Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsMH63_11G0419900 | OGI:11077650 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:31328310-31362659 | ||||||||
Gene Symbol | YR2, YR6, YR9, YR10, YR21, YR23, DRP-RP13, OsDRP-RP13, - | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MATIVDTLVGSCINKLQAIITDKAILILRVEDELEELQRRTDVIRSSLQDAEARRMEDSAVEKWLDQLRDVMYDVDDIIDLARFKGSVLLPDYPMSSSRKSTACSGFSLSSCFSNIRIRHEVAVKIRSLNKKIENISKDKVFFELHRAQHNGSGSAWTPRESSSLVEPNLVGREVIHACREVVDLVLAHKEKNVYRLAIVGIGGVGKTTLAQKIFNDKKLERRFDKRAWVCVSKEYSGDSLLRQVLRNMGIQHDKYESVGELQSNLASNIQGKSFFLVLDDVWHSEAWADLLRTPLHAAATGIVLVTTRDDTIARVIGVDHTHRVDLMSADVGWELLWRSMNINQEKQVQNLKDIGIEIVCKCGGLPLAIRVIATVLASQEQTENEWRRILGKNAWSMSKLPRELRGALYLSYDALPHQLKQCFLYCALCPEDGIIHRDYLIWMWVAEGFIEKQEDQLLEDTAEKYYYELIHRNLLQPDGSYIDHTTCKMHDLLRQLACYLSREECFVGDPESIGSDSMCKVRRISVVTEKDMVVLPSVDKDQYKVRCFTNHLYGTSQRIDDSLFKRLVCLRVLDLSDSLLHNIPGEIGHLIHLRFLDLNRTDISSLPESIGSLQNLQILNLLDCESLHSLPLATTQLCNLRRLGLGGTPINNVPKGLGRLKFLNDLVGFPVSHGSGNTKMQDGWNLEELAHLSQLRRLGLSNLEKATPSSSTDSLLLIDKVHLKYLYLFCTVPADEEYSEEDVSNVEKIFDQLEPPHNVQEVNIIEYFGRRLPIWIGTTHFHSLDYLILVGCKSCDHLPPIGRIPNLKYLRIEGATSITKIGPEFVGYGEGNLRPRDEVAFPKLELLIIKDMPNWEEWAFIEEEVKEATTAAEEGGEDGATSKQKGKEVLSPRSSWLLPCLKKFDIVNCPKLTALPPQLGQQATSLKLLIIGYAGCLKRVENLWFLSDSLHIEGCESLERVSNIPHVRKLYVTSCPNLRCVEELGSLEQLWLMEDMLEISLVWVPRLQEQHRQHHEDELEVIEWFVCRMATIVGTLVGSCINKLQAIITDKAILILGVKDELEELQRRTNVIRYSLQDAEARRMEDSAVEKWLDQLRDVMYDVDDIIDLARFKGSVLLPNYPMSSSRKSTACSGLSLSSCFSNIRIRHEVAVKIRSLNKKIDNISKDDVFLKLSRTQHNGSGSAWTPIESSSLVEPNLVGKEVVHACREVVDLVLAHKAKNVYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIFNDKKLEGRFDHRAWVCVSKEYSMVSLLTQVLSNMKIHYEQNESVGNLQSKLKAGIADKSFFLVLDDVWHYKAWEDLLRTPLNAAATGIILVTTRDETIARVIGVDRTHRVDLMSADVGWELLWRSMNIKEEKQVKNLRDTGIEIVRKCGGLPLAIRAIAKVLASLQDQTENEWRQILGKNAWSMSKLPDELNGALYLSYEVLPHQLKQCFLYCALFPEDATIFCGDLTRMWVAEGFIDEQEGQLLEDTAERYYHELIHRNLLQPDGLYFDHSRCKMHDLLRQLASYLSREECFVGDPESLGTNTMCKVRRISVVTEKDIVVLPSMDKDQYKVRCFTNLSGNSARIDNSLFKRLVCLRILDLSDSLVHDIPGAIGNLIYLRLLDLDRTNICSLPEAIGSLQSLQILNLQGCESLRRLPLATTQLCNLRRLGLAGTPINLVPKGIGRLKFLNDLEGFPIGGGNDNTKIQDGWNLEELAHLSQLRCLDMIKLERATPCSSRDPFLLTEKKHLKVLNLHCTEQTDEAYSEEGISNVEKIFEKLAPPHKLEDLVIGNFFGRRFPTWLGSTHLSSVKYVLLIDCKSCVHLPPIGHLPNLKYLKINGASAITKIGPEFVGCWEGNLRSTEAVAFPKLELLAIEDMSNWEEWSFVEEEEEVQEEEASAAAKEGGEDGTAALKPKGEEAPSPTPRSLWLLPCLTKLQLVECPKLRVLPPQLGQQATNLKELHIRYTSCLKTVEDLPFLSGYLLVDGCEGLERVSNLPQARKLFVNECLNLRHVEELGGLEQLLLEKGMQEISQLWIPGLQEQHRQLHGDEHELEVTESRCLKTVEDLPFLSSYLLVEGCEGLERISNLPQVRELFVNRCLNLRHVEELGGLEQLLLDEGMQEISQLWIPGLQEQHRQLHGDEHELEVRPNVTDSLQPVSRILKMEGLCPTSVPSVGLLIKVNLEEFGLQSPSSLPQICNLLMDSEIRIEHKAKHSYSASSDEKRKGEENEGSCTSVVLEVLRRRRRWTRRRFTSSERSLACRHRINGNGKNARTTRLSCLRTNRQPLAGAPSGNPKSRRPYPEAVRVPLVLGLLSSFRSGRLSQHLLTTKQWLLLQFGLQFKCSNMLCAICALVHKLRMVILFHSEEMEQLRNAEPLGSEENSPGQKDRKWSNVNGEQLISIDHGEAEPDKSTALGVMILATHKSFLELANRNVGLLGHHLAFQKTPACSTVVPIDPIHFSLSSAFIPNNHQKSHVDPLLFATAQDQAHPIYGITTSVIFFLSGDAMRGCTHQLRPHSDEAHPIYGITGNMLTIFLDIGDVAAAHSGDESFLMEEKLKNIYEVCWMATIVDTLVGSCINKLQALITDKAILICGVKNKLEELLQRTDFIRSSLNDAEERRMEDSTVEKWLDQLRDVMYDVDDIIDLARFKGSALLPDHPMSLSRKLTACSGLSLSSCFSNIRIRHEVAVKIRSLNKKVENISKDEVFLKLSRTQHNGSGSAWTPIESSSLVEPNLVGKEVIHACREVVDLVLAHKAKNVYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIFNDKKLEGRFDHRAWVCVSKEYSMVSLLTQFLSNMQIHYEQNESVGNLQSKLKAGIADKSFFLVLDDVWHYKAWEDLLRTPLNAAATGIILVTTRDETIARVIGVDRTHRVDLMSADVGWELLWRSMNVKEEKQVKNLRDTGIEIVRKCGGLPLAIRAIAKVLASLQDQTENEWRQILGKNAWSMSKLPDELNGALYLSYEVLPHQLKQCFLYCALFPEDATIFRDDLTRIWVAEGFIDEEKGQLLEDTAQRYYYELIYRNLLQPVGLYFDHSRCKIHDLLRQLACRLSREECFVGDPESLGSNSMCKIRRTLVVTEKDIVVLPSMDKERYKVRTYRISYEKPLQVDSSHFKKLKYLHVLDLTNSHVQRIPNYIDNMIHLRLLDLDGTDISHLPESIGSLQNLQILNLQRCKSLHSLPLATTQLCNLRRLGLAGTPINQVPKGIGRLKFLNDLQGFPIGGESDNTKIQDGWNLEELAHLSQLRCLDMIKLERATPCSSTDSFLLAEKKRLKLLALWCTEQTDESYSEENASNVENIFEKLTPPHNLEKLVIVNFFGCRFPTWLGTTHLPSVKSVILTNCKSCVHLPPIGQLPNLNYLKIIGASAITKIGPEFVGCREGNLRSTEAVAFPKLEWLIIKDMPNWEEWSFVVEEEEDVVEEGASAAAKEGGEDGTAASKQKGEETLSPRSLWLLPCLTKLELQDCPKLRALPPQLGQQATNLKELDIREEKCLKTVEDLPFLSGYLLVEACEGLERISNLPQVRELYVNLCPNLRHVEELGSLEQLGLTKNMQEISKLWVPRLQEQHRRLHGDEHELEVNEWL |
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Function | Putative disease resistance protein RGA4 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA39] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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Protein seq | MATILDSLVGSCANKLKEIITEEVILILGIQEELAELQRKTELIHCCVSDAEARRMEESAVDNWLGQLREVLYDVDDIIDLARFKGSILLTDHPSSSSRKSIACTGLSISTCFSNVQARHEVAVKIRSLNRKIENISKDRVFLTLKSTVPTGSSSVLRVRKSSHLLEPNIVGKEIIHACRKMVDLVLEHKGRKLYKLAIVGTGGVGKTTLAQKIYNDRKIKGSFNKKAWVCVSKVYSEASLLRELLRIMEVHHDQDESIGELQSKLEIAIKETSFFLVLDDMWQSDAWTNLLRIPLHAAEMGAILITTRNNIVALEIGVDHTYRVDLMSTDVGWELLWKSMNISESIELQTLQDVGIEIVRKCGCLPLAIKVIARVLASKEQTENEWKKILSKNAWFMNNLPNDLRGALYLSYDELPRHLKQCFLYCSVYPEDANIYRDDLTRMWIAEGFIEDHGGQLLEETADEYYYELIHRNLLQPDGLYYDHSSCKMHDLLRQLASYLSREECFVGNPESLVGNTVSKLRRVSVVTDKNMVMLPSMDEVQYKVRTWKTSYEKTLRVDNSFFKRFPYLRVLDLTDSFVPSIPGCIGNLIHLRLLDLDGTNVSCLPESIGNLKNLQILNLERCVALHSLPSAITQLCNLRRLGLNYSPIYQVPKGIGKLEFLNDVEGFPVYGGSSNTKMQDGWNLEELAYLYQLRRLHMIKLERAAYRTTYPLLTDKGFLKFLYLWCTERTDEPYTEKDFSNIEKIFEQLIPPCNLEDLAIVKFFGRQYPFWIDSTHLAYVKSLHLFNCKFCMHLPPVGQLPNLKYLKIEGAAAVTIIGPEFAGLRASNLGRTVAFPKLEELLIRDMPNWEEWFFIDEATSTAKERVDDGDSAMPKEKALPPRMQILSRLRRLELSGCPKLKALPRQLAQINSLKEIELRWVSSLKVVENFPLLSETLLIATCQALEKVSNLPQVRELRVQDCPNLRLVEELGTLEQLWLYEDMHEVSTLWVPGLQQQCRQCHGEDLDVYNWTYALHAATGKLPSSRHSEGKGRHDTYLRVLQPQLQSQMEGVTLYMVDYPF
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.593919 | 1.271223 | 0 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
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Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0677000 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g45050 | SBH | 1.895145 | 2.270342 | 1.721375 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0677101 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0023760 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0022010 | SBH | 0.330990 | 6.824082 | 4.459390 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0023090 | SBH | 0.067817 | 0.359010 | 0.315617 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0023080 | SBH | 0.163884 | 0.083088 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0023750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0418200 | RBH | 0.0914695 | 0.017517 | 0 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0024040 | SBH | 0.631033 | 1.936608 | 0.070722 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0431800 | RBH | 0.0247405 | 3.3243495 | 0.4231555 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0023800 | RBH | 0.366803 | 0.284244 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0023790 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0023320 | RBH | 1.731517 | 4.641118 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0023040 | SBH | 0.306741 | 0.0 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0023260 | RBH | 0.907562 | 3.272615 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G023610 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0023820 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |