Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_12G0022600 OGI:09005370 | 16/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr12:1306918-1311632
Gene Symbol -
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Transcripts

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OsMH63_12G0022600 OsMH63_12T0022600-mRNA-3 Chr12 1306918 1311632 - maker
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_12G0022600 OsMH63_12T0022600-mRNA-7 Chr12 1306918 1308283 - maker
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ATGGACAACAATAGTGGCAAGGGAGGAAGCACCCATGCTTCATGGACGTCAGCTATGTCATCTTTCATGCTGAAACACCTTGCCAATCTTGTGGCCGGTGGCACAAGTACCTCATCTGGCTTCAAGGCAGTGCATCTCAATGCATGTGCGAGGGCTGTGAATAAAAGGTTTAACAGTACTCTCACGGGTGAGCAAATTAAGAATCATTTGAAGACATGGCAAAGAAAGTTTACAAAGATAAATAGGCTTAGGAAAGTTAGTGCTGCTGGTTGGGATGAGAAAAATTTCATCATTACTCTTGATGATGAGCACTACAATGGCTATATTGAGGATCACAAGGCTGATGCTGATTATTTTAACAAACCTCTTGCGCACTATGGTGAGATGCTTACAATATTTGGTAGCACCATGGCTACGGGAAAGTATGCAAAGGACTCAAGTTCAGTCCTAGGAACAGAGGATGTCCAAGAGGAAAATGATGAAGAGGAAAATGATGGCCCTGCCACTACTGATGATCGTCCGGAGGCATCATCTGCAAGCAAGCCAAAGAAAGCTAGAACACAAGAAATTGAAGATGATGGGCTGATTGGTGCATTCACCAGTGTTGGTGACAAGTTAGCTTCTGCTATACTAAAGGTCGCTGAGCCAGACAATAAACTGCCAGATGGTTTATTTGAAACCTTGAAAAGCCTTCCTGGGTTTGAGGAGATCCACGTATCTGTTTACTATGCTCATTTGGTTGCTAACCCTCACATTGTTAGAGCTTTTGATGGACTTCCTTTCGAAAACAAGATACATTGGGTCCATTTGTTCATTAATGAGAAGTTTCCTGGATCAATGTAG

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Protein seq

MDNNSGKGGSTHASWTSAMSSFMLKHLANLVAGGTSTSSGFKAVHLNACARAVNKRFNSTLTGEQIKNHLKTWQRKFTKINRLRKVSAAGWDEKNFIITLDDEHYNGYIEDHKADADYFNKPLAHYGEMLTIFGSTMATGKYAKDSSSVLGTEDVQEENDEEENDGPATTDDRPEASSASKPKKARTQEIEDDGLIGAFTSVGDKLASAILKVAEPDNKLPDGLFETLKSLPGFEEIHVSVYYAHLVANPHIVRAFDGLPFENKIHWVHLFINEKFPGSM

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0 0.0068885

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0401400 SBH 0.0 0.0 0.226274
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g03250 RBH 0.0 0.0 0.089358
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0401400 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0004160 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0336400 SBH 0.005577 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0004150 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0023800 RBH 0 0 0.0028585
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0003920 RBH 0.059174 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
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