAGTGATAAAATTGTCTTGAACAATATAGAGTCAGCAAAACAAGGTCTATTGTCTACGTCAGGCTACTTGAAATGTGTTCAGAATAATTTGCATGTGACAGTTTCCTCTTTAGTGGCCTCTGCTGTAGTCTGGATGGCAGGGCTGCCTAGTAAGTTGAACCCAGTCATTTTGCCTTTAATGGCTGCTGTAAAAAGGGAACAGGAGGAAATACTTCAGGACAAAGCTGCAGATGCACTTGCTGAGCTCATTTTTAGTTGTGTTGGCCGCAAACCTGGCCCAAACGACAAACTAACAAAGAACCTCTGCACGTTAACATGCACTGATGCAAGTGAGACACCTCAAGCTGCAGTTATAAACTCAATTCAGACTGGAGATGATCTTATGAAAGAAGATCCAAGTATTGCGCAGTTAGGAAGATCTTGTGAGGACAAGGAACCGCAGTCCCTTATAAATAATATCCAGGTTGTTCGTTCGGTTACACCTCATTTGGCTGAGCCCTTGAGGCCTCAATTGCTAAGTCTCCTTCCCTGTATTCTTGGTTGTGTGCGCCATCCTCATGTCGCTGTCAGGTTAGCTGCTGCAAGGTGCATCACATCAATGGCAAAATCATTGACTGCTAATGTAATGGTAATTGTGATAGAAAATGTCATACCGATGTTGTCAGATTCATCTTCTGTCTGTGCAAGGCAAGGAGCTGGGATGCTTTTGAGCCTTCTTGTTCAGGGTTTGGCTGTGGAGTTGGTTCCTTATGCTCCTTTCCTTGTTGTTCCTCTTCTAAGGTGTATGAGTGATCCTGATGGTTCTGTTAGACAGACTGTAACTCACAGTTTTGCTGCTCTGGTTCCTTTGTTGCCATTAGCAAAAGGTTCTTTGTTACCGGATGGACTGAGTGAACGCTTATCTAGCAGTGCAGAAGATGCGCAGTTTCTAGAGCAGCTCCTCGACAACTCCCAAATTGATGATTACAAGCTCAGCATTGATCTCAGTGTTGAACTGCGAAGGTACCAGCAAGAAGGAATTAACTGGCTAGCATTCCTTAGACGGTTCAAGTTACATGGAATTTTATGTGATGACATGGGTCTTGGCAAAACACTCCAGGCGTCTGCTATTGTAGCAGCTGATATTGCTGAGTCACGTGCACGGAATGATGAGCAAGATCCGAAATCTTTGATTATCTGCCCTTCTACATTAGTAGCACACTGGGAATATGAAATAGAGAAGTACATAGACAGCTCTATCATGAAACCTCTTCAGTACATCGGTTCATCACAAGATAGGATTATCCTCCGTTCTCAGTTTGATAAGTTCAACGTAATCATAACGTCATATGATATTATACGCAAGGATATTGATTTTCTTGAGAATGTCTTTTGGAACTATTGTGTGCTGGATGAGGGGCACATAATAAAGAACTCAAGATCTAAAATAACATCTGCTGTGAAACAATTGAAAGCACAACACCGTCTTATCCTCAGCGGTACTCCAATTCAGAATAATGTATTGGAGCTCTGGTCTCTATTTGACTTTCTTATGCCTGGATTTCTTGGGACAGAAAAACAGTTCCAAGCTACATATGGAAAACCATTGCTAGCAGCAAAAGATCCAAAATGTTCAGCAAAGGATGCTGAAGCTGGCATTCTTGCTATGGAGGCACTGCATAAACAGGTCATGCCGTTTCTACTTAGAAGAACAAAGGATGAAGTTTTATCTGATCTTCCTGAGAAGATTATCCAGGATAGATATTGCAATCTCAGTCTATT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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_02G004730 OsN22_02G004730_02 Chr02 3174868 3180304 + IsoSeq
CDS seq

ATGGGATCAGTCTCAGTATGCAGACGAGTACGATCTCAACCAGTTCTTGGCGAAGCTCAACGGCTGAACACACGATCACCGGTCCTGTACAGTGTAAAGCGAATTGGGGCGTGTGATGAACAGGTTGGCAGATTTTGTTGGCAACCACAGGAGTCAGAAATTTTTTTGTTGTTTCATACGGAAGAAGGGAAAAAAAAAGGAAGATCGCAAGATCTAGAGCAATGT

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Protein seq

MGSVSVCRRVRSQPVLGEAQRLNTRSPVLYSVKRIGACDEQVGRFCWQPQESEIFLLFHTEEGKKKGRSQDLEQC

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
SE Chr02 3178108 3178552 + OsN22_02G004730_02 OsN22_02G004730_02,OsN22_02G004730_01 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 2.426976 6.776647 8.631062

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0161300 RBH 6.605115 7.969881 7.864865
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g06588 RBH 4.419050 5.034160 1.939060
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0161300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004740 RBH 2.264087 23.132471 27.473930
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004940 RBH 1.268722 5.727453 7.957779
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004750 RBH 4.137586 15.831674 26.549681
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004650 RBH 2.151191 1.697295 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0004700 RBH 25.628529 31.671902 64.309471
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0056800 SBH 16.800069 31.231049 25.726528
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004660 RBH 0.984976 1.192995 3.824199
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0059500 RBH 21.759051 46.3681125 29.188855
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0005070 RBH 0.880991 0.681984 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0004640 RBH 1.381853 20.751240 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004960 RBH 13.847345 23.873499 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004900 RBH 3.379436 2.700910 2.631346
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004670 RBH 1.827172 14.218543 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004690 RBH 6.039907 32.112606 16.047117
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