Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_01G004320 | OGI:01011260 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:3249335-3287987 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Function | Receptor-like protein 19 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9ZUK3] | ||||||||||
Transcripts
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| OsN22_01G004320 | OsN22_01G004320_01 | Chr01 | 3249335 | 3270818 | + | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_01G004320 | OsN22_01G004320_02 | Chr01 | 3270818 | 3287987 | + | NAM | ||
| CDS seq | ATGACTGTTAGTATACTCAAAATGATGATATCCACCAAGCAACGCCTCCTCACTCCCATTCTCATTCTCCTCATTTGTTGTTACTCCATAGTCACTGCAGCCAACAATGACACAACCGTCCCTTGTCTCCCAGAGCAAGCTTCTTCCCTCCTACAGCTCAAAAATTCCTTCATCAATAATGCAAACTTATCGTCATGGCGAGCTGGATCGGACTGCTGCCACTGGGAGGGCATCACATGTGGTATGGCCTCCGGCAGGGTCATTTCCCTTGACCTCAGTGAGTTGAACTTGATGAGCAATCGTCTCGATGCTGCACTCTTTAACCTCACCTCTCTTACAAACCTTAACCTTGCTTCCAATTACTTTTGGAGAGCCGAACTCCCAGTATCTGGGTTTGAGAGGCTCACAGATATGATCCACCTCAACTTCTCACACAGCAACTTTTATGGTCAGATCCCCATTGGACTTGCTTGCCTCATGAAACTTGTCACTCTTGACTTTTCTAGTAATGATGGGTTGTATTTCGATGAACCAAGTTTCCAAACCGTCATGGCAAACATGAGCAACCTGAGGGAGCTCCATCTTGATGAGATAGAAATTTTCGGATCAACTTGGTCAGTTGTTTTAGCAGACAACATTCCTCAACTCGAGATTCTTAGCTTGTTTGCGTGCCGTATATCTGGTCCTATTCACTCTTCCTTCTCAAGGCTTCGTTCCTTAAAGGTGATCAACCTTGGATACAATTTTGGACTCCCCAGCAAAGTTCCTGAGTTCTGTGCTGAATTATCTTCTTTGAGCATTCTTGAAATTGCAGGCAATTCTTTTGAAGGGCAGTTCCCAACAAAAATCTTCCACCTAAAAAGTTTGAGAACGCTTGATTTGTCTCATAACCCCAATCTTTCTATTAACCTACCAGAATTCCCTGATGGAAATAATCTAGAAACACTAGGTCTAGCAGCAACCAATTTATCTTATCACATACCGTCCTCATTTGCCAATCTCAAGTCCTTGAAGCGTTTGGGTATGAGCACGGCACGAACTTCCAAGGAGCTGCCCTCTTTATTAGATAAGCTTCCTTCATTGACAGAACTGGAATTGCAAGGATCGGAATCAGGCTTGGAGAAGGCGGTATTATCTTGGGTAGGCAACCTTAAGCAGCTGACTGCTTTGGAGCTTGTATCGTACGATTTCTCTGAATCGGCACCCTCCTGGATAGGCAATTTGACGAATTTGAAGTTTTTGTGGATCTGGGACTGCAATTTCTCTGGGTCAATAATACCATATCAGATTGGCAATCTTGCAAAATTGGAGACCTTGGACTTTAGAGGGTGCGAGTTCTTTGGACAGCAAATACCACCGTGGATCGGTAATTTTACGAAGTTGGCAAATTTAGAGATGGATAGTTGTGGCTTCTCTGGATCGATACCCTCAACAATAGGGAATCTGACCCAACTGGAAAGTCTGCGGATCACATCTAATCCCCAACTCAACGGGAAAATTCCACAATCGTTGTTCGCTCTTCCGAGGCTGGAAAATGTTTACCTTCAAGAAAACCAGCTTTCTGGTTCACTAGAAGACATTCCTTACCCTTTAACTTCATCTCTGTTATGTATTGACTTAGCCAACAATCAACTATCAGGCCCGATACCCAACTCACTTTTTCATCTTACAAATCTTAATTATCTCATTCTTGAATCAAATAAATTCACAGGCACAGTTGAACTTAGCTCTGTCTGGAAGCAGAAGAATCTATTTATCCTAAGCCTGTCAAACAATTTGATATCACTCATAGATGATGAAGTGCCTCCTTATCTTCCTAACATCAAGTACTTATACCTGTCATCTTGCAACCTTACAAAAATTCCAGGCACATTAAAATATCTTGATGCGGTTTCCCTTCTTGACCTTTCGAGTAATCAAATAACGGGGGCTATACCAAATTGGATATGGGAGAATTGGAAGGGCCACCTTAATATTTTGAACCTCTCGTGCAACATGTTAACTACTTTGGAACAATCTCCTTCTCTTGTTAATATGTCCAATTTAGCTTATCTTGATCTCAGTTTCAATAGACTTCAAGGAAGCATACCAATACCAGTAACCACATCCAGTGAGATCGCATTGGACTACTCAAACAACCACTTCTCTTCAATAGTACCGAACTTTGGCATATATCTTGAAAACGCCAGCTATATTAATTTCTCCAATAATAAACTAAGTGGCAATGTACCATCTTCGATTTGTAATGCAAGCAAAGCCATTATCACGGACTTATCTGGCAACAACTACAGTGGATCAGTACCAGCATGTCTTACAGGAAGTGTAAACTTAAGCGTATTGAAATTGAGAGACAACCAATTCCATGGGGTGTTACCTAACAATAGTAGAGAGGGGTGCAATCTTCAGTCAATAGATGTGAATGGAAACCAAATTGAAGGTAAACTACCTAGATCACTATCATACTGCCAATATTTGGAGCTCCTGGATGCTGGAAATAATCAGATTGTTGATTCTTTTCCATTTTGGTTGGGTAAACTTCCAAATCTCCGAGTCCTTGTCTTAAGATCCAACAAACTCAATGGCACAATAAGGGGTCTTAAAGGTTGTCACCAAAATTGTAATCACTTCAAAAGGTTGCAAATAATTGATTTGGCCTCCAACCATTTCTCTGGCAACATACATCCAGAATGGTTTGAGCATTTTCAATCAATGATGGAAAATGACAACGATGAGGGACACATATTAGAGCATACCACAAACACAAAAATACCATTGCTCTATCAGGATATTACGGTTGTCAATTACAAAGGGGGCACTCTTATGTTCACTAAAATCCTAACCACCTTCAAAGTAATTGATCTCTCAGATAACTCATTTGGTGGTCCTATTCCAAAGTCATTGGGGAAGCTTGTTTCACTACGTGGACTTAACCTGTCACACAATGCCTTCACAGGACACATTCCATCGCAGCTTAATTCTCTGACTCAGCTGGAGTCATTGGATCTCTCTTGGAACAAACTCTCAGGGGAAATCCCTCCTGAGTTAGCTTCTCTAACTTCTCTTGCTTGGTTGAATCTTTCGTACAACAACTTGACCAGAAGAATACCGCAGGGTAACCAGTTCGGGTCATTTAGCAACAGCTCCTTTGAAGGTAATGTCAACCTCTGTGGAAAGCCACTCTCTAAACAATGTGATACTCCAGGCTCAACATCTCCAAGTGCATCAGCTCCTTCAGGTACCAACAGTTTCTGGCAGGACAGACTTGGCGTGATCCTTTTGTTCATCTTTTCTGGCCTGGGGTTCACAGTGGGCTTCATATTGGCAGTCTGGCAAGCTCGACGACGGTACTACGAGACATCGTTACTCGTACTGATGCTCCTCCTCCTCCTACAAGCTAGGCTCGCGCAATCGCTTCCTCCATGCTCGCCGGACCAGGCCACGGCGCTGCTCCAGCTGAAGCGGTCGTTCACCGTGAACACCGCGTCGGCCACCGCCTTCCGGTCATGGCGCGCTGGCACCGACTGCTGCCACTGGGCGGGCGTCCGCTGCGACGACGACGACAACGACGCCGCCGCGAGCGGGAGCACCGGCCGCCGCGCCACTTCCCTCGATCTCGGCGGCCGCGGCCTGCAGAGCGGCGGCCTTGACGCTGCCGTCTTCAGCCTCACGTCGCTGGGGTATCTCAACCTCGGCGGCAACGACTTCAACGCGTCACGGCTCCCGGCCGTCGGGTTCGAGCGGCTCACCGAGCTGACCCATCTCAACATCTCCCCACCCAGCTTCACAGGCCAGATACCGGCAGGTATAGGACGCCTCACCAACTTGGTTTCTCTCGATTTATCAACTCTTTTCTATGTGATCAATCAAGAAGACGATCGTGCCGATATCATGGCACCTTCGTTTCCCAACTGGGGCTTCTGGAAGGTAGATTTTCTGAGGTTGGTTGCAAATCTTGACAATCTGAGGGAGCTCTATCTTGGCTTTGTGTATATGTCCAATGGAGGGGAAGGATGGTGCAACGCTCTGGTTAATTCCACTCCAAAAGATCAGTTCTTCGCCGATTTGTCCTCCCTTGGTGTTCTTCAACTCTCAAGAAACAAGTTGGAGGGTTTATTTCCAGCAAGGATCTTCCAGAACAGAAAATTAACAACCGTAGATATTAGCTACAACTACGAAATCTATGGCAGTTTTCCCAATTTTTCACCCAATAGTAGTTTGATCAATTTGCATCTCAGTGGTACCAAGTTCTCTGGTCAGATACCAACCTCCATTTCTAATCTCACAGGTCTGAAAGAGCTGGGTCTTAGTGCCAATGATTTCCCTACAGAGCTACCATCTTCTCTAGGAATGCTTAAATCCTTGAACTTATTAGAGGTTTCTGGGCAAGGCCTAGTAGGATCAATGCCAGCTTGGATAACAAATCTAACATCTCTGACAGAGCTTCAGTTTTCTAATTGTGGCTTGTCTGGATCATTACCATCTTCCATAGGCAATCTCAGAAATCTCAGGAGACTATCTTTATTCAAGTGCAGTTTTTCTGGAAACATACCATTGCAAATATTTAACTTGACACAACTGCGGAGCTTGGAACTTCCAATCAACAACTTTGTGGGGACAGTGGAACTTACCTCATTCTGGAGACTACCATATTTATCAGACCTTGCTCTTCAAATAATAAATTATCTGTGGTGGACGGTTTAG
More
|
|||||||
