Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_01G0056800 | OGI:01011260 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr01:3211938-3265982 | ||||||||
| Gene Symbol | KEAP1, OsKEAP1 | ||||||||||
| DNA seq | 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||||||||||
| Function | Receptor-like protein 6 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C637] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_01G0056800 | OsMH63_01T0056800-mRNA-1 | Chr01 | 3211938 | 3238736 | + | maker | ||
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| OsMH63_01G0056800 | OsMH63_01T0056800-mRNA-6 | Chr01 | 3258058 | 3265982 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGTCACATAATGCTCTTACAGGACCAATTCCCAACCAGCTTGCTAGTCTGCATCAACTTGAATCTTTGGACCTCTCTTCAAATAAGCTTTCTGGGGAGATCCCTCAAAAATTAGCATCCTTGGACTTCCTATCAACATTGAACCTATCAAATAATATGCTGGAGGGAAGAATACCAGAGTCACCTCATTTCTTGACACTCCCCAATAGTTCATTTACAAGAAATGCTGGTTTGTGTGGGCCTCCACTGTCAAAAGAATGCAGCAACAAATCAACATCAGATGCGATGGCGCACCTTTCTGAAGAGAAATCTGTAGACGTTATGCTATTTCTCTTCGTTGGATTGGGTTTTGGTGTTGGGTTTGCTATTGCAGTTGAGTCTGCCAGTCTGCTTCCCCTTGTAATTTTAGCTGTAATTGTAGCTAGCATGCATCTCAACCTCGGCGGCAACGACTTCAACGCGTCACAGCTCCCGGCCACCGGATTCGAGATGCTCACCGAGCTCACCCATCTCAACATCTCCCCACCCAGCTTCGCAGGCCAGATACCGGCAGGTATAGGACGCCTCACCAACTTGGTTTCTCTTGACCTGTCATCTAGCATCTACATCGTAAATCAAGGAGATGACGATGTCAGTATCATGTCAAATTTGTTACCCCCCTGGGGATTCTCGAGGGTAAACTTCGAGAAGTTGATTGCAAATCTTGGTAATCTGAGGGAGCTCTATCTTGGATTGGTGTACATGTCCAACGGAGGCGAAGGGTGGTGCAATGCTCTGGCTAATTCCACTCCTAAGATTCAGGTTCTGAGCCTACCATTATGCCAGATCTCTGGTCCCATTTGCCAATCTCTGTTTAGTTTGCGATCCCTTTCTGTTGTTGACTTGCAAGGAAATGACCTGTCTGGCGCCATACCTGAATTCTTCGCTGATTTGTCCTCACTTAGTGTTCTTCAGCTTTCAAGAAATAAGTTTGAGGGTTTGTTTCCGCAAAGGATCTTCCAGAACAGAAAACTGACAGCTATTGATATTAGCTACAACTATGAAGTTTATGGTGATTTGCCCAATTTTCCACCTAATAGCAGTTTGATCAAATTGCATGTCAGTGGCACCAAGTTCTCAGGTTACATACCAAGCTCTATTTCTAATCTCACGGGTCTGAAGGAGCTGGGTCTGAGTGCAAATGATTTCCCTACAGAACTGCCGTCTTCTCTAGGAATGCTTAAATCCTTGAACTTATTTGAGGTTTCGGGGCTCGGCCTAGTAGGATCAATGCCAGCTTGGATAACAAATCTAACATCTTTGACAGATCTCCAAATTTCTCATTGTAGCTTGTCTGGATCTTTACCATCTTCCATAGGCAATCTCAAGAATCTCAAAAGACTGTCTTTATTCAAAAGCAACTTCACTGGAAACATACCATTGCAAATCTTTAACTTGACACAACTGCATAGCTTGCATCTTCCACTAAACAACTTCGTGGGGACAGTGGAACTTACCTCATTCTGGAGACTACCATACTTATCACACCTTGATCTTTCAAATAATAAATTATCTGTGGTGGACGGGTTAGTCAATGATTCAGCAGTGTCCTCTCCCAAAGTAAAATTCTTGAGCCTAGCTTCCTGCAACATATCAAAGTTTCCCAATGCATTAAGACATCAAGATAAGATAATCTTCCTTGACCTTTCAAATAACCAAATGCATGGGGCAATACCTCCATGGGCATGGGAAACTTGGAAAGAATTGTTCTTCTTGGACCTATCAAATAACAAATTTACCAGTCTTGGACATGACACTTTGCTCCCCCTGTACACAAGATATATCAATCTCAGTTATAATATGTTTGAAGGACCCATACCTATACCTAAAGAGAGTACAGACTCTCAGTTGGATTACTCGAATAATCGGTTTTCTTCTATGCCGTTTGATCTAATTCCATATCTTGCTGGTACACTATCTCTAAAGGTCTCTATGAACAATGTCTCTGGAGAAGTCCCATCAACATTTTGTACTGTTAAGAGTCTTCAAATCCTTGACCTTTCCTACAATATCTTAAATGGCTCAATTCCTTCCTGTCTGATGGAGAATTCATCAACACTAAAAATATTAAATTTGAGGGGAAACGAACTTCGCGGAGAGTTGCCACATAATATGAAGGAAGACTCTGCATTTGAGGCATTGGATGTCAGCTATAATTGGATTGAAGGGACACTACCTAAATCATTAGTAACTTGCAAAAACTTGGTGGTACTTAATGTTGGGAACAATCAAATTGGAGGCTCTTTTCCATGTTGGATGCATCTTCTTCCTAAACTCCAAGTCCTTGTCCTGAAGTCCAATAAGTTCTACGGACAGTTGGGGCCTACTCTTGCTAAAGATGATGAATGTGAACTACAGTATCTCCGAATTCTTGATCTAGCTTCAAACAACTTCTCGGGAGTATTGCCTTATGAATGGTTTAGGAAACTAAAATCCATGATGTCAGTCTCCAGTAACGAAACATTGGTCATGAAAGATGGAGATATGTACAGCACATTTAACCATATAACATATCTTTTTACTGCTAGATTTACATATAAAGGACTGGACATGATGTTTCCTAAGATCTTAAAGACCTTTGTACTAATTGATGTCTCCAATAATAGATTCTATGGCAGCATTCCTGAAACTATTGCCACACTAAGCATGCTCAATGGTCTCAACATGTCACATAATGCTCTTACAGGACCAATTCCCAACCAGCTTGCTAGTCTGCATCAACTTGAGTCTTTGGACCTCTCATCAAATAAGCTTTCTGGGGAGATCCCTCAAAAATTAGCATCCTTGGACTTCCTATCAACATTGAACCTATCCGATAATATGCTGGAGGGAAGAATACCGGAGTCACCTCATTTCTTGACACTCCCCAATAGTTCATTTATACGAAATGCTGGACTGTGTGGGCCTCCATTGTCGAAAGAATGCAGCAACAAATCAACATCAAATGTGATGCCACATCTTTCCGAAGAGAAATCTGCAGACGTTATACTATTTCTCTTTGTTGGATTGGGTTTTGGTGTTGGGTTTGCTATTGCAATTGTAGTGAGGAAACCTTGCATTGGCAAATAA
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| Protein seq | MSHNALTGPIPNQLASLHQLESLDLSSNKLSGEIPQKLASLDFLSTLNLSNNMLEGRIPESPHFLTLPNSSFTRNAGLCGPPLSKECSNKSTSDAMAHLSEEKSVDVMLFLFVGLGFGVGFAIAVESASLLPLVILAVIVASMHLNLGGNDFNASQLPATGFEMLTELTHLNISPPSFAGQIPAGIGRLTNLVSLDLSSSIYIVNQGDDDVSIMSNLLPPWGFSRVNFEKLIANLGNLRELYLGLVYMSNGGEGWCNALANSTPKIQVLSLPLCQISGPICQSLFSLRSLSVVDLQGNDLSGAIPEFFADLSSLSVLQLSRNKFEGLFPQRIFQNRKLTAIDISYNYEVYGDLPNFPPNSSLIKLHVSGTKFSGYIPSSISNLTGLKELGLSANDFPTELPSSLGMLKSLNLFEVSGLGLVGSMPAWITNLTSLTDLQISHCSLSGSLPSSIGNLKNLKRLSLFKSNFTGNIPLQIFNLTQLHSLHLPLNNFVGTVELTSFWRLPYLSHLDLSNNKLSVVDGLVNDSAVSSPKVKFLSLASCNISKFPNALRHQDKIIFLDLSNNQMHGAIPPWAWETWKELFFLDLSNNKFTSLGHDTLLPLYTRYINLSYNMFEGPIPIPKESTDSQLDYSNNRFSSMPFDLIPYLAGTLSLKVSMNNVSGEVPSTFCTVKSLQILDLSYNILNGSIPSCLMENSSTLKILNLRGNELRGELPHNMKEDSAFEALDVSYNWIEGTLPKSLVTCKNLVVLNVGNNQIGGSFPCWMHLLPKLQVLVLKSNKFYGQLGPTLAKDDECELQYLRILDLASNNFSGVLPYEWFRKLKSMMSVSSNETLVMKDGDMYSTFNHITYLFTARFTYKGLDMMFPKILKTFVLIDVSNNRFYGSIPETIATLSMLNGLNMSHNALTGPIPNQLASLHQLESLDLSSNKLSGEIPQKLASLDFLSTLNLSDNMLEGRIPESPHFLTLPNSSFIRNAGLCGPPLSKECSNKSTSNVMPHLSEEKSADVILFLFVGLGFGVGFAIAIVVRKPCIGK
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.10463 | 0.270119 | 0.10602 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0162300 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0004520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0004200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0012640 | SBH | 5.246065 | 23.924568 | 26.454285 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0012100 | SBH | 0.381584 | 0.863463 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0004300 | RBH | 3.366402 | 2.023709 | 4.148655 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0057100 | RBH | 0 | 0.0605585 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0004230 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0058000 | RBH | 1.0294765 | 0.135955 | 0.996199 |
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| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0004240 | RBH | 0.299800 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0004290 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0004280 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0004210 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G012280 | SBH | 2.352120 | 10.527529 | 8.430974 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0012130 | SBH | 6.591588 | 14.994800 | 19.610842 |
