Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_11G0209700 OGI:11040030 | 15/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr11:16111263-16116358
Gene Symbol PPR
DNA seq

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Function Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g35030, mitochondrial [UniProtKB/Swiss-Prot:O64766]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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OsMH63_11G0209700 OsMH63_11T0209700.3 Chr11 16111297 16115979 + maker
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OsMH63_11G0209700 OsMH63_11T0209700.5 Chr11 16111297 16115973 + maker
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.204027 0.569324 0.266634

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0433101 RBH 0.246723 0.386488 0.625818
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g24530 RBH 0.134810 0.357066 0.149714
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0433101 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0012290 RBH 0.068361 0.0 0.228214
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0012310 RBH 0.0 0.0 0.336364
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0012230 RBH 0.157262 0.0 1.204827
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0011970 RBH 0.037593 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0012390 RBH 0.0 0.952334 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0012240 RBH 0.102009 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0223100 RBH 0.5131335 0.722531 2.7675275
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0012360 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0012480 RBH 0.000000 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0012090 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0011960 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0012290 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G012160 RBH 0.059410 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0012170 RBH 0.0 0.0 0.0
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