Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_02G0056800 | OGI:02010390 | 7/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr02:3313091-3334314 | ||||||||
| Gene Symbol | DLN43, OsDLN43 | ||||||||||
| DNA seq | 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Transcripts
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| Protein seq | MLGPPRRGPAYKTKLCALWQRGNCNRDTCSFAHGHGDIRRPPSSRGAFTHHPGRRDYRAGDFRGRIDRRFSPRRRHSPGRESRGHRPLYDRRPSSRERDSSYSRSPSRKSERRHEKKTDDGETNSSRSLSLSDNNDEKKKDKFSSGDEKEDHEKQLKQIRLDMEALRDDKTQMEVILDEKIDEVRKISSKVNDLEVQLRREKDECHRMTSKMKKFIKAHARFLKAQEEVKRSQARFERLGDLLASDILKRGANEEGSSVNEDLNERSPNTAATKKRSIPYSTSEEAKAVKKRRERDSDTMTRSDKYRSDVTDFDKTSKGTEATKSLYLKKKLWEDEKSKLGANIFTEKVKGSPVRHVLPSTGMAAHAIDDLNEAIELEDRHESIDALLENDADDKTRSPAIPLQPPPVVQNAYEQVSPYLRSKNWDTRVAAAHAIGAIAENVKHTSVKDLFASAEAEKHASGLSGIGDVGSTLRHADTTATSELAFGSFDINRVLEFGSPLLASGGQEYDIANDNGKNPAERLARQKQNLRRRLGLDVCEQFMDFNDVIKDEDLLAQKNYWGANMQNNGFYSFNTGQNIQHLVASMVPRYPKHSNFRSRRLSARELNMLKRKAKSNAKDHTKAVPEDDDVVPKSSGPSNGASSDQDTVDAITDEDNLEYSENGRWPFQQFVDQLIHDMFDPIWEVRHGTIMALREILTHQGACAGVYFPDLNSPFADLDDKNNLDSLKRAHGIDLNEDIDSGQLEPVLKRQKKEESNPEVMDIQLDKEPSNGDYSKTEASLSTEPTVSSGEPNLAHAKVESPFQVDGSANPSKVDPYCTPPHETLNSMPKLSSTHLPENSKFIKLMKLANYSAVKNWEFLQDCAIRFLCVLSLDRFGDYVSDQVVAPVRETCAQALGAVLKYMHPTLVCHTLNILLQMQRRQEWEVRHGSLLGIKYLVAVRQEMLKDLLNYVLHACKAGLEDPDDDVRAVAAEALIPAAASLVRLNDQMLHSIVMLLWDILLDLDDLSPSTSSVMNLLAEIYSQPEMVPKMLGTTAIGEDNEFDLNSVTLVAGEEKMGSNDNPYVLAALTPRLWPFMRHSITSVRRSAVRTLERLLEVGNTRNSAKLWLASILGDALQVVFQNLLLESNDEIIRSSERAWKLLLQCPTEDLESAASSYFSNWVQLATTPYGTALDSAKMFLPVALPRGSRSRAAAKIKSARLEHENTRMISFGSTGENTSQEKHSEASLSVSKIIVGSDSDKSVTHTRVLTSMALGLFASKLPEGSWQVVLGPLASDLMSLSGVQRQVASMVIVSWFKDLRKSDPAAVGTLLAFLSSLKGWMLDLLACSDPSFPTKDSPLPYAELARTYRKMRNEANNLFQSIESCALLKEYTSNLNFEADMLSVDDAINFTSKLLLPSEPDFSLDSDKIVLNNIESAKQGLLSTSGYLKCVQNNLHVTVSSLVASAVVWMAGLPSKLNPVILPLMAAVKREQEEILQDKAADALAELIFSCVGRKPGPNDKLTKNLCTLTCTDASETPQAAVINSIQVIEDQNLLSIGKRFSNHKSRGQMTSGGESKSEGFISRRGSELAFKHLCEKFGASLFEKLPKLWDCLTEFLKPVKTGDDLMKEDPSIAQLGRSCEDKEPQSLINNIQVVRSVTPHLAEPLRPQLLSLLPCILGCVRHPHVAVRLAAARCITSMAKSLTANVMVIVIENVIPMLSDSSSVCARQGAGMLLSLLVQGLAVELVPYAPFLVVPLLRCMSDPDGSVRQTVTHSFAALVPLLPLAKGSLLPDGLSERLSSSAEDAQFLEQLLDNSQIDDYKLSIDLSVELRRYQQEGINWLAFLRRFKLHGILCDDMGLGKTLQASAIVAADIAESRARNDEQDPKSLIICPSTLVAHWEYEIEKYIDSSIMKPLQYIGSSQDRIILRSQFDKFNVIITSYDIIRKDIDFLENVFWNYCVLDEGHIIKNSRSKITSAVKQLKAQHRLILSGTPIQNNVLELWSLFDFLMPGFLGTEKQFQATYGKPLLAAKDPKCSAKDAEAGILAMEALHKQVMPFLLRRTKDEVLSDLPEKIIQDRYCNLSLLQLKLYDKFSNSNAKQEISTIVKENELDQSTSQPKATRHVFQALQYLLKLCSHPLLVTGESPPDYLVDLLKEIGMGTGDELHDLHHSPKLVALQEILQECGIGSEISSPDASAAIGQHRVLIFAQHKALLDIIEKDLFQSHMRSVTYLRLDGSVEPEKRFEIVKAFNSDPTIDVLLLTTHVGGLGLNLTSADTLVFMEHDWNPMKDLQAMDRAHRLGQRKVVNVHRLIMRGTLEEKVMSLQRFKVSVANAVINAENASLKTMNTDQLLDLFASTPASRKASVLPSSSGGDQSKDSKGKSGGKGLKSILNGLDELWDQSQYADEYDLNQFLAKLNG
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 16.800069 | 31.231049 | 25.726528 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0161300 | RBH | 6.605115 | 7.969881 | 7.864865 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g06592 | RBH | 5.088842 | 3.749341 | 1.806028 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0161300 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0004730 | SBH | 1.710220 | 8.287537 | 15.889673 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0004940 | RBH | 1.268722 | 5.727453 | 7.957779 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0004740 | SBH | 2.772591 | 14.246268 | 33.364807 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0004640 | SBH | 0.482236 | 0.386348 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0004690 | SBH | 15.039126 | 24.706997 | 45.278843 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0056700 | RBH | 19.766378 | 53.770962 | 89.348572 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0004660 | RBH | 0.984976 | 1.192995 | 3.824199 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0059500 | RBH | 21.759051 | 46.3681125 | 29.188855 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0005060 | SBH | 0.610908 | 0.680359 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0004630 | SBH | 1.113986 | 25.026409 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0004950 | SBH | 9.444281 | 13.715423 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0004890 | SBH | 2.227141 | 2.162222 | 2.514400 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0004660 | SBH | 0.804902 | 6.109559 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G004710 | SBH | 1.301482 | 4.473851 | 5.907066 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_02g0004690 | RBH | 6.039907 | 32.112606 | 16.047117 |
