Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_11G0093400 | OGI:11017610 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:5952339-5976918 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK316, OsWD40-186, OsRLCK316, RLCK318, OsWD40-188, OsRLCK318 | ||||||||||
| DNA seq | 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Transcripts
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| CDS seq | ATGAATCCAACTAATGTACCATACCAATTGTTAAAAGAAATTACAGATGGATTCTCTGAGGAGCGAAAGCTTGGTAAAGGTGGATATGGAACAGTTTATAAGGGAGAGCATAAAAATGGAGATAAAATTGCGGTGAAGATTCTTCACACGGAAGGGTTTGACGATAATAAATTCAATAATGAGTTTGGGAACCTTATGATGGCCAACCATACAAACATTATACGGTTAGTTGGATACTGCTATGAAATAAAACATACAACTGGACTGGCTAAAGGAAGACTAGCTTTGATTGCAACCATAGATAGAGCACTTTGCTTCGAGTATATGCCTCGGGGGAGCCTTGAAAACTATCTTTCTGATGAAGATGATGGTCTTGACTGGCCCATACGGTACAAAATTATTAAAGGGACATGTGAGGGTTTAAAACATCTCCATGTGGAAATGAACCCACCTATTTACCATTTGGACCTAAAGCCTGCCAATATTTTGCTAGACAACAACATGGTGCCAAAAATTGCAGATTTTGGTTTGTCTAGGTTCATCACTGAAGAGAAAACAATGATCACAAAAAATCTTGTTGGGACTCTCCCATACATGCCACGAGAATACATAGAGAGGAAAGAAATATCAAACAAGTTAGACATATTCAGCTTGGGCGCTGTAATGCTAGATATAATTGCAGGACCTACAGGACGCTTCAGAAGCACGAAAATGCCTTCCCTAGAATTTACCAATCAAGTACAAGGGAAATGGAAAAACAGGTTACAGACAAGAAGGAATGGTCCCTTACTAGAAGCATATTGCCAGCAAGTAAAGACATGCACTGAGATAGCACTGAAATGCCTGGAAATTGATAGGGAAAATAGGCCTAATATATTGGAAATCATCAATCAAATTAATGAGAAAGAAGATATAATTGGTGAGCTGCCGATAGACCATGCCTTGGAGAAGCTACCCTCATACAACAACGAGTCTATCAACCTTGAGAGCAAATTGGCAAGCCATTTGAACTTAAATGAGACCAGAGAAAACCAAGAACCTGATCACCATAATGAATCATGTTCCAAAGAGAAAGAGGAGGACCAAGAGGAAGATCAGATCATCCCAATGGAGCATCCTGATTTTCCAAGAGATGTGCATCCATCAGAGCCATGGATCTTGACGAGCAATATGTTTGGCTCAGTTGACATCTTGAACTGTAATACGCAGTTCATCGCGCGAAAGCAATGGTTTGTGGTTGGACATCAAGATGGTTTCATAAGAGTTTACACATATGAGTCCCCAGTAAAGCAAGTGAAGAGATTCAAAGCTCATGTATGGAACATCACAACTTTGGATGTCCATCCAACTGAGCCTTACCTACTGTCAGTAGGCTCACAAGACCAGATCAAGCTGTGGGACTGGAACAAGGGCTGGGAGTGCATTAAGACATTTGACCTCCATGGCATAGCATATCAAATAAAATTTAACCCAAAAGATACACATAAATTTGCTATTGCGAGCTTGCAGGATGCACAGGTTTGGAATATCCGTTCTTCCCGTCATGAATTCACATTGTCTGGGCACGGATATATAGTGAGTTGCTTGGATTACTTTACTCGAGGCAATCAACTGTACATGATAACTGGTTCCTGGGACAAAACAGCCAAGATCTGGGATTGCCAGAGAAGGACTTGTGTTCAAACACTTGAAGGACATACGGATTGCATTACCTGTGTTTGTTCCCATCCAGATCTTCCAGTACTACTTACAGGTTCAAATGATGAGACAGTTCGTCTGTGGAACTCCATAACCTTCAAGCTTGAGGGTGTACTGGACTTTGAGCTCGGACAAGTTACTGCTATAATTTGTTTGAAGGGCTCAAAACGAGTTGTGATTGGACATGATGCTGGATTAGTGATTACTGAAATTCGCCATGAAAAGCCTGCGGCGTGGCACTTGGTGGTGGTGATGTCCTCCGTGAGTGAGTGCGCGCCGCGGATGGGGACGAGGTCGACGCTGACGACGAAGGCCCCCACGGGCGCGTGGTTGACGGCCACCTGGACCCATCCCCCGGGCGCCGCGCAGAGGTCGAGCACCGCGAGCGCCGTCGGCAGGAAGCGGAACCGCGCGTCGAGCTGGAGCAGCTTGAAGGCCATGCGAGCTATGAATCCAACTAATGTAACATACGAATTGTTAGAAGAAATTACAGATGGATTCTCCGAGGAGCGAAAGCTTGGTGAAGGTGGATATGGAACAGTTTACAAGGGAGAGCATAAAAATGGAGATAAAATTGCAGTGAAGATTCTTCATGATACGCAAGATTTTGACGGCAAGAAATTACAAAATGAGTTTGGGAACCTTATGATAGTCAACCATCCAAACATTGTACAGTTAGTTGGATACTGCTATGAAATAAAACATACACACGGACAAGTCAAAGGAAGACCAGTTTTGGTTGCAACAATACATAGAGCACTCTGCTTCGAGTATATGCCTCGGGGGAGCCTTGAAAACTATCTTTCTGATAAAGTTGATGGTCTTGACTGGCCTATACGGTACAAAATTATTAAAGGGACATGTGAGGGTTTAAAACATCTTCATGTGGAAATGAAGCCACCTATTTACCATTTGGACCTAAAGCCTGCCAATATTTTGCTAGACAACAACATGGTGCCGAAAATTGCAGATTTTGGTTTGTCCAGGTTCATCACTGAAGACAAAACCATGACTACAAAAACTCTTGTTGGGACAATCACATACCTACCACGAGAATACATAGAGAGGAAAGAAATATCAAACAAGTTAGACATATTCAGCTTGGGCGTTGTAATGCTAGAGATAATTGCAGGACCTGGACCTACAGGACGCTTCAGAAGCACCGAAATTCCTTCTCAAGAATTTACCGATCAGGTACTAGGGAATTGGAAAACTAGGCTAGAGACAAGAAGGAATGGTTCCCTACTGGAAGCATATTGCCAGCAAGTGAAGACATGCACCGAGATAGCACTGAAATGCATGGATACTGATAGGGAAAATAGGCCTAATATAGTGGAAATCATCAATCAAATTAACGAGAAAGAAGCTATCATTGGTGAGCTGCCGATAGACCGTGCCTTGGAGAAGCTACCCTCACACAACAACGAGTCTGTTACTCTTGAGAGCAAATTGGCCAGCCATTTGAACTTAAATGAGACCAAAGAAAATCATGAAGCCGATCACCATAACAGTTCTAGTTCCAAAGAGAAAGAGGAGGACCGAGAGGAAGATCAGATCATCCCAATGGAACATCCTGATGTTCCAATAGATGTGCATCCATCGGAACCATGGATCTTGACGAGCAATATGTTTGGCTCGGTTGACATCTTAAACTATAATACGCTTACGCAGCTAGTTACATTTTCGTTTGGTGGGACAGTTACTGCAGCCAAGTTCATCGCGCGAAAGCAATGGTTCGTGGTTGGACATCACGATGGTTTCATCAGAGTTTACACATATGAGTCCCCAGTAAAGCAAGTGAAGAGATTCAAAGCTCATGCTTGGAGTTGGACCATCACAACTTTGGATGTCCATCCAACTGAGCCTTACCTACTGTCAGTAGGCTCACAAGACCAGATCAAGCTGTGGGACTGGAACAAGGACTGGGAGTGTATCAGGACATTTGACCCCCATGGCGTAGCATATCAAATCAAATTTAACCCAAAAGATACACATAAATTTGCTGTTGCAAGCTTGATGGATGCTCAGGTTTGGAATATACGTTCTTCGCGTCATGAATTCACACTGTCTGGGCATGTATCTATAGTGGATTGTTTTGATTTCTTTACTCGAGGCAATCAGCTGTACATGATAACTGGTTCATGGGACAAAACGGCCAAGATCTGGGACTGTCAGAGAAGGACTTGTGTTCAAACACTTGAAGGACATACGGATTGTATCACCTGTGTTTGTTCCCATCCAGATCTGCCAATCCTACTTACAGGGTCAAATGATGAGACAGTTCGTCTGTGGAATGCCTCTACCTTCAAGCTGGAAGGTGTACTGGACTTTGAGCTCGGCAAAGTTACTGCTATTGTTTGCTTAAAGGGTTCAAAACGTACAAAGGTGGATGAGGAGAAAGACGGCTCCACTGTAACAACGGTTAATTCGATACATACCATTGCAGATATGCTATTTCATATAAATACTATTATAATTCATCTATTCGTAGTCATGTCACTAAAATTTTATAAAATTGGGATTGTGACATTGTCATCACGTTTTTTATCCATCTCTTCCTTGTCCGTCTTCTTCCTTCTAACCATGCATGCCAGTGGGGCATGTAGCTGGGCAATGTCAAGAAGATGTGTGCTCTCACCACAGCTGCCTTGGCCCTTGTCCTTACTGACGGCGCCGTTCTGCCTCCGGTGCACCGCATCGGACATAGCCCCGGTGCCACCACCCGAGGCCCAGATACAACGCTGCGCGGAGAGGCGCGCGGCGCGGAACTCGTCGTGCGTGAGGTCCGCGGAGCGCCAGGGTGTACGACGCGGACGCCCCGTTGCTACTTGCGTTGTGCGCCGCCAGCCCGCCACGCCCACAAACGCCACGTTTTACATTGACCGTGAACACCGCCAGCCTCGCCGCGCGCTCCCTCCGCGTCTCATGCGAATCCCCGTGCTCCGCGCACCGAAATACTGA
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|||||||
| Protein seq | MNPTNVPYQLLKEITDGFSEERKLGKGGYGTVYKGEHKNGDKIAVKILHTEGFDDNKFNNEFGNLMMANHTNIIRLVGYCYEIKHTTGLAKGRLALIATIDRALCFEYMPRGSLENYLSDEDDGLDWPIRYKIIKGTCEGLKHLHVEMNPPIYHLDLKPANILLDNNMVPKIADFGLSRFITEEKTMITKNLVGTLPYMPREYIERKEISNKLDIFSLGAVMLDIIAGPTGRFRSTKMPSLEFTNQVQGKWKNRLQTRRNGPLLEAYCQQVKTCTEIALKCLEIDRENRPNILEIINQINEKEDIIGELPIDHALEKLPSYNNESINLESKLASHLNLNETRENQEPDHHNESCSKEKEEDQEEDQIIPMEHPDFPRDVHPSEPWILTSNMFGSVDILNCNTQFIARKQWFVVGHQDGFIRVYTYESPVKQVKRFKAHVWNITTLDVHPTEPYLLSVGSQDQIKLWDWNKGWECIKTFDLHGIAYQIKFNPKDTHKFAIASLQDAQVWNIRSSRHEFTLSGHGYIVSCLDYFTRGNQLYMITGSWDKTAKIWDCQRRTCVQTLEGHTDCITCVCSHPDLPVLLTGSNDETVRLWNSITFKLEGVLDFELGQVTAIICLKGSKRVVIGHDAGLVITEIRHEKPAAWHLVVVMSSVSECAPRMGTRSTLTTKAPTGAWLTATWTHPPGAAQRSSTASAVGRKRNRASSWSSLKAMRAMNPTNVTYELLEEITDGFSEERKLGEGGYGTVYKGEHKNGDKIAVKILHDTQDFDGKKLQNEFGNLMIVNHPNIVQLVGYCYEIKHTHGQVKGRPVLVATIHRALCFEYMPRGSLENYLSDKVDGLDWPIRYKIIKGTCEGLKHLHVEMKPPIYHLDLKPANILLDNNMVPKIADFGLSRFITEDKTMTTKTLVGTITYLPREYIERKEISNKLDIFSLGVVMLEIIAGPGPTGRFRSTEIPSQEFTDQVLGNWKTRLETRRNGSLLEAYCQQVKTCTEIALKCMDTDRENRPNIVEIINQINEKEAIIGELPIDRALEKLPSHNNESVTLESKLASHLNLNETKENHEADHHNSSSSKEKEEDREEDQIIPMEHPDVPIDVHPSEPWILTSNMFGSVDILNYNTLTQLVTFSFGGTVTAAKFIARKQWFVVGHHDGFIRVYTYESPVKQVKRFKAHAWSWTITTLDVHPTEPYLLSVGSQDQIKLWDWNKDWECIRTFDPHGVAYQIKFNPKDTHKFAVASLMDAQVWNIRSSRHEFTLSGHVSIVDCFDFFTRGNQLYMITGSWDKTAKIWDCQRRTCVQTLEGHTDCITCVCSHPDLPILLTGSNDETVRLWNASTFKLEGVLDFELGKVTAIVCLKGSKRTKVDEEKDGSTVTTVNSIHTIADMLFHINTIIIHLFVVMSLKFYKIGIVTLSSRFLSISSLSVFFLLTMHASGACSWAMSRRCVLSPQLPWPLSLLTAPFCLRCTASDIAPVPPPEAQIQRCAERRAARNSSCVRSAERQGVRRGRPVATCVVRRQPATPTNATFYIDREHRQPRRALPPRLMRIPVLRAPKY
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.193188 | 1.072584 | 0.1490385 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0213000 | RBH | 0.234043 | 0.000000 | 0.816230 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g10710 | RBH | 0.177515 | 0.000000 | 0.209009 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0213000 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0007190 | RBH | 0.0 | 1.435141 | 0.919097 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0007260 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0007080 | RBH | 0.0 | 9.297534 | 2.610318 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0007100 | RBH | 0.0 | 0.043554 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0007060 | RBH | 0.0 | 0.0 | 3.701287 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0093000 | RBH | 0 | 0.132161 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0007050 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.078700 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0100400 | RBH | 1.2949105 | 1.729072 | 0.2452115 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0007200 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0007090 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0007100 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0007180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0007170 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G007220 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.613813 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0007060 | RBH | 0.0 | 4.860302 | 1.331363 |