| Protein seq | MTVSILKMMISTKQRLLTPILILLICCYSIVTAANNDTTVPCLPEQASSLLQLKNSFINNANLSSWRAGSDCCHWEGITCGMASGRVISLDLSELNLMSNRLDAALFNLTSLTNLNLASNYFWRAELPVSGFERLTDMIHLNFSHSNFYGQIPIGLACLMKLVTLDFSSNDGLYFDEPSFQTVMANMSNLRELHLDEIEIFGSTWSVVLADNIPQLEILSLFACRISGPIHSSFSRLRSLKVINLGYNFGLPSKVPEFCAELSSLSILEIAGNSFEGQFPTKIFHLKSLRTLDLSHNPNLSINLPEFPDGNNLETLGLAATNLSYHIPSSFANLKSLKRLGMSTARTSKELPSLLDKLPSLTELELQGSESGLEKAVLSWVGNLKQLTALELVSYDFSESAPSWIGNLTNLKFLWIWDCNFSGSIIPYQIGNLAKLETLDFRGCEFFGQQIPPWIGNFTKLANLEMDSCGFSGSIPSTIGNLTQLESLRITSNPQLNGKIPQSLFALPRLENVYLQENQLSGSLEDIPYPLTSSLLCIDLANNQLSGPIPNSLFHLTNLNYLILESNKFTGTVELSSVWKQKNLFILSLSNNLISLIDDEVPPYLPNIKYLYLSSCNLTKIPGTLKYLDAVSLLDLSSNQITGAIPNWIWENWKGHLNILNLSCNMLTTLEQSPSLVNMSNLAYLDLSFNRLQGSIPIPVTTSSEIALDYSNNHFSSIVPNFGIYLENASYINFSNNKLSGNVPSSICNASKAIITDLSGNNYSGSVPACLTGSVNLSVLKLRDNQFHGVLPNNSREGCNLQSIDVNGNQIEGKLPRSLSYCQYLELLDAGNNQIVDSFPFWLGKLPNLRVLVLRSNKLNGTIRGLKGCHQNCNHFKRLQIIDLASNHFSGNIHPEWFEHFQSMMENDNDEGHILEHTTNTKIPLLYQDITVVNYKGGTLMFTKILTTFKVIDLSDNSFGGPIPKSLGKLVSLRGLNLSHNAFTGHIPSQLNSLTQLESLDLSWNKLSGEIPPELASLTSLAWLNLSYNNLTRRIPQGNQFGSFSNSSFEGNVNLCGKPLSKQCDTPGSTSPSASAPSGTNSFWQDRLGVILLFIFSGLGFTVGFILAVWQARRRYYETSLLVLMLLLLLQARLAQSLPPCSPDQATALLQLKRSFTVNTASATAFRSWRAGTDCCHWAGVRCDDDDNDAAASGSTGRRATSLDLGGRGLQSGGLDAAVFSLTSLGYLNLGGNDFNASRLPAVGFERLTELTHLNISPPSFTGQIPAGIGRLTNLVSLDLSTLFYVINQEDDRADIMAPSFPNWGFWKVDFLRLVANLDNLRELYLGFVYMSNGGEGWCNALVNSTPKDQFFADLSSLGVLQLSRNKLEGLFPARIFQNRKLTTVDISYNYEIYGSFPNFSPNSSLINLHLSGTKFSGQIPTSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSSLGMLKSLNLLEVSGQGLVGSMPAWITNLTSLTELQFSNCGLSGSLPSSIGNLRNLRRLSLFKCSFSGNIPLQIFNLTQLRSLELPINNFVGTVELTSFWRLPYLSDLALQIINYLWWTV
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.094549 | 0.0 | 0.188561 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0161300 | RBH | 0.000000 | 0.296935 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g06820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0161300 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0004220 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0012640 | SBH | 5.246065 | 23.924568 | 26.454285 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0004130 | SBH | 0.134132 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0004300 | SBH | 3.366402 | 2.023709 | 4.148655 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0056800 | SBH | 0.10463 | 0.270119 | 0.10602 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0004250 | RBH | 0.024807 | 0.015142 | 0.051441 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0058000 | RBH | 1.0294765 | 0.135955 | 0.996199 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0004070 | RBH | 0.067293 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004240 | RBH | 0.299800 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0004320 | RBH | 0.680627 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0004300 | RBH | 0.032240 | 0.0 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0004230 | RBH | 0.093167 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G004140 | SBH | 0.292217 | 0.129017 | 0.793193 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0004210 | RBH | 0.726669 | 0.0 | 0.794022 |
