Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Gene Symbol -
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ATGCCGTCACGCGCCGTCATCGCGCAGCCGCCTAGCTCTAGCAATACCAATGCTTCTGTTGATCCACGGTTGGCTACTCTCTTCGCGGAAGAGAACCATCTTGTCGGTATAGATGGCCCAAGGGATGAACTTGTCAATTGGTTGGATGCAGAGAGCAGGTTGATAAAGTGTCGCAAGGTATTATCTATTGTGGGGTTTGGAGGTCTTGGGAAGACAACTCTAGCGAATGAGGTATATCGCAGGGTTAGAGTTCATTTCGACTGCCATGCATTTGTGTCAGTGTCACAAAAGCCCGATTTCAAGAATATCTTCAAGGATATAATATACAATATGCCTACGAAAGATGGTTTCCTCAAAGATATTGACACATGGAATGAAAAGAAATTTTTTGAAAAGCTAAGAGAACTACTTGTGGATAAGAGGTATCTTGTTATAATTGATGATGTATGGTCTATTTCGGCATGGAAAGCTATCACGGTTGCATTCCTGGAGAATGACTGTTCCAGTACAATTATAGTTACTACACGCGTTTCCGATGTTGGATGGTCATGCTGCTTAAATGGCATTGACCGCAATTATCAGATGGAACCTCTAAGTGAAGTTCACTCTAGAAGACTATTTTGCAAGAGAATTTTCAGTACAAATGAGGATGGCTGCCCAGATATTTTACAGGAAGTTTCAACAGATATATTGAAGAAATGTGGCGGTCTTCCATTAGCAATTATTAGCATATCTGGCTTATTAGCAAATAGACCAGTTATCAAGGAAGAGTGGGAGAAAGTGAAAGAATCGATTGGTTTTGCATTGGACAAGAACCAAAATCTAGAAGGAATGAAAATCACTGTCCCTTAG

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Protein seq

MPSRAVIAQPPSSSNTNASVDPRLATLFAEENHLVGIDGPRDELVNWLDAESRLIKCRKVLSIVGFGGLGKTTLANEVYRRVRVHFDCHAFVSVSQKPDFKNIFKDIIYNMPTKDGFLKDIDTWNEKKFFEKLRELLVDKRYLVIIDDVWSISAWKAITVAFLENDCSSTIIVTTRVSDVGWSCCLNGIDRNYQMEPLSEVHSRRLFCKRIFSTNEDGCPDILQEVSTDILKKCGGLPLAIISISGLLANRPVIKEEWEKVKESIGFALDKNQNLEGMKITVP

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_10G0036700 OsMH63_10T0036700-mRNA-4 Chr10 2536695 2541397 + maker
CDS seq

ATGTCGTGCGGCATCTCCGGTGGCTTAGGGCTTCAACGATCCGCGGCGGCGCGGATCCGGCCGCCGCTATGTCGGTTGCCGCCGTCCGACGAGCTGCTCGCCGTTGCACCCACCACCGCCCGAGCACCCGAGGAAGATAGAGCCGTCCGCTATTCACTACCGGCCCTCGCAGTCCACCGAGCTCACCGCCGCGCCCACCACTACCCCGTTGGCACTCCCGGCTGCGACAGCCACCGCCGCTTCTCCCCGAGCCCGTCGACGTCGCTGTCGCCCGCCGCGTAA

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Protein seq

MSCGISGGLGLQRSAAARIRPPLCRLPPSDELLAVAPTTARAPEEDRAVRYSLPALAVHRAHRRAHHYPVGTPGCDSHRRFSPSPSTSLSPAA

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 5.792574 26.232547 19.232971

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0133000 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g04110 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0133000 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0001660 RBH 0.845731 2.095128 3.416203
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_10g0001630 RBH 0.608830 0.891640 4.772571
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0001620 RBH 2.580737 6.798419 5.609202
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0001560 RBH 0.279214 0.112165 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0001540 RBH 6.165460 6.406488 10.872694
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0036800 RBH 0.075501 0.0549845 0.0612005
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0001710 RBH 0.0 0.0 0.030543
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0038900 SBH 0.015219 1.538173 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0001580 RBH 0.146785 0.002566 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_10g0001640 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0001690 RBH 0.0 8.486369 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0001580 RBH 0.0 0.0 0.135842
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_10g0001450 RBH 0.327523 3.186733 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G001640 RBH 0.442532 1.469370 2.293955
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_10g0001510 RBH 1.572620 3.276791 2.591505
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