Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_11G0435900 | OGI:11076340 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:32740533-32747104 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | ATGGCACGGCATCACCATACCCCTCATCGGCAGTTGCTGGATGAACTTCTATCTTCCAACGAAGGTAACCGGCTGCAGATTGGGTCGGTAAAGACCGAGGAGTTTAAGGTTCCAAGAGTCCGGTACGTTCAGGAAGCCACAAGGAACGTCATCTCAGTGGCCCAGCTTGCTTATCATAGGCTTGTTTGGATCCTTCGGGCTATTAAATATCCCTCCGGAATCTTGTTATTTAAGAGTATTAAACGTAGATTACTGACAAAACCAATTCCATAACCCCTAGGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGAGGTATATTAATCCACGATTAGCGAATGATTACTGTAGTATCACTGTAGCAAATTATGGATTAATATACATCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGGTTATGGAATGGGTTTTATCAGTAATCTACGTTTAATACTCCTAAATAACAAGATTCCGGAGGGCTATTTAATAGCCCTCCGGATCCAAACAGGCATGATATCATGGTTTGGTTACGGTGTTTGAGCCGACATGTTGCCACGTGAAAGTTAAGGAAACCGGAGAGATCATTGGTGAGGGCACGTTATGCCAGGGCCAATACGTGCTGGACTACCTGCGCATTCACCAGGTATATACTCCCTCCGTTTCGAAATATTTGACACCGTTGTTGACTTTTTAGCACATGTTTGACCGTTCGTCTTATTAAAAACTTTTGTGAGATTTGTAAAATTATATGTCTACATAAAAATATACTTAACAATGAATCAAATGATAGGAAAAGAATTAATAATTACTTAAATTTTTTGAATGAGACGAATGGTCAAACATGTGATAAAAAGTCAATGGCGTCAAACATTTCGAAACGGAGGGAGTATATATATTAACATAGCTCTTTTAATTTACGTACACGTAAAATTTTCTAACAAACTTTTTACAAACTAGAAAGAAAATTAACCTGCGCAAATGCGCATCCATTTTAATGTATGATATTTCAAAAATATCGATGCCATTTAATGATTATATATAAACTGCTAAGCTTCTGTTTTAATATTATTTGTTGATTCTGTTTTATATTTTTTTTATTAATTCTGATATTTGACATTTTTTTACTTTAACTTAATCTAACAAATTATAGTGTAAAAGAAATTACCCACCACCCTTCTGTTTAATTTGACTCAGTAGGGTTTGTCTCTTTATCGATGACCATTGCATTATTGCCAATCGACTAGCTTAATTAATAATCTATCGTTGTTTCCGTTCGATACAGGATGCTGCTGAGGGTGCTCAGGAATTACAAGGCCACGACCGTTCAGGACCGCAGCAGCGGGAGTGGTCTAAGAAAGACGGCTTGTTTGGGAAGCCAATATTCAACAGGTACGTACGATTCTAGGTGGTCTGGCTGAATGCGTTGTGTAACAAATATTCTTTTATTCTAATATATTGACGTGCAATCCTTTTGCGCGTTCGAGAAAAAAAAAAGATTCTCAATCGATTTGTACGAACTTACTGTAGCTGGTGTGAGACAGCCTAATTTTGCTATATATTTGTGCAGCTCGTCGTCACATGAACAACATGACATGGAATGCTGATGCTCTAAAAGCCTACCATGCCGATCTCATGATCGAACCATCCATACAGTCTGTGCCCAGAGTTGATTCCGAGCTTTCTCCTCCTGTTGAAGTTAAAGGGATTGGGTACATCGACAGTGAAGGGGGGTCGCTTGATCGGGTGTTATTTGTTCCTGATTCGGATGTAAATCTGGTTTCCGTTAGCCAGCTTACGAGGGATCGCTCTGTGAGGGTGGTATTCCACCAGGATGTGTTCTGGGTTGAGAAGCTCCAAAACTCTGAGAGGATTGGGTGCGGCCACAAAGTTGGCAGTACCTACGTGGTGACTCGTTTGGATGTAGGAGCAGCGGACCACTGGATTCTCGATACCTTTGCATCGTGTCACTATACCCACAATCCGCGGATGCTTGATCAACTCCTGTCTTCCAACGATGTTCTACCGATGTTAGGGGGTAACCAGCTGCAGATTCTTGGGACGGGGTCGGTACAGACCGAGCGGTTCAAGGTCCCAGGCGTCCGCTACGTTCAGGAAGGCCAAAGGAACACCATCTCCGTGGCCCAGCTTGCTGGTCTTGGCTTGGTTACGGTTTTTGAGCCGATATTTTGCCACGTCAAGGATGAGGAGACTGGAGACATTATTGGTAGGGGCAGGTCACGCAACGGCCTATACGTGCTGGACTACCTGCGCATTCACCAGGTACTAGCTAGTTCGATTATCACTTTAATTTGCTATTCATGAGTCACCTTGTTTTTTCTTCTTATTATCTGCCAATTACCTACACTTGCACAAGTTACAGCCTGGACTTGCATAATGTGGAAAACTGCAACTTCAGTACAAATGAAATACAACCCTATGTATTCGCGCGGGCATGTATTCTATGGGCCTGTTTGGATCCGGAGGGCTATTAAATAGCCCTCCGGAATCTTGTTATTTAGGAGTATTAAACGTAGATTACTGATAAAACCCATTCCATAACCCCTAGGCTATTTTGCGAGACGAATCTAACGATGTATATTAATCCATAATTTGCTACAGTGATACTACAGTAATCATTCGCTAATCGTGGATTAATATACCTCGTTAGATTCGTCTCGCAAAATAGCCTAGGGGTTATGGAATTGGTTTTGTCAGTAATCTACGTTTAATACTCTTAAATAACAAGATTCCGGAGGGATATTTAATAGCCCGAAGGATCCAAACAAGCCCTATATTGCTTTGAAAAACTTATGTGGACCTCCATAAATTTTCTTCATCATTATTGCTTAGATAATTTTTTCAAACTATTTGTTAGCTTTAAAAATATATAATATTTAATACATCTCTATAAATAATTATCTATGATCTTATTTAGAAAACGTGTCTAACTTAAAAGTAAGATGTTTTGTCTTGTTTAATTGAATGTTTAGTGGCTTTTTTAAACAAATCTTAAAGAACAATTATCATAAATAAATATGTTTTATTTGTAGCATCAAGTTAGTCATCCTTCTAGTTAGTTCAAATTGACGCAAGTTGTTATATACTTACATATAAATTAACAAAGACATGTTGTGATATGTGTGATATATACTATTTTTTAAAAGAAAATACCTAATAAACATTGTGAAATCGTTGTCATGATTAATATTTGTGATGAACAATTGGCTGTGCAAATGATTTTATCAATGAATTGGTTTGAAAAGATGTGTGGATGTTGGTGTGAGTGCGTGTGACTAATGTGGGTCAGGTTGTGATATCTGTGCCCAGGAACGGTTGTTTTGTCTGATTGTGTGCAGGTAACTTGAGATCAGCCTTGGTCAATGGTGAGGACCGGGACTATGCTCAAGGAGGAGCAGAGGTATATTGCGGTCGGAATACCATGTGAGAAGGTGACTAGAGTTAGTATTCTTGGAGGTCAACTTCGGTCAACGGTGGGGATCGGGACTAAACTCAGGGAGGAGTTGAGGTCCAGACGGTCAAGGATACCGGGTGACGAAGTTGGATACGAGATGACATACGGTGGATGGATACCGTGTGGGAGAGATCTTCGCAACGGGCTTCACGAGGTGTGCGTGCAAGCGTCGGTGTTCGCGAAGGGAATTGGAAGAGGCTTATGTATGGTGCTACAGTACGGTGGTGTACTGTAGCGTGCATATATGTATGCGTGCTGGTGTGCAGCGTGCATATATGTGTGGTATACATGCAGTACGTGCATGCATGTGTGATGCATGTATGTATGCATGGTGGTGATTGACTTTGGCTTTGCTTGCGTGGTCAAGCAGCTTCAATGATGGCAGGCTTGATCCATGCAGAGGCAAGCCGAGTCGGCTCAGGCAGCAAGCAGCAGCAGCGACGGCAGGAGAGTCTGACTCGGTGTGGTGCGGCTGCAGGTTTGGTAAATTGTAAACGGCGTGGAAATTGTGGTTTGAGTACTATTGTGAATAGGAGTTCTACACCTACTTTGAGTAGGGGATTTTTGTGGTATAAATAGAGAGGGAGCGTGAGGCTTTCCGGTATCGCTTTTCAGTGTCGCTTTTGAGAGCAATTGAGTTGCTAGTTTAGTTAGGGTTTCGAGTTTAGTCGAGATTTTTGTAAGGAGTGCTGTTCGTGCACTTTGTAAACACAGAGAGAAGCAATAAAGTTGTCATCTACTTTGAGAGTTCTTCGATTTGTGTTTCATTGAGTACGGCGGTCACACCCGCGGCAGGGAGGCGGTTCAACCGACGACAAGACGGCGGTTCGACTGGCAGCGTGCGAGCAGTCCGACCGGCGGCGGCGACAGGACTACGTCGAGATTTCCATCGATTTGAGGGTAACTTTTATTTCCGCTAAAAGTTTTTGGGTATTTGGTTTTCCCTACCATTCACCCCCCCTCTGGTAGGCTTAGTTTCTTGTGTTCGATCCTGTTGAATAGTCTCACATTGGTTGTGGAAGGGCAAAGGACCTAAGATATAAGTGGGGGAGCCCCTCACCTTAATGGCTAGCTTTTGGGGTGGGAAAGGCCCTTTACGATCCTACAATTGGTATCAGAGCCTGGCTAGGTTAACATCTCTGGCCCGATGGACACGTGTGAAGGCCTGATGGACCGTGGGTGCCTGCGGGGCCCGTATACCTGATGGACCGTGGGCCGGTGGGATCTATACACGGTGAAGGGGCGGTGAAGGGCTGAGGAACACCAATGTGTGAAGGGGGAGATTGTTGAATAGTCCCACATTGGTTGTGGAAGGGCAAAGGACCTAAGATATAAGTGGGAGAGCCCCTCACCTCAATGGCTAGCTTTTAGGGTGGGAAAGGCCCTTTACGATCCTACAAACATGAGTCCTAAAATTTAAATTTAATAGTAATAAATATAACTTTTTGACCAGCTATATACTGCTTCCTTAGTGTAGTTTCTTATATATGCAACAATATGCTGAGAAACTCATAATGTTACGGTATAGGATAGAAG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| Protein seq | MARHHHTPHRQLLDELLSSNEGNRLQIGSVKTEEFKVPRVRMLLRVLRNYKATTVQDRSSGSGLRKTACLGSQYSTARRHMNNMTWNADALKAYHADLMIEPSIQSVPRVDSELSPPVEVKGIGYIDSEGGSLDRLTRDRSVRVVFHQDVFWVEKLQNSERIGCGHKVGSTYVVTRLDVGAADHWILDTFASCHYTHNPRMLDQLLSSNDVLPMLGGNQLQILGTGSVQTERFKVPGVRYVQEGQRNTISVAQLAGLGLVTVFEPIFCHVKDEETGDIIGRGRSRNGLYVLDYLRIHQC |
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| Function | - | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_11G0435900 | OsMH63_11T0435900-mRNA-1 | Chr11 | 32740533 | 32747104 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGCACGGCATCACCATACCCCTCATCGGCAGTTGCTGGATGAACTTCTATCTTCCAACGAAGGTAACCGGCTGCAGATTGGGTCGGTAAAGACCGAGGAGTTTAAGGTTCCAAGAGTCCGGATGCTGCTGAGGGTGCTCAGGAATTACAAGGCCACGACCGTTCAGGACCGCAGCAGCGGGAGTGGTCTAAGAAAGACGGCTTGTTTGGGAAGCCAATATTCAACAGCTCGTCGTCACATGAACAACATGACATGGAATGCTGATGCTCTAAAAGCCTACCATGCCGATCTCATGATCGAACCATCCATACAGTCTGTGCCCAGAGTTGATTCCGAGCTTTCTCCTCCTGTTGAAGTTAAAGGGATTGGGTACATCGACAGTGAAGGGGGGTCGCTTGATCGGCTTACGAGGGATCGCTCTGTGAGGGTGGTATTCCACCAGGATGTGTTCTGGGTTGAGAAGCTCCAAAACTCTGAGAGGATTGGGTGCGGCCACAAAGTTGGCAGTACCTACGTGGTGACTCGTTTGGATGTAGGAGCAGCGGACCACTGGATTCTCGATACCTTTGCATCGTGTCACTATACCCACAATCCGCGGATGCTTGATCAACTCCTGTCTTCCAACGATGTTCTACCGATGTTAGGGGGTAACCAGCTGCAGATTCTTGGGACGGGGTCGGTACAGACCGAGCGGTTCAAGGTCCCAGGCGTCCGCTACGTTCAGGAAGGCCAAAGGAACACCATCTCCGTGGCCCAGCTTGCTGGTCTTGGCTTGGTTACGGTTTTTGAGCCGATATTTTGCCACGTCAAGGATGAGGAGACTGGAGACATTATTGGTAGGGGCAGGTCACGCAACGGCCTATACGTGCTGGACTACCTGCGCATTCACCAGTGTTGA
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| Protein seq | MARHHHTPHRQLLDELLSSNEGNRLQIGSVKTEEFKVPRVRMLLRVLRNYKATTVQDRSSGSGLRKTACLGSQYSTARRHMNNMTWNADALKAYHADLMIEPSIQSVPRVDSELSPPVEVKGIGYIDSEGGSLDRLTRDRSVRVVFHQDVFWVEKLQNSERIGCGHKVGSTYVVTRLDVGAADHWILDTFASCHYTHNPRMLDQLLSSNDVLPMLGGNQLQILGTGSVQTERFKVPGVRYVQEGQRNTISVAQLAGLGLVTVFEPIFCHVKDEETGDIIGRGRSRNGLYVLDYLRIHQC
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.134064 | 0.1522 | 0.0066205 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0678200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0678200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0023930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.393465 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0024050 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023600 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0023850 | RBH | 0.000000 | 1.390832 | 8.885913 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0433700 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024160 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 1.106125 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 1.546784 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0023810 | SBH | 0.187614 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G023790 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.047838 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
