Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsMH63_11G0292400 | OGI:11055260 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:21647890-21686339 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Protein HASTY 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q0WP44] |
Transcripts
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CDS seq | ATGGACACTGTCCTCCCCTCCGCTGTGCCTGACTCAGCGGCTCCTGTCGCTGGAGATTCAGGGCTCTCAGAGCAGCAGCTGATTCAATATATACACTCGCTTCGGGAAAATCAAGTTGTTGACGCTATTCCATTGGTTTTGTGTTGCCCTCCTGAATTCTCCAAGAAATTGGCAATCAAGTTTGTACAACCCATGTTACGACAGTGTAAATTTGTACTTAATTTTGCTTGGTTCAATCATTTATACAAAGGGAAAGCTGAAGTACCATTCCTTTCTGAATTTGGTGAGACAGAAAAGCTACAGCAAAAATTACTACTTGATTTCACTCGTGAAGTTTCAGAATTTCTTGGAGTATTGGCAGTAACAGAAGAAAACTATTTGCAAGATCCTGAATCTATGTCATCAATCTCTCTCTTTAGGTTTATTTTAACTGGTGATTGTTTTGACTGGCTGGATATGAGCCTCTTTGGGTACTTTGTGGATGATGAAGCAACAAGCAAGGCTATTCCTTTTTTACGTTCTCTCATTCACCTTGCAACAACTGATGATATGAGTCTCAGGCTCTTCATCGTGGATGATTTGCTTCCATCTATAGTTAGACGTCTAGACAATCAGCTTACTTGTGCAATCCAGTGCCAAAGACACAAACTGAATCCAGGTGCAGCTGATAGTGCTGGCAAGGACCTTGAGTTTTCTAGAGAAGGCAAAGACAATTGTAGCGCTGAATGCAGCTTTAGCGTCTGGATTGAAAAGCTGAAGAAAGATCTTGAATTAAAGGCGTCTTCTGCTAGTAAGGAACTTCCTGAGGGTTGTGAGTGGAATTGGGAGTTCGAAGAAGAATTTCAGAGGTACCTTCATGTTTATATGGACATCTTACAAGAAGTGAATGCAATGGATGATTGTATGGAGCGTGATTATTTGGACAAAGAAACTCTCTTCCAGAAATTGAAATTTGAATTCAGATATAAGCATGCCATCAACAGCTATCAACATCCTTATATGGTGACCATTTCTTCTCTCCGACAACGACAATTTTACACAAGGACTTGCTTCAGATGCAACATGCAGATATGTAAATTTCTTAGCGAACTTGTCAAACTGAAACCCTACATTAAGGTTTCTGATTGTTCTTATGATGTTATTGAAAATCTCAAACAAAATCATGAGATACTTACTGAGATTTCAGACTGTGAAGTGCTTTTGCTTCATTCTGTGTTGTATATTTGGGAGCCTAGATTTCATCCTTTGATACGTGAGTTGTTGGTGATTTCCCTTCACACTTACAGCCTTATGCGTATGCATTTGTTGACAATTAAGTTTAGAGATTCCATGTATTATACTGCTGTAGAGCAAATACGCTTGCACAAAGAGTTTGACAATTATTTGTCCTCTGGTGAACTGGATCATTCTATGGATGAGTTTATTTCTTCAAAGGATGAATTTGTAGAAGATCTCATTAGAGACGAGAGCACGATGGCACAGTTTTCAGATTTGAATCATGCTCTCTTGAAATTGTCTTTGGAGAGGAGAGCTGATGTTCTGGAAAATCAGCAACAAATTTGCATATATTCAGAATGTTTACGACACCTCTTGGAGGATGAGTCGCTAAAGGATTATATCAAAAGGTTGATGAATGATCACAAAACGGAAGGTTTTTTCGACACGAATGATGATTCTATTAACTGGGACAAGAAATGCTTTTCAGATCTTGTAGATGAATTCAATGAGAGAGTTTTTTCTGGGCATTCCCTTCCTAAGCATTACATGATCAGAGGAATCATTGATTGTTGGTTAATCTTCACGCGGAAGGGTAACTCTTGGCAAGATACTTTCGAAGAGGTGGTTGTTGAAGCATGTGAAAGGTGGACTGAAAATCGTGAGAAGGTTTTTTCCTCGTTTCTTCCATCAATAGAATCTCGCCGTTAG
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|||||||
Protein seq | MDTVLPSAVPDSAAPVAGDSGLSEQQLIQYIHSLRENQVVDAIPLVLCCPPEFSKKLAIKFVQPMLRQCKFVLNFAWFNHLYKGKAEVPFLSEFGETEKLQQKLLLDFTREVSEFLGVLAVTEENYLQDPESMSSISLFRFILTGDCFDWLDMSLFGYFVDDEATSKAIPFLRSLIHLATTDDMSLRLFIVDDLLPSIVRRLDNQLTCAIQCQRHKLNPGAADSAGKDLEFSREGKDNCSAECSFSVWIEKLKKDLELKASSASKELPEGCEWNWEFEEEFQRYLHVYMDILQEVNAMDDCMERDYLDKETLFQKLKFEFRYKHAINSYQHPYMVTISSLRQRQFYTRTCFRCNMQICKFLSELVKLKPYIKVSDCSYDVIENLKQNHEILTEISDCEVLLLHSVLYIWEPRFHPLIRELLVISLHTYSLMRMHLLTIKFRDSMYYTAVEQIRLHKEFDNYLSSGELDHSMDEFISSKDEFVEDLIRDESTMAQFSDLNHALLKLSLERRADVLENQQQICIYSECLRHLLEDESLKDYIKRLMNDHKTEGFFDTNDDSINWDKKCFSDLVDEFNERVFSGHSLPKHYMIRGIIDCWLIFTRKGNSWQDTFEEVVVEACERWTENREKVFSSFLPSIESRR
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.230818 | 1.6535065 | 33.372328 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0517400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 3.687678 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g31700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.978769 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0517400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0015330 | RBH | 0.0 | 0.0 | 8.127762 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0015290 | RBH | 0.0 | 0.0 | 2.412430 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0015240 | RBH | 0.115225 | 0.000000 | 13.953617 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0014940 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0015340 | RBH | 0.0 | 0.0 | 3.065104 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0290100 | SBH | 0 | 0.011645 | 0.761261 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0015560 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.288076 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0303800 | RBH | 0 | 0.678771 | 3.211362 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0015530 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0015460 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0015210 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0014930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0015220 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G015050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.850850 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0015360 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 2.233903 |